Protein

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Genbank accession
AGE61211.1 [GenBank]
Protein name
collagen triple helix repeat protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MLLTIHDANLKKVAFIDNDKQETLNYYDDTWTRSLETGSSTFEFTVYKKAIKSDTAINKTYNLLNERAFVSFRHNGKSYVFNVMTVEENEQTIKCYCENLNLELINEYANPYKATKAMSFVEYCNAMDLLNFTHLSVGINEISDQKRTLEWDGQDTKLARLLSLAKKFDAEIDFDTQLNADSSIKSFKVNVYHENDDKHQGVGRIRNDIQLTYGKNLKSIKRKIDKTGIYNAIRPTGKRRVKNSKGEEVEEIVTICSLDAWSENNADGVREFYQQGDFLYAPLSMQMYPSAFTSSTTNDQWIRKDMEVESDSPSVIRAAAIANLRKNAYPAITYEVDGFIDVEIGDTIKIYDNGFSPILLVQARVSDQKISFTNPNSNKTTFANFKTLENNLSDGIQAAFERLFEASKPYLIKLSTDNGVIFKNQIGQSIVTPTLYKGGKPVVAGVTWRWSLDGHTTTGMTYTVRGVDVTDTATLTIAAYIGNDEVAVDEISFVNVLDGTMGIPGTPGRDGRTPYVHTAWANNATGTSGFSLDSSINKLYIGIYTDFEPNDSTNPAKYKWTLIKGEKGEKGEKGDPGQRGLDGLQGEKGEQGIPGKNGADGRTQYTHLAYSNSADGSKDFSLSASDRSYIGMYVDFNSADSNRPSDYNWTLVKGSNGANGVAGKAGADGRTPYLHIAYSNIVLLANEFQNFNLSQTTLVRFGIEGSWVYKELSAGTYTANVATFGSDPARGKTKKVESISDFSVTDTVNKRYIGTYTDYTQEDSTDVSSYTWTLIKGDDGNGIANVTNYYLATTVSTGITKNSAGWTTTPQQISYTKRFLWNYRIELYTDGTTKTTDPTVIGVHGEKGDQGERGLQGLQGPKGDTGIQGPKGADGKSSYTHIAYATNSTGTQGFSTSDSTNKTYMGMYVDNIEADSTTPSKYHWTLIKGSDGAQGIPGAKGVDGRTPYLHIAYATNSTGTQGFSVTDSSGKTYIGQYTDFTQNDSTDPTKYKWSLIKGDKGDRGETGPQGPQGIQGIQGPKGDQGIAGAKGADGRTQYTHIAYADNATGGGFSQTDQTKAYIGMYQDFNVTDSTNPSSYRWSPWKGKDGKDGVPGPKGADGRTPYIHWAYSDSADGTGLTTSDNGQRYIGHYSDYTQADSTDKTKYRWADRWAKIEVGGQNLISGTASFSGTHWDKQGTWRLEESLYKRAGILTWVGGAKSSPIANISVQSGDTYTFSAYIKKENAGTVYFYLYDEHETWFAAANVPRETLIRDVGNNFQRFTITFKVTRSGILKPRFAIMASDTGGFSVAGYQLETGTLATDWSLAPEDIQAGIDSKADQVLTQERLNALNERAQILDAELKAKASMDALSDLEKAYQSFVKSHADSRAKAEADLAEAGRRIELLVTQFGGFKELKTFIDTYMSSSNEGLVIGKNDASSTIKVSSDRISMFSAGKEVMYISQGVIHIDNGIFTASVQIGRFRTEQYHLNVDMNVIRYVG
Physico‐chemical
properties
protein length:1480 AA
molecular weight: 162705,05120 Da
isoelectric point:5,64510
aromaticity:0,10541
hydropathy:-0,56034

Domains

Domains [InterPro]
IPR007119
64–382
IPR007119 IPR050149 Coil
IPR010572
144–386
IPR010572 IPR008160 G3DSA:1.20.5.320 G3DSA:1.20.5.320
AGE61211.1
1 1480
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage phiST1
[NCBI] 		1277892 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGE61211.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC413988 [NCBI]
CDS location
range 3882 -> 8324
strand -
CDS
ATGCTATTAACAATTCATGATGCAAATCTAAAGAAAGTAGCATTTATTGATAACGATAAACAAGAAACTTTAAACTACTATGATGACACTTGGACACGCAGTCTAGAAACGGGGTCATCAACTTTTGAATTTACAGTATACAAGAAAGCTATAAAGTCTGATACAGCGATAAATAAAACATATAATTTACTGAATGAGCGTGCTTTTGTCTCATTTAGACACAACGGCAAAAGCTATGTATTTAATGTGATGACTGTTGAGGAAAATGAGCAAACTATCAAATGCTATTGCGAAAACCTGAACTTAGAGCTTATCAATGAGTATGCCAATCCGTACAAAGCTACTAAAGCTATGTCATTTGTTGAGTATTGTAATGCAATGGACTTGTTGAATTTCACTCACCTTTCTGTTGGTATCAATGAAATTTCAGACCAAAAACGGACTCTAGAATGGGATGGGCAGGATACCAAACTTGCCCGCTTACTAAGTCTTGCCAAAAAGTTTGATGCAGAGATTGATTTTGATACGCAGTTAAATGCTGATAGTTCCATCAAATCCTTTAAGGTAAATGTGTATCATGAAAACGACGATAAACATCAAGGGGTAGGGCGTATTAGGAACGATATTCAGCTTACCTATGGGAAAAATCTTAAATCTATCAAGCGTAAGATTGATAAAACGGGGATTTATAACGCTATCCGCCCAACTGGCAAAAGGAGAGTTAAAAATTCAAAAGGGGAAGAAGTTGAGGAGATTGTAACCATTTGCAGTCTGGATGCATGGTCAGAAAACAACGCTGATGGTGTTCGTGAGTTCTACCAGCAAGGAGACTTTCTCTATGCACCATTGTCAATGCAGATGTATCCATCCGCCTTTACCAGTTCCACAACCAATGACCAATGGATTAGGAAAGATATGGAGGTTGAAAGTGATAGTCCATCTGTTATTAGGGCAGCAGCTATTGCTAACCTTAGAAAAAACGCTTATCCAGCCATAACCTATGAAGTGGATGGTTTTATTGATGTAGAGATTGGCGACACCATCAAGATTTATGATAACGGTTTTAGCCCTATCTTGCTGGTGCAGGCTAGGGTGTCAGACCAGAAAATAAGTTTTACGAACCCCAATAGTAACAAAACTACTTTTGCTAATTTTAAAACTCTTGAAAATAACTTATCAGATGGTATTCAAGCTGCTTTTGAGCGTTTGTTTGAGGCATCTAAGCCCTACCTTATTAAGTTATCCACAGACAACGGCGTTATCTTTAAAAACCAAATTGGACAGAGCATTGTCACTCCTACCTTGTACAAGGGTGGTAAGCCTGTCGTTGCTGGTGTCACATGGCGTTGGTCCTTGGATGGTCATACAACAACAGGAATGACCTACACAGTTCGTGGGGTGGATGTGACAGACACGGCTACCTTGACTATCGCAGCCTATATTGGTAATGATGAGGTGGCAGTTGATGAGATTTCCTTTGTCAATGTCTTGGATGGCACCATGGGAATACCAGGAACACCGGGGCGAGACGGTCGAACTCCTTATGTGCATACAGCATGGGCAAATAATGCTACTGGTACATCCGGTTTCTCTTTGGATAGTTCGATTAATAAACTCTATATTGGTATCTATACGGATTTTGAGCCAAATGATAGCACTAACCCCGCTAAGTACAAATGGACTTTAATCAAGGGCGAAAAAGGCGAAAAGGGCGAAAAAGGCGACCCTGGACAGCGAGGGCTTGATGGTTTGCAGGGAGAAAAAGGTGAGCAGGGCATACCGGGTAAAAATGGGGCTGATGGTCGTACTCAATATACCCACCTAGCTTATTCTAATAGCGCAGATGGCTCTAAGGATTTCTCATTAAGTGCCTCTGACCGCTCTTATATCGGTATGTACGTTGATTTTAATAGTGCTGATAGCAATAGACCATCTGATTATAATTGGACACTTGTTAAAGGCTCGAATGGAGCAAATGGTGTTGCTGGTAAAGCTGGTGCAGATGGTAGGACACCATACTTGCACATAGCCTATTCAAATATCGTATTACTTGCTAATGAGTTTCAAAATTTCAATCTATCACAAACTACCTTGGTTCGTTTTGGAATAGAAGGTAGTTGGGTCTATAAAGAGTTGTCAGCAGGTACATATACTGCAAATGTGGCGACTTTTGGTAGTGACCCAGCCCGTGGAAAGACAAAGAAAGTTGAAAGTATTAGTGATTTTAGTGTAACAGATACTGTAAATAAGCGGTACATTGGAACATATACCGACTATACACAGGAAGATAGTACGGATGTTTCTAGCTATACATGGACATTGATTAAGGGTGATGATGGTAATGGTATTGCCAATGTTACTAACTACTATCTAGCTACCACAGTCTCAACAGGAATTACCAAAAACAGTGCTGGTTGGACAACGACACCTCAACAAATAAGCTACACTAAACGTTTTTTATGGAACTATCGCATTGAACTTTACACAGACGGCACTACGAAAACAACAGATCCAACAGTTATTGGCGTCCACGGTGAGAAAGGCGATCAAGGGGAACGTGGTTTACAAGGTTTGCAAGGACCAAAGGGAGATACTGGTATCCAAGGACCAAAAGGTGCAGATGGGAAATCAAGCTATACTCACATTGCCTATGCTACTAATTCGACAGGTACACAGGGATTTAGCACATCTGATAGCACAAACAAAACGTATATGGGTATGTATGTTGACAATATTGAGGCTGACAGCACTACACCATCTAAGTACCACTGGACCTTAATCAAAGGCTCTGACGGTGCTCAGGGCATACCTGGTGCCAAAGGAGTTGATGGGCGTACTCCATACTTACATATTGCCTATGCTACCAACTCAACAGGTACACAAGGATTTAGTGTGACTGATAGTAGTGGTAAAACCTATATTGGTCAATACACCGATTTTACGCAAAACGACAGCACAGACCCTACTAAGTATAAGTGGTCATTAATCAAAGGAGATAAAGGGGACCGGGGTGAAACTGGCCCGCAAGGTCCACAAGGAATACAAGGTATTCAGGGACCAAAGGGTGACCAGGGGATTGCTGGCGCTAAGGGCGCCGATGGACGTACCCAATACACTCACATTGCATATGCTGATAATGCAACTGGCGGAGGTTTTAGCCAAACAGACCAAACTAAAGCCTATATTGGCATGTACCAAGACTTTAACGTTACTGATAGCACCAATCCTAGCTCTTATCGTTGGTCTCCATGGAAAGGTAAGGATGGGAAAGATGGTGTTCCTGGACCTAAGGGGGCAGACGGTAGAACTCCATACATCCATTGGGCTTACTCGGATAGTGCGGACGGTACAGGCTTGACCACATCAGATAATGGTCAGCGATATATCGGGCATTACTCAGATTACACACAAGCTGATAGCACGGATAAGACAAAGTATCGCTGGGCAGATAGGTGGGCGAAGATTGAGGTGGGTGGACAAAATTTAATTTCAGGTACTGCATCTTTCTCTGGGACACACTGGGATAAGCAAGGGACGTGGCGACTAGAGGAGTCGCTTTATAAACGTGCTGGTATCCTGACTTGGGTTGGTGGCGCGAAATCGTCGCCGATAGCTAATATATCTGTACAATCAGGGGACACCTATACCTTTAGTGCCTATATCAAGAAAGAAAACGCAGGAACCGTTTATTTTTATCTGTATGATGAGCATGAAACATGGTTTGCGGCTGCAAATGTCCCTCGCGAGACTTTAATTCGAGATGTCGGGAACAACTTTCAGCGGTTTACAATCACTTTTAAAGTTACTCGGTCAGGTATATTAAAACCTCGATTTGCTATTATGGCTTCGGATACGGGCGGTTTTAGTGTAGCAGGCTACCAATTGGAAACTGGTACACTTGCGACAGACTGGTCGCTCGCTCCTGAAGATATACAAGCAGGCATTGACTCCAAAGCTGACCAAGTCCTAACTCAAGAACGGCTTAACGCTCTTAACGAGCGGGCACAGATACTTGATGCAGAGCTTAAAGCAAAGGCGTCTATGGATGCGCTTAGTGACCTCGAGAAAGCTTATCAATCATTTGTAAAATCACATGCTGATAGCCGAGCTAAAGCAGAAGCAGATTTGGCAGAGGCAGGCAGACGGATTGAGTTGCTGGTTACGCAGTTTGGCGGTTTTAAAGAGCTTAAAACATTTATTGATACTTATATGTCAAGCTCTAACGAGGGTTTGGTTATCGGCAAGAATGATGCAAGCTCAACCATTAAAGTGTCAAGCGATAGAATTTCCATGTTTTCGGCTGGTAAAGAAGTAATGTACATTTCGCAAGGTGTTATTCATATAGACAATGGTATCTTTACTGCCTCTGTACAGATTGGACGGTTCCGCACAGAACAATATCATCTCAATGTCGATATGAATGTCATACGGTATGTTGGGTAG

Tertiary structure

PDB ID
95f9543cf2c6c67aabe38531d9ca713df5482d05831482e9a1d7686b36fb5a76
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6857
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50