Protein

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Genbank accession
XZP16784.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,97
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDAFSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNNLDNWVEWRRMGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATGPTGSILVSMKQIFDSIAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESNGNVMEVGAFGVGGNGKSLVNITSDVDLMTRLKALGGTVFRANTASGYTGAPYYSHGTGFYGRASDTMSALNIDYATGIVRVFATNDSGLASGKVNANVLYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGPGTASVYVNAGSGNAHVWFRTDGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITTGDSKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPSGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGDGAAVAMLKITPEGYVQFGYQTAVATPSPTKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISGKTIDLNSLVIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGNNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNGGVEGTYIRYAQNGSWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVSFGNLVTNDLTANGNARLVGRLNLGSTSATGGVLRANETGAVVLGSASGQNIHIRAGSPDTSSGETRFEPNGNVLVGGVLTSSGSLQVNGEATMGRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFTVAKSSATTIANPATETYTDVFKIDADGNQTVYGNAQVNRQLTVSSSATVNGIINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLIITGDQLKTTSLWTTGDAAVNGALTVDGNVVSNYGIGSFVGAVDVKAPAADNGTTHLWFRHSNGGERGVIYMPRDNNTMMGLRAGGSEWQLDGPTGQMLGPGARWRIHSDGNLQGDVYGGYITNYINDRFNQCAQWVRTGAQQDFGPIGRPAPGKTVPAGWVLVGLNGNSNEANQNMQLIGGRLQVWKPGVQWVDSAT
Physico‐chemical
properties
protein length:1391 AA
molecular weight: 146027,41040 Da
isoelectric point:7,94690
aromaticity:0,07045
hydropathy:-0,31100

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–619
DC_1942 cd19958 DC_0238
DC_0468
STR
484–1013
DC_0468
XZP16784.1
1 1391
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-619 | STR 620-1013 | RBD 1014-1345 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XZP16784.1
1 1391
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1056 1056 0,1716
Central domain 1057 1255 200 0,3957
C-terminal 1256 1391 135 0,8917
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1056
Central
1057-1255
C-terminal
1256-1391

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage PKP_Kh11
[NCBI] 		3434970 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XZP16784.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV702341.1 [NCBI]
CDS location
range 40331 -> 44506
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGTGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACCTCTGGCACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCGGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGTGCATCTGACCAAGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGTGTAGGCGCTAATGACGCGTACATTAAAAACCTGAGAGGAACCGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTACGCTATGAATGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTAACTAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACTGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTTTTCACAGTTAGATTTAATGATTACCGGCGGCATTGATTCTGGACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGCTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACCAACAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATGGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAACGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATATGGCAATGGCCTTTACGTTACAGTGCTAAACACCGCTGGATACAACGGTCAAGACAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCGGCCAAGATACTGGTGCTACTGGACCGACTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTATCGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGCGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCTCGAAATAACTTAGGTCTTAGAACTGCGGCTGTTCGCGATGTTGGTGAATCCAACGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCCTTTGGTGTCGGTGGTAACGGAAAATCACTGGTAAATATTACGTCTGACGTTGATTTAATGACTCGCCTTAAGGCTCTTGGTGGTACAGTATTCAGAGCCAACACAGCGAGTGGTTATACCGGGGCTCCTTATTACTCCCATGGTACAGGTTTTTATGGAAGAGCTTCTGACACAATGTCTGCTCTTAATATAGATTATGCAACCGGTATCGTCAGAGTATTTGCTACAAACGATAGTGGTTTAGCAAGTGGCAAAGTAAATGCTAATGTTCTCTATGGTACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACTGGTGATTTAACTGTTCCTAATTTACATGCTTCCGGCCCGGGTACTGCATCAGTATATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAGACGGTAACGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGATTTAGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGAGGCACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAATGATATCACCACTGGCGATAGTAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAATCCTAGTGGAACATTTGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCTGATAAGTATAGCAGATTAACCCTTGCTCGTAAAGTTGGCGATGGCGCTGCTGTGGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGCTATCAAACTGCAGTTGCTACTCCATCTCCTACCAAGTACATCAGAGTTAAACCTGACGGTCTTGATGTAGAAGGGGATTTAGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGCACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTGGTAAGACCATTGACCTTAATAGTCTTGTCATTAAAAGAACCGACCCAGGTACTCGTCAGTTATATAAATGCGTATCTTCTGGCGGTGGAAATAATATATCGAACAAACCTACATCTGATGGTAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTACGCAAGGTTTCTGATACCGATTGGTCATGTAAACAAACCTTTACTACAAAGAACGGCGGTGTTGAAGGTACATATATCCGCTACGCACAAAACGGCTCATGGTCTGCATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCGATCAATTTAGGCGGTACTGGAGCAACATCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGACAAACAGTATCATTCGGTAATTTAGTTACCAACGATTTAACTGCAAACGGAAACGCTAGATTAGTTGGAAGACTGAACCTTGGTTCTACTTCTGCGACTGGCGGCGTATTACGAGCTAATGAAACTGGTGCGGTTGTCTTAGGTTCTGCTAGTGGTCAAAACATCCACATCAGAGCAGGAAGCCCAGATACTTCTTCTGGTGAAACCCGCTTTGAGCCAAATGGAAACGTTTTAGTTGGTGGAGTTCTGACGTCTTCAGGAAGCTTGCAAGTAAATGGCGAAGCCACGATGGGCAGAAGCTTGATCGTTTCTCAAAACATAAAGAATACTAACGATAACAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCAGGCGCTAAACTGGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTACTGTCGCTAAATCGTCAGCAACTACCATAGCTAACCCAGCGACGGAAACTTATACTGATGTGTTTAAAATTGATGCTGATGGAAACCAAACCGTTTACGGAAATGCCCAAGTTAACAGACAATTAACTGTTTCTAGTTCAGCAACTGTTAACGGTATTATTAATGCAAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTTCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACCGGAAGATTAATAATTACAGGTGATCAGTTAAAAACTACATCGCTCTGGACTACCGGAGACGCTGCTGTTAACGGTGCTTTAACTGTTGACGGTAATGTTGTTAGTAATTACGGTATTGGTAGCTTTGTTGGTGCTGTCGATGTTAAGGCCCCTGCCGCAGATAATGGTACAACCCACCTTTGGTTCCGACATTCCAATGGTGGTGAGCGTGGTGTTATTTATATGCCGCGTGACAATAATACCATGATGGGATTAAGAGCTGGCGGTAGTGAGTGGCAGCTGGATGGTCCGACAGGTCAAATGCTAGGACCAGGAGCACGGTGGAGAATTCATTCTGATGGTAACCTACAGGGTGATGTTTACGGTGGTTATATCACTAACTATATCAACGATAGGTTTAACCAATGTGCTCAATGGGTTCGTACTGGTGCTCAACAAGACTTTGGTCCAATTGGTCGTCCAGCACCTGGTAAAACTGTTCCTGCTGGTTGGGTGCTTGTTGGTCTTAACGGTAACAGCAACGAAGCTAACCAGAACATGCAACTTATCGGCGGACGGTTACAAGTATGGAAACCGGGCGTTCAATGGGTTGATTCTGCTACTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5bb0b30b0a7aaf863a7e0ab3d8b980b9936e01aa6defcefa8a81832331c95a86
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7086
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50