Protein

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Genbank accession
AGF91536.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MAFASRTYTPGSSTTTFALTTSGGSPIGYIQQSDISVTVNNVVQSASSYSFSGTSTVEQPNGGNIVLNAGVTGTVTLTRVTSIQNATVTYTAGSTLTAADLNNADNQIRFGLQEFSDTFAALNTGTGDLEALGGFIGSNEAWSSDNTKAATTGAIDARVDSKIDTALTTDVSGGDGVTIVDNNPGSGQIRVDLDADIATLRNMQSGAASALAALTSTELQVLDGATLTTTELNYVDGVTSAIQTQLDNKQPIDSELTTLATMASGTASALKDLTQAEVEILDGATVTTAELNVLDGIPAGLTATELGYVDGVTSAIQTQIDGKQPLDAELTELATMSSGTASALADLTQTEVQILDGVTATTAEINKLDGVTATTSEINLLDGVTATTAEINKLDGVTATTAEINYVDGVTSNVQTQLNAKQPLDTELTTLSGMQAATASILASGTALTSTTTELNQLDGKTLGETSLTTNSNTAIPTSKAVADHVAGAVTAVGGFIAIATEVTFPNSQPAADVIVSVSDAGGLSINSSGVVSGATTVGGTSVTITGVPAALYGGAAGNANPNVLAAGEGLQLTSSGSNHSYAYHKILATETDVAQLSGQINDFNERYRYGAQNPTTGLHAGDLFFNTGTGKMLVYDTTGTPGWEEVQSIGNFFISSFTESFDGSRIDFTLSNAPSSAQQVILSINGVVQKPNSGTGRPSEGFSLNGATLQLPTGSGPASGSDYFVIVMGSTVNIGTPSNNTVTTAILQNGSVTNDKINASAAIALTKLATSGTPNNTNFLRGDGAWTTVNTDLVSDTTPQLGGDLDTNSFEISLDDNHAVKFGNSADLTISHSGTEGSIDCNTGDLQIKLNDRLEILPDNGTSVSARFTTNEVQLMYDNEKMFQTNADGSEFFDSDSNLNIYFSTNGSTRRGYIFVESTSGGKISFYDSQDHPMLSCTKNGAVELYHDNTKRLETTSTGYTVTGDIRFGGTGTWTGEADQGKIQNYGGIVYIQGGNNATYGIVLRDNGGTDRVAVTQDGHLVPAVNNTYDLGTTSLRWRNIYTNDLNLSNEGGANDVDGTWGSYTIQEGAESLFLINKRNGKKYKFNLTEVT
Physico‐chemical
properties
protein length:1093 AA
molecular weight: 113130,25130 Da
isoelectric point:4,19059
aromaticity:0,05947
hydropathy:-0,16761

Domains

Domains [InterPro]
DC_0126
ATT
9–254
DC_0126 DC_1940 DC_1940 DC_1194
IPR005604
ATT
26–119
IPR005604
AGF91536.1
1 1093
Architecture
ATT
STR
STR
STR
ATT 9-254 | STR 255-347 | STR 375-449 | STR 564-1093
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-RSP2
[NCBI] 		756283 No lineage information
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGF91536.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ332139.1 [NCBI]
CDS location
range 11886 -> 15167
strand -
CDS
ATGGCATTTGCATCAAGAACATATACACCAGGCTCTTCTACAACAACTTTTGCTCTGACAACTTCAGGTGGAAGTCCTATTGGTTATATACAACAATCAGATATTAGTGTAACTGTTAACAATGTTGTTCAATCAGCAAGTTCATATTCTTTTTCAGGAACTAGTACTGTTGAGCAACCTAATGGTGGCAACATTGTTTTAAATGCAGGTGTAACTGGAACTGTTACGTTAACTAGAGTTACGTCAATTCAAAATGCAACGGTTACCTACACAGCAGGTTCTACATTAACTGCTGCTGACCTTAACAATGCAGATAACCAAATTAGATTTGGTCTACAAGAATTTTCTGATACGTTTGCTGCTTTAAATACTGGTACTGGAGATTTAGAAGCTCTAGGTGGTTTTATAGGTAGTAATGAGGCTTGGTCATCTGATAATACTAAAGCTGCTACTACAGGGGCTATTGATGCCAGGGTAGACAGTAAAATTGACACAGCTCTTACTACTGATGTGTCAGGTGGTGATGGAGTAACGATTGTTGATAATAATCCTGGATCTGGTCAAATAAGAGTTGATTTAGATGCTGATATAGCCACTCTTAGAAATATGCAATCAGGAGCTGCTAGTGCTCTTGCTGCGTTAACATCAACTGAATTACAAGTATTAGATGGAGCAACACTTACAACTACTGAATTAAATTATGTAGATGGTGTTACAAGTGCTATCCAAACTCAATTAGATAATAAACAGCCTATAGATTCTGAGCTTACTACTTTAGCTACAATGGCTTCAGGAACAGCAAGTGCATTAAAAGATCTTACTCAAGCTGAAGTAGAAATATTAGATGGAGCTACTGTAACTACTGCTGAATTAAATGTTTTAGATGGTATTCCAGCAGGTCTTACAGCAACAGAACTTGGATATGTAGATGGTGTAACTTCTGCAATTCAAACTCAAATTGATGGTAAACAACCTTTAGATGCTGAGTTAACAGAACTTGCAACAATGTCTAGCGGAACTGCTAGTGCATTAGCTGATTTAACACAAACAGAAGTTCAAATTTTAGATGGTGTTACTGCTACAACTGCTGAAATAAACAAATTAGACGGAGTAACAGCTACCACTTCTGAAATTAATTTATTAGACGGAGTTACTGCTACTACAGCAGAGATTAATAAATTAGATGGGGTAACTGCTACAACTGCTGAAATTAATTATGTAGATGGAGTTACTTCTAACGTACAAACTCAGTTAAATGCTAAACAACCTCTTGATACAGAATTAACAACGCTATCTGGTATGCAAGCTGCAACTGCTTCAATTCTTGCAAGTGGTACAGCATTAACTTCAACAACAACTGAGCTAAACCAGCTAGACGGTAAAACTCTTGGAGAAACTAGTTTAACTACTAATAGTAATACAGCAATACCAACTTCTAAAGCTGTAGCTGACCATGTAGCTGGAGCTGTAACAGCAGTTGGTGGTTTTATAGCAATAGCAACCGAAGTAACTTTCCCTAACTCTCAACCAGCAGCAGATGTGATAGTAAGTGTTTCTGATGCAGGTGGTTTATCTATTAATAGTTCTGGAGTAGTTTCTGGAGCTACTACCGTAGGAGGCACTAGTGTAACAATAACTGGTGTACCTGCTGCGTTGTATGGTGGAGCTGCTGGTAATGCTAATCCCAATGTTTTAGCTGCTGGAGAAGGTTTACAGTTAACATCTAGTGGATCAAATCATAGTTATGCATATCATAAAATCTTAGCTACAGAAACAGATGTAGCTCAACTTTCAGGTCAAATAAATGATTTTAATGAAAGATATAGATATGGAGCACAAAATCCTACAACAGGTTTACACGCTGGAGATTTATTCTTTAATACAGGAACTGGAAAAATGTTGGTATATGATACCACAGGTACTCCAGGATGGGAAGAAGTACAAAGTATAGGTAATTTCTTTATATCTAGTTTTACAGAATCTTTTGATGGTAGTCGTATAGATTTTACATTATCTAATGCTCCAAGTAGTGCTCAACAAGTCATATTAAGTATTAATGGTGTAGTTCAAAAACCAAATTCAGGTACTGGTAGACCTTCTGAAGGTTTTTCATTAAATGGTGCTACTTTACAATTACCAACAGGATCTGGACCTGCTAGTGGCTCTGATTATTTTGTAATCGTAATGGGTTCTACTGTAAACATTGGTACTCCAAGTAACAACACAGTAACAACAGCCATACTGCAAAACGGGTCAGTTACTAACGATAAAATAAACGCAAGTGCAGCGATAGCTTTAACAAAACTTGCTACATCTGGTACACCTAATAACACAAACTTTTTAAGAGGTGATGGTGCATGGACAACTGTCAACACAGACTTAGTATCTGACACAACTCCACAGCTAGGCGGTGATTTGGATACTAATAGTTTTGAAATATCATTAGATGATAACCACGCTGTTAAGTTTGGTAATAGTGCTGATTTAACTATTAGCCATAGTGGTACAGAAGGAAGTATCGATTGCAACACAGGCGATCTTCAAATTAAATTAAATGACCGATTAGAAATACTACCTGATAATGGAACTTCTGTTTCTGCAAGGTTTACGACTAATGAAGTACAACTCATGTACGACAACGAAAAAATGTTCCAAACCAATGCGGATGGATCAGAATTTTTTGATAGTGATAGTAACTTAAATATTTACTTTAGTACAAATGGGTCAACAAGAAGAGGTTATATCTTTGTTGAATCTACAAGTGGTGGAAAGATCTCGTTCTATGACTCTCAAGACCATCCTATGTTAAGTTGTACAAAAAATGGAGCAGTAGAGCTATATCACGACAACACTAAACGGCTTGAGACAACCTCAACTGGTTATACTGTTACTGGAGATATAAGATTCGGAGGTACTGGTACTTGGACAGGCGAAGCTGATCAAGGAAAAATACAGAACTATGGTGGTATTGTCTATATACAAGGTGGTAATAATGCTACTTACGGAATTGTATTGAGAGATAATGGAGGTACTGATAGAGTTGCAGTAACGCAAGATGGACATTTAGTGCCAGCAGTTAATAACACTTACGATTTAGGAACTACATCACTACGTTGGAGAAACATCTACACCAATGACCTTAACTTATCTAACGAAGGTGGTGCTAATGATGTTGACGGAACTTGGGGAAGTTATACTATACAAGAAGGTGCGGAGTCGCTATTCTTGATTAACAAACGCAATGGCAAGAAGTATAAATTCAATCTAACGGAGGTTACATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8120c1256f5c49f7062815fb224a4904948b283626d044c7f0830c0e7b7a8993
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5484
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Prochlorococcus phage P-RSP2 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank