Protein

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Genbank accession
YP_010348234.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MANKKVDLPKAPGTDSRGNIALPGGPRVLDLSDYDDLFGDITSDSKKSGWEQFKEGFTASLSNRLDTKDTIRNFLRSAAPEGISSAFGAYDDFKQSVGNIKDTLERTNAADLEYISRRAQDYLPQLKDYMSDDFFNEINEGLEARIEDYKYTVDATRNQTAIRAKAKDEQEDRTIQLALDNIALSAKLDHNRSEQAANRRDKVHRAERGLRDVVDTKRFNFLARTMGMMADNTANIKNYQEQFDAGVKRKGLELQFRTFMGIKDLVRLAETSLQVQIQAAEQLVRNTGTPDHQKGALADNRKFQRQGMSGTGNRLLQGAGRGLQQYLGGFGGNVEDRVSQGLGSRLSEIVQAARMTENGPSMWDQKYNILGSLAGELFGDGIQNHLVPMAGRELRPTATKLVNKYGGGKHNQLGYLLDNIPAFAQEFVNNQQNQYGARGVLRDLIAPYIPTFGLQDRLKDGTYQTIDQQASFNQMTQRSIVEVIPSLLSTAVQELRMIRTGRDDVSREVFDITTGKMTIEKTANDNLLKRIIPDNAIRAASSTINDALNTFDPDGQLSPTARKALAERMLRESSHNKRFDPEQYLKSGGYADGMRGETADELGRFFRGKFEFDSKGKMKDTAGNHQLRQDWSQAFLDIRSISRDPYKEIERLIASGRTEPLRMMGIITTEGNQDRINYERIWEILRSGVTGNNPYAPGGSGFDPNKDDMSGTYGHKDFMGPAYEGEAKRFTNNMLRKTRDRFTPVEKSARDAAARRIRELRAKYGNNAHKIAEMMEQFQADPKGSMAAGYGKATDFTAQLMGGQFGVGNMKAKVESAYDKAMASMTPEAKGSFVPAGMDKLTDLYSKFNPSEPLIKAIDFIQGKLVDLKTKVIITKPSDITGTVINLDGMTVASAREVAAGLFNGLGDKIVSIASAIGDAASNAIARYQGLHASAPDAMSDPSNPDAPQDLSLSPGEDVVITARGIENGEYFNRSTGKLVTSMEDLDGDIVDRDGNVVVTAQEVREGLYSYKTGKRWKLSKGAAKVLKSLGSLSRFSGMTATQLGFHAIKFMGKAAIGIGSKAFNFFVENQNAYLPDSPDPVFTRRQLKAGDYFDEKGKVIEDFVDVYGLIYGKDGEPVIAQDQYKNLMNYDGTKHQLAKNKTFIGRTLMRGLRGIRSAYTAASMRYWKWLGRKTVSVGGALGRKTLGGFAKVGGNLFNKVFEKADPEAMANPTNMILAQILQQLQANAPEPEERAGSWKDKAKKKAMELGGNVKEKLGMNRDKTLLGGLMSTLGGLFGKKKGKDKDDEDDDDGFGLDDAADMADIGDSIDNARERRRRKKLRGKGKPGRLSRIASKGWNALKGSRLAGLAGTGLAAGASTLAGTAAAGSLVNGAIAVGSTIATGVATLLSAPAWLLVGGAALIGGGAYLGYRAYKASGDFKYLRMMQYGITSTGEKLSVLKMEAALEKYTDKSSDTPTMNINSDIAKEILGAMDIDIKDVPRVMAFSRWMDMRFKPVYLSYCKSLGALGLKNVALNDIDDKVPDEQKADLLAGVKFSYEGETPYNYLDNPFDPDSKLDNTIPEIKEQFDKLTEKFAGAKAKADKAKGEAGTEADKAKTDATTVAAGTAAATATVTAADIVQDQKDNAAPPGPQSASDVVKGAAKVAALSGIASGAVPAEKVGKELTSLQSIRMRAYGLQTLGIADVESLLTLEYVYSRDLSVSDGTIDYTGDFQVFLREAGTYLGMSTAVGSDSRNKLSNWLASRFAPAFRAYWNAVLSKSPTAQLSSVESQLKINEKIIAANAIMGASNSMGDSIWDVDSIFEVTGKLSDLRALAEADLKYLKDVGDKDIAGTPTQKASDQVAGKNNASMGGSFVDSVVDSAKNAWDTTKSTVGDAYNKVAGWFGGGETKDGNLSFPEGGYKNTSGTQVASTGVTFGSLAKGNGGKWEDVPMPTANGTAKGAAPTFKAAAAMVGIPVELMFIIAGIESGYKYDISAQPSVNKKTGERSKQSSAYGWFQFLNATWDEVYSKVISQFGAPADDAARSMRKDPRLQALAGALFIKGNYDRLSKALGRPISDTDIYIAHFLGAGGAIQFLKADPNALGYQVMKDAWSSNLTIFFVGGDKSKPRTVAQIYKLFDDKIAKYRQGAGTPSDVPQTVGAEVSPEKAAEEQAQAAQATQAPPEEDPTKNKDDSSSGSSGPSSPGQAIAGTAPGAPGMSPSTTNGLPSGGAGSIGQDSGGSSIDAQRQASEEAALQAQQRRDQELRKTKQTDNEIDKIRVRQLDAILEIRDLIKEMAGQGGINRPSANDSRMGVSTGTNGTSNSMTTPIQNRSAQYRESPLTLK
Physico‐chemical
properties
protein length:2326 AA
molecular weight: 251284,69260 Da
isoelectric point:8,66637
aromaticity:0,07309
hydropathy:-0,49033

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–946
DC_0124 PTHR47372 DC_0834
Coil
Unmapped
139–159
Coil DC_0124
Coil
Unmapped
1569–1589
Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
1944–2055
IPR023346
YP_010348234.1
1 2326
Architecture
STR
RBD
STR 1-2055 | RBD 2056-2326
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage Phabio
[NCBI] 		2006668 Uroviricota > Caudoviricetes > Chimalliviridae > Phabiovirus phabio >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010348234.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062582.1 [NCBI]
CDS location
range 198492 -> 205472
strand +
CDS
ATGGCTAATAAAAAAGTAGATCTACCTAAGGCTCCCGGTACGGATTCCCGTGGGAACATCGCGCTGCCTGGCGGACCTAGGGTATTAGACCTTAGCGACTATGATGACCTGTTTGGAGATATCACGTCAGACTCAAAGAAGTCTGGTTGGGAACAATTCAAAGAGGGCTTCACGGCTTCACTGTCTAATCGACTAGATACAAAAGATACTATTCGGAACTTCTTGCGTTCAGCTGCACCGGAAGGAATTAGTTCTGCCTTTGGTGCTTATGACGACTTTAAACAATCAGTTGGTAATATCAAGGATACCCTTGAAAGAACTAACGCTGCGGATCTGGAATACATTTCCCGTAGAGCACAGGATTATTTACCTCAGTTAAAAGATTACATGTCCGATGATTTCTTTAATGAAATTAATGAGGGACTGGAAGCAAGAATTGAGGATTACAAATACACTGTTGATGCAACACGCAATCAAACAGCTATTCGCGCAAAAGCAAAAGACGAACAGGAAGACCGTACGATTCAGTTGGCTCTGGATAACATTGCACTGAGTGCTAAGTTAGACCATAACCGTTCTGAACAGGCCGCTAATCGCCGTGATAAAGTTCATCGTGCTGAACGTGGTTTACGAGATGTTGTTGATACTAAACGTTTCAACTTCCTTGCTCGAACCATGGGTATGATGGCTGATAACACAGCTAACATTAAGAACTACCAGGAACAGTTTGATGCTGGCGTTAAACGTAAAGGTCTGGAATTACAATTCCGTACATTTATGGGTATCAAGGATCTCGTACGTTTGGCTGAGACTTCTCTCCAAGTACAAATCCAAGCCGCAGAACAATTAGTTCGTAATACAGGTACACCTGATCATCAGAAAGGCGCACTTGCAGATAACCGTAAGTTCCAACGTCAAGGTATGTCTGGGACGGGTAATAGGTTATTGCAGGGTGCCGGTCGTGGTCTACAACAATACCTGGGTGGTTTTGGTGGTAATGTAGAAGACCGTGTATCACAAGGTCTTGGTAGTCGTTTATCGGAAATTGTACAAGCTGCACGCATGACCGAAAATGGCCCTAGTATGTGGGATCAGAAATACAATATCCTTGGTAGTCTAGCTGGTGAACTATTTGGTGATGGTATTCAAAATCACCTTGTTCCAATGGCAGGTCGTGAGTTAAGACCTACAGCTACTAAGCTGGTTAACAAATACGGTGGTGGTAAGCATAACCAACTTGGTTATCTCTTAGACAACATTCCTGCTTTTGCTCAAGAGTTTGTAAACAACCAACAAAACCAATATGGTGCACGGGGTGTGTTACGTGACCTGATCGCTCCATATATTCCGACCTTTGGTTTGCAAGATCGTCTTAAAGATGGTACCTATCAAACAATTGATCAGCAAGCGAGCTTTAACCAAATGACTCAGCGAAGCATCGTTGAAGTTATCCCTAGTTTGCTTTCCACCGCTGTTCAAGAATTACGTATGATTCGTACTGGTCGTGATGATGTATCTCGTGAAGTATTTGACATCACTACTGGTAAAATGACCATCGAGAAAACAGCTAATGACAATTTGCTGAAACGTATTATTCCCGATAACGCTATTCGTGCTGCTTCGTCTACAATCAACGATGCCTTGAACACATTTGATCCAGACGGTCAACTGTCCCCTACTGCTCGTAAAGCTTTGGCTGAACGTATGTTGCGTGAGTCTTCACATAACAAACGGTTTGATCCGGAACAATACTTGAAGTCAGGTGGTTATGCCGATGGGATGCGTGGTGAAACCGCCGATGAACTCGGTCGTTTCTTCCGTGGTAAATTTGAATTTGACTCGAAAGGGAAAATGAAAGATACCGCTGGTAACCATCAATTACGACAGGACTGGTCTCAAGCCTTCTTGGATATCCGTTCTATTAGTCGTGACCCTTACAAAGAGATTGAGCGTCTTATTGCATCGGGTCGTACTGAACCATTACGGATGATGGGTATCATTACAACTGAAGGCAACCAAGACCGTATTAATTACGAACGTATTTGGGAAATCTTAAGGTCTGGTGTAACTGGTAATAATCCATATGCCCCTGGTGGTAGTGGATTTGATCCTAATAAAGATGACATGTCTGGTACATACGGACATAAAGACTTTATGGGTCCAGCTTACGAAGGTGAAGCAAAACGTTTTACTAACAACATGTTACGCAAGACTCGTGATCGCTTTACTCCAGTTGAGAAATCTGCACGTGATGCAGCTGCTCGACGTATTCGTGAACTGCGTGCTAAATATGGTAATAACGCACACAAAATCGCCGAGATGATGGAGCAGTTCCAAGCTGATCCAAAAGGTAGTATGGCGGCAGGTTATGGGAAAGCTACTGATTTCACTGCTCAACTCATGGGTGGTCAATTCGGTGTAGGTAATATGAAAGCCAAGGTTGAATCAGCTTATGATAAAGCTATGGCTAGTATGACTCCAGAAGCTAAAGGCTCTTTTGTTCCAGCAGGTATGGATAAACTAACTGACCTTTATTCTAAGTTCAACCCAAGCGAACCTTTGATCAAGGCAATTGATTTTATACAAGGTAAACTTGTCGACTTAAAGACCAAAGTCATCATTACTAAACCTAGTGATATCACTGGTACTGTTATTAACCTCGACGGCATGACGGTTGCTTCTGCTCGTGAAGTTGCTGCTGGTCTATTTAATGGATTGGGTGACAAAATTGTTAGTATTGCTTCTGCAATTGGTGATGCTGCATCTAATGCTATCGCTAGATACCAAGGGCTCCATGCATCGGCACCAGACGCAATGTCTGACCCGAGCAACCCAGATGCGCCACAAGACCTGAGTTTATCTCCTGGTGAAGATGTTGTTATCACTGCACGTGGTATTGAGAATGGGGAATACTTTAACCGTTCAACGGGTAAGCTTGTTACTTCGATGGAGGACTTGGATGGTGACATCGTAGACCGTGATGGTAATGTGGTTGTTACGGCACAAGAAGTTCGTGAAGGATTATACAGCTACAAAACTGGTAAACGTTGGAAACTATCTAAGGGTGCTGCTAAAGTACTCAAGTCACTCGGTTCGTTAAGTCGTTTCTCTGGCATGACCGCAACACAACTAGGTTTCCATGCTATCAAGTTTATGGGTAAAGCTGCAATCGGTATTGGTTCGAAAGCTTTTAACTTCTTTGTAGAAAACCAGAACGCTTACTTACCTGATTCTCCTGATCCGGTATTCACCCGTCGTCAACTTAAGGCAGGTGACTATTTCGATGAGAAAGGTAAGGTCATTGAAGACTTCGTAGATGTTTACGGTTTGATCTACGGTAAAGACGGTGAACCTGTAATCGCCCAGGATCAGTATAAGAACCTGATGAACTACGATGGTACTAAACACCAACTCGCTAAGAACAAGACCTTTATTGGTCGTACCTTAATGCGGGGTCTTCGTGGTATTCGTTCTGCCTATACTGCCGCTTCCATGCGTTACTGGAAATGGCTTGGTCGTAAGACTGTATCGGTTGGCGGTGCTTTAGGTCGTAAGACTCTTGGTGGTTTTGCTAAGGTCGGCGGTAACCTTTTCAATAAGGTATTTGAGAAAGCCGATCCAGAAGCTATGGCTAACCCTACCAACATGATTCTTGCACAGATCCTGCAACAGCTTCAAGCTAATGCTCCTGAACCAGAAGAACGTGCAGGTAGTTGGAAAGACAAAGCTAAGAAGAAAGCAATGGAACTTGGCGGTAACGTCAAAGAGAAATTGGGTATGAACCGCGACAAAACTTTGCTCGGTGGTTTGATGTCTACTCTTGGCGGTCTGTTCGGTAAGAAGAAAGGGAAGGACAAAGATGACGAGGATGATGACGATGGTTTCGGTTTAGATGATGCGGCAGATATGGCTGACATCGGTGATTCCATTGACAATGCACGTGAACGGCGCCGTCGTAAGAAACTACGTGGTAAAGGTAAACCTGGTCGCTTGAGTCGTATTGCCTCTAAAGGATGGAATGCTCTCAAAGGTTCTCGTCTAGCGGGTCTGGCTGGTACTGGTCTAGCTGCTGGTGCAAGTACTCTTGCTGGTACAGCTGCTGCCGGTTCGCTTGTTAATGGTGCCATTGCTGTAGGTTCTACCATTGCTACAGGCGTTGCTACTTTGTTGTCGGCTCCTGCTTGGTTGTTAGTGGGTGGTGCTGCCTTAATTGGTGGTGGTGCTTACTTGGGTTACCGTGCTTACAAAGCATCAGGCGACTTTAAATATCTGCGTATGATGCAATACGGTATCACTTCAACTGGTGAGAAATTATCGGTACTGAAGATGGAAGCTGCGTTGGAGAAATATACGGATAAGAGTTCTGATACCCCAACCATGAATATCAACTCTGATATTGCTAAGGAAATTCTTGGTGCTATGGATATTGATATTAAGGATGTTCCACGCGTCATGGCATTCAGTCGTTGGATGGACATGCGTTTTAAACCTGTATACCTCTCGTATTGCAAATCGCTTGGGGCATTGGGTCTGAAGAATGTAGCGTTGAATGACATTGACGATAAAGTACCAGATGAACAAAAGGCTGACCTCTTGGCTGGCGTTAAGTTCTCTTACGAAGGTGAAACTCCCTACAACTACTTGGACAACCCGTTTGATCCAGATAGCAAATTGGATAACACTATTCCGGAGATCAAAGAACAGTTTGATAAACTGACTGAGAAATTCGCCGGTGCCAAAGCTAAGGCCGATAAGGCTAAAGGCGAAGCAGGTACTGAAGCTGATAAAGCTAAGACTGATGCCACAACTGTAGCAGCAGGCACTGCCGCAGCGACAGCCACTGTAACAGCTGCTGACATCGTTCAAGACCAAAAGGATAACGCTGCACCACCAGGACCACAAAGTGCTTCAGACGTGGTTAAAGGAGCTGCTAAGGTAGCTGCCTTAAGTGGGATCGCTTCTGGTGCGGTACCAGCAGAGAAAGTAGGTAAAGAACTGAC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9b4efc9718f76c5a392843fcbac87da52184adc1535c04dfd1047271dd7029f3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4983
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50