Protein

View in Explore
Genbank accession
AIX46575.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSPWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTAARLASSRQITLGGDLDGSAIFDGSTNITISADLDLVPTLPHYDGTNTSSATYTKVVVDSKGRITNASSPTSLSEYGLDGTVEGQSAQAYDLDLAAIAGLTTTGIISRTSGGNMQTRTITGTATRISISQGAGISGNPTIDMITTAVTAGDYNTESLTSVSGAGSNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSSTNVPIATATEGSKYAAYAGGTTYVRYDIIEDSSRVYQSITGIAAGGGAPTHTDASDAGGWRYLGAAATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYFKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGDVNQTLDKTGDGNLFLQLTQNSATARTFSILSTNSGSGAANIVVAATDLVDIQASDAAGKVYVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAVAGTVRVWGNLQVDGTTTTVNSSTLQVDDPIITLGGDTAPVADDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLAGHGGGYSFLHAATNTAEVFTGTASGIIAGNVKLTSGTASSSNTTGDLVVAGGVGIAGAVNIGGLLDVDSTFRANSTSRFDDNMVIQGASKTLQINNGSGTTKIEFQSTTGNAIIGGVTDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITTAKNSETGVWEIQSSDYGSLRVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTLRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYNSDTVKFSVLGASGDTEIQGTLLVEDNVNFNGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNLTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQVNDTLGVSDVVTFTRNTEQTLTGSYAADGAFRLTGGAGIARNLAVGGDARVYGATELTGALDLNNNANISGTLLQGGGATFLSNVEILAGVGGATKFQVVSATGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTITGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFLTSASNSSEVLSGTDGPLRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVASGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMTGTGLVTRTADNTYARRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALVQASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADVNTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGVGVELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNVFYTEARFDASLAGKNTANLAEGTNLYYTDARADARIAAADTDDLSEGSTNLYHTSARADARVNLQTGANLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAAVTTSVTNGGGGGFVAGTAVATTGGTGSSLTVNTTVVNGIITAAAVNAGGSGFLVNETVTVANANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITASAGAITNVTINDGGTGYVVGETITIVQPTGLDGSNPGAGGTVNVATVATDATLQLTDVTTMEIGATVTGATSGTTGVITALAASAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTVQSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2007 AA
molecular weight: 204345,44250 Da
isoelectric point:4,18894
aromaticity:0,05780
hydropathy:-0,09043

Domains

Domains [InterPro]
DC_1619
ATT
1–455
DC_1619 DC_1607 DC_0029 DC_0029
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AIX46575.1
1 2007
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-455 | STR 456-1559 | RBD 1577-2007
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014a
[NCBI] 		1493507 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Acionnavirus > Acionnavirus monteraybay
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX46575.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019163 [NCBI]
CDS location
range 84603 -> 90626
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGGGGTGGTGCTCAGGAATGGGCGAACGCGAACCCAACTCTCGCTCAAGGCGAATTGGGAATCGAACTTGATACTGGACGTTTCAAGATTGGTGATGGCGTTTCTCCCTGGAATACATTACGATATGAACGTCCTGTTGAATCTACTTCAAACACAGCAAACACTCTTGTGCAAAGAGATGCTGATGGTAATTTTTCAGCAGGTACAGTTACTGCAACATTAATTGGTAATGCTTCAACTGCTGCTCGTCTTGCATCATCTAGACAGATTACTCTTGGTGGTGACCTTGACGGATCTGCTATCTTTGATGGTTCAACAAACATCACGATTTCAGCAGATTTAGATTTAGTACCAACACTTCCACATTATGATGGTACTAACACGTCAAGTGCAACATATACAAAAGTTGTAGTTGATTCTAAAGGTAGAATTACTAATGCATCTTCACCAACCAGTCTTTCAGAATATGGTCTGGATGGAACAGTAGAAGGTCAATCAGCACAGGCATATGATCTTGACCTGGCAGCAATTGCAGGTCTTACCACCACGGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGCGGTAATATGCAAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTTCTATCAGTCAAGGTGCTGGTATTAGTGGCAACCCAACCATTGATATGATCACTACAGCAGTAACTGCTGGAGATTATAATACAGAATCACTAACATCAGTTTCTGGTGCTGGATCTAACTCAGAACCATTTGGTACAGAAACTGTAAATGCTACAAAATTTACAGTAGATGCCTATGGCAGACTGACAAGTTCAACAAACGTACCTATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGGAGGTACAACATATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAATCAATTACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCACACTGATGCTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTCGGTGCAGCAGCAACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAGGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATTTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTATTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGACGGTGATGTTAATCAGACACTGGATAAAACTGGGGATGGTAACCTTTTCCTTCAACTAACTCAGAATAGTGCAACTGCTAGAACCTTCAGCATTCTTTCTACAAATTCTGGTTCTGGTGCAGCAAACATTGTTGTTGCTGCAACTGATTTAGTTGATATTCAGGCAAGCGATGCAGCAGGTAAGGTATATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTTGATCCTGGTGATGACCGTGCTGTAGCTGGTACTGTTCGTGTCTGGGGTAACCTCCAGGTTGATGGAACTACTACAACAGTAAATTCATCGACTCTACAAGTTGATGACCCTATCATTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCAGTTGCTGACGATAATCTAGATCGTGGTATTGAATTTAGATATTACGATACCGAAGCACGTCTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTATACCGACTTAGCTGGTCATGGTGGTGGTTATAGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATACTGCTGAAGTTTTTACTGGTACTGCTTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACATCTGGCACTGCATCTTCTTCCAATACAACTGGCGATCTGGTTGTTGCTGGTGGTGTTGGAATCGCGGGTGCAGTTAATATTGGTGGTCTATTAGATGTAGATAGTACATTCCGAGCAAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAAATTAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGATTGAGTTTCAATCAACAACTGGTAATGCAATTATCGGTGGTGTAACTGATGTAACTGGCAACTTCAACGTCAATACTAACAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACTTCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAACATCGCTACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCTGAAAGCACTAACGATATTACCACTGCTAAGAACTCAGAAACAGGTGTATGGGAGATTCAGTCTAGTGACTATGGATCTCTGAGAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTAATTGATGGCACACTACACGTTAATGGTGCGATTGAAGTTAAGGATAGCGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCCTCCTATGCATCTCACAACACTACAACTCTGAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACCCTTCATGTTGGTGGTACGGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACAATAGTGATACTGTTAAGTTCTCTGTTCTGGGTGCATCTGGTGATACAGAAATCCAAGGTACGTTGCTTGTCGAAGATAATGTAAATTTCAACGGCACTCTGGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATTTAACTGGCAATACCGATATCCAAGGCACACTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAACGCTGTAACATTCGATCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACGGACAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTTCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAATATTATCGGTACATTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGGTTAATGACACCTTGGGTGTATCTGATGTTGTAACCTTTACTAGAAATACCGAGCAAACTCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGGTATTGCTAGAAATCTTGCTGTTGGTGGTGATGCTAGAGTTTATGGTGCTACCGAACTTACAGGTGCTCTCGACCTCAATAATAATGCCAATATTTCAGGAACACTCCTACAAGGTGGTGGTGCCACATTCCTTTCTAACGTTGAGATTTTAGCAGGCGTTGGTGGTGCTACTAAGTTCCAGGTAGTTTCTGCAACTGGCAATACTGATATTCGTGGCACTCTAGATATCGGTGGTGATGTAACTGCCGAGTCCAACCTTACTATTACAGGAAATCTAACAGTCAATGGAACAACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAACAACTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGACAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCTTAACAAGTGCAAGTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGAACTGATGGTCCTCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGTACATCACTTGATGTTGATGCAAACGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATTTCTCAGGTTGCTTCTGGTGCTGCTCTGGTTATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGAACAATCACTGTTGATGGTGTTGTTGATGGTAGTGTATCATTTAATGGTTCTGCCGATGTAACTATCAGCACTACCTACAATGATGCAGATATCACTGCACTTGCTGCAATGACGGGCACTGGTCTGGTAACAAGGACTGCCGATAACACTTATGCACGACGCACACTTGCTGTCACAGCATCCTCTGGTATTACACTGACGAATGCTGATGGTGTTTCTGGTAACCCAACAATTAACGTTGCTTCCACAGCAAGTAACTCAGCAAATAACCTTGTTCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGAACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTCACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCATGATACCGATGCTCTTTCAGAAGGTTCTACCAATCTTTACTTCACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAATCGACGCACTGGTACAAGCAAGCACTGGTATTACTAAGGTATATGATGACACAGCAGGCACCTATACACTCTCTGTAACGCAGGCAGACGTTAATACTGACAATGTAACAGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGCACACACTTCACATACGGAGTAGGCGTAGAACTTAGTGGTGCAGGCGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACCGACAATGTAACTGAAGGTTCTACGAATGTCTTCTATACTGAGGCACGCTTTGATGCAAGTCTTGCAGGTAAGAATACTGCTAATTTGGCAGAAGGTACTAACCTCTACTATACGGATGCAAGAGCAGACGCAAGAATTGCAGCAGCAGATACTGATGATCTAAGCGAAGGTTCTACCAATCTCTATCACACAAGTGCTCGTGCTGATGCAAGAGTCAATTTACAGACTGGTGCAAACCTGGATCTTTCTAGTAAGTCGACTTCTGATCTTTCAGAAGGTACTAATCAGTATTACACTGAAGCAAGAGTACAGACAAAACTGGATAATGCATTTGCTCAACTACAAGCAATGCTCACCAACCTTGCAACTACTACAACTCTAACCTTGAATCTCTCTGGTGATCCTACACCTGGTGCTGCTGTTACTACTTCCGTCACAAACGGTGGTGGTGGTGGATTTGTTGCTGGAACTGCGGTTGCAACAACAGGTGGTACAGGTTCTTCCCTGACAGTTAATACTACTGTTGTTAATGGTATTATCACTGCTGCTGCAGTTAATGCAGGTGGTTCTGGTTTCCTTGTCAATGAGACTGTAACAGTCGCCAATGCTAATGCTGGTAAAGTATTGTCACTGAACCTAGCATCTCTTGCAGGCGGTTCTAACTATGTTACAGGAACTGCTCTTGCAACAACAGGTGGATCTGGTTCTGCCTCACTGACTGTTGATATCACTGCCTCTGCTGGTGCAATCACTAACGTTACTATTAACGACGGTGGCACTGGATACGTTGTTGGTGAGACAATCACCATTGTTCAACCCACTGGATTGGATGGTAGCAACCCTGGTGCAGGTGGTACAGTTAATGTTGCCACTGTTGCTACTGATGCAACTCTGCAACTGACCGACGTTACTACAATGGAAATTGGTGCAACTGTAACGGGTGCTACCAGTGGCACCACTGGAGTTATTACTGCTCTTGCTGCTAGTGCAATTACTGTCGATACCGTTGATGGATTCTTCAAAGTTGGAGAAGTCGTCAGTGCTAATGATGTTACTACTTTGACTGTCCAATCATTCGCTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1322429ff859caf0c4d55dd94d90a7a7cfb9e8f75865911295ae8535c50080c3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5294
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank