Protein

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Genbank accession
BBJ27095.1 [GenBank]
Protein name
phage tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MVDYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITVGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFSLRQAIVTDGEQLTLKKTTNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGNASNTNVYLYNHATGSMLTLDATASFNKTLRIMGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGANTFTNSVSVNSDAAAIILKNKTVNDNLFILARDSENNNLWYIGKGDTNSNVTLYDYKGGTAIKLDSSGVTFNKVVKIIGQVQPSDWANIDSRYIPAATLNNLAKLNVANTFVNVQTIVSNNEGLVLRNLTQGQPLYIRGVDTANVSRWWLGVGGANSNVVTLNNSYSGTQIALEPSVIVANKNLAITGQVQPSDWSNLDARYYTQSTANSRYMLANSSGGGTEVGDGDGIAWNAKTGLYNVYTKSGGSTQLVYQMFVGGGSTPTAQLKFSYRNGGFWYRSARDGYGFEKAWAKIYTDQDKPTPSEIGAYTKAETDQKIATAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNSTGGHTHSGSGSTSTNGEHSHYIEAWNGTGAGGNRTSSYAVAYRVGGSNTNAAGNHSHTFSFGTSGAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:786 AA
molecular weight: 84234,86290 Da
isoelectric point:8,80504
aromaticity:0,09288
hydropathy:-0,37824

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
157–218
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR053827 IPR005003 IPR005003
IPR048388
158–247
IPR048388 IPR048388 IPR048388
BBJ27095.1
1 786
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage L27
[NCBI] 		2562890 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBJ27095.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC473039.1 [NCBI]
CDS location
range 63378 -> 65738
strand +
CDS
ATGGTAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCGATTGACACAATTCGTTCAGATGACCTTCTCCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAGATGTTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTACTGTTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGCCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACGCAAGGCTTGCTGTTACAAATAACTTCAGCCTTAGGCAAGCAATTGTAACTGATGGTGAGCAGTTAACCCTTAAGAAAACAACCAATGCAGGTGCTTCATATATTCAAGGTAGGGATGCTAATAACCAGCAAACTTGGTATGTTGGACAAGGAAATGCAAGCAATACTAATGTTTATTTGTACAATCATGCTACTGGCTCAATGTTGACACTTGATGCAACAGCGTCATTTAACAAGACACTAAGAATTATGGGTCAAGTTCAACCATCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGGTACTTCACCCAGACAGTAGCTAACCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTGCAAACACATTCACTAATTCCGTCAGTGTGAACTCTGATGCTGCTGCTATCATTCTCAAAAATAAAACTGTTAATGATAATTTGTTCATCCTAGCAAGAGACAGTGAAAACAATAATTTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATACAAACTCTAATGTCACATTATATGATTATAAGGGTGGTACTGCTATTAAATTAGACTCATCTGGTGTAACATTCAATAAGGTTGTAAAAATCATTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAATAATCTTGCTAAACTTAATGTGGCAAACACTTTCGTGAATGTGCAGACTATCGTATCAAATAACGAAGGTTTAGTATTAAGAAACTTGACACAGGGGCAACCACTATATATCCGTGGTGTGGATACCGCGAACGTATCGAGGTGGTGGTTAGGTGTAGGTGGTGCAAACTCTAATGTGGTAACCTTAAACAATAGTTACTCTGGTACTCAAATTGCCCTTGAACCATCAGTAATTGTTGCGAATAAGAATTTAGCCATTACTGGCCAAGTTCAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGCCAGATATTACACGCAATCTACCGCAAACTCTAGGTATATGCTCGCTAATTCCTCTGGAGGTGGTACAGAGGTGGGTGATGGTGATGGTATTGCTTGGAATGCTAAAACTGGTCTGTATAATGTATATACTAAATCTGGTGGTTCAACACAACTAGTTTATCAGATGTTTGTTGGTGGTGGCTCAACACCAACTGCACAGTTGAAGTTTAGCTACAGGAATGGTGGTTTTTGGTATAGGTCAGCAAGAGATGGGTATGGATTTGAGAAGGCTTGGGCTAAAATCTATACAGACCAAGATAAACCAACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAAATTGCAACAGCAATTAGTGACTCCACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTCGGTAGGACTATCAGAATCGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACTCATAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGCACTAATAGTACTGGTGGTCACACACACTCTGGTAGTGGTTCTACCAGCACAAATGGTGAGCACAGCCACTACATCGAGGCATGGAATGGTACTGGTGCAGGTGGTAATAGGACATCATCATATGCCGTAGCATATAGGGTGGGTGGGAGTAACACTAATGCGGCAGGGAACCACAGTCATACTTTCTCTTTTGGGACTAGCGGTGCTGGTGACCATTCCCACTCTGTAGGCATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
e96d84d20bd3807a6132a851d53a6db73bfb55b484190c0bcf353ab1e3398ad8
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7013
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of the Escherichia Bacteriophage L27 Fujiki,J., Munby,M., Usui,M., Tamura,Y., Sasaki,M., Sawa,H. and Iwano,H. 2021-07 — GenBank