Protein

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Genbank accession
XLV08213.1 [GenBank]
Protein name
colanic acid degradation protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAVFSNFEGTMQPKFILGKKGASINFINDSVSIKDYLGEQFLPLKVGTSSDPNSAVNVKYLEDNPNALFGVVPPTDDVGKNNNTYFQIDEDGIVDIFAKSNGTWVKSLYINKKVLSSKNGGDFIGLITGGTVQQAQFYITPEEFGAKGDGETDDTAAVNLCAAYAKENKIQIQAGGNYRIKTAIYLEDVTWFGGTITGNGGTMVSVINSQIQFATLTGCYLKFFGGDGKFYFNKFINITSTAAFLMQGMTQPGTIDFCFNEMTQCKYGVLQQGTGEKMKVGRYSYNHIHDIYGDAIELNVINSHYPDGFVIEGNVIENVDGSNAPIPLSNWGIGIGVAGSGPYGLDAPDTQYVRNFVIKNNRLYNVRQCIHVELGMDFKILNNEVYPSSLVSVGTGLTTAGVITYGSKEFIIDGLTGHLLNDPSITNRMVSINWGVTSGRFAGPPRNFKISNLYIPESSILVYTSGSDNWLNNTELSNITCSKILWRGLPSSSKFSDIRTKELDVIGQHLSTEGEGGGIYTRSKYTYTNWTNCVVQDDCNVSKYSFSKMYVDRIDQSSNNFKVTTAIDGTGHRGPVLIPVVEQYYIPYDTFPGGRYFSEGTIIHKQSGGKYIVTVGGSFFGKYDTIRQTVAGQTYIEALGVSWGENQYAKAAGTEIIISGAGENGGDLRTYITRAVYVVNNVYRIDIADPIITATAAGAALKAAQPVTYITLP
Physico‐chemical
properties
protein length:713 AA
molecular weight: 77701,51320 Da
isoelectric point:5,46339
aromaticity:0,11360
hydropathy:-0,15442

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
131–476
IPR011050
IPR012334
142–504
IPR012334
XLV08213.1
1 713
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage SHEFM2K
[NCBI] 		3378341 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLV08213.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ390715 [NCBI]
CDS location
range 271391 -> 273532
strand +
CDS
ATGGCAGTATTTTCTAATTTTGAAGGAACTATGCAGCCCAAATTCATATTGGGGAAAAAAGGTGCTTCAATAAATTTTATCAATGATTCAGTTTCTATAAAAGATTATCTAGGAGAACAGTTCCTACCACTGAAGGTAGGAACTTCATCTGACCCTAATTCAGCAGTTAACGTAAAATATCTTGAAGATAACCCTAATGCATTATTTGGTGTTGTACCCCCTACCGATGATGTAGGAAAGAACAATAATACGTATTTTCAAATTGATGAAGATGGTATTGTTGATATTTTTGCAAAAAGTAATGGTACATGGGTAAAATCATTATACATTAATAAAAAAGTTCTATCCAGTAAAAATGGTGGCGATTTCATCGGACTTATTACTGGAGGTACAGTTCAACAGGCCCAGTTTTATATAACACCAGAAGAATTTGGTGCTAAAGGTGATGGCGAAACTGATGACACTGCTGCTGTAAATTTATGTGCTGCTTATGCTAAAGAAAATAAAATCCAAATTCAGGCTGGTGGTAATTACCGTATCAAAACTGCAATATACCTGGAAGATGTAACTTGGTTTGGGGGAACTATTACTGGTAATGGTGGTACTATGGTATCCGTTATTAATTCCCAAATACAATTTGCAACACTTACTGGATGTTATTTAAAATTCTTCGGTGGCGATGGTAAGTTTTATTTTAATAAATTTATAAACATCACAAGTACTGCTGCATTTTTAATGCAAGGTATGACACAACCAGGAACAATAGATTTTTGCTTTAATGAAATGACCCAATGTAAGTATGGTGTTCTTCAACAAGGTACTGGTGAGAAAATGAAGGTTGGTAGATATTCATATAACCACATACATGATATATATGGTGATGCAATTGAACTAAACGTAATTAACTCACATTATCCTGATGGTTTTGTGATTGAAGGAAACGTAATTGAAAACGTTGATGGTTCTAACGCTCCAATCCCACTTTCAAACTGGGGCATTGGTATTGGCGTTGCTGGTTCTGGTCCTTATGGTTTAGATGCACCAGATACACAATATGTCAGAAACTTTGTTATTAAAAATAACAGACTATATAATGTTAGACAATGTATCCACGTTGAATTAGGAATGGACTTTAAAATACTTAATAATGAAGTTTATCCATCATCTTTAGTTTCTGTTGGTACTGGATTAACCACTGCTGGTGTTATAACTTATGGTTCGAAAGAATTCATTATTGATGGGTTGACTGGTCATTTGCTTAATGATCCTTCTATCACAAATAGAATGGTTTCAATAAACTGGGGTGTAACTTCTGGTCGTTTTGCTGGACCACCTAGAAACTTTAAAATTTCTAATCTCTATATTCCAGAGTCTTCTATACTTGTTTATACTTCCGGTTCTGATAATTGGTTAAATAATACAGAATTGAGCAATATCACCTGTTCTAAAATCCTTTGGCGTGGTTTGCCATCATCATCTAAATTTAGTGATATTAGAACTAAAGAATTAGATGTAATTGGTCAACACCTCTCTACCGAAGGCGAAGGTGGTGGTATCTATACTCGCTCTAAATATACTTATACTAATTGGACTAACTGTGTTGTTCAAGATGATTGTAATGTTTCAAAATATAGTTTTTCTAAAATGTATGTAGACAGAATAGACCAATCATCTAATAACTTTAAAGTTACAACTGCAATCGATGGTACAGGACACCGTGGCCCAGTACTGATACCTGTAGTTGAGCAATATTATATTCCATACGATACTTTTCCTGGGGGACGCTATTTCTCTGAAGGCACGATTATTCATAAACAATCGGGTGGAAAATATATTGTAACTGTTGGTGGTTCTTTTTTCGGAAAATATGACACAATTAGACAAACGGTAGCAGGACAAACATACATAGAAGCATTGGGTGTGTCATGGGGTGAAAACCAATATGCAAAAGCTGCTGGTACTGAGATCATTATATCCGGTGCTGGTGAAAATGGTGGTGATTTGAGAACGTATATAACTCGTGCAGTGTATGTTGTAAACAACGTATATAGAATTGATATTGCAGATCCTATCATAACAGCAACTGCCGCTGGTGCAGCATTAAAAGCTGCCCAACCCGTAACTTACATAACCCTACCATAA

Tertiary structure

PDB ID
a2d60778024a50d68ac86d93925a26d48fa046f7bf446d317f4eb7620c4c722c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7235
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50