Protein

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Genbank accession
YP_009850444.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDENDKVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKSISFEASDLSGALVRHITGRCANNDGWYIGAGGASDRGFLEIGTYDNGDEPIYFVQRTGGTAQAEVRRLALLDGMGDTSIPGDLRLTGKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGSGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMSGRGPGKDGTLLTNVINERQLKQDNFPITTGSETRWTKIALLKDPGSGQSRLQLMVSNGGNYGSTYSSIDFIDCSARNFPSSLTSSNIRNYLQVRRLGNPALDDTNQLRYSLIRTTEGLELWVMQRAFIGGVKVALLSAAGIEYYLPNGYTTTSTAPEGLVESTAIRIYDEVNKPNVVDGTEGVLSISRGGTGGTSAAAARNNLGLGTAAIRDVGEGTGNLLENGAYGLGGNGGKSIENITSNADMLNRLKAYGGTFWRGSIKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASARVRVYAANNSSLAAGNVRYNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTDGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTIKANLKVENPNGSMVDFGSENSDKYSRITLARKVGSGAAVAMLKVTPEGHVQFGYQDAVATPAPTKYLLVKSNGLEVEGDLVFNQTYCGTEDAINISDKTNDLNNMVIKGSDLGTRLLYKCTSTGGASNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKISDNDWTCKQTFTTKNGNVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTATFGGLNVNGIGTNDPYITFKNGARIREGQGNGIGALILSASSSTDSKYLALRPYGDTSGVDIKVKANGSSEALLEWSYGPGIRSNSSGAFVIYSKAGQALHLRPNGDSSNQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKMAISKSNSFTVMVSTNTNNRINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSTISRALTVSSVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGTRLKTWQLEVDGKSTLRGGLDVSNSLRVSSGNLVAADTTNAGGLFAKNGNVYCDAGSPGTNSNYWFRDSAGNVRGVIWSNGQNGDMIIRNQSGRELVFRNDGYLQLAHLAPGNTNTGNTVNGIRLQRGDTFFDSFNSWQSGEYVRAGWHFYNTIAAGNPGSVDQWLTITDTGVKIWGSAANLRVEGVGNFWDVEIRSDRRVKSNIAKIDNALDKVSKLSGNVYDLQLPNGDTKPSAGLIAQEVQEVLPEAVTTDNDKDALLRLNYNAVIALLVESVKELKAEIEELKSKQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1508 AA
molecular weight: 159674,67230 Da
isoelectric point:7,49117
aromaticity:0,06698
hydropathy:-0,34562

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–609
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_1159
STR
442–1094
DC_1159 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1415–1508
IPR030392
YP_009850444.1
1 1508
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-609 | STR 610-1094 | RBD 1115-1508
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_009850444.1
1 1508
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 335 335 0,0905
Central domain 336 534 200 0,2191
C-terminal 535 1508 973 0,6479
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-335
Central
336-534
C-terminal
535-1508

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage Marfa
[NCBI] 		2587809 Uroviricota > Caudoviricetes > Marfavirus >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009850444.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048798.1 [NCBI]
CDS location
range 154414 -> 158940
strand +
CDS
ATGGCCGATCAGAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGTACAGAGAATAAAGCGCCTGGTGCCGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCACTGAATACCCATGGTCGTACTCTAGCCATTTATACTAAAGATGAAAATGACAAAGTAGTACAGTTAGCTGGTAAAGGTGTTCCATTTTTAGATACTTCCGGTACTCTTAGTGTTGATGGAACCACTACATTAAAAGATAACGTAACTATTTCTCCGAATAAATCGATCAGTTTTGAAGCTTCGGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAGGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGCGGCGCATCTGACCGGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAGACGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGGCTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGATGGGTGATACATCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTGGTAAAACAGTAAAAATTTCAAACGGCAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGCGTAGGTGCTAATGACGCTTACATTAAAAACTTGAGAGGTTCTGGTGTTCTTCAACTAACTAATGATAGTAATCTGACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTACGCCATGAGTGGAAGAGGTCCTGGTAAAGATGGTACTCTTCTGACTAATGTGATAAATGAGCGCCAGCTTAAACAAGATAATTTCCCTATAACTACCGGTTCCGAAACTAGATGGACTAAAATTGCTCTTTTAAAAGACCCCGGGTCAGGCCAGAGTCGCCTGCAATTAATGGTGTCTAATGGCGGTAATTACGGTAGTACTTATAGTTCTATTGACTTTATCGATTGTAGCGCTAGAAATTTCCCGTCCTCATTAACAAGCAGTAACATTCGTAATTATCTGCAAGTTCGTCGACTTGGTAATCCGGCGCTTGATGACACTAACCAGTTGCGGTATAGTTTAATTCGTACAACTGAAGGTTTAGAACTGTGGGTTATGCAGCGCGCATTCATCGGCGGTGTTAAAGTTGCATTGTTATCTGCTGCCGGTATTGAATATTATCTGCCTAACGGTTACACAACTACTTCAACTGCGCCTGAAGGTTTAGTTGAGAGTACGGCTATTCGTATCTATGATGAGGTAAACAAGCCTAACGTTGTTGATGGTACTGAGGGCGTTCTGTCTATTAGCCGAGGCGGTACTGGTGGCACTTCTGCTGCAGCTGCTCGTAATAACTTAGGTCTTGGCACTGCGGCCATCCGCGATGTCGGTGAAGGCACTGGTAACCTTTTAGAAAATGGCGCTTACGGTTTAGGCGGTAATGGTGGTAAATCAATCGAAAACATTACCTCTAATGCTGATATGCTGAATCGTTTAAAAGCATATGGCGGTACTTTCTGGCGCGGCTCTATTAAATCTGGGGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCATGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCCGCTATTAATATCGACTACGCCAGTGCTAGAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGCAGTCTTGCGGCGGGAAATGTTAGATACAACGAACTTTATGGTACAGCAAATAAACCATCTAAGGCTGATGTTGGGCTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGATACAATGACCGGCGATTTAACTGCTCCTAATTTGCACGCTTCCGGCACTGGTACTGCATCGGTATATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCACATGTATGGTTTAGAACAGACGGTAACGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCGAATACTGCTGACTTAGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGAGGCACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGACTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCAATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGATATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGTGACACCATGACCGGTAACTTGACTATTAAAGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGGTCAATGGTTGATTTTGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGAATAACTCTTGCACGCAAAGTTGGCTCTGGCGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGACACGTGCAATTTGGCTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCAGCTCCTACCAAGTACCTCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGGGATTTAGTTTTTAATCAGACTTATTGTGGTACTGAAGATGCAATTAATATTAGTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCTATTATACAAGTGTACTTCTACCGGCGGTGCTTCTAATATATCTAATAAACCTACATCTGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGACAATGATTGGACGTGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATGGTAATGTTGAAGGTACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGTACATGGTCTGCATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCGATCAATCTAGGCGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCCCGTAATAACCTTGGCGTTGGTGAAGGACAAACGGCAACGTTTGGTGGATTGAATGTCAACGGCATTGGAACCAACGACCCCTATATCACATTTAAAAATGGCGCAAGAATACGAGAAGGACAAGGCAATGGTATTGGAGCTTTGATTTTATCAGCTTCTTCATCCACTGACTCAAAATACCTTGCATTACGCCCTTATGGTGATACCTCAGGTGTTGATATTAAAGTAAAAGCCAACGGGTCGAGTGAAGCATTGCTTGAATGGTCTTATGGCCCAGGTATTCGTTCGAATTCATCGGGTGCTTTTGTTATCTACTCAAAAGCCGGCCAAGCACTTCATTTAAGACCAAATGGCGACAGCTCGAACCAAGCTACAGTTATTGATCAGAACGGTAAAATGACGGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCGCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACTTGAACGTCTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGTAAAAACTCTGATATAGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCAGGAAAAATGGCTATCAGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTATCAACAAATACCAACAACCGAATTAATCCTGCTGATACGTTTAATGATATATTCAAAGTAGATGCTGATGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATTCAACAATTTCTAGGGCTTTGACAGTATCAAGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTTCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACTAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACCTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGTAACCTCGATGTAACTGGCACCAGATTAAAAACATGGCAGTTAGAAGTTGATGGCAAAAGTACTCTAAGAGGCGGGCTAGATGTTAGTAACAGTCTTAGAGTTTCTAGCGGAAACTTAGTCGCCGCGGACACAACCAATGCTGGCGGTCTTTTTGCTAAAAACGGTAATGTTTACTGTGATGCAGGTTCACCTGGTACAAACTCTAACTATTGGTTCCGCGATTCTGCTGGAAATGTCAGAGGTGTTATTTGGTCAAATGGTCAAAACGGTGACATGATTATCCGTAACCAAAGTGGCCGAGAGCTTGTATTCAGAAATGATGGATATCTGCAATTAGCCCACTTGGCGCCAGGAAACACAAATACTGGAAACACTGTAAATGGAATACGTTTACAGCGCGGTGATACGTTTTTCGATAGCTTTAACTCATGGCAGTCGGGTGAATATGTTCGCGCTGGTTGGCACTTCTATAATACAATCGCGGCGGGTAACCCAGGAAGTGTTGATCAATGGTTAACGATCACAGACACCGGGGTAAAAATCTGGGGTAGTGCTGCTAATCTACGTGTTGAAGGTGTTGGTAATTTCTGGGACGTTGAAATTCGTTCTGACCGTCGTGTGAAATCAAATATTGCTAAGATTGATAACGCCCTTGATAAAGTGTCGAAGCTATCTGGTAATGTTTATGATTTACAGCTTCCAAACGGTGATACTAAACCATCGGCGGGTCTTATCGCACAAGAAGTGCAGGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACAACTGATAACGATAAAGATGCATTACTTCGTTTAAACTATAATGCAGTAATTGCGTTATTAGTCGAATCTGTTAAAGAGCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAACAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
82e640e43970a9d485ac4559e9ef6d8ccc24e5fd097d80bba80946c07ffe2bd6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6525
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50