Protein

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Genbank accession
WPK36295.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLITAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSASAINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLELAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQPLESYEKNGYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPININASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140103,57650 Da
isoelectric point:5,36403
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,32506

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
WPK36295.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage AV119
[NCBI] 		3077264 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK36295.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR352949.1 [NCBI]
CDS location
range 53783 -> 57652
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAGCAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGATGGAGAGCGTTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCGTCAGGACCTTATCAATTAAAATCAGGCGAATCGATTTCAGTTAACACCGCAGCTGGTAATGATATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAATCAGGTTTTAATTACAGCTCCGGTACAAAGCATTGTAAACTTTAGAGGTCAACAAGTACGCTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACTCCTGCGAGTCTCTATCAGGCACAATCAAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTTCAGCAATTAATATTAAACTTCCAAGATTTGCCAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTGGATAAATTAAATCCTCTTTATCACACAATTGTTACTACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAACGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTCAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACGGTTAAAATCAAAGCTGCAGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAGTGGGTTACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTAGAGCTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATATTGGGTTGTACAGCAAAATGTTCCAACCGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGTGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTCGCAGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATTACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCGGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAGGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAGGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCGACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCGTCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCAACACAGCCATTAGAATCATATGAGAAAAATGGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAATCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCCGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCGCTCCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAAACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACATTCGGTGGATCAGTTTCAGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCACAGACGATGACTATTAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGCGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTAATGCCAATAAACATTAATGCTTCGGGTTCTTTAAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTTAGAGCAATAAACGGTGATTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTGCCAACACATATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGATGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGCGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACACCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCCACAATGGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
7e0a413342651a62d62260e9777c51e7de9aa5acd303bfaf2bc90537d6303f3b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5678
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
A collection of diverse bacteriophages for biocontrol of ESBL- and AmpC-beta-lactamase-producing E. coli Vitt,A.R., Sorensen,A.N., Bojer,M.S., Bortolaia,V., Sorensen,M.C.H. and Brondsted,L. 2023 — GenBank