Protein
View in Explore- Genbank accession
- YAW78467.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MDIRFQGVLRDPLDNPMPNHEIRITALHTDETIKGSTVVFYTDASGAYDFYLLKGFYSLEVLNTAGDEYLLTGNLCLNQSTPQNITLEDALKYSEDIEPEDTVVLDATWSTWWNSLVNASLTSSREHRDQINHDEAHSVDLQETWASGDDTEHGVQRTLEVKAGDARIQEQHRVFDDEFAATGSKVETSQASVHETVNVGTEIDRKKTQTAVTSTNVENEHVGLEIRKDETSTISSGSWSKLKELAANIREVVSFAFGSNQLNKRSSVGTSVEEAYDTLVGSKASSVTHSNDGTTSQHEIIVDEHFIGKTPLSPTVFVDTVTGKVTVYGQLQISELLDGNGDPIDLNPEDGNTIFQVYQYSDSSNGPWEDVVQPYYYWRRENWSINGVVDPGTWSQPYQFRGFDGEPGDPGDTIYIEYQYSPDALVWHSPPLTSGDKWRRERIVTNGVAGPWSAAGQIRGDDGSTVEVRSEYSIDGIYNWHTTLDPADKFERRATFVNNVQDTPWSDPFPIGQGPEGDPGRNGSGWYTLVNATGTWPGDAMATAEFTTAFGRTPVLDDHLTYTNNSNPDLVTASEVKRCNSDFGQSVTWSTPAMVIQGDLIAQGTISGNRLVADTITGNEISSATTIIAGTGSWTAGMNGDDSTGAGIYQNWRFWSGASNPSLAPFRVGRSGNLWASNANINGHITATSGSFTGDIFAETLTLSGVGAQIQSSNYVTGVSGWALFNDGNAEFNNGTFRGTLSAATGNFLGTVYAEKIAGDIVTAISKTNTPVNNNGALFGGVTVSTGRPYVRTLVITLMLSAKATSSGENPPAATATCRLRVNFNGVNYYSNYIESSKGSGSNDPAFSRSQVTIAVPVPANFTGTANCYLSVGQGGGVTELSAPSSNDVWTPLLFKDGGDLS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 902 AA molecular weight: 97432,22200 Da isoelectric point: 4,53936 aromaticity: 0,09313 hydropathy: -0,40976
Domains
Domains [InterPro]
IPR057549
501–616
501–616
1
902
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAW78467.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ510824
[NCBI]
CDS location
range 5194 -> 7902
strand +
strand +
CDS
ATGGATATCCGTTTCCAAGGCGTCTTACGAGATCCCTTAGACAATCCAATGCCTAACCACGAAATTCGTATTACGGCGTTGCATACGGATGAAACGATCAAAGGCTCTACTGTTGTGTTCTATACGGATGCCAGCGGAGCTTATGACTTTTATCTGTTGAAAGGATTCTACTCGTTAGAAGTCCTAAATACAGCCGGTGATGAATACCTTCTCACTGGTAATTTGTGTTTGAACCAATCTACCCCTCAGAACATTACCCTTGAAGATGCACTTAAGTATTCCGAAGACATTGAACCAGAAGACACTGTTGTTCTGGATGCAACGTGGAGTACGTGGTGGAATAGTCTAGTTAATGCCTCATTAACTAGCTCTCGTGAGCACAGAGACCAGATTAACCATGACGAAGCACACTCGGTCGACTTACAGGAAACATGGGCCTCAGGGGATGATACAGAGCATGGTGTTCAACGCACTCTTGAAGTAAAAGCAGGAGATGCTAGAATCCAAGAGCAACATCGCGTATTTGATGACGAGTTTGCTGCTACTGGTTCAAAGGTTGAGACATCTCAAGCCTCAGTTCATGAGACTGTGAATGTTGGTACAGAGATCGATCGTAAGAAGACTCAGACAGCTGTGACATCTACTAACGTAGAGAATGAGCATGTTGGCCTAGAGATTCGTAAAGACGAGACATCTACTATCTCATCTGGTTCATGGAGCAAGCTAAAAGAATTGGCGGCTAATATCCGCGAAGTAGTATCTTTTGCTTTTGGTTCAAATCAGTTAAACAAACGATCATCAGTAGGTACGTCTGTTGAAGAGGCCTATGATACCTTAGTTGGTTCAAAAGCTTCTAGTGTAACTCACTCGAATGACGGCACTACTTCTCAACATGAGATCATTGTTGATGAGCATTTCATTGGTAAGACTCCATTGAGTCCTACTGTGTTCGTCGATACAGTTACTGGTAAGGTAACGGTCTATGGTCAGCTACAGATCTCTGAGCTGTTGGATGGGAATGGTGATCCTATTGATCTAAATCCAGAAGATGGTAATACGATCTTTCAGGTGTACCAGTACTCAGATAGTTCAAATGGCCCTTGGGAAGATGTGGTTCAACCATACTACTATTGGCGTCGTGAGAACTGGAGTATTAATGGTGTTGTGGATCCGGGTACTTGGTCTCAGCCGTATCAGTTCCGTGGATTTGATGGCGAACCGGGTGACCCTGGCGACACAATTTATATTGAGTACCAATACTCCCCTGATGCTTTAGTGTGGCATAGCCCTCCTTTAACTTCAGGAGATAAATGGCGTAGAGAACGTATTGTTACAAATGGGGTAGCTGGGCCTTGGTCGGCTGCAGGACAGATTAGAGGGGATGATGGATCAACAGTAGAGGTACGTTCTGAGTATTCTATTGACGGGATTTATAACTGGCATACTACTTTAGATCCTGCTGATAAATTTGAGCGAAGAGCTACTTTTGTTAACAACGTACAAGATACTCCTTGGAGTGACCCTTTTCCTATTGGTCAAGGGCCAGAAGGTGATCCGGGAAGAAATGGTTCAGGATGGTATACTCTTGTTAATGCTACCGGTACTTGGCCGGGAGATGCTATGGCTACTGCAGAGTTTACGACAGCATTTGGGCGTACTCCGGTTTTAGATGATCACCTTACCTATACTAATAACTCAAACCCTGATCTCGTAACTGCTTCCGAAGTTAAGAGGTGCAATTCTGATTTTGGGCAGTCTGTTACATGGTCTACTCCTGCTATGGTTATTCAAGGTGACTTAATTGCTCAAGGCACTATTTCAGGTAATAGGTTAGTCGCAGATACCATTACAGGCAATGAAATTAGTTCTGCTACTACAATTATCGCAGGAACCGGTTCGTGGACAGCAGGCATGAATGGGGACGATTCTACTGGAGCAGGTATTTACCAGAATTGGAGATTTTGGTCAGGCGCTAGTAATCCTAGTTTAGCCCCGTTTCGCGTAGGTAGATCAGGTAACCTTTGGGCTTCTAATGCTAATATTAACGGGCATATTACGGCTACATCTGGTTCATTTACTGGGGATATTTTTGCCGAGACGTTAACTCTTTCTGGGGTTGGTGCTCAAATTCAATCTTCTAACTATGTTACAGGTGTATCTGGCTGGGCTCTCTTTAATGATGGTAATGCAGAGTTTAACAATGGTACGTTCCGAGGTACATTGTCAGCAGCAACCGGTAACTTCTTAGGTACTGTGTATGCTGAGAAGATCGCAGGTGATATCGTTACAGCGATTAGTAAGACGAATACTCCGGTAAACAATAATGGTGCATTATTTGGCGGTGTGACGGTATCAACAGGGCGTCCTTATGTACGTACTTTGGTGATTACTCTAATGCTTTCAGCAAAGGCTACGTCAAGCGGTGAGAACCCGCCAGCAGCTACTGCGACTTGTCGTTTGCGTGTAAACTTTAATGGAGTAAACTATTACAGTAACTACATCGAGAGTTCTAAAGGCTCTGGTTCAAATGACCCAGCATTTTCTCGATCACAGGTGACTATTGCTGTACCCGTTCCTGCGAACTTTACAGGTACTGCAAATTGTTATTTAAGTGTTGGTCAAGGTGGTGGTGTGACAGAGTTGAGTGCACCAAGTAGTAACGATGTATGGACGCCGCTTCTATTTAAAGACGGCGGAGACTTGAGCTAA
Tertiary structure
PDB ID
7db355f41a8400ebccf98b4a9add052bfef241c8810ad75c18aa6f0efaf2fb87
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50