Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAH1486989.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTSSNRVAIRADGTFDSTQRISMRTGLFLSGDDNTNALTFKAPTGVDGTKTINWDAGTRNGQNKNTVTIKAWGNSFNAEKGNRETVFEVSDSQGYYFYAQRTNPASGETVGPVNFKFNGTVETGHIIGLGNISASGTGSFGGNVTMTNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYITLSTGKVSMDHDVDIGGGIFKVETSGTTAGKRITVNAASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVTKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDTVDITKPLKVGNAQFGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDTDLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSAAGNHQHSQTGPRGPSNQPTGIFPNGATLISGTQVISFGLSNGIVPGTSQYIAKSSTEGNHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1037 AA molecular weight: 110264,22160 Da isoelectric point: 8,15785 aromaticity: 0,08679 hydropathy: -0,42392
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage UGJNEcP1 [NCBI] |
2912554 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAH1486989.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OV754623
[NCBI]
CDS location
range 106330 -> 109443
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGCGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCACTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACAGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACAGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAGTAGCAATGCCAAGATGTATCACTATTTCCGTGGCACTGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGTGATGGGCTTCTTGTTGAGCCTGGCATTTTAGATATTAAAACCAGTTCAAATAGGGTTGCTATTAGAGCAGATGGTACATTTGACTCAACCCAACGTATTTCAATGCGTACTGGGTTATTTTTATCAGGTGATGACAATACCAATGCTTTGACATTTAAAGCGCCTACAGGCGTTGACGGGACAAAAACCATTAACTGGGATGCAGGTACTCGTAATGGTCAGAATAAAAATACTGTAACCATTAAAGCATGGGGTAACTCATTTAACGCTGAAAAGGGTAATAGAGAAACTGTATTTGAAGTATCAGATTCACAAGGTTATTATTTTTATGCTCAACGTACCAACCCGGCTTCTGGTGAAACAGTAGGTCCTGTTAACTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACAGGCCATATCATAGGCCTTGGTAATATAAGTGCCTCCGGTACAGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACCATGACTAATGGCCTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACAGGCCAAGTTAAAATTGGTGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACCCCGCAGAATGCTGGCGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTACCGGTAAAGTTTCTATGGACCATGATGTAGATATCGGTGGTGGAATATTTAAAGTAGAAACTAGTGGAACAACAGCAGGGAAACGTATTACAGTTAATGCGGCGTCAGATGCTATTAGAATAAATGCCCCAACGCAAGAGTCTTCTAACTTTATTCAAGGACGTAAAGCAGATGTTACAAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCATAGTTACACCTATTCACATGGTATTGCACTGAATTCTGATACTGTCGATATTACTAAACCATTAAAAGTTGGTAATGCTCAATTCGGTACTGATGGTAATATCACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACAGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGCCAGACGTTTGATACTGACTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGCGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCCGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCGTCAAGCACGGATTTAGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAAACCAGTAATACTACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTGCCGCTGGTAATCACCAGCACTCACAGACAGGCCCAAGAGGACCTAGTAACCAACCGACCGGGATATTTCCTAATGGGGCTACTCTAATTAGTGGGACTCAGGTTATTAGTTTTGGCCTAAGCAACGGTATCGTGCCTGGTACAAGCCAATATATTGCAAAGTCGTCAACAGAAGGTAACCATACCCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACTGGTAACCATGCCCATACGGTAGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGGCATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACTGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
1cff3fe57d150d40b968d5afcff50a9081b6785f1855b40e7747e79fcf228f3a
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50