Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOO12685.1 [GenBank]
- Protein name
- putative short tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MPYQFSASPLYVEEGQSIQFRYEAPPLFNDITQVKIEIGELTVFWIIETKLEDFEPDPFFLRNVDDAEPDTLLTYAATTDPDNGVAYTGLASDPDPLREGEEVITITGLDPGTQAPLIVSSNVIDVNDWSYRLRLYNEGSSSYGAWGAWTRALNNTVSNLDQIQVRLVSSSSPSDTKNVVVTVGTGSATWDVTTGAIPVNTPNPAPDFGSLNNLPLGQLVYSDIAQILGLTTSAIISVDNGADIAVSNFNTTFTNADGYEVLNNISSVWGNNLTVSNGQYVQLRGTSSATPTATINFSVTVGDGAGISVWQITSGQGIDDNPTNFVFQDLVGQIPGQTGLRSETASGSSTSVAGRNVALVGGLDAGLFVPVTVRPADTNIVPKISINGGSSGLINNVTVQNGDTIELVVDNSTDITNPVIPGQGVVTVGINVGNRFIQTWTVANWTGPDTIPAFTPINQVINRTPGGASIIGPIGLTDFNLPITISATNPESFNEFNFATNENIGDVLFSINGDSATVGPRTVNPDPGGDPVFITIIMQQPGNADLDPVQGLSNYGQTVITFGDASPFQLRSINYAVKPIPPAYLGVWYSEKNAYFDDTSWAAAGEDPNNARDYYRAPKFDGYSIGTVVPITKETPLNDGNFGYGDIEERYPGFLPCDGATFAAADYPWLWEAIGNTYGGNGAYIPATKSYTGNFNVPDYRNVRMVGAGIVDSNRGSSSFVPVTSAGGSFELTGSTGGYWYVDDVDVAGPDPLEQVVAPAGSSDGIESEYFTLGTPRTFGTEELEADVEFTVTGEVVANIGPVSDVSVRPPQHEHELISGQIDSDDGDPLIPWGTRAYYGTSASGSQNWSGRPDSDTDAVDDGYWEDAGFWNFGNFESEVENSGRGSLLDLLPGRGSSSVAFGNYWGSPFSEISSLSDDYFTKNGNPGNGDCGVIDTEATRARIDNYLSIYTGTLNHSHLLGTDPVTNPQTDFSYGNVNSDATAFRQGLATFNSTFALKFTQNASTDGGAGVDIELNPATFSWNNTSKPIPTAAMNPQRKVPIIAPFHKVKYIIKAY
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1057 AA molecular weight: 112606,05700 Da isoelectric point: 4,06424 aromaticity: 0,10123 hydropathy: -0,21892
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM44 [NCBI] |
1278485 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO12685.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349296
[NCBI]
CDS location
range 41996 -> 45169
strand +
strand +
CDS
ATGCCATATCAGTTTAGTGCCAGTCCGCTGTATGTTGAAGAGGGACAGTCTATCCAGTTTCGTTACGAAGCTCCTCCTCTGTTCAACGATATTACTCAAGTCAAGATTGAGATTGGCGAGCTTACTGTCTTCTGGATTATTGAGACTAAACTAGAAGATTTTGAACCTGATCCGTTCTTCCTTAGAAATGTTGATGATGCAGAACCCGATACTCTATTAACATATGCAGCAACAACAGATCCTGATAATGGTGTTGCATATACTGGACTAGCAAGTGATCCTGATCCACTAAGAGAAGGTGAAGAAGTTATTACAATCACTGGTCTTGATCCTGGAACACAGGCACCATTGATTGTTAGTTCCAATGTTATTGATGTAAACGACTGGTCTTATCGTCTAAGACTATACAACGAAGGATCCAGTAGTTATGGTGCTTGGGGTGCATGGACTAGAGCACTTAACAATACCGTATCTAATCTTGACCAGATTCAGGTCAGACTAGTATCTTCTTCTTCACCATCAGACACAAAGAATGTTGTTGTTACTGTTGGAACAGGTTCTGCTACTTGGGATGTTACAACTGGTGCAATTCCAGTCAACACACCAAATCCAGCACCAGATTTTGGTTCGCTAAACAATCTACCACTAGGACAACTTGTATACAGTGATATTGCACAAATTCTAGGATTAACTACTTCTGCTATCATTAGTGTTGATAATGGTGCAGATATTGCAGTATCTAATTTTAATACTACATTTACTAATGCTGATGGATATGAAGTTCTGAATAATATTTCAAGTGTTTGGGGCAACAACCTGACAGTAAGTAATGGTCAGTATGTTCAGTTAAGGGGCACATCATCAGCAACACCAACAGCAACTATTAACTTCAGTGTTACTGTTGGTGATGGTGCTGGTATTTCTGTATGGCAGATTACATCTGGACAAGGTATTGATGATAATCCAACTAATTTTGTATTCCAAGATCTAGTTGGTCAGATTCCTGGACAAACTGGTCTTAGATCAGAAACTGCATCAGGTTCTTCTACATCAGTTGCTGGCAGAAATGTAGCACTGGTTGGTGGACTTGACGCTGGACTATTTGTTCCTGTTACAGTCAGACCTGCTGATACTAATATTGTTCCTAAGATTAGTATTAATGGTGGTTCTTCTGGTCTCATCAACAATGTCACAGTTCAGAATGGTGATACTATCGAACTGGTTGTTGATAACTCTACAGATATCACTAACCCTGTAATTCCTGGTCAAGGTGTTGTTACTGTTGGTATTAACGTAGGAAACAGATTTATTCAGACATGGACTGTAGCAAACTGGACTGGTCCAGATACTATTCCAGCATTCACACCTATCAACCAAGTTATCAATAGAACTCCTGGTGGTGCTAGTATCATTGGTCCTATTGGATTGACTGACTTCAATCTACCAATCACTATTAGTGCAACAAATCCTGAATCATTTAATGAATTTAACTTTGCTACCAATGAGAACATTGGTGATGTTCTATTCTCAATCAATGGTGATTCAGCAACTGTAGGACCACGAACAGTTAATCCTGATCCTGGTGGTGATCCTGTATTCATCACCATTATTATGCAACAACCTGGGAATGCAGATCTTGATCCTGTTCAAGGACTGTCAAATTATGGTCAAACAGTCATTACATTTGGTGATGCATCTCCATTTCAGTTGAGATCTATCAACTATGCTGTTAAACCTATCCCTCCTGCATATCTTGGTGTGTGGTATTCTGAGAAGAATGCATATTTTGATGATACATCATGGGCAGCAGCAGGCGAAGATCCTAACAATGCTAGAGATTACTATAGAGCACCTAAGTTTGATGGTTACTCTATTGGAACTGTTGTTCCCATCACTAAAGAAACACCACTAAATGATGGTAACTTTGGTTATGGTGATATTGAAGAAAGATATCCAGGATTCTTACCATGTGATGGAGCAACCTTTGCTGCAGCAGATTATCCTTGGTTGTGGGAAGCAATTGGTAACACATATGGTGGCAATGGTGCATATATTCCTGCAACTAAATCCTACACTGGAAACTTCAATGTTCCAGACTATCGTAATGTTAGAATGGTAGGTGCTGGTATCGTTGACTCTAATAGAGGATCATCTTCTTTTGTTCCTGTAACAAGTGCTGGTGGTTCATTTGAACTGACTGGATCAACTGGTGGTTACTGGTATGTTGATGATGTTGATGTTGCTGGTCCAGATCCACTAGAACAAGTTGTTGCACCTGCTGGATCTAGTGATGGTATAGAATCAGAATACTTTACACTAGGAACTCCAAGAACATTTGGAACTGAAGAACTAGAGGCAGATGTTGAATTCACTGTCACTGGTGAAGTTGTTGCTAACATTGGTCCTGTTAGTGATGTTTCTGTTCGTCCTCCACAGCATGAACATGAATTGATTAGTGGACAAATTGATAGTGATGATGGTGATCCACTCATTCCATGGGGCACTAGAGCATACTATGGCACATCTGCTAGTGGTTCACAAAACTGGAGTGGAAGACCTGATAGTGATACAGATGCTGTTGATGATGGTTACTGGGAAGATGCAGGATTCTGGAACTTTGGCAACTTTGAGTCAGAAGTTGAAAACTCTGGCAGAGGATCACTTTTAGATCTGTTGCCTGGTAGAGGTAGCAGTAGTGTAGCATTTGGTAACTACTGGGGTTCACCATTCTCGGAGATCAGTAGTCTAAGTGATGACTACTTCACTAAAAATGGTAATCCAGGTAATGGTGACTGTGGAGTTATTGACACAGAAGCAACTCGTGCTAGAATAGATAACTATCTGTCTATCTACACTGGCACACTAAATCACTCTCACTTACTAGGAACTGATCCTGTTACTAATCCACAAACTGACTTTAGTTATGGTAACGTCAACTCAGACGCTACTGCATTCAGACAAGGACTAGCAACATTCAACTCTACATTCGCACTTAAGTTTACTCAGAATGCATCGACAGATGGTGGAGCAGGTGTTGATATTGAGCTCAATCCAGCGACATTCTCATGGAACAATACCAGCAAACCAATTCCTACTGCTGCTATGAATCCACAGCGCAAGGTTCCTATCATTGCACCATTCCACAAAGTTAAATATATAATTAAGGCATACTAA
Tertiary structure
PDB ID
4e097c0360eecb052f6db89d04bcdb285668c8657cd08b7251a7df02028e086b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50