Protein

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Genbank accession
QXV77227.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSVDGEAGAVVLTSKYLQITKYNLDQQELNTRLTGIDSSIKSNTNAIGNINTALSSMNTTIDSKAAKGANNDITELNALTKAITVAQGGTGATSPDGARLALELNHLTKSADVSYMSSPDSSKLFYVNNDGTWGVTANGGGTNYALPITQGGTGAISAAEALVKLMDGKPLPLAADGQAPYDAVTVRQLANISGGGNASMSGVMNNFIGAVEWFNGNRTKLPAGYIPADGQLVSRTDAKTADLWSAVSSGLFYSVSDALWINSGDPVRPCAWRASYSTGDGSTTFRVPDLNGTQLNSIKHLFLSGSSGATNEPSANQVWNQVAPNITGTFYTHGSNADAADAMGAFYLNAQDTGGSLTVGGPDKGDHLGFSASRSSKTYGRGVAYQPDPGGTSPIGDLYPNHAAGIWIIRANGSFNAAGSQYHVINGDSTRPADGTNTYGGFAYSDYRVGEVVNHSALIVSAKRFGNPYSVAVLQAHNMENGDLANLEVQSNGVVNLPTSINNKSWIKASGANGLHLEATTTTTDLHTMPGGGCGVSPADRNAIELNNAPGAVGSGGYVNWLQGWWYDDRFQFGTVRSGSVVLAAVALTIYSNTFGLKQWFFRASDGRIASTAGTIAIEGSDIKLKENIVRASEGALDRITKITPREFDWKAGGRHDRGYIAQELRDVDPTYVYSSTVGEGEEVLNVSTSALISDLIAAVTALKQELDSAKLEIKKLKAK
Physico‐chemical
properties
protein length:747 AA
molecular weight: 78299,98460 Da
isoelectric point:5,72900
aromaticity:0,07764
hydropathy:-0,21486

Domains

Domains [InterPro]
IPR030392
648–741
IPR030392
IPR030392
648–700
IPR030392 Coil
QXV77227.1
1 747
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage DaisyDussoix
[NCBI] 		2852003 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV77227.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ501058.1 [NCBI]
CDS location
range 24267 -> 26510
strand +
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCTAAATCTGGCGCAATGGCGCCTTACGTAGTAGTTAACAGAGACGCCGCAGTTGCCGGCGTTTTCTCTGTTGATGGAGAAGCTGGTGCTGTTGTACTAACTTCTAAATACCTACAAATTACAAAATATAACTTAGATCAGCAAGAACTTAATACGCGTTTAACTGGTATTGATAGCTCTATCAAAAGTAATACTAATGCTATTGGGAATATCAATACTGCTCTTAGTAGTATGAATACCACTATAGATAGTAAAGCTGCTAAAGGTGCTAATAACGATATTACAGAACTAAATGCACTTACTAAGGCTATTACTGTAGCTCAGGGTGGGACAGGTGCTACTTCTCCAGATGGAGCACGTTTAGCATTAGAATTAAACCATCTTACTAAGTCAGCAGATGTTTCATATATGTCATCCCCCGATAGTTCAAAGTTATTTTATGTTAATAACGATGGGACTTGGGGAGTTACTGCTAATGGTGGAGGAACTAACTATGCCTTACCTATTACTCAAGGTGGTACAGGTGCTATTAGTGCTGCTGAGGCACTAGTTAAGCTAATGGATGGTAAACCATTACCATTAGCTGCAGACGGGCAAGCTCCTTATGATGCTGTGACGGTAAGACAATTAGCTAATATTTCTGGTGGCGGCAACGCTAGCATGAGTGGGGTTATGAATAACTTCATTGGTGCTGTAGAATGGTTTAACGGTAACCGTACTAAACTGCCAGCCGGCTATATACCAGCAGATGGTCAGTTAGTTAGCCGTACTGATGCTAAAACAGCAGATCTATGGTCTGCGGTATCTAGTGGTCTATTTTACTCTGTTTCCGACGCTTTATGGATTAATAGTGGGGATCCTGTTAGACCCTGCGCTTGGAGAGCTTCCTACTCTACTGGTGATGGTTCTACTACTTTCCGAGTTCCAGATCTTAACGGTACTCAGTTAAATAGTATTAAGCATTTATTTTTATCTGGTAGTTCAGGTGCTACTAATGAACCTTCGGCTAATCAGGTGTGGAATCAGGTTGCTCCCAATATTACTGGTACTTTCTACACTCATGGTAGTAACGCAGATGCTGCAGATGCCATGGGGGCTTTTTATTTAAATGCTCAAGATACAGGTGGTTCACTTACTGTAGGAGGTCCAGATAAGGGAGACCACTTAGGATTTTCGGCCTCTAGAAGTAGCAAGACATATGGTCGTGGTGTGGCTTACCAACCAGACCCTGGTGGTACCAGCCCTATTGGTGATCTATACCCTAACCATGCAGCCGGTATTTGGATTATCCGTGCTAACGGTTCTTTTAACGCTGCTGGTTCACAGTATCATGTTATTAACGGAGATTCTACACGCCCTGCTGATGGAACTAATACTTATGGGGGCTTTGCATATAGCGACTACAGAGTAGGGGAAGTAGTTAATCACTCAGCTTTAATAGTAAGTGCCAAAAGATTTGGTAATCCTTATAGTGTTGCTGTTCTACAAGCGCATAATATGGAGAATGGGGATCTTGCTAACTTAGAAGTACAATCTAATGGTGTTGTTAACTTACCTACTTCGATTAATAATAAATCCTGGATAAAAGCTTCGGGGGCCAATGGCCTACATTTAGAGGCTACTACTACTACTACGGATCTACATACTATGCCTGGTGGGGGTTGTGGTGTATCTCCGGCAGATAGAAATGCTATCGAGTTGAATAATGCCCCAGGTGCTGTAGGTTCTGGTGGTTATGTTAACTGGCTGCAAGGATGGTGGTATGACGATAGGTTCCAATTTGGGACTGTTCGTAGTGGTTCTGTTGTATTGGCTGCTGTAGCCTTAACTATATATTCTAATACATTTGGGCTAAAACAGTGGTTCTTTAGAGCTAGTGATGGTAGGATTGCTTCCACTGCAGGTACTATTGCTATTGAAGGTTCGGATATCAAACTTAAGGAGAATATAGTTAGAGCATCCGAAGGGGCCTTAGATAGAATAACTAAAATCACTCCTAGAGAGTTTGACTGGAAAGCTGGGGGTAGGCATGATAGAGGATATATTGCTCAGGAATTACGTGATGTAGATCCTACCTATGTATATTCATCAACCGTTGGGGAAGGAGAAGAGGTATTAAATGTTAGTACATCTGCTCTGATTTCTGACTTAATAGCTGCTGTTACAGCTCTTAAACAAGAGTTAGATTCTGCCAAATTAGAAATTAAAAAGCTGAAAGCTAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
608f282af85ce91f4f383221bcb9b3054c5db0ef65317bc58f9fcf11b586bebd
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6507
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Systematic exploration of Escherichia coli phage-host interactions with the BASEL phage collection Maffei,E., Shaidullina,A., Burkolter,M., Heyer,Y., Estermann,F., Druelle,V., Sauer,P., Willi,L., Michaelis,S., Hilbi,H., Thaler,D.S. and Harms,A. 2021 — GenBank