Protein

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Genbank accession
YP_009782943.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGEVLYTNVAPIDENSNLDLTSPNNVLYKYNSIEGGIIVPRGASLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTVFAAKGINTEDQVPSRTSIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSVETLAPKFSHHRLTCFEFADGVNSLSTLISQGRVPNSDYSAVPNILERTDLEIYYQKVSKAFASIPDTSGDPAADQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGNTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGPQSELDASLYNGSFTVTSASGNIFTYQMIQEPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMLADGSRATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNESTGNYDVASAGDGAHLDGFAEYRKGWAHRHIVASNDAFIQAVSVFAVGYGSHFTCESGADMSITNSNSNFGNTALRAAGFKAKSFSKDKAGEITHIVPPKALNVISTIASGASGEASITLANDGSVNGVVQGMTVTGDNIGTGATVVSVNTNTRIITLSVVNSDAVNGNVIFGEETSVNWVNIDIQRTKVINQSLAGAGGTPGTRLYLYGYTAPAGAPTTRVQGYTVGARQDGTGVSAIPDKINCLLVAQGATEATVQSAFISPYGPSVSGLAAGVAGSPIQYDSNTYTISGVAGQVGGWYLSVDSVDNDIYTTLSTNTRYNNVNFTPTTFLRRIPDPRDLADRTFRIRLKIDKDKTNPLPRDPLSGYVLQPLNSDSTNYKLDKTFYIYDIEKVQEFERGVSDGLYYITLLCASITPSTSNFNDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPNPAVSVADNETIGLVYSTDGATPTPNKDPKRSITKEAIKFLLTDTGWTQPGTTPNFDSVNNRLSNVELTARAGDEEVRKINIRENNDGTVAPIPVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSADQVKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQVSSTSNLIAKKITYNNQDGTVIKQTLLAPEDALGQPDFTNITGYTTPSDGDLVYNINWTPGKSLGWIYYQGLWKEFGITDTGQIDIQTFVDGDGVDQQHLGFGVAANSTYRANILGNVRIDGNLTTTGTGGISADKYVTRTYTGDGNTLTYNITTFTGGVKHTADSLLVFLNGVAQIGGTNFSVDANGANIIFGAGDAPLSTDTIHIIELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1325 AA
molecular weight: 142719,46900 Da
isoelectric point:4,81099
aromaticity:0,09283
hydropathy:-0,23419

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8
[NCBI] 		756278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009782943.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047733.1 [NCBI]
CDS location
range 22936 -> 26913
strand +
CDS
ATGGCTCTTACTAGACTTAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATTATCTACGTTAACCCTGACGATTTCGATGCATCTGATGCTATTGATAATAGGGGAAACTCTGCACTTCGTCCGTTTAAGTCTATTCAGAGGGCATTCTTAGAAGTTGCTAGATTTTCGTATCGAGTCGGTCTGTCAAACGACGAATTTGACGCCTTCTCGATTATGCTTTATCCAGCAGAATATGTTGTTGATAACAGACCTGGAGAAGTTCTTTATACAAACGTTGCTCCTATTGATGAAAACTCTAACTTAGATTTAACATCACCAAACAACGTTCTTTACAAATATAATTCTATTGAAGGTGGTATCATTGTTCCTAGAGGTGCTTCCCTCGTTGGTACTGACCTTCGTCGTACAAAAATTATTCCTAAGTATGTTCCCTATCCTACAGTATTTGCTGCAAAGGGAATCAACACAGAAGACCAAGTTCCTTCTAGAACTTCAATCTTTAAGGTAACTGGTGGTACTTATTTCTGGCAATTCTCGTTCTTTGATGGTGCTGAAGAGGGTGTCTATTTCAAACCAGATAGTGTAGAAACACTTGCACCTAAGTTCTCTCACCATAGATTGACATGTTTCGAGTTTGCTGATGGTGTAAACTCTCTTTCAACTCTTATTAGTCAAGGAAGAGTACCAAACTCAGACTATTCTGCAGTCCCTAATATCCTTGAAAGAACTGACTTAGAGATTTACTATCAGAAAGTATCGAAAGCATTTGCATCAATTCCCGATACATCTGGAGACCCTGCAGCAGACCAAATTCAGGCAAGAGTTGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCTGACGAATATCGTGTTCTTCAAATTACTCGCAACGGCAATACTGCAACCGCAGTTACTGTTGATGAATTTGATAACCCCAGAGACCATGGATTCTCTGTTGGTGTTAACATTAACATCTCTGGTGTTACTGGTTCTACTGGACCACAATCAGAACTGGATGCTTCCTTGTATAATGGTTCATTCACAGTAACATCTGCGTCTGGTAACATTTTTACCTATCAGATGATTCAAGAACCTACAGGTAATGCCGTTGGTTCTAACATTACAGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTCAACTTGTCTCTTAGAAGTGTCTGGGGCATGAATGGAATGCTCGCAGATGGTTCTCGTGCAACTGGTTTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTTTACGGGTCTATCTTTGCAGAAAGATGATAGAGCGTTTGTAAGATATAATGAGTCTACTGGTAACTATGATGTTGCATCTGCTGGTGATGGTGCTCACTTAGACGGTTTTGCTGAGTATCGTAAAGGTTGGGCACACAGACACATTGTTGCATCTAACGACGCATTTATTCAGGCAGTTTCGGTGTTCGCGGTTGGATATGGTTCCCACTTCACTTGTGAGAGTGGTGCTGACATGTCCATTACCAACTCTAACTCCAACTTCGGTAATACCGCTCTTCGTGCTGCTGGATTTAAGGCAAAATCTTTCTCTAAAGATAAAGCAGGAGAGATTACACATATTGTTCCACCTAAAGCACTTAATGTTATTTCAACAATCGCAAGTGGCGCTAGTGGCGAAGCATCAATCACTCTTGCAAATGATGGGTCGGTTAATGGTGTTGTTCAGGGAATGACTGTTACTGGAGACAATATTGGAACTGGAGCAACAGTTGTCTCTGTCAATACAAATACTAGAATTATTACACTTTCGGTAGTTAATTCTGATGCAGTTAATGGCAACGTAATTTTTGGTGAAGAAACTTCTGTTAACTGGGTCAACATTGATATTCAACGTACTAAAGTAATTAACCAGTCTCTTGCTGGTGCTGGTGGTACTCCTGGCACCAGACTTTACCTCTATGGATATACTGCTCCTGCGGGTGCCCCAACAACCAGAGTTCAGGGTTATACAGTTGGCGCTCGTCAAGATGGTACTGGAGTAAGTGCAATTCCTGATAAAATTAACTGCTTATTGGTTGCCCAAGGTGCAACTGAGGCGACAGTACAATCTGCATTTATTTCACCCTATGGTCCCAGTGTATCTGGTCTCGCTGCTGGTGTTGCTGGTTCACCCATTCAGTACGATAGCAATACCTACACTATTAGTGGAGTTGCTGGACAAGTCGGTGGTTGGTATCTTTCTGTTGATTCTGTAGATAATGATATCTACACAACACTGTCTACTAATACTCGTTATAACAATGTTAACTTTACTCCAACTACATTCTTAAGAAGAATCCCTGACCCTAGAGACCTTGCAGACAGAACATTCCGTATTCGTTTGAAGATTGATAAAGATAAGACTAATCCATTACCCAGAGATCCCCTGAGTGGTTATGTACTACAACCATTGAATAGTGATAGTACAAACTACAAACTTGATAAAACTTTCTACATTTACGATATTGAAAAAGTACAAGAGTTTGAGAGAGGTGTTTCCGATGGACTTTACTACATTACCCTCCTTTGTGCATCTATTACACCTTCAACTTCTAACTTCAACGATAGAAAGTTCTCCCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTAACCCTGCTGTATCCGTCGCTGACAACGAAACTATCGGTCTAGTATATTCTACTGATGGTGCAACTCCAACTCCAAACAAAGACCCCAAACGTTCTATTACTAAGGAAGCGATTAAGTTTCTTCTGACTGATACTGGTTGGACACAACCAGGTACAACACCCAACTTTGACTCTGTTAATAATAGACTTTCTAACGTTGAACTTACTGCTCGTGCTGGTGATGAAGAAGTTAGAAAGATTAACATCAGAGAGAACAATGATGGAACAGTTGCTCCTATTCCAGTAGAGTTCAGAAGGCACTCCATCTTACGTTCAGGTAACCATACGTTTGAATATCTTGGTTTCGGTCCTGGTAACTATTCTACCGCATTCCCCCAGACTCAGGTAGAAACTCTGAGTGCAGACCAAGTTAAGTTCTCGCAGTCTATTAAGGAAGAAGCAGGTGTTGCTTTCTATTCTGGTTTGAACTCTAACGGTGACCTGTTTATTGGTAACCAGGTTATTAACCCTGTTACTGGTCAAATTACAAACGAAGATATTGCACAACTGAACGTTGTTGGTGAAGAAAATACAACAATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTTCTTACCGATAAACTTACGGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTGGAATCTATCTTTGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGTCAAGTATCTTCTACTAGTAACTTAATTGCTAAGAAGATTACCTACAATAACCAAGATGGTACTGTTATTAAACAGACCTTACTTGCACCAGAAGACGCACTGGGTCAACCAGACTTTACTAATATCACTGGATATACCACACCTTCCGATGGTGATTTAGTTTACAACATTAACTGGACACCTGGTAAATCTCTTGGATGGATTTACTATCAAGGTCTTTGGAAAGAGTTTGGAATCACAGATACAGGTCAAATTGATATTCAAACGTTTGTAGATGGTGATGGTGTAGACCAGCAGCATCTTGGTTTTGGTGTTGCTGCTAACAGCACTTATAGAGCAAACATTCTTGGTAATGTTCGAATTGATGGTAACTTAACTACAACTGGTACTGGTGGTATTTCTGCTGACAAGTATGTCACCAGAACATATACTGGTGATGGCAATACTCTCACCTATAATATCACCACATTCACTGGTGGTGTTAAGCATACGGCGGATTCTCTGCTAGTATTCTTAAATGGTGTTGCTCAGATTGGTGGAACTAACTTCAGCGTTGATGCAAATGGTGCCAACATTATCTTCGGTGCTGGCGATGCACCACTCTCTACGGATACGATTCATATCATTGAATTGCCTATCTAA

Tertiary structure

PDB ID
db6bd3810fa111dc0f93dee3ca03c33ea3915daf9567e76afb789808443fa8e3
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3858
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50