Protein

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Genbank accession
AGN12305.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTRFRSGRVPHQHIGISSFTEDKLVLDVIGNATISGTLSVGVGTNNSGNGNISIGGTTGTIGQYLKSTGVGVTWADFADVRDSQSFVATAGQTTFVFTANELNQYNPNFIDVYVNGVKLINSEYDAFNGSNVVLKSACFAGDIVELISYNTNQITNGMGGSTIGINTFATSTFTHIGASGVVTATTYYGDGSNLTGVTTSLRSEYADVSGISTISQGLTGTPDIAVRNINVGIATFTGNLDAVDASFSGNVSIGGTLTYEDVTNIDSVGLITARNGIDVTGPIKGFSYTQSPYSNTVETIIVKVVTKTAAHRYNGNGSSLGYTFDGVESPFLTLTPGKTYRFDQSDNSNLTHQLRFYLDPEKVVEYLRTPGEIVYSGAAGSNGSYTEIQILDDTPTVLYYQCVNHSYMGNAVQVNTGHAIGFATAASIDTSGIITAFRYYGDGTYLSGVQSQLVIQEEGGAVGTAGTINFVGVGVTASVTDDIATIQVGNHFAVTAGIATVAEGITGSPNASFSGITATGLQMTGLCTAGTFVGNLVGGVAGGNWGGYDSTATNNVSAGQNVSAGQSVTAGNGFYGDGSGITNLVTTSDTAPSNPTDGNLWWKSDEGQLKIYYQDADSAQWVDANASGGAGSSGGSSDLLNDTTPQLGGTLDLNNRDITGTGNISINGGLTLIGGTSNIGNVYSTGIVTASTFYGNIVGDLSGTSTGNVTGTVNATGLSTFTTLDINGDVNVSGASTITGALDVTDSVDAHSINVSTAVTAISFHGDGQYLTNIYSAPPQGISTTGYTGLTNLFCGGYLEVDGQSILDDVIVSAAATFQGALSANTGPVTLNNATINGTTNVTGPSTLTTVNVVGHSELDNVNISGVATAIGFVGPLTGNAATASNLSGSPSISVTNVSAGIITATNGYYGNVNVNNQNIEVGNCTTQGTDNTIKVGSSALEIFHRPAAYATYLQNKADTNLFITGNDATGTWGNIFIRPYLSNFSGVACWWGGATELFYGNNNTKRLETTSGGVNIIGTLSKSGGSFKIPHPVSGLSTTKHLVHSFLEGPQMDLIYRGKVDLVGGTATVNIDTKAGMTEGTFVLLNRDVQCFTTNETGWTAVKGSVTGNEITIVAQDNSCTDTISWMVVGERQDDTVKALDMTDSEGNLIVEPDQPAADTKHADVQAQL
Physico‐chemical
properties
protein length:1170 AA
molecular weight: 120490,79270 Da
isoelectric point:4,36242
aromaticity:0,07778
hydropathy:-0,01650

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM5
[NCBI] 		536454 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN12305.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ632825 [NCBI]
CDS location
range 118778 -> 122290
strand -
CDS
ATGACAAGGTTTAGAAGCGGAAGAGTCCCCCATCAACATATCGGTATTAGTTCTTTTACCGAAGATAAGCTTGTCCTTGATGTAATAGGTAATGCCACGATTAGTGGTACTTTAAGTGTTGGTGTTGGAACTAATAATAGTGGTAATGGTAATATTAGTATTGGTGGAACTACTGGAACAATAGGTCAGTATTTAAAATCCACTGGTGTTGGAGTTACTTGGGCTGATTTTGCTGATGTAAGAGATTCTCAATCCTTTGTTGCAACTGCAGGACAAACAACATTTGTATTTACTGCAAATGAACTTAATCAATATAATCCAAATTTTATTGATGTATATGTTAATGGTGTTAAATTAATTAATAGTGAATATGATGCATTTAATGGATCTAATGTAGTTTTAAAATCTGCGTGTTTTGCTGGAGATATTGTTGAGTTAATTTCTTATAATACAAATCAAATTACTAATGGTATGGGTGGAAGTACCATTGGTATTAACACCTTTGCTACATCAACCTTTACTCATATAGGTGCAAGTGGGGTTGTAACTGCTACAACTTATTATGGTGATGGATCTAATTTAACAGGAGTAACAACTTCTTTACGTTCTGAGTATGCTGATGTATCTGGCATTTCAACTATCTCTCAAGGGTTAACTGGAACACCTGATATTGCAGTAAGAAATATTAATGTTGGTATTGCAACTTTTACTGGGAACCTTGATGCTGTTGATGCTTCCTTTAGTGGAAATGTATCTATCGGTGGAACATTAACATACGAAGATGTAACAAATATAGATTCAGTTGGACTTATAACTGCTAGAAATGGTATAGATGTAACTGGTCCTATAAAGGGGTTTAGTTATACTCAATCACCATATAGTAATACTGTAGAAACAATAATAGTAAAAGTAGTAACTAAAACTGCAGCACACCGATATAATGGTAATGGTAGTTCACTTGGATATACTTTTGATGGTGTCGAATCTCCTTTCCTCACGTTAACACCTGGTAAAACTTATAGATTTGATCAATCAGATAATTCAAACCTTACACATCAATTAAGATTTTATTTAGATCCTGAGAAGGTAGTAGAATATCTTAGAACTCCTGGTGAGATTGTTTATAGTGGAGCAGCAGGTTCTAATGGTTCTTATACTGAAATTCAAATACTTGATGATACCCCAACGGTCTTATATTATCAATGCGTAAACCATTCTTATATGGGTAATGCGGTTCAGGTTAATACTGGACACGCTATTGGATTTGCAACAGCAGCATCTATAGACACATCTGGTATTATAACTGCATTTAGATATTATGGTGATGGAACATATCTAAGTGGAGTACAATCTCAACTTGTAATACAAGAAGAGGGTGGTGCTGTAGGTACTGCTGGAACAATTAATTTTGTTGGTGTTGGTGTAACAGCATCGGTTACTGATGATATTGCAACAATTCAAGTTGGTAATCATTTTGCTGTTACTGCTGGTATTGCTACTGTTGCTGAAGGGATAACAGGATCTCCAAATGCTTCATTCTCTGGTATAACTGCAACAGGATTGCAGATGACTGGATTATGTACTGCTGGTACTTTTGTTGGTAACTTAGTTGGTGGTGTTGCTGGTGGTAATTGGGGTGGATATGATTCAACTGCTACTAATAATGTAAGTGCTGGTCAAAATGTAAGTGCTGGTCAATCAGTAACAGCAGGAAATGGATTCTATGGTGATGGTTCTGGTATAACAAATCTTGTTACAACCTCAGATACCGCACCAAGTAATCCTACTGATGGTAATCTTTGGTGGAAATCTGATGAAGGTCAATTAAAAATATATTATCAAGATGCTGATAGTGCTCAATGGGTAGATGCAAATGCTAGTGGTGGAGCTGGTTCTTCTGGTGGATCTAGCGATCTATTAAATGACACAACACCACAGTTGGGAGGAACACTAGATCTTAATAACCGTGATATTACTGGAACTGGTAATATATCCATTAATGGAGGTTTAACTTTAATTGGTGGTACAAGTAATATAGGTAATGTATACTCGACTGGTATTGTAACTGCTTCAACTTTCTATGGAAACATTGTAGGTGATCTTAGTGGTACTTCTACTGGTAATGTAACTGGAACTGTTAATGCTACTGGATTATCTACTTTTACTACCCTTGACATAAATGGTGATGTTAATGTTAGTGGTGCATCTACTATAACTGGTGCTCTTGATGTAACTGATAGTGTTGATGCACATAGTATAAATGTTTCTACAGCAGTAACGGCAATATCATTCCACGGTGATGGACAATATTTAACTAACATATATTCTGCACCTCCACAAGGTATTAGTACAACTGGATATACTGGATTAACAAATTTATTCTGTGGTGGATACTTAGAGGTAGATGGTCAATCTATCCTTGATGATGTTATTGTATCTGCTGCTGCAACTTTCCAAGGTGCTTTAAGTGCTAATACAGGACCAGTTACTCTTAACAATGCAACTATTAATGGTACTACAAATGTAACTGGTCCATCTACGCTTACAACTGTTAATGTGGTTGGTCATTCAGAATTAGATAATGTAAATATTTCTGGTGTTGCTACTGCTATAGGTTTTGTTGGACCTTTGACTGGTAATGCTGCTACTGCTTCTAATTTAAGTGGATCCCCAAGTATTAGTGTTACGAATGTATCTGCTGGAATTATAACTGCAACTAACGGTTATTATGGAAATGTAAATGTTAATAATCAAAATATTGAAGTTGGTAATTGTACCACTCAAGGAACCGATAATACTATAAAGGTAGGATCTAGTGCATTAGAAATTTTCCATAGACCTGCTGCATATGCAACTTATCTTCAAAATAAAGCAGATACAAACCTCTTTATAACTGGTAATGATGCTACTGGAACTTGGGGTAATATATTCATTAGACCTTATCTAAGTAACTTTAGTGGAGTTGCTTGTTGGTGGGGCGGTGCTACAGAATTATTCTATGGTAATAATAACACTAAGAGATTGGAGACGACTTCTGGTGGTGTTAATATTATTGGAACCCTGAGTAAGAGTGGTGGATCGTTTAAGATTCCTCATCCAGTATCAGGATTATCTACCACTAAGCACTTAGTTCATTCTTTCCTTGAAGGTCCACAAATGGATCTTATCTATCGTGGTAAGGTTGATTTGGTTGGTGGTACTGCTACAGTTAATATTGATACCAAGGCTGGTATGACTGAAGGGACATTTGTTTTATTAAATAGAGATGTTCAATGTTTTACTACAAATGAAACTGGGTGGACAGCAGTGAAGGGTTCTGTAACTGGTAATGAGATTACTATAGTTGCACAAGATAATAGTTGTACTGATACTATTTCTTGGATGGTTGTTGGTGAAAGACAAGATGATACTGTTAAGGCATTAGATATGACTGATAGTGAGGGTAACTTAATTGTTGAACCAGATCAACCAGCAGCAGACACAAAACATGCTGATGTTCAAGCACAGTTATAG

Tertiary structure

PDB ID
2e439f1e223e9b9454e4cbf068c1082c7a57964ad70cd2c30079f501f7513857
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5387
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Prochlorococcus phage P-SSM5 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank