Protein

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Genbank accession
WPK34456.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,64
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVSSGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPAAPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRVDSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVKQNVPTVERVDAGTDTTRARVGVIALATQAQANVDFENSPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTATFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAIDSEVIAGQSQSGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGASTRLIFEKGPQTGNNPAQAMNIRVWGNQFAGGSDTSRATIFEVGDETSNHFYSQRDNLGNITFSINGTVRPINVNASGTLNANGAATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAISGNYGFFIRNDAVNTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTADLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139614,63920 Da
isoelectric point:5,38916
aromaticity:0,07514
hydropathy:-0,30511

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–141
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1066–1275
DC_1209
WPK34456.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-141 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1275 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage AV112
[NCBI] 		3077257 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK34456.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR352942.1 [NCBI]
CDS location
range 50663 -> 54538
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGCGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTCTCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACATTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGACACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGGCACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGTGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCTGGAATTTTGAGTGGTGACACCGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCGTTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCGGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACGCGTTATTGGGTTGTTAAACAAAACGTCCCAACTGTAGAACGTGTCGATGCTGGAACTGATACAACTAGAGCTCGTGTAGGTGTTATTGCTCTTGCAACTCAGGCACAGGCAAATGTTGATTTTGAAAATTCTCCGGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCCAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCAACATTTGTAGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAATTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCCGAAACACTATCGGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCCGAAACTCGTGGGGCTGCAGGCACTAATGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTACGCCCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTATTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAGTCTGGATACTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAGAGCGACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATCAAGGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCGAACACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAAAACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCGTATGAATTAAACCGTGTATTGGCAAATTACTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACGGCTACGTTTGGTGGTTCGGTATCTGCTAATAGTACATTAACTATTTCTAATACAGGTGCTTCAACTCGCTTAATATTTGAAAAAGGTCCACAAACTGGAAACAACCCTGCTCAGGCGATGAATATCCGTGTATGGGGTAACCAATTCGCCGGCGGTTCTGATACATCTCGTGCTACGATATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAACCACTTTTATTCACAACGGGATAACCTTGGTAATATTACTTTCAGCATCAACGGTACAGTTCGGCCGATTAATGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGTGCGGCAACATTTGGACGTTCGGTGACAGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTCAGAGCAATTAGTGGTAATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGTTAATACCTATTTTATGCTTACTGCATCAGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGATGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACCGCTGATTTATACACCCGTGCACCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCGAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGCGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTTCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
067922d8b95d08ff1dcf10812cc4b9ee0db5cb59e8f47edeadbb840a2ccc21ed
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5490
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
A collection of diverse bacteriophages for biocontrol of ESBL- and AmpC-beta-lactamase-producing E. coli Vitt,A.R., Sorensen,A.N., Bojer,M.S., Bortolaia,V., Sorensen,M.C.H. and Brondsted,L. 2023 — GenBank