Protein

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Genbank accession
CAL9954962.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPRKQSTNRNVGNVQKFVGTSYDEMKALYDNLDALLALETGVQYTLRYLGPSAGDAPSTREDGSPIQDGDYFFDTDADALVYYDAVDDIWFAVDPSEVIQARDEAIAASIVAGQAKDNAELAANNARLSENTAKVYETNAEASKDAAGLSEMSAGLSATDAATYAAQSAIDASNTAADVMTTNADVVTTTDNAATTSTHAINAKNSETAAALSAQQAEQAFDSFDDRYLGTFSTPPTTDNDGDPLVKGATYYNSVELAVYYWNGAVWEAPDKSASDSADAAAASAATATTKAGEASNAATTALNAQTAAKSSENAAQSSQNAAEAAEVGAELAESNAATSEANAAESETVARASENNAANSAASAKENADRSEQHAAGGKGLTLAIRDALRAQRKREYTGSGFTEWGNQYDYNDGDPVQHGLWTYYGSTGSANELGLGADPSVDPNNLQGESRTDYPIANVDGVEMSLIGSTTSTPAYKNANKILFPTAPDGSKTLNESTGEVRKYHDLAGVGTPYEAHTVDFDGSTYIDLVASPYVMPVGSKVEFKFKLNDVSGYQYLFDTQNLTRVYIYKTTGTNNLLWGGFGSTIKVNGVDISTNTFAVEAGVEYHIEATTNATSNIDRIGAKSAGGVLSDFARGQIWDITLASSEDGVEPITYNTVTTQPKDDAAPVVSEIDAGDNPDMPTGYMPFYQDAGYVTIPEFPLADSMNISMVMRPDNDTELMVFGQNPEGQTMRLYWYNDTSSGLFRIAAGSGTSLTFDPLVAGRVYVTEVQIRKNVGASDYTVTAQVNGVIKTQSNVTFGHNTFDSFTLGSEEGVKNNNRWDGAIFGFGIEYPDAPDLNRTYGSVEVDDPAGRLTVEDDLGFGTEDWTPEFDGFNNVIVPPVMNFTGIARELEMTVVPDNVGSSWRIGQTFSKDGEVNRFYLRYDASGTITAGIGNATIQSVLNMTVGETYNFKFICDNSLNIELFVNGVSTITGTTSFRADFVLDNFYLGAAGTADSGPSEHLNGKLTNVRITDPNSVANSRHYPLVINQPTQPDTLIAEDAGYDKDTAPFYTPSYSNTDGWVEIPEITLGSGDAIKLKFQWEDEGKAYDGILDNASVPSLHLRIHNDGRLRWTNHGTLRVNGTVYTDGSFYPVSGEVYEVEIALDRNLTLARIGRLYNGNPWSGKIWDIEFTDNTDPTNSRYYPSVDYRVDGDTSGTVLDETHGLLSDSFSDGRWVESAAGTINGESLTITSSFGSGRVGTFPSPAINGVDVTVSFDVVSYSGTTNGGRVIVYRNGSQDGNLGTFDSSDVGTRVTLTANPTGNYGSDGNDVVFYVDASGISFEVANVEVSANNNGTLVNFPSGSEWTLAQVDGASDGTLENFTAGLEWNNDLPITDGTMVGFAQPWHHETGRYIGSIIGETTQAVWDVQDSQKAFHDVKYNADFHVITSRKDLVFLETWLEKVEGFVRPYGNVQFGGSSHDGVTLVPVTNFKAQGYSAFGEWDENTVGKVADWDAMTPTQKSVWASNPKNNLVFNPEDNEYYQDSYRIRTVEGLGDEWACVRPTIASTGTPTWLGYAQSGTNSRYIVQRGQREDTRDWYKDNTVSGTIFGGTNRSGFNDDEPTIFQNTEGTNTSSANGKCFAMPIALVQRLNQGAYHPTYNPQGCDAFIRNDGAAKVGWYVSNKFREPNNTGDCFPVRKGYPAWDGFRYGHGYIGQSGGRADQYKYYDAIYAGQVEDLRLNANKQDKQELLTDAVRRGVRGETRGKGKVPFTTVQTADQAATGSPTSAFDGIDTSHITVGDMCWAEDAAGDYQRRTITYAGSNGTISFNETIQGRKSDSKLIHERELSAEYDSLPWVDLIGDPERIAATFPDGVVGQWIPDLTTGNSDRDLNRKGIVLTGTLFTENDGASWTVESKAINSTTNTVNTFLDSSLLRLYLLTYEALSDFTESDDNLAVVGDLGDVYNAKFYTIERGNRIAPSLLGVILKDNRDPTHHQLRVNSYSIHPANGDLDGGSGYLPIHEPIRLPAPANDSDAVKALPHLVEKDGLLYVQWHGTQLFYDAAGTVGNEWGDTFAGTTFTNAYGKISIVDGEDTKPDENGNTVKVVTHTETIPIGIANHNQDI
Physico‐chemical
properties
protein length:2107 AA
molecular weight: 227549,30300 Da
isoelectric point:4,42363
aromaticity:0,09824
hydropathy:-0,44542

Domains

Domains [InterPro]
IPR013320
880–1017
IPR013320
CAL9954962.1
1 2107
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage D472
[NCBI] 		3105238 Viruses > unclassified bacterial viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL9954962.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ195751.1 [NCBI]
CDS location
range 2364 -> 8687
strand +
CDS
ATGCCACGTAAACAGTCAACCAACAGAAATGTTGGTAATGTACAAAAATTCGTAGGGACATCCTACGATGAAATGAAAGCCCTTTACGATAATCTTGATGCGTTGTTGGCATTGGAAACAGGTGTCCAGTACACATTACGTTACTTAGGCCCATCTGCCGGAGATGCTCCGTCAACTCGTGAAGATGGTTCACCAATCCAAGATGGTGATTATTTCTTTGATACAGATGCGGATGCCTTGGTGTACTACGATGCAGTTGATGACATTTGGTTTGCAGTTGACCCAAGTGAAGTTATTCAAGCTCGTGATGAAGCTATTGCTGCATCTATCGTTGCAGGCCAAGCAAAAGACAATGCAGAATTAGCGGCAAACAATGCACGCTTATCTGAAAATACTGCAAAAGTGTACGAGACCAATGCTGAAGCATCAAAGGATGCAGCAGGGTTGTCTGAAATGTCTGCAGGCTTGAGCGCAACAGATGCCGCTACATATGCAGCACAATCAGCAATTGACGCGTCAAATACTGCCGCAGATGTCATGACAACAAATGCAGATGTGGTGACTACAACAGATAACGCTGCGACAACTTCTACCCATGCAATCAATGCAAAAAATTCTGAGACGGCTGCAGCTCTTTCAGCTCAACAAGCAGAACAGGCATTTGATAGTTTCGATGACCGTTACCTGGGTACGTTTTCTACCCCGCCTACAACAGACAATGATGGTGACCCTCTAGTAAAAGGCGCTACTTACTACAACTCTGTGGAATTAGCGGTGTACTACTGGAATGGTGCTGTATGGGAGGCACCTGATAAGTCTGCATCTGATTCGGCTGATGCGGCAGCAGCGAGTGCAGCCACAGCTACAACTAAAGCCGGTGAAGCGTCAAACGCAGCAACTACAGCTTTAAATGCACAGACAGCGGCAAAGTCTTCTGAAAATGCAGCGCAGTCTTCACAGAATGCAGCGGAAGCGGCAGAAGTGGGCGCAGAACTTGCTGAGAGTAACGCAGCAACAAGTGAAGCCAATGCTGCTGAATCAGAAACTGTTGCTCGTGCAAGCGAAAACAACGCGGCTAATTCGGCTGCTTCTGCCAAGGAAAATGCTGACCGTTCTGAACAACATGCTGCGGGTGGTAAAGGTTTGACTTTAGCCATACGTGACGCACTTCGTGCCCAACGTAAGCGTGAATACACAGGTTCAGGTTTCACGGAGTGGGGTAATCAGTACGATTACAACGATGGAGACCCTGTACAACACGGGCTATGGACGTACTACGGTAGTACGGGTTCAGCAAATGAACTGGGTTTAGGTGCAGACCCTTCAGTTGACCCTAATAACTTACAAGGGGAGTCTAGAACTGATTACCCTATTGCAAACGTTGATGGTGTGGAAATGAGCCTCATCGGTTCAACTACATCTACACCTGCGTATAAAAATGCAAATAAAATCTTATTCCCAACAGCACCAGACGGTTCTAAGACACTAAACGAAAGCACAGGTGAAGTACGTAAGTACCATGACCTAGCAGGTGTGGGTACTCCATACGAAGCTCATACGGTTGACTTCGACGGCTCTACTTACATTGACCTAGTAGCCTCGCCTTACGTGATGCCTGTAGGTTCTAAGGTTGAGTTTAAGTTTAAGTTAAATGATGTGAGTGGCTATCAATATCTATTTGATACGCAAAATTTAACGCGAGTTTACATCTACAAAACAACAGGAACTAATAATCTTTTATGGGGTGGTTTTGGTTCTACCATAAAGGTTAACGGCGTAGATATTTCAACTAATACATTTGCTGTAGAGGCTGGTGTTGAATACCATATTGAAGCAACTACAAACGCTACATCAAACATAGACCGTATTGGCGCTAAATCAGCAGGTGGCGTATTAAGTGATTTTGCGCGTGGTCAAATCTGGGATATCACTCTAGCTTCTAGCGAAGATGGTGTTGAACCGATTACGTACAACACAGTAACTACTCAACCTAAAGATGATGCAGCTCCTGTAGTGTCTGAGATTGATGCAGGTGACAATCCTGACATGCCGACTGGTTACATGCCTTTCTATCAGGACGCTGGTTACGTAACTATTCCAGAGTTCCCACTGGCTGATAGCATGAATATTAGTATGGTTATGCGACCTGATAACGACACTGAACTGATGGTATTCGGTCAGAACCCTGAAGGACAAACAATGCGTTTGTATTGGTACAACGATACATCATCAGGGTTATTCAGAATTGCAGCAGGTTCAGGGACAAGTTTAACTTTTGACCCTCTGGTGGCAGGTCGTGTTTACGTTACAGAGGTACAGATTCGTAAGAATGTAGGTGCAAGTGACTACACGGTTACAGCACAAGTAAATGGGGTTATTAAAACTCAGTCCAATGTTACGTTTGGTCATAACACATTTGATTCGTTTACCCTAGGTTCAGAAGAAGGTGTCAAGAACAATAACCGTTGGGACGGTGCTATCTTCGGATTTGGTATTGAATACCCTGATGCTCCAGACCTTAACCGTACCTACGGTTCAGTTGAAGTTGATGACCCTGCGGGACGATTGACTGTAGAAGATGACTTAGGTTTTGGTACGGAAGATTGGACACCTGAATTTGATGGTTTTAATAACGTAATTGTACCACCAGTAATGAACTTTACTGGTATAGCACGGGAACTTGAAATGACAGTAGTTCCCGATAATGTCGGTTCATCATGGCGTATAGGTCAAACGTTTTCTAAGGATGGTGAAGTTAACCGTTTTTATCTCCGTTATGACGCATCTGGAACGATTACAGCGGGTATTGGTAACGCAACAATACAGTCAGTTCTTAATATGACTGTTGGTGAAACATATAACTTTAAGTTCATATGCGATAATTCACTTAATATTGAACTGTTTGTTAATGGAGTTAGTACCATAACAGGTACTACATCATTCCGTGCAGACTTTGTTCTTGATAATTTCTATCTGGGTGCTGCGGGTACAGCAGATAGTGGTCCGTCAGAACACTTAAATGGTAAACTTACGAATGTACGTATTACTGACCCCAATTCAGTTGCTAACAGTCGTCACTATCCACTAGTAATCAATCAGCCTACACAGCCTGATACATTGATTGCAGAGGATGCGGGTTACGATAAAGACACAGCACCTTTCTATACCCCTTCTTATTCTAACACTGATGGTTGGGTAGAAATTCCAGAGATTACACTGGGTTCAGGCGATGCTATTAAACTGAAATTCCAATGGGAAGATGAAGGTAAGGCATATGATGGCATTTTAGATAATGCAAGCGTACCTTCATTGCACTTAAGAATACACAATGATGGTAGATTACGATGGACTAATCACGGCACGTTACGTGTTAATGGCACTGTGTATACAGATGGTTCATTTTATCCAGTATCTGGTGAAGTGTATGAAGTAGAAATTGCACTTGATAGAAACCTTACACTTGCAAGAATAGGAAGACTTTACAATGGTAATCCTTGGTCTGGTAAAATCTGGGATATCGAGTTCACAGATAACACAGACCCTACGAACTCACGTTATTACCCATCAGTAGATTACCGTGTAGACGGTGATACTTCTGGTACTGTTTTGGATGAGACTCACGGTTTACTGTCTGATTCATTCTCAGACGGTCGTTGGGTAGAAAGTGCAGCAGGAACTATTAACGGTGAATCATTAACAATTACATCTTCTTTTGGTTCAGGTAGAGTGGGCACATTCCCATCCCCTGCGATAAATGGTGTTGATGTTACAGTCTCATTTGACGTAGTTAGTTACTCAGGCACTACGAACGGTGGACGTGTCATCGTGTACCGTAATGGTTCTCAAGATGGCAACCTAGGCACATTTGATAGTTCGGATGTAGGTACTCGCGTCACACTTACAGCGAACCCTACTGGTAACTATGGCTCTGATGGTAATGATGTTGTTTTCTATGTAGATGCTTCTGGTATTTCTTTTGAAGTAGCTAATGTAGAGGTATCAGCAAATAACAACGGTACTCTAGTTAACTTCCCAAGCGGTTCAGAATGGACACTTGCTCAAGTAGACGGTGCTTCAGATGGTACGTTAGAGAACTTCACAGCAGGTTTAGAGTGGAACAATGACCTACCTATTACTGACGGTACAATGGTTGGCTTTGCACAACCTTGGCATCACGAAACAGGTCGTTACATTGGCTCCATAATTGGTGAAACTACTCAAGCAGTATGGGACGTTCAAGACTCTCAGAAAGCTTTCCACGATGTGAAATACAATGCCGACTTCCACGTGATTACATCACGTAAGGACTTGGTGTTCTTGGAAACTTGGTTAGAGAAAGTAGAAGGGTTTGTTCGACCTTACGGTAACGTACAGTTCGGTGGCTCTAGTCATGATGGTGTTACCCTGGTTCCGGTTACTAACTTCAAAGCTCAAGGCTACTCAGCGTTTGGTGAGTGGGACGAGAACACAGTTGGTAAGGTTGCTGATTGGGATGCAATGACCCCAACACAGAAATCTGTATGGGCAAGCAACCCTAAGAACAACTTAGTGTTCAACCCAGAAGACAACGAGTACTATCAAGACTCATATCGTATTCGTACAGTAGAAGGTTTAGGTGATGAATGGGCTTGTGTTAGACCAACAATTGCATCAACAGGTACACCTACATGGCTTGGTTACGCCCAATCAGGTACAAATAGTCGATACATAGTTCAACGTGGACAACGTGAAGATACTCGTGATTGGTATAAGGACAATACAGTATCGGGTACTATTTTTGGGGGTACTAACCGTTCTGGATTTAATGATGATGAACCAACCATTTTCCAGAATACAGAGGGTACAAACACTTCTTCTGCTAACGGTAAGTGTTTTGCTATGCCCATCGCACTAGTGCAGCGTTTGAACCAAGGTGCTTACCATCCAACGTATAACCCACAAGGTTGTGATGCTTTCATACGTAATGACGGTGCTGCTAAGGTTGGTTGGTATGTATCTAA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Tertiary structure

PDB ID
65e580c6296b8cef1a37231aeb51a252e1f520d80ec290708e9ee9e3b1da90a1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5132
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50