Protein

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Genbank accession
WPK39665.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTLGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGALSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNDTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTDWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNAAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAAGNTLIWNASTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITTGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPAQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREVDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106437,07370 Da
isoelectric point:4,90392
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18224

Domains

Domains [InterPro]
IPR005068
706–745
IPR005068 IPR005068 IPR005068 IPR030392 Coil
IPR030392
914–1002
IPR030392
WPK39665.1
1 1008
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage Deifobo
[NCBI] 		3092176 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK39665.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR805293 [NCBI]
CDS location
range 249827 -> 252853
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAGCAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACATTAGGTGGGCTTAGAGTAACAGGTGATCAGTCTAAATTTGATGGATCATTAGAAGTTGGATATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAACGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAACAGAGATTCTCTAGATGCAATGCTCATTCACGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTCGTGAATACAGATGACGTAGGTCCAGGCGTCACTGCAACATATTCTGGTTTTGAAGTCCAGCGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCTGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGATTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTGAATGATAGCATAACTGCTGCACTTGACGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAATGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATATGTAAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAATTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACATTATCATCGTTGTCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAACAGACTAATTAATTACTCTGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACTAATGATACAGTTGTTAATAACGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAATTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGTCAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCCGGTAATGTACTAAGATATAACGGAACTGATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACCCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGGTTAAATGATACTAATGATACTGCACTTTCGGGTGGTTATTTACGATGGAATCCCACCGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGTCAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCATCTAAATGGGTAAACACTAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCAACCTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGCGATACTGCAAGCACATCTGTACCATTGGGATATCTTAGATGGAACGCCGCTGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACGATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCAGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTTACAACGCCTGCTGCTGGGAATACTTTAATATGGAATGCGTCTACAAATAAATGGACAAACGGCATATTGGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGAACTGGTCTATCTGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACTGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACACATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCTAATTCGGTAAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACTACTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCAGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCTAGTACATCTACAACTACTGCTGCTACACCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTAGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCACGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGATTACCGTTTGCCTCAACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACATCTATATCTACTGCTGCTACACCGAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGCTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCCGGTGCATTGTCAGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCCATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACCTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAAGTAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Tertiary structure

PDB ID
aa0a01caada9b1fc0e8644078b2c547bb2effeba54489c7bf3cad34a0e5e5d36
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2511
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D. — — GenBank