Protein

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Genbank accession
AGG91306.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MATTEVFYNGDGSDLTFTIPFEYLEESDVKVSVGGTLKTQDTDYTFSTLTEITFTTAPPSGTNNVRIFRDTDIDSGVRNEFFAGSAIRAQDLNDDFLQVLYSAQEIEDQYVTKTDGEFDTNVDMNDNRVTEMADPVNAKDAVNKQYFEANSWDSDTETILSNETWNSVDNQIATTASIENRVTAKIDDAITNDIGTDGTGITVSDDGDGTITLGLAENTIDFDRIKNTDIITQAEQDAGTPAAADSNIFTALGAARRFDTLVQTGTPSGSDWETGKTWYQNDADKAVYIWDGNSWETVTSGGAFTRLDQVIYVDATNGDDANNGHRISTPKKTIRAALADINSDATYGNGSTILVAPGIYKETAPLDIQKTDVSIVGASVRNVIVHPTEATETNSLFRVNSGSYLANMTFTGVKASGTRGASGSLWTDSEYGLPPTQGWNVSFYPDAKIFKSPYIQNCTNFSDSEIDNDALDFYTGDSDRGQAGDLDSEPTGGGLLVDGSTVHDDSPLRSMVADSYTHVALNGPGIFVTNNGYAQITSSYSFFNHFHIGCLNGGQANLAASTSDFGRFSLVASGRSTSAIFSATTTVEAASGATTFTIGAPTAGSDWFGNATRPADNMLVQVSNNFYPIQSAVPNGSGWDVTIIRPDTTDRTQNLGLNGIVALGSSAFFYLRSMIASSGHTMEYVGAGTDYRALPYNATGTYTVGSGTQPNGVPIEAHQVKELDNGKVWAAITDHNGKFRVGDTFSVNQQTGFVSIPAGALSVSTLLEDLDVNGKEIKTDTTNQDIVLNPNGTGVVNVSTSKITNVVDPTDAQDAATKNFVDNLTTSSTTELNILDGATLNTSELNILDGATLDTNELNQLDGASLTDNPTWTSTTQFPSAASINTRFLGLLNALGGFVAIADENSFPNGNPDPSDGAGTVVSIADAGGMSVNASGEGTGQTTGGDTVTITGFPASFNSSTLPAQQGLQVQTTTTLNTYTYHKVIARDDDIVRLNDDVNDFFQRYRFGASNPTTDNDAGDLFFNTGSGTMLVWDTSGATNEWKEVQSIGEFFVIPTSEFPTWNGTINDITITNAPTNASQIILSINGVVQEPNTGTARPTDGFALDGSVIRLSDAPATGSEAWGVIIGSTVNIGEPSANTVSTDKIVDGAVTTAKLGSGAVTADKLADTAVTAGSYTLSSITVDAQGRITAASSGTAADPDIITEGNTSVEVVDTGSNGEVRLTTEGTRAMTIDSSQRAGLGTSSPTAPMHVKKADTSTSGLVDGIRLQQGSATNSNRLSLTFGSLDNFTVAGVNGVIETHSGTESNNVGRLEFYTKANGSSITERMRIDSSGNVGIGTTSPDHGKLTLFDSASAAFNALVIQQGNTGSTVSDGLHVGIDSNVDAYITHKENRALAFGTANTERLRILAGGGLTFNGDTATANALDDYEEGTWTPELADAVSGGNTVTHAVQDGKYTKVGNIVTCYFRITWSSKGSCADSSLLRVRNFPFTSLSNSGQFYYTGAITPLDGPTTLAMAGNGTDSILYDDNNPNTLQRFSNIPSSNTGGGINGCITYQAN
Physico‐chemical
properties
protein length:1558 AA
molecular weight: 163995,46440 Da
isoelectric point:4,23907
aromaticity:0,07702
hydropathy:-0,28639

Domains

Domains [InterPro]
IPR005604
4–110
IPR005604 IPR011050
AGG91306.1
1 1558
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIP2
[NCBI] 		754040 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGG91306.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ317389 [NCBI]
CDS location
range 3483 -> 8159
strand -
CDS
ATGGCTACAACTGAAGTATTTTACAACGGTGACGGTTCCGACCTCACCTTTACAATCCCATTTGAATATCTAGAGGAATCCGACGTCAAAGTTTCTGTCGGAGGTACCTTAAAAACTCAAGACACTGATTACACGTTTTCAACTCTAACTGAAATTACGTTTACTACTGCTCCCCCGAGTGGTACTAATAACGTACGGATTTTTAGGGATACGGATATTGACAGTGGAGTCCGCAACGAATTTTTTGCGGGCTCTGCCATCCGTGCTCAGGATCTTAATGACGACTTCCTGCAGGTCTTGTACTCTGCACAGGAAATTGAAGACCAGTATGTAACTAAAACCGACGGTGAATTTGATACCAACGTCGATATGAATGACAACCGGGTCACCGAAATGGCTGACCCTGTTAACGCTAAAGATGCTGTTAACAAGCAGTATTTTGAAGCTAACAGCTGGGATTCAGATACTGAAACTATTCTTAGCAACGAAACTTGGAACAGCGTTGACAATCAAATTGCAACCACGGCTTCTATTGAGAACCGTGTTACTGCAAAGATTGACGACGCTATCACCAACGATATTGGTACCGATGGTACTGGTATCACTGTAAGTGATGATGGTGACGGTACTATCACTCTTGGTCTTGCGGAAAACACGATCGATTTTGATCGGATTAAAAACACCGACATTATCACTCAAGCTGAGCAAGATGCAGGTACTCCTGCTGCAGCTGATTCTAACATCTTTACTGCACTAGGTGCTGCACGTCGTTTTGATACTCTTGTACAAACTGGTACGCCTAGCGGATCTGATTGGGAAACTGGTAAGACTTGGTATCAAAATGATGCAGACAAAGCTGTTTACATCTGGGACGGCAACAGCTGGGAAACTGTCACTTCTGGTGGTGCCTTCACTCGTCTTGATCAAGTCATTTATGTTGACGCTACTAACGGTGATGACGCCAATAATGGTCACCGTATCAGTACTCCTAAGAAGACCATTAGGGCTGCTCTTGCTGATATTAACTCCGACGCTACTTACGGAAACGGTAGCACCATTTTAGTTGCTCCTGGTATCTACAAAGAAACCGCACCTTTGGACATTCAAAAAACTGATGTCTCTATTGTCGGTGCGTCTGTTCGTAACGTTATTGTACACCCGACTGAGGCAACTGAAACCAACAGCTTGTTCCGTGTAAACAGCGGTTCGTACCTTGCTAACATGACGTTTACTGGCGTCAAGGCTAGCGGTACCCGTGGTGCTAGCGGTTCTCTGTGGACTGATTCTGAATACGGTCTACCGCCTACTCAAGGTTGGAACGTTTCGTTCTATCCTGATGCTAAGATTTTCAAATCTCCTTATATTCAGAATTGTACTAACTTCTCGGATAGTGAGATTGACAACGATGCTCTGGACTTCTACACGGGTGATTCCGATAGAGGTCAAGCAGGTGACCTTGACTCCGAACCTACTGGTGGTGGTCTGCTAGTTGACGGTAGTACTGTTCACGACGACTCTCCACTTCGTTCGATGGTGGCTGATAGCTACACTCACGTGGCTTTGAATGGTCCTGGTATTTTTGTTACCAATAATGGTTACGCTCAAATTACTAGCTCCTACTCATTCTTTAACCACTTCCACATTGGTTGTTTGAATGGTGGTCAAGCTAACCTTGCAGCTTCCACTTCTGACTTTGGTCGGTTCTCGTTGGTTGCAAGTGGCCGTTCGACCTCTGCCATTTTTAGTGCAACTACAACCGTAGAAGCTGCCTCTGGTGCTACCACGTTTACTATTGGAGCTCCTACGGCTGGTAGCGACTGGTTTGGTAATGCTACCCGACCTGCAGACAACATGCTTGTTCAGGTTAGTAATAATTTCTACCCTATCCAGTCTGCTGTACCCAACGGTAGTGGGTGGGATGTGACTATTATCCGCCCAGATACTACTGACCGTACCCAAAACCTTGGTCTTAATGGTATTGTTGCTCTCGGTTCGTCTGCTTTCTTTTACCTTCGGTCTATGATCGCTTCTAGCGGTCACACGATGGAGTATGTGGGTGCTGGTACTGACTACCGTGCACTTCCTTACAACGCAACTGGTACTTATACTGTTGGTTCTGGTACTCAGCCTAATGGTGTTCCTATTGAAGCACATCAGGTTAAAGAACTAGACAACGGTAAAGTTTGGGCAGCTATTACTGATCACAACGGTAAGTTCCGTGTGGGTGATACTTTTAGTGTTAACCAGCAAACTGGTTTCGTCAGCATTCCGGCAGGTGCATTGTCTGTCAGCACCTTGCTGGAAGACCTGGATGTTAACGGCAAAGAGATTAAAACTGACACTACCAACCAAGACATCGTTCTTAACCCGAATGGTACTGGTGTAGTTAACGTTAGCACCAGTAAAATTACTAACGTTGTTGACCCTACCGATGCTCAGGATGCAGCAACCAAGAATTTTGTTGACAACCTTACCACGTCAAGCACTACTGAGCTGAACATCCTTGATGGTGCAACGCTTAATACCAGTGAGTTAAACATTCTTGACGGTGCAACTCTTGACACTAATGAGCTAAACCAGCTTGATGGTGCGTCACTGACTGATAATCCTACTTGGACTTCTACTACTCAGTTCCCCAGTGCTGCATCTATCAACACCCGTTTCCTTGGGTTGTTGAATGCTCTTGGTGGTTTTGTTGCTATTGCTGACGAGAACAGCTTCCCGAACGGCAACCCTGATCCTTCGGACGGTGCTGGCACTGTTGTGTCTATTGCCGATGCTGGTGGCATGTCCGTCAATGCAAGCGGTGAAGGTACTGGTCAAACCACTGGTGGTGATACTGTTACCATTACTGGTTTCCCAGCTAGCTTCAACAGCTCTACGCTTCCTGCACAACAGGGTCTGCAAGTTCAGACTACCACTACTCTTAATACCTACACCTACCACAAGGTTATCGCCCGTGATGACGATATTGTTCGTCTAAACGATGACGTTAACGACTTCTTTCAACGCTATCGTTTTGGTGCCTCTAACCCTACTACTGACAACGATGCTGGTGACCTGTTCTTTAACACGGGTTCTGGCACGATGCTGGTGTGGGATACTTCTGGTGCTACTAACGAGTGGAAAGAAGTTCAGTCTATTGGTGAGTTTTTTGTCATTCCTACTAGCGAGTTCCCGACGTGGAATGGTACTATTAATGACATCACTATTACCAATGCACCGACTAATGCTTCCCAGATTATTCTGTCTATTAACGGTGTAGTCCAGGAACCTAACACGGGTACTGCACGTCCTACTGACGGTTTTGCTCTTGATGGTTCTGTCATTCGACTGTCTGATGCACCTGCTACTGGTTCAGAAGCTTGGGGTGTAATCATTGGTTCTACCGTCAACATTGGTGAACCCAGTGCAAACACGGTGAGCACTGATAAGATTGTTGATGGTGCTGTTACGACAGCTAAACTTGGTTCAGGTGCAGTCACCGCTGACAAGCTGGCTGACACCGCTGTAACCGCTGGTAGCTACACGCTGTCCAGCATCACGGTTGACGCCCAGGGACGTATTACTGCTGCTTCTAGCGGTACTGCTGCTGACCCTGACATCATCACCGAAGGCAACACCAGCGTTGAAGTTGTTGACACTGGTTCTAACGGTGAGGTTCGGCTAACGACCGAAGGCACCCGTGCAATGACGATTGACTCGTCGCAGCGTGCAGGTCTGGGGACCAGTAGCCCCACTGCGCCGATGCACGTCAAAAAAGCAGATACAAGCACGTCAGGACTAGTTGATGGGATTAGGCTGCAACAAGGATCTGCAACTAACAGCAACAGGCTTTCTCTCACTTTCGGCTCTTTAGATAATTTTACTGTTGCTGGCGTAAACGGCGTAATTGAAACTCATTCAGGGACAGAATCAAATAATGTAGGCAGATTAGAGTTCTACACAAAAGCAAACGGAAGCTCCATCACCGAACGCATGAGGATTGACTCCTCAGGCAACGTAGGGATTGGCACCACGAGTCCTGATCACGGCAAATTAACCTTATTTGACTCTGCCTCTGCTGCTTTTAATGCGCTAGTTATTCAGCAAGGAAACACTGGAAGTACTGTTTCTGATGGTCTTCATGTTGGCATTGATAGTAACGTTGACGCATATATTACGCACAAAGAAAATAGAGCACTTGCATTTGGAACTGCTAACACAGAACGCCTCCGCATCCTTGCTGGTGGCGGTCTAACCTTCAACGGCGACACGGCTACTGCTAACGCGCTGGATGATTATGAGGAGGGGACTTGGACTCCAGAGCTTGCAGATGCAGTATCTGGAGGCAACACCGTAACTCACGCCGTGCAAGATGGAAAATATACTAAAGTCGGCAATATAGTCACCTGCTATTTTAGGATTACTTGGAGCAGCAAAGGATCATGCGCAGACAGTAGCCTTTTGAGAGTGCGCAACTTCCCTTTTACCAGCCTTAGCAATAGTGGTCAATTCTATTACACAGGGGCAATAACCCCCTTGGATGGACCTACGACTCTAGCTATGGCAGGCAACGGAACTGACAGCATTTTGTACGACGATAACAATCCCAATACGCTTCAAAGGTTTTCAAATATACCGTCGTCAAACACTGGTGGCGGCATTAATGGCTGCATAACCTATCAAGCTAACTAA

Tertiary structure

PDB ID
88f94d0a3a69902a5d6fc7e22a30ade776ad73c7afa239556b6fcd71426b4e72
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7782
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-RIP2 isolate N1_2007 Henn,M.R., Marston,M., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Fitzgerald,M.F., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Neiman,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2021-02-24 — GenBank