Phage RBP Database

UniProt accession

A0A1D8KSC4 [UniProt]

Protein name

YadA domain-containing structural protein

RBP type

TF

Evidence RBPdetect2

Probability 0,93

Protein sequence

MANRIQLRRDGAQQWANVNPVLAQGELGIELDTSRLKIGDGVTPWNSLKYERPLETESNTANTLVKRDADGNFEAGAINATLIGNAATATRLANARNFTLTGDMSGSASFDGSANINITAELNFQPGLPHYDENDLNATGTYTRLVIDSRGRVVTGDNPTTLTDYGIGDAQPLSADLTAITGITTIGMLTRTGTGTYATRQVTGAPGRIVTSNANGQTGNPLVDLADTPVVIGSYNPTGSVSLDQPETSVQETGSIHQTVNTTEFTVDRYGRLTYAATAPISTAREGTLAPVYDNATAYARYDKVKNGDDRLYEAILPINAGGGEPTHTDTSDTGSWRYLGSALTPQKGLASFSQEDFDVTEWDHAGGIQGGYVKIADRGVDNLQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTSTTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDGGTGALDVNVRSYYSDPNIDLDGATDQLIDKYGDGNLDIFLTQNSASNRQFSIASTNTGTGQALLDISADNDITIYATDVNSRVNVEDYHFQDNVLSTTNSTMVLDPNDDDDVTGLVRIRGDLQVDGTTTTVNSVTTTIQDPIITLGGEDTLTLDDNLDRGIEFRYYDSQERFGFFGWDEDYADANIWNGTGGYRFLYNATNTNEVYAGTDAALIAGNLRLTTNTGSTSTTTGTLVVTGGVGISENVYVGGTVDIANDFDINSGQFTVTASNGDIYTQGDLTVDSNVTLGNASTDTVLVNSDTTFEDDVRIVGPNTVFSITDGTTERFVIDTDNGNIHSDGTLDVDSGVTFNSTLDVDGATTLNNTLDVDGNSVFHNNITLDTTGKYFKITNGVSDKFTVLSTNGNTNIEGTLDVTGNVTLTNNLTVNGSQTTIGNSNTDILTVNADVTFTDNLTVNQPVDFDSTLNVDGAVDFNNTLTVDGTTTVFNDVLLRAANKSFQIQDGVSNTQLSVDYDNGNTVIGRSGLGTSSAGTLTVHGNALFETDVTINATQTTIGNANTDALTVNAVSTFTDNVTVNGDLEVDQNVIINQNLTVHGTTTTVNSTVVTLDDPIVTLGGDTAPTSSDGKDRGVEFRYYANSAARVGFYGWDESASRYAFYHNATNSSEVFNGTRSGIDAGSIKLFDATNATSSSTGALIVGGGASVGIDLYVGDDLVVADAGSFGGNVDITGTLDVTDDFAINTNKFTVDAQTGNTVIDGTFLVRGNSTIGNAGTDAHTVNGTVQFNHALTGAARANIRDLKIGTDAANEIGTLAGNLILDSTGGTVNVTDNLDVDLDLNVDGNTKIDGTLTVDGNATIGNADTDAHTVTGTVQFNQALTGAERANIRDIKIGTDAANEIGTLAGNLILDSFAGKVHITDNAEVDGFLKVDGNTTLGDAVGDTLTVNATSTFNAAITSTDITADSIKIGVDASNEISTTTGNLILDSAAGTVNITDNADVDGNLNVDGNTQIDGTLTVDGNVTLGNAGTDVHVVTGTVTFNNAMTATDVTIDNITIGVVANNVIDTTSGNLTFQSFGGTVYTDANHQINQSLTVLGNTIFGNAGTDTHTFTGTTTFNNFVDINGGADIDGIGFNTRTISATGGSLVLDSSVNNVQVTANLGVSNNLTVSDSAVLGSSSADSLTVNAISTFTAPITSTNLTADSIKIGVDANNEISTLAGNLILDSFTGETVIDDNLTVNGTLDVDGTTIITDSVFVRADNQQFAVQTGASVTVFSVDSDNGNTAIAGTFNVNGASVIDDTLNVTGAVDFDSTLTVDGIQSITNTTNASTGSSFSSSGALRVAGGVSIARDLAVGEDFKVYGDFEVDGNVVQKGNQEFRGRVEFSKSENPTSLADDAPIMVTSGGMTILKDVYIGETLFLGANNATKITVDGVTGNGSFSGTLGVTGITTLTTLNATSVTTTGNIASGGNLSVGGSNFIVTAANGNTSIAGTLGVTGATTLTSTLNVQAATDLDSTLNVDGAATFNNTITQNSTSLFKDNFVLRGASKTLKLQNGSSQDRITLESTTGNITAVGLITTNTLNVTTNTTIGGTLGVTGTITGNVTGDLTGTADKTDLVNITETASSDLNYFIPFVSTNTGYTEVRTDSQNLSYNPSTNTMTVNNFKSTTNFEVQGNLNVTGNVTYGQSQVGSIANHDTDALAEGTTNLYFTDERVDDRVAAMIAGGTGISASYDDVGNLLTLSAVQADLNTDNFTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIQHDGSGTLSVTQSDINTDNVTEGSTNIFFTQSRARGAFSVSGDLGYNASTGVFSVTLPTQASLNVDDLITLTGRANGSTHLATFAGSTISDNNTIKGALGQLETAVEANASNLTAATGSGLDLSQKSTTDLSEGNNLYFTNERVDDRVAALISAGTGISSTYDDSGNLLTLSAVPGDFDTDDISEGTTNLYYTDTRADARIALQVGANLDLSQKSTTNLSEGNNLYYTNSRADARIALAAPNYATAAQGTLADSATQPGDDISTLNNDSNFITSAGAPVQSVAGKTGTVSLVKGDVGLGNVDNTSDANKPVSTAQQTALDLKADLASPALTGTPTAPTAAQATNTTQVATTAFVQSNLTASLLRAALGIPEYASDGLATAGGLAAGDVYYNTLSSKYTTV

Physico‐chemical properties

protein length:	2616 AA
molecular weight:	271319,52370 Da
isoelectric point:	4,05003
aromaticity:	0,06040
hydropathy:	-0,17882

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_1619	ATT	DC_1619	1	454	Novel HMM	DC_1619	N-terminal	Low	Positional only	123 proteins / 123 hits
SSF69349	STR	SSF69349	4	228	Merged direct domain	SSF69349	Central	Low	Positional only	153 proteins / 153 hits
IPR041352	ATT	DC_0533	5	43	InterPro cluster	Major tropism determinant, N-terminal domain	Central	Medium	Text match	295 proteins / 296 hits
DC_1607	STR	DC_1607	329	857	Novel HMM	DC_1607	Central	Low	Positional only	159 proteins / 159 hits
DC_1607	STR	DC_1607	934	1331	Novel HMM	DC_1607	Central	Low	Positional only	159 proteins / 159 hits
DC_0351	STR	DC_0351	2355	2615	Novel HMM	DC_0351	Central	Low	Positional only	44 proteins / 44 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage S-WAM1 [NCBI]	1815521	Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Sokavirus > Sokavirus swam1
Host	Synechococcus sp. [NCBI]	1131	cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

AOV61566.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

KU686210 [NCBI]

CDS location

range 93533 -> 101383
strand +

CDS

ATGGCAAATAGAATCCAGTTAAGACGTGACGGTGCTCAACAGTGGGCAAACGTCAATCCAGTCCTTGCCCAAGGCGAACTTGGTATCGAACTAGATACCTCGCGTCTGAAAATCGGGGACGGTGTTACTCCGTGGAACTCATTGAAATATGAGAGACCACTCGAAACGGAATCGAACACCGCCAACACTCTCGTTAAGAGAGATGCTGATGGTAACTTTGAGGCAGGTGCTATCAATGCCACACTGATTGGTAACGCTGCTACTGCAACTAGACTTGCCAACGCTAGAAACTTCACCCTGACGGGTGACATGTCAGGTTCGGCATCTTTTGATGGTTCTGCCAACATCAACATCACCGCAGAACTGAACTTTCAACCTGGTCTGCCTCACTATGATGAGAATGACCTGAATGCTACTGGTACATATACAAGACTTGTTATTGACTCTCGTGGTCGTGTTGTTACAGGTGACAACCCCACAACCTTGACCGACTATGGTATTGGAGACGCTCAACCATTATCGGCCGACCTGACTGCTATTACTGGCATCACCACTATTGGTATGCTGACCAGAACTGGAACTGGTACATATGCCACACGTCAGGTAACTGGTGCTCCTGGTCGTATTGTTACCTCTAATGCTAACGGTCAGACTGGCAACCCGCTGGTGGACCTTGCTGATACTCCTGTCGTTATTGGTTCTTATAACCCAACTGGATCTGTTTCTCTTGATCAACCAGAAACTTCTGTTCAAGAAACAGGTTCAATTCACCAGACTGTTAACACTACTGAATTTACTGTTGATAGATATGGTCGTCTGACCTATGCCGCCACTGCACCTATCTCCACTGCAAGAGAAGGTACTCTGGCACCTGTCTATGATAATGCCACCGCTTACGCTCGTTATGATAAGGTCAAGAATGGAGATGATCGCCTGTATGAGGCTATCCTTCCTATTAACGCTGGCGGCGGTGAACCGACACACACAGACACCTCCGATACAGGGTCTTGGAGATATCTCGGATCTGCTCTGACACCTCAGAAGGGTCTTGCATCTTTCTCCCAAGAAGACTTTGATGTAACTGAGTGGGATCACGCTGGCGGTATCCAAGGTGGTTATGTCAAGATTGCTGATCGTGGCGTTGACAACCTCCAACTTCAAAATAACAGAATCTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTAGCACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATATCAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGCGGAACTGGGGCACTTGATGTCAACGTACGCTCGTACTACTCTGATCCTAATATTGATCTCGATGGCGCTACTGATCAACTCATTGATAAGTATGGAGATGGTAACCTAGACATCTTCCTTACACAAAACTCTGCTAGCAATCGTCAGTTCAGTATTGCTTCTACCAATACTGGTACTGGTCAAGCACTGCTCGACATTTCGGCAGACAACGACATCACGATCTATGCTACTGATGTCAACAGCAGAGTCAACGTAGAAGACTATCACTTCCAAGATAACGTTCTGTCCACCACCAACTCCACAATGGTGTTGGATCCCAATGACGATGATGACGTTACTGGTCTTGTGAGAATTCGTGGTGACCTCCAAGTTGATGGCACCACAACCACAGTCAATAGCGTAACAACGACTATCCAAGACCCCATCATCACACTTGGTGGTGAAGATACGCTAACATTAGATGACAATCTGGATCGTGGTATCGAATTCAGATACTATGATAGTCAAGAGAGGTTTGGTTTCTTTGGTTGGGATGAAGATTATGCAGATGCTAACATATGGAATGGCACTGGCGGGTATCGGTTCCTCTACAACGCGACCAACACGAATGAAGTTTATGCTGGCACTGACGCTGCTCTCATTGCTGGTAACCTCAGGCTCACAACAAACACAGGATCCACATCTACCACGACTGGCACCCTGGTAGTCACTGGTGGTGTTGGTATCTCTGAGAATGTCTATGTCGGTGGCACTGTTGATATCGCCAACGACTTCGATATCAACTCGGGTCAATTCACAGTCACCGCTTCTAATGGCGACATCTATACTCAGGGCGATCTGACGGTTGATAGCAACGTTACCTTGGGTAATGCATCGACCGATACTGTCCTGGTCAACTCCGACACTACATTTGAAGATGATGTAAGAATTGTTGGTCCTAACACAGTATTCTCTATCACTGATGGCACTACCGAAAGATTTGTCATTGATACTGACAACGGTAATATTCATAGTGACGGCACACTTGACGTTGATAGTGGCGTAACATTCAACAGCACACTAGATGTTGATGGTGCAACTACTCTTAATAATACTCTTGATGTTGATGGAAACAGTGTGTTCCATAACAACATTACTCTTGATACCACTGGTAAGTATTTCAAGATTACCAATGGTGTGTCTGATAAGTTTACAGTGCTGTCTACTAATGGCAACACCAACATTGAAGGCACCCTAGATGTTACAGGTAACGTAACCTTAACAAATAATTTGACTGTAAATGGCAGTCAGACTACGATCGGTAACAGTAACACAGATATTCTTACTGTCAATGCCGATGTCACATTTACGGATAACCTTACGGTTAATCAGCCCGTTGATTTTGATTCCACTCTTAATGTTGACGGCGCTGTTGACTTTAATAATACTCTCACAGTAGATGGTACAACCACCGTCTTCAATGATGTTCTGCTGAGAGCTGCTAACAAGAGTTTCCAAATCCAAGATGGGGTATCAAACACTCAATTGAGTGTTGACTATGATAATGGTAATACTGTAATTGGTCGTTCTGGTCTGGGCACTTCTTCGGCAGGTACGCTGACCGTTCATGGTAACGCTCTGTTTGAGACAGATGTTACTATCAATGCCACTCAGACAACCATCGGTAATGCAAACACCGATGCCTTGACTGTTAATGCTGTTTCCACCTTTACCGACAATGTAACAGTCAACGGCGATCTGGAAGTTGATCAGAATGTAATCATTAACCAGAATCTCACAGTCCACGGCACAACCACCACTGTGAATTCCACGGTGGTCACTCTGGACGATCCTATCGTCACTCTGGGCGGCGACACTGCCCCTACAAGCAGCGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCAGATATTATGCAAACTCTGCTGCTCGTGTTGGTTTCTATGGTTGGGACGAGTCGGCATCTCGTTATGCCTTCTACCACAACGCTACCAATAGCAGTGAAGTATTCAATGGCACCAGGTCTGGTATTGATGCTGGTTCCATCAAACTGTTTGACGCGACTAATGCCACCTCTTCTTCCACTGGCGCTCTGATCGTTGGTGGTGGTGCTTCTGTCGGTATCGATCTATATGTTGGTGACGATCTGGTCGTCGCTGACGCTGGTAGTTTCGGTGGAAACGTTGACATTACAGGAACTCTGGATGTCACCGATGACTTTGCAATTAACACTAATAAATTTACAGTCGATGCTCAAACTGGTAACACTGTCATTGATGGCACTTTCCTTGTTCGCGGTAACAGCACAATTGGTAATGCTGGTACAGATGCTCATACAGTAAATGGTACAGTTCAGTTCAACCATGCACTGACTGGTGCCGCACGAGCAAACATCCGTGACTTGAAAATTGGTACAGATGCTGCCAATGAGATCGGAACGCTGGCAGGAAATCTAATCCTGGATTCGACAGGTGGCACTGTTAATGTCACAGACAATCTGGACGTTGATCTGGATCTGAATGTTGACGGCAACACTAAGATCGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTAATGCCACAATCGGCAATGCTGACACCGATGCTCACACCGTAACTGGCACCGTTCAATTTAATCAGGCATTGACAGGTGCTGAGCGTGCTAACATTCGCGACATTAAGATTGGCACGGATGCTGCTAATGAGATTGGCACTCTGGCAGGTAACCTGATCCTTGACTCCTTTGCTGGCAAGGTTCACATCACAGATAATGCTGAGGTAGATGGATTCCTGAAAGTTGACGGCAATACAACTTTGGGTGATGCTGTTGGTGATACTCTAACCGTTAATGCAACATCCACATTCAATGCTGCTATCACTTCAACAGATATCACTGCCGACAGCATCAAGATTGGTGTTGATGCCAGTAATGAGATCAGTACAACTACTGGCAACCTCATCCTTGACTCCGCTGCTGGCACCGTCAATATCACCGATAATGCTGATGTAGACGGCAACCTCAACGTTGATGGCAATACGCAAATTGATGGCACTCTAACTGTTGACGGTAATGTAACTCTTGGCAACGCTGGCACAGATGTTCATGTCGTGACAGGTACAGTTACATTCAATAATGCCATGACGGCAACTGATGTAACTATCGATAACATCACAATCGGTGTTGTTGCCAATAACGTCATTGACACTACTTCTGGTAATCTCACATTCCAGTCGTTTGGTGGCACTGTTTATACTGATGCAAATCATCAGATAAATCAAAGTCTGACAGTTCTCGGCAATACTATATTCGGCAACGCTGGCACTGATACTCATACGTTTACTGGTACTACTACGTTCAATAATTTTGTTGACATCAATGGTGGTGCCGATATTGATGGTATTGGATTCAATACTCGTACTATCAGTGCAACTGGTGGATCGCTGGTCCTGGATTCTTCTGTTAATAACGTTCAGGTCACCGCCAACCTTGGTGTTAGTAACAACTTGACTGTTAGCGATAGTGCAGTTCTTGGTTCTAGTTCTGCTGACAGTCTGACAGTTAATGCAATTTCCACATTCACTGCTCCTATCACTTCGACCAACTTGACTGCCGACAGCATCAAGATTGGTGTTGATGCTAATAACGAAATCAGCACACTTGCTGGTAACTTGATTCTAGATTCCTTTACAGGTGAGACTGTAATTGATGACAACCTCACTGTTAATGGAACACTGGATGTTGATGGCACAACAATCATCACTGATAGTGTATTTGTAAGAGCAGATAATCAACAGTTTGCAGTTCAGACTGGTGCTTCTGTTACTGTCTTCTCTGTTGATAGTGACAATGGCAACACGGCCATCGCTGGTACTTTCAATGTCAACGGCGCTTCGGTCATCGATGACACCCTGAACGTTACTGGCGCTGTTGATTTCGATAGCACATTGACTGTTGATGGCATTCAGTCAATCACCAATACAACCAACGCATCTACTGGTAGCAGCTTCTCTTCCTCTGGTGCTCTGCGAGTTGCAGGTGGTGTGTCTATCGCTAGGGATCTGGCAGTTGGCGAAGACTTCAAGGTCTATGGCGACTTTGAGGTAGATGGTAACGTCGTCCAGAAAGGTAACCAGGAATTCCGTGGTCGTGTTGAGTTCTCCAAGAGTGAGAACCCAACCAGCCTGGCAGATGATGCTCCGATTATGGTCACCAGTGGTGGCATGACGATCCTAAAAGATGTATACATCGGTGAGACTCTGTTCTTGGGTGCTAATAACGCCACCAAAATCACCGTTGATGGCGTAACGGGTAACGGTTCGTTTAGTGGAACTCTTGGTGTTACTGGCATCACAACACTGACAACTCTAAATGCTACCTCAGTAACTACAACTGGTAATATTGCATCTGGCGGAAACCTCAGTGTCGGTGGATCTAATTTTATCGTCACCGCCGCCAATGGTAATACTTCAATTGCAGGCACCCTTGGAGTCACTGGTGCTACAACTCTTACTAGCACATTGAATGTACAAGCAGCAACTGATCTCGATAGCACACTGAATGTTGATGGTGCTGCTACATTCAACAACACAATTACACAAAATAGCACATCCTTGTTCAAGGATAACTTCGTTCTGCGTGGTGCTAGCAAGACTCTCAAACTTCAAAATGGTTCTTCTCAGGACCGTATCACTCTTGAATCTACCACTGGTAACATAACCGCTGTTGGTCTGATAACTACCAACACTTTGAATGTAACCACGAATACTACTATCGGTGGTACTTTGGGTGTTACTGGCACGATTACTGGTAACGTTACGGGTGACCTCACAGGTACTGCCGACAAGACTGATCTGGTTAACATCACCGAGACTGCATCTTCCGACCTCAACTACTTTATCCCCTTCGTTTCTACGAATACAGGATACACCGAGGTTCGTACAGACTCTCAGAACTTGTCCTACAACCCGTCAACCAACACAATGACGGTAAACAACTTCAAGTCAACCACGAACTTTGAAGTTCAAGGTAACTTGAACGTTACTGGTAACGTTACTTACGGTCAATCTCAGGTTGGTTCTATTGCAAACCACGACACCGATGCTCTGGCAGAGGGCACCACTAATCTTTACTTCACCGATGAGCGTGTTGACGATCGTGTTGCCGCTATGATTGCTGGTGGCACAGGTATCTCTGCTAGTTATGATGATGTCGGCAATCTGCTCACATTGAGTGCAGTACAGGCAGATCTGAACACAGATAATTTCACTGAGGGTTCTACCAACCTCTTCACTACTGCTGCTCGTACCCGTACACACTTTACTTATGGTACAGGTATTCAGCACGATGGTTCTGGCACTTTGAGTGTTACACAGTCGGATATCAATACCGACAACGTAACTGAGGGATCTACTAATATCTTCTTCACTCAGTCTCGCGCTCGCGGTGCATTCAGTGTCAGTGGCGACCTCGGTTACAACGCCTCCACTGGTGTATTCAGTGTAACTCTACCCACACAAGCATCTCTGAATGTTGATGATCTGATCACGTTGACAGGTCGTGCTAACGGGTCTACTCACCTGGCAACATTCGCTGGCAGCACTATCTCCGACAACAACACCATCAAGGGTGCTCTGGGTCAGTTGGAGACTGCTGTTGAGGCAAATGCTTCTAATCTGACTGCTGCTACTGGATCTGGTCTGGACCTGTCTCAGAAGTCCACCACGGACCTCTCTGAGGGCAATAACCTCTACTTCACCAATGAGCGTGTTGATGATCGTGTTGCTGCTCTGATCTCTGCTGGTACAGGTATTTCTTCTACCTACGATGATTCAGGTAACCTGCTGACTCTGAGTGCAGTTCCTGGCGACTTCGATACCGATGACATCTCTGAGGGCACAACAAATCTGTACTACACAGATACTCGTGCTGATGCTCGCATTGCTCTCCAAGTTGGGGCAAACCTGGATCTGTCTCAGAAGTCCACCACGAATCTCTCTGAGGGCAACAACCTTTACTATACAAATTCTCGTGCTGATGCTCGTATCGCTCTTGCTGCTCCAAATTATGCAACCGCTGCTCAGGGCACGCTGGCAGATTCCGCTACTCAACCTGGCGATGACATCAGCACTCTGAATAATGACTCTAACTTCATCACTTCTGCTGGTGCTCCTGTCCAGTCCGTCGCTGGCAAGACTGGCACCGTCTCTCTGGTTAAAGGTGATGTTGGTCTGGGCAATGTTGACAACACTTCTGACGCTAACAAACCCGTTAGCACTGCTCAGCAGACCGCTCTGGATCTGAAAGCAGACCTGGCATCTCCTGCACTCACAGGCACGCCTACTGCTCCTACCGCTGCTCAGGCAACCAACACAACTCAGGTTGCTACCACAGCATTCGTCCAATCGAATCTGACCGCATCGCTCTTGCGTGCTGCTCTGGGTATTCCTGAATATGCTTCTGATGGTTTGGCAACAGCTGGTGGACTCGCTGCTGGTGATGTCTACTACAACACACTTTCTAGCAAATACACTACCGTCTGA

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence