Protein

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Genbank accession
YP_010100377.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKSIQFKRSKIAGAKPTAAQLDEGELAINLRDRTIFTKSDQGQIIDLGFAKGGTIDGDVLQNGTFNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVSEGSFKFHYINETGDSKYWTFNRNGSFIVDNGNIEVRAGNINSANGVITGPEIVTKNINFSTKPFVANANIGYDWVSLPTWVYNPPADGSDDTTNGLNYLRKLRASSASSIFHEIADCRKGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDNSGRITAGKSISVGLPDNGANGRYPLESAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVYDLMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGTTWDFPNTNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGTNTLSFRADGTVASTQRTKFDNGLMLNSNTRNDGITFTAASSIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKYRETVFEVSDGQGYHFYSQRGAPTNDETVGPVLMQIAGSLNARGTLNTDSNLYVKGLSTHEGTVTMNNGLRLTGGANISGQVKIGGVNDALRIWNDRYGAVFRRSETSLHIIPTNENEGENGPISNLRPFSIELGTGAINIGHSLMIGNSARADGLLNIDTKAFLITINSHSKINPNYRMDLENGAYINALMDSNGRSAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRDDTSTYVPMIKQRYVQGNGCFSIGTLLNNGNFRVHYHAGGDGGSTGAQIADYGWEFTKSGDFVSPKRVSAGGTVYLGTDGNITGGSLPNFANLNLTLDRKVNTRMVSYSGTGGWYKLATVTMPQSTSTVTFEIAGGNGYNINTPHQCVTSKIVLRTSNNNPKGVNAVVWSMDVAQGIKNVATVNTSGDVYDIYVNVGTYAQALAVSYYATPNATINQIFASDSSGATETAVELPAEAIQGVVASVLNNLAPTPTGVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNYDKAGSNALMMRNDGGSFYILITDKNATDGAATVNGDWNSLRPFTISMTTGEVSMNNGTIHRGSSLFYNGINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDGTRGNRIEIADDSSYIVYFEKTPAGANRSSYNSCEVNGITTLSVGTKINTPQIGAFGVNTTNGWGGNSIAIGDSDTGFRQVGDGLLEAWANNVKVVRFTSSEVYSEKNVNAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALEKVEQLDGLIYDKAEYIGGEAVQTEAGVIAQKLKEVLPEAVHESLDSQENMVLTVSTQAQVALLIEAVKTLSAKVRELEAKLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1323 AA
molecular weight: 142273,25490 Da
isoelectric point:6,17132
aromaticity:0,08617
hydropathy:-0,36047

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–981
DC_0538 DC_1942
IPR030392
CHP
1225–1282
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1225–1322
IPR030392
YP_010100377.1
1 1323
Architecture
STR
ATT
STR 1-981 | ATT 1150-1322 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_010100377.1
1 1323
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 215 215 0,1142
Central domain 216 437 223 0,5690
C-terminal 438 1323 885 0,6146
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-215
Central
216-437
C-terminal
438-1323

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage AnYang
[NCBI] 		2499909 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Dhakavirus
Host Escherichia coli O157
[NCBI] 		1045010 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010100377.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055782 [NCBI]
CDS location
range 122468 -> 126439
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAATCGATACAATTTAAAAGAAGTAAAATAGCAGGAGCCAAGCCTACTGCAGCTCAGTTAGATGAAGGCGAACTGGCTATTAACTTGCGTGACCGCACTATTTTTACCAAGTCAGACCAGGGACAGATTATTGATTTAGGTTTTGCGAAGGGTGGAACTATTGATGGGGATGTTCTTCAAAACGGGACATTTAACCTTAACGGTAACCAATTTGTTTATGCCGGTAAATATATTGAATTTTTACCTAAGACTGCCGGTAACGGTGCCTGGGCTAACCAACATCTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTGAGTTCAACTACTTCAACTTCTGAATACCACCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAGACGGCACTTTTTCAGCAGGTACATTAGTAAGCGAAGGCAGTTTTAAATTCCATTATATCAATGAAACGGGTGATTCAAAATATTGGACGTTTAATCGTAATGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAATATTGAGGTCCGCGCAGGTAATATTAACTCGGCCAATGGTGTTATCACTGGTCCTGAAATTGTTACTAAAAATATTAATTTCAGTACAAAACCCTTTGTAGCTAATGCCAACATCGGCTATGACTGGGTTTCTTTGCCCACCTGGGTTTATAACCCACCAGCTGATGGTTCTGATGATACTACTAACGGTTTAAACTATTTGCGTAAATTACGCGCATCAAGTGCATCAAGTATTTTCCATGAAATTGCTGATTGTCGCAAAGGTAAGCCACAAGAAATTTCTTGGTGGACTGGTGTCGGTCCTTCGTCTTTCCAATGGGCTTTTGATAACTCTGGACGTATTACTGCAGGTAAATCTATTTCTGTCGGTCTTCCTGATAATGGTGCAAATGGACGTTATCCACTTGAGTCTGCAATTTCTATTGGTATTGCAATTGGTGATAACGATACTGGTATTAAATGGGTCCGTGACGGTGTTTATGACCTGATGGCTAATGGTATTTCATCTGCTACCATTTTGAATAACGGTATTAATAGCACTAAGAAATTGATGGTTGGTTATAGCCGTGATTCGGGTACTACATGGGATTTCCCAAATACCAACCAGGCTATGTTCACTGCACGTACTGATGTTGATGGCAATAATAACGGTGATGGTCAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAATGCCAAGATGTATCACTATTTCCGTGGCACGGGTCGTATGTCTGTTAGCATGGGTGATGGACTTCTTGTTGAGCCAGGTATTTTAGATATTAAAACCGGTACTAATACGTTATCTTTCCGCGCCGATGGTACCGTAGCTTCAACACAAAGAACAAAATTTGATAATGGCCTAATGCTTAACTCTAATACCAGAAATGACGGTATTACATTTACTGCTGCTTCATCCATTGACGGCACTAAACAGATTTTATGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCCACTGGCGATAAATATCGTGAAACTGTATTTGAAGTTAGTGACGGGCAAGGATACCATTTTTATTCTCAACGGGGCGCGCCTACAAATGATGAAACTGTTGGCCCTGTATTAATGCAAATTGCAGGTTCTTTAAATGCAAGAGGAACATTAAACACTGATAGCAATCTTTATGTGAAAGGATTAAGTACACATGAAGGTACCGTAACCATGAATAACGGCCTTCGCTTAACAGGCGGCGCTAATATAAGTGGCCAAGTTAAAATTGGCGGTGTTAATGATGCATTGAGAATTTGGAACGACCGATATGGTGCCGTTTTCCGTCGCTCAGAAACATCATTACATATTATCCCAACCAATGAAAATGAAGGGGAAAACGGTCCGATAAGCAACCTTCGTCCGTTTAGTATTGAATTAGGTACCGGTGCCATTAATATAGGCCATTCTTTAATGATAGGCAACTCGGCACGCGCCGATGGCCTGTTGAATATTGATACCAAAGCATTCTTGATTACAATTAACAGTCATTCGAAAATTAACCCTAACTATCGTATGGACCTGGAAAACGGTGCTTATATAAATGCTTTGATGGATTCAAATGGTCGTTCAGCTGGTGCAGGTTCATTTGCTTCCCAGAATAACGAAAACGTCCGCGCGCCATTTTATATGAATATCGACCGTGATGATACCAGCACTTATGTTCCTATGATAAAACAACGTTATGTTCAGGGCAATGGTTGTTTTTCGATAGGTACTTTGCTTAATAACGGTAATTTCCGTGTTCATTACCATGCAGGCGGCGATGGTGGTTCTACCGGTGCTCAGATTGCTGATTACGGTTGGGAATTCACTAAATCCGGTGATTTTGTATCCCCTAAACGCGTTTCTGCTGGTGGTACAGTTTATCTTGGCACCGATGGTAATATTACGGGTGGTTCATTACCTAACTTTGCTAACTTGAACTTGACATTAGACCGTAAAGTCAATACCCGAATGGTTTCTTATTCAGGTACTGGCGGTTGGTATAAATTAGCCACTGTAACAATGCCACAATCCACTTCAACCGTCACATTCGAAATTGCTGGTGGAAATGGTTATAATATTAACACTCCACACCAATGCGTTACTTCGAAAATTGTTTTAAGAACTTCGAATAACAATCCGAAAGGTGTTAACGCGGTTGTTTGGTCGATGGATGTTGCTCAAGGTATTAAAAATGTCGCAACTGTTAATACATCAGGTGATGTTTATGACATTTATGTAAATGTAGGTACATATGCTCAGGCTCTAGCAGTTTCTTATTATGCTACTCCTAATGCAACCATCAACCAGATATTTGCTTCAGATTCATCCGGCGCAACAGAAACTGCAGTTGAACTTCCAGCCGAGGCTATCCAAGGGGTGGTTGCTAGTGTTCTGAATAACTTGGCTCCTACCCCGACCGGCGTGAAGCGTTATGAAGCTGATTCCGAAATAGCTATTAACAACCAAACCGGTATTCGTATCAGAAGTAACTACGATAAAGCGGGTTCTAATGCTTTAATGATGCGAAATGATGGTGGAAGTTTTTATATTCTTATAACTGATAAAAACGCAACCGATGGCGCTGCAACAGTTAACGGTGATTGGAACTCATTGCGTCCTTTTACAATAAGCATGACTACCGGTGAAGTATCAATGAATAATGGTACAATTCATCGTGGTTCCTCTTTGTTCTACAATGGCATAAACGTCAAAGATAACGGTTCGATTAACTTTGATAAATCAGGCGCAAACCCGAGAAACATGCGTATATTCCATGCTGGTGATGGCACACGCGGAAACCGTATTGAAATTGCTGATGACTCAAGCTATATTGTTTATTTCGAAAAAACTCCGGCCGGAGCAAACCGTTCTTCATATAATAGCTGCGAAGTTAACGGTATAACTACCCTTAGCGTCGGAACTAAGATTAACACCCCACAAATTGGAGCATTTGGTGTCAATACAACAAATGGATGGGGTGGTAACTCCATTGCAATTGGTGATAGCGATACAGGTTTCAGACAAGTTGGTGATGGTCTTTTAGAAGCTTGGGCTAACAACGTTAAAGTTGTACGTTTTACTTCTAGTGAAGTATACTCCGAGAAAAACGTCAATGCTCCTAACGTTTATATTCGTTCTGATATCAGATTGAAATCAAACTTCAAGCCTATTGAAAATGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTCGACGGTTTAATCTATGATAAAGCAGAGTATATTGGCGGTGAAGCGGTTCAAACTGAAGCAGGTGTTATTGCTCAGAAACTTAAAGAAGTATTACCTGAAGCAGTGCATGAATCTTTAGATTCGCAGGAAAATATGGTTCTGACAGTTTCGACTCAGGCACAAGTTGCTCTGTTAATTGAAGCAGTTAAAACCCTGTCGGCTAAAGTTAGAGAACTTGAAGCTAAATTAAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ed016523457f385a13c5b71d15284369ba9be00590c70149de1fcdb7cac63f82
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4737
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50