Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOZ62238.1 [GenBank]
- Protein name
- right handed beta helix region protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MGLLERNDEMSNVRKVGLLPTSPYRRYLPSAFDESMNIYEQLIACIEHVNNLGISFNELVDWLDKVVLQQNERLDEQDKKIDMLRDEWHIFEDYVINTLLKKKVVEVLKEWLEDGTLAEIINNDVMNMKVDKAGTVYVKDFKRLETETDDTGRIKRAIEELKKDENSTLVFEPIKYVVSEGFDVPSNKVIRGYKGKTVIDGSNIETATTLYQKGLFHVKGTLAEPIGLAQSVAQGDSKIVAPACDALLIGDLLIITSDESYAEGAPPSSRRGEIVTVKSFDGSNIELQGEVYFSYDQTKNARVQCMRGMKDVTIKDLDIIMGGKGKGHNGVIVENAQRIIIKNVFIDGAEDCGVVMTTCYNSHVYKSDIINNTSPGGTIGTSGYGVAFLSSKECSARDNFFRNSRHAIAGGGFIPAFACDITGNKAVDCPQYAYDCHEPCFFWNFSNNSATSCVGGFTIRGQFTRVVGNTITSSFANGILVESYTPVDNQKGNLIADNTIQYSKLNGIFCDGTNAIQTDLTITNNKIFDVKFAGINVFNTMNTIIEGNSVKNDYENGIRVLGRATGYRSNKLVIKGNTVYKSRFSNIRVAGVDNVIISGNNVETNTKDGIELFGAKEFIVDGNLVKDCEFYGIRSEESTNGSYTNNYLKTVRGENSDGLRIIKGGKIVMNGNTVVDPQRFGIYTTDTLYTVITSNNVYDCPSDGVKIDGPIKTHINQNNLTKAIDA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 726 AA molecular weight: 80185,57280 Da isoelectric point: 5,27559 aromaticity: 0,08402 hydropathy: -0,27934
Domains
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacillus phage QCM11 [NCBI] |
1909400 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOZ62238.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX961631
[NCBI]
CDS location
range 17926 -> 20106
strand +
strand +
CDS
GTGGGTTTACTAGAAAGGAATGATGAGATGAGTAATGTTAGAAAAGTTGGTTTATTACCAACAAGTCCTTACAGACGATATTTACCTAGTGCTTTTGATGAATCAATGAACATTTATGAGCAACTTATTGCATGTATTGAACATGTAAATAATCTTGGTATATCTTTCAATGAATTAGTTGATTGGTTAGATAAAGTTGTATTGCAGCAGAATGAAAGACTAGATGAACAAGATAAAAAGATTGATATGTTACGTGATGAGTGGCATATTTTTGAAGATTATGTAATTAACACTCTTCTAAAGAAAAAAGTTGTTGAAGTTCTTAAAGAATGGCTAGAAGATGGAACGCTTGCTGAAATAATCAACAATGATGTAATGAATATGAAAGTAGATAAAGCTGGAACAGTTTATGTGAAAGATTTTAAGAGATTAGAAACTGAAACAGATGATACTGGTAGAATTAAAAGAGCAATTGAAGAATTAAAGAAAGATGAAAATTCGACTCTTGTATTTGAACCAATTAAATATGTTGTGTCTGAGGGTTTTGATGTTCCATCTAATAAAGTTATTAGAGGCTATAAAGGTAAAACTGTTATTGATGGCTCAAATATTGAAACGGCTACTACATTATATCAAAAAGGATTATTCCATGTAAAGGGAACTCTTGCTGAACCTATTGGTTTAGCTCAAAGTGTTGCTCAAGGAGATAGTAAAATTGTAGCTCCTGCTTGTGATGCTTTGTTGATTGGTGATCTACTAATTATAACAAGTGATGAATCTTATGCTGAAGGTGCACCTCCTAGTTCTCGTAGAGGTGAAATTGTAACAGTGAAGTCATTTGATGGTTCAAATATTGAATTACAAGGTGAAGTTTACTTTAGTTATGATCAAACTAAAAACGCTAGAGTTCAATGTATGCGAGGAATGAAAGATGTAACAATTAAAGATTTAGATATCATTATGGGTGGTAAAGGAAAAGGTCATAATGGTGTTATTGTTGAGAATGCTCAACGAATTATTATTAAAAATGTGTTTATTGATGGTGCTGAAGATTGTGGAGTTGTTATGACAACTTGTTATAACTCACATGTTTATAAATCAGATATTATCAACAATACTTCTCCGGGTGGAACGATTGGAACAAGTGGGTATGGTGTTGCTTTCTTATCGTCAAAAGAATGTTCAGCAAGAGATAACTTCTTTAGAAATTCACGTCACGCTATTGCGGGCGGTGGTTTCATTCCAGCATTTGCTTGTGATATTACAGGAAATAAAGCTGTTGATTGTCCACAATATGCTTATGATTGTCATGAACCTTGTTTCTTCTGGAATTTCTCTAATAACTCAGCTACATCTTGTGTAGGTGGTTTTACGATTCGTGGTCAGTTTACTAGAGTTGTAGGAAATACAATTACAAGTTCATTTGCAAATGGGATCTTAGTTGAAAGTTATACACCTGTTGATAATCAAAAAGGAAACTTAATTGCTGACAACACAATTCAATATTCTAAATTAAATGGTATTTTCTGCGACGGAACAAATGCGATTCAAACAGATTTAACTATTACTAATAATAAAATATTTGATGTTAAATTTGCTGGTATTAACGTTTTCAACACAATGAATACAATTATTGAAGGTAATAGTGTTAAAAATGATTATGAAAATGGTATCCGTGTACTAGGTAGAGCGACTGGTTATAGAAGTAATAAATTAGTTATTAAAGGTAACACTGTTTATAAGAGTCGTTTCTCTAATATTCGTGTTGCTGGTGTAGATAATGTAATTATTAGTGGAAACAATGTTGAAACAAATACAAAAGATGGTATTGAATTATTCGGTGCTAAAGAATTTATTGTTGATGGTAACTTAGTTAAAGATTGTGAATTCTATGGAATAAGATCTGAAGAGTCAACAAATGGTTCTTACACAAATAACTATCTTAAAACTGTTCGTGGTGAAAACTCAGATGGTTTACGTATTATCAAGGGTGGAAAGATCGTTATGAATGGTAACACTGTTGTTGATCCTCAAAGATTTGGTATTTATACAACTGACACTCTTTACACTGTTATTACTTCCAACAATGTGTATGATTGTCCTTCTGATGGTGTGAAAATTGATGGACCGATTAAGACTCATATCAATCAAAATAACTTAACAAAGGCTATTGACGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
9a8e9fac2e23d72cc449ad92b8d758565d7213a492be892ab196ef0db4e306f9
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Predicting Genome Terminus Sequences of Bacillus cereus-group Bacteriophage using Next Generation Sequencing data | Chung,C.-H., Walter,M.H., Yang,L., Chen,S.-C., Winston,V. and Thomas,M.A. | — | — | GenBank |