Protein

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Genbank accession
WBF05297.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,67
Protein sequence
MAITQNDLEILKSEIMADTPDGGGLPTGIAVIDGVSNNLFPDVSDIDRLIGRVRLRKVSLGVKTANAELLQAVRMLFTELPDNPNISVFAFKASSFADRRSDAQNAIESYLTLGTRAAGHLLETQLKGQRVIQLSLDNSDDAPKAGSPLVLVQNEGQVDEFYQYIRPTKVSTARRSFQLNFEKRVTRIVATIEFGEALRYSFTGLTVPEFYANANTNRRAVLREAQVSDVAKYYSASRLAEPVVAMQSRQVKLKSIYTQIVPSSLTETALPLLDPVGRSKALVRASNGTVTINKSVSINPTTPWLVGSSIYPSTISLTVGGILMTDADGELRDTSGILYGSVDYSAGRITWYDTVSAGISTIVGSFTPAGSTMRVMQSEVIYTPETDVGSSYIRELQAKPARGSMQASFQVGGQVTIIRDNAKGALVDNDGKSYGILDYDSKLVQLVLPAIPDAESAIVFTYSTDLGTTNIGGQNIKGYFEFTSQGYMPANSTIKWGSKSAVISDGVISGDATGTFDGFYLKIKPNELPSVGTLFTINYSTPTSSTEINMGNGNATAQTPNRFAFNVGAIDAGKLEGFINVTSGSWVGDGVTAELTEFHISYTDDGAGNIVKTSLNNATKVGAATKNLSVTLSGTVNYATGAVVIDVNATASLYDIVSTISKDPRFKYFKYIDANVISYSEKLTPVTAEITGIRYDYSGTNGVTGTKLTDFAWSADNLILELPKNVDAPVLPSSVFIMGANDSNGLMLRNGATVGSIDYRVGVVSLTDWSASSNNISVDGAVRELDVPPVSSLVFRTASAPIKIGSFTVNVTVDGEARKLTAEADGTFGSGINYTNGKLDRGVTGFIEYKTGVVALYGNNIDPNSVTYTGMAYSYLPLDSALIGLDPVRLPSDGRVPFVRKGDSIAITELKTMVLPTNAPNDTFDLGFERLSDVNVVDNTGKKVSFDYLDIDLDAGTLKLNSTFVMTGLTAPLTTKYRIMDIALVIETDISGRVTLSTPITHDYSTAAVFSSMLLAGDMQARAYNVFGQKSWSGVWSDSLIGDATTSQLQVTNNPIVVTNHDAIEERWSLVFTSDKAFNIIGQTVGQIGIGTTTTLTAPINPMTGYAYFTIPAAAWGTGWSANNVVRINTSAAKYPVWIGNAIQQHQGSSTDNYDFTIGYHANIDRERV
Physico‐chemical
properties
protein length:1169 AA
molecular weight: 125320,43780 Da
isoelectric point:4,99077
aromaticity:0,08469
hydropathy:-0,04192

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WBF05297.1
1 1169
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 571 571 0,9094
Central domain 572 998 428 0,3762
C-terminal 999 1169 170 0,4852
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-571
Central
572-998
C-terminal
999-1169

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Psychrobacter phage vB_PmaS_Y8A
[NCBI] 		3017068 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Psychrobacter sp.
[NCBI] 		56811 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBF05297.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ059336 [NCBI]
CDS location
range 18032 -> 21541
strand +
CDS
ATGGCGATTACTCAAAACGATTTAGAGATACTAAAGTCCGAGATTATGGCTGATACGCCTGACGGCGGCGGATTGCCGACTGGTATTGCCGTCATTGATGGGGTATCAAATAACTTATTTCCCGATGTGTCGGATATTGACCGTCTAATTGGTCGTGTGCGCTTGCGTAAAGTATCGCTAGGCGTTAAGACGGCTAATGCTGAGCTATTGCAAGCGGTGCGAATGCTGTTTACTGAATTGCCAGACAATCCAAATATCAGCGTCTTTGCGTTTAAAGCGAGCAGCTTTGCAGATAGGCGTTCAGATGCTCAGAACGCTATTGAGAGTTATTTAACGCTCGGTACTAGAGCAGCGGGGCACTTGCTAGAGACCCAGCTCAAAGGTCAGCGCGTCATACAGTTGTCTCTAGATAATAGCGATGATGCGCCAAAAGCCGGCAGCCCATTGGTATTGGTGCAAAACGAAGGGCAAGTTGATGAGTTTTATCAGTACATCAGACCAACTAAAGTTAGTACCGCAAGGCGATCATTTCAACTAAATTTTGAGAAACGAGTGACGCGTATTGTAGCAACAATTGAGTTTGGCGAGGCTTTGCGATACTCGTTTACAGGCTTAACTGTGCCGGAATTTTACGCAAACGCTAATACAAATAGACGTGCTGTCTTACGTGAGGCGCAAGTGTCTGATGTAGCTAAGTATTACAGCGCTAGTCGCTTAGCTGAGCCAGTCGTGGCAATGCAATCAAGACAAGTTAAGCTTAAATCTATTTATACGCAAATTGTACCAAGCTCGTTGACTGAAACAGCACTACCATTACTTGACCCTGTCGGTCGCTCAAAAGCTCTAGTTAGAGCAAGTAATGGCACGGTAACAATCAATAAGTCTGTGTCTATTAATCCAACTACCCCTTGGCTTGTTGGCTCTAGTATTTACCCCTCAACCATTAGCTTAACGGTCGGTGGAATACTTATGACAGATGCTGATGGAGAGCTAAGAGACACAAGCGGTATCTTATACGGCTCAGTCGATTACAGCGCAGGGCGTATTACGTGGTATGACACGGTAAGCGCCGGTATTAGTACGATTGTAGGCAGCTTTACCCCTGCTGGCTCAACCATGCGCGTGATGCAAAGCGAGGTTATTTATACGCCAGAGACCGATGTAGGCTCTAGTTATATCAGAGAGCTACAAGCCAAACCTGCTAGGGGTAGTATGCAAGCCAGTTTCCAAGTTGGCGGACAGGTGACGATTATCAGAGACAATGCAAAAGGCGCGTTGGTTGATAATGATGGTAAAAGTTACGGCATCTTAGATTATGACAGCAAATTGGTGCAGTTGGTTTTACCTGCTATACCTGACGCCGAATCAGCTATTGTGTTTACCTACTCTACGGATTTAGGCACAACAAACATTGGCGGTCAAAATATAAAAGGGTATTTTGAATTTACATCGCAAGGCTATATGCCAGCCAACTCAACGATAAAATGGGGCAGTAAGTCGGCAGTTATTAGCGATGGCGTGATTAGCGGCGATGCAACCGGTACGTTTGACGGCTTTTACTTAAAGATAAAACCTAACGAGCTACCGAGTGTCGGCACGTTATTTACCATCAATTACAGCACTCCAACCAGCTCAACCGAGATAAATATGGGTAATGGCAATGCGACCGCCCAAACACCCAATAGGTTTGCATTTAATGTTGGCGCTATTGACGCAGGTAAGCTTGAGGGCTTTATTAATGTTACGTCTGGCTCATGGGTTGGTGATGGTGTCACGGCTGAGCTAACCGAGTTCCATATCAGCTATACCGATGATGGCGCAGGTAATATTGTAAAAACTTCACTTAATAATGCTACTAAGGTTGGTGCCGCCACAAAAAACCTATCGGTCACGTTGAGCGGTACGGTTAACTATGCTACGGGCGCTGTTGTCATTGATGTTAATGCCACAGCAAGTCTTTATGACATCGTTTCAACGATTAGCAAAGACCCGCGATTCAAGTATTTTAAATATATTGATGCCAATGTTATCAGCTACTCAGAGAAACTAACGCCGGTAACTGCTGAAATAACAGGCATACGCTACGACTATAGCGGTACTAATGGTGTAACAGGTACAAAGCTAACTGATTTTGCTTGGTCTGCTGACAACCTAATACTAGAGCTACCGAAAAATGTAGATGCGCCAGTATTGCCAAGCTCGGTATTTATCATGGGCGCAAATGACAGTAATGGCTTGATGTTACGTAATGGCGCAACCGTTGGCAGCATTGATTATCGCGTGGGTGTTGTGTCGCTAACCGATTGGTCGGCATCTAGTAATAATATTAGTGTGGATGGCGCGGTCAGAGAGCTTGATGTACCGCCGGTATCTAGCCTTGTTTTTAGAACGGCATCAGCGCCTATTAAAATTGGCTCGTTTACAGTCAATGTGACGGTCGATGGTGAGGCGCGTAAGCTGACCGCTGAGGCAGACGGCACGTTTGGTAGCGGTATTAACTACACAAATGGCAAGCTTGACCGAGGTGTAACTGGATTTATTGAATACAAGACAGGGGTTGTGGCGTTATACGGCAATAATATCGACCCCAATTCAGTGACTTACACTGGCATGGCTTACAGTTATTTGCCGCTTGATAGCGCGTTAATCGGACTTGATCCGGTGCGACTGCCTAGTGACGGTCGTGTACCATTTGTGCGTAAAGGCGACAGCATAGCGATTACTGAGCTTAAAACGATGGTGCTACCGACCAATGCGCCAAACGATACGTTTGATTTAGGCTTTGAGCGCTTGTCTGATGTTAATGTCGTTGATAACACAGGTAAAAAGGTCAGCTTTGATTATCTTGATATTGACTTAGACGCAGGTACGTTAAAGCTGAATAGCACCTTTGTCATGACAGGGTTAACAGCGCCATTAACGACTAAATATCGCATCATGGATATTGCGCTAGTGATTGAAACCGACATATCAGGTCGTGTGACGCTATCAACGCCTATCACGCATGACTACAGCACAGCAGCCGTCTTTAGTTCAATGCTACTTGCAGGTGATATGCAAGCCCGAGCGTATAACGTCTTTGGTCAAAAGTCATGGTCAGGCGTTTGGAGTGATAGTTTAATAGGCGATGCCACAACATCGCAGTTGCAAGTCACTAACAATCCTATCGTAGTGACTAATCATGATGCGATTGAGGAGCGATGGTCGCTAGTGTTTACCAGTGATAAGGCGTTTAACATTATCGGTCAAACAGTTGGTCAAATCGGTATAGGTACAACGACTACACTAACAGCGCCAATTAACCCAATGACGGGTTATGCGTACTTTACGATACCGGCAGCCGCATGGGGCACAGGTTGGTCAGCTAATAACGTGGTTCGTATCAATACATCCGCCGCCAAATACCCTGTTTGGATTGGTAACGCTATTCAGCAGCACCAAGGCAGCAGCACGGATAATTACGACTTTACGATTGGCTATCACGCTAACATTGATAGAGAGAGGGTTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5b36eb7bb5a5c99bafd0c898042cb513562649ceffbcd27e1ead6a751be85613
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2673
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50