Protein

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Genbank accession
XUK82138.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRLLFTKDDTGAIIDLGFAKGGNIDGNVIHTGNYNQTGDYTLNGTFTQIGDFNLKGIARVTRDIIAAGQIMTHGGELITKSSGTAHVRFHDLADRERGIIFSPANDGLTTQVLNIRVQDYKAGSESTFAFNGNGLFSSPEVFGWKSVSTPVIYTNKVITNKKVKDDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYSGDGLDAYLWSFTWSGGIKSSHSISIGLTPGNKDYSILGPSSIALGDNDTGFKWHQDGYFFTVNNGTKTFLSGPAETTSLRKMVMGYSVNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLMFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFTNPSVGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKDGDIGPLRPFSLALDTGKVVIPDLDLSHTTFAANGFIKFGGHGAGAGGYDIQYVQAAPVFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEIESGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNMDGTVNFPDNVLVGGGEAAIARNGNIFSDIWKVFTTAGDVTNIRDAIATRVSKEGDAMTGTLWINKDAAGIVLNPPLASDSSFIRSDTAGVNNWYIGKGGADNGLGFYSYVTQGGVYITNNGEISLSPQGQGTFNFNRDRLHINGTQWVAHKSGAWGDQWGLEAPIFVDFGSVSNDCYYPIIKGKSGITNEGYFSGVDFGMRRITNNWAQGIIRVGNQENGHDPQAIYEFHSNGTFYAPSLLKSNRVSAGGGDPAWGSPCIVLGDNDTGFLWEADGIFNAYANGQGVFSFRAGLAQTFGNVNFHCNAGMYVRDNIDVNDVYIRSDIRCKSEIKLIDNAQEKSKLLGGYTYLLKNPVTDEVKPSAGLIAQEVQKVFPELVSEDKETGLLRLNYNGIIGLNTATINEHTDEIKELKSEIAELKALIKSLIK
Physico‐chemical
properties
protein length:1083 AA
molecular weight: 116944,73940 Da
isoelectric point:5,61083
aromaticity:0,09972
hydropathy:-0,27701

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
450–549
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
978–1033
IPR030392 Coil
XUK82138.1
1 1083
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage NHEP10
[NCBI] 		3420449 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XUK82138.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ511148 [NCBI]
CDS location
range 87695 -> 90946
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTTTACTTTTTACTAAAGACGATACTGGAGCGATTATCGACCTTGGCTTTGCTAAAGGCGGTAATATCGACGGAAACGTTATTCATACAGGCAATTATAACCAAACTGGCGATTATACTTTAAATGGCACCTTCACTCAAATTGGCGATTTCAATCTCAAGGGTATTGCTCGCGTAACTCGTGATATTATTGCTGCGGGTCAGATAATGACCCATGGTGGCGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTCATGATTTAGCTGACCGTGAACGTGGAATCATTTTTTCTCCTGCTAATGATGGATTAACTACACAAGTTCTTAATATTAGAGTTCAAGATTACAAAGCTGGTTCAGAAAGCACTTTCGCTTTTAATGGAAATGGTTTGTTTTCTTCACCAGAAGTTTTTGGGTGGAAATCTGTATCAACTCCGGTAATTTATACCAATAAAGTTATCACCAATAAAAAAGTTAAAGATGATTATGACATCTATTCGATGGCAGACAATGTCCCATTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTACGTGTCATGCGCAATGCAGTAGGTTCTGGTATTTTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACTTGGTATAGTGGAGATGGATTAGATGCTTATCTTTGGTCATTTACCTGGAGCGGCGGAATTAAATCAAGTCACTCAATTTCTATCGGTTTAACACCCGGTAATAAAGATTATTCAATATTAGGACCATCTAGCATTGCTTTAGGAGATAATGACACCGGGTTTAAATGGCATCAGGATGGATATTTTTTTACGGTAAACAACGGTACAAAAACTTTCCTTTCTGGTCCGGCGGAAACCACTAGCCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTGTAAATGGTACCGATTTGACTACTCCTCCAACTGAAAACTATGCTCTTGCTACTGTTGTGACATATCATGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTAGGATATTATCAAGGCGGTAACTATCATCATTATTTCCGCGGCAAGGGTACCACAAACATTAATACTCATGGCGGTTTGTTAGTTACTCCTGGTAATATTGACGTTATTGGTGGTTCGGTTAATATTGATGGTCGTAATAATGCTTCTACATTGATGTTTAGAGGTAACACAACTGGTAGTAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCTGTATGGGGTAATACGTTTACTAATCCTAGTGTAGGTAATCGTAAAAATGTCATGGAAATTTCTGACGCAACTAGTTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACTGGTGAAGTAGAAATGAACGTTAACGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAAATAGAGGAGTTCACACAACGGGCGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCTCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGAAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGCGAAGGCAAAGATGGCGATATCGGTCCACTTCGTCCGTTTAGTTTGGCTTTAGATACAGGTAAGGTGGTTATTCCTGACTTAGATTTATCCCATACCACTTTTGCAGCAAATGGTTTTATTAAATTTGGCGGTCATGGAGCAGGCGCGGGTGGTTATGATATTCAGTATGTTCAAGCAGCTCCTGTTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACGGTAAATCCGTTTGGTCTTTAGGTACCGAAATTGAATCAGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACATCAAGATTTAATATGGATGGTACTGTTAATTTCCCTGATAATGTTCTGGTCGGTGGTGGTGAAGCTGCTATTGCTCGTAATGGTAATATTTTCTCTGATATTTGGAAAGTATTTACAACTGCAGGTGATGTAACTAATATCCGTGACGCTATTGCTACTCGTGTTTCTAAAGAAGGCGACGCGATGACCGGCACTCTTTGGATTAATAAAGATGCTGCTGGAATAGTTCTTAATCCTCCTTTGGCCAGTGATTCATCATTTATTCGTTCCGATACGGCCGGGGTCAATAATTGGTATATTGGTAAAGGCGGTGCCGACAATGGTCTAGGTTTTTACAGTTATGTTACACAAGGCGGTGTATATATAACAAATAACGGAGAAATATCACTTTCTCCTCAAGGTCAAGGAACATTTAATTTTAATAGAGACCGCCTTCATATAAACGGTACACAATGGGTTGCGCATAAATCTGGCGCCTGGGGTGACCAATGGGGTTTAGAAGCTCCTATATTTGTAGATTTTGGATCCGTCAGCAATGACTGCTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCTGGTATTACTAACGAAGGATATTTTTCCGGCGTAGATTTTGGTATGCGACGCATTACTAATAACTGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAATGGCCATGACCCACAAGCTATCTATGAATTCCACTCTAATGGCACTTTTTATGCTCCGAGCTTACTTAAGAGTAACAGAGTATCGGCTGGTGGTGGTGACCCAGCATGGGGCAGTCCTTGTATTGTATTAGGTGACAATGATACCGGATTTCTTTGGGAAGCAGATGGTATTTTCAACGCATATGCAAACGGCCAAGGCGTATTCAGTTTTAGAGCTGGTCTCGCACAAACGTTCGGTAACGTTAACTTCCACTGTAACGCCGGTATGTATGTTCGCGATAACATTGACGTTAACGACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTGTAAATCGGAAATTAAGCTTATCGATAACGCACAAGAGAAATCTAAACTCTTAGGTGGTTATACTTATCTGCTTAAAAACCCCGTTACTGATGAAGTTAAACCGTCCGCCGGTTTAATCGCCCAGGAAGTTCAAAAAGTATTTCCTGAACTTGTTTCTGAAGATAAAGAGACCGGATTGCTTCGTTTGAATTATAATGGTATTATTGGTTTAAATACTGCTACTATCAACGAGCATACTGACGAAATCAAGGAATTGAAATCTGAAATTGCTGAATTGAAAGCATTAATTAAATCATTGATAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
da18414dd5f3f9ab973024d42f2ec2f06edce2a07b3f2d72e1acb8ab2875dd1b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2397
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50