Protein

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Genbank accession
UYE94917.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,80
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLGFTKGGQVDGNVTINGLLKLNGDYVQTGGMTVNGPIGSTEGVSALVFRSMRGSFYARATNDTSNAHLWFENTNGSERGVLYSKPQSENEGVITMRVRQGTAAGAQNSEFHFISTDGGIFQARKLTALTSISTPTISVNLINHDYKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTMWHELCTAQTGQADEMSWWTGNTPSSKQYGIRNDGRMAGRNSLALGTFTTGFPSSDYGNVGVMGDKYLVLGDTVTGLKYIKQGVYDLVGGGYSVASVTPDSFRSTRKGIFGRSEDQGATWNMPGNNAAFLSVQTQADENTAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLVTGSNNVQFYADGTISSIQPVKLDNELFLNSSNNTEGLKFGAPSKVDGSRTIQWNAGTRAGQNKSYLTMKAWGNAFDPTAGNRETVFELYDGQGYHFYSQRLAPTGSETVGSLQFRISGALRVGGGIISAGSIVSESSLVANNGLSVNGQAKFGGTANALRIWNAEYGAIFRRSETALHIIPTLKDQGENGEIGNLRPLSIALHNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMVTVDNDSKLVVITSHSRISPNYRMQLGQSAYIDAECTDTARPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAVIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKIDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAVMEGQTFDTDLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASNTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAESNIAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1062 AA
molecular weight: 112554,82050 Da
isoelectric point:8,31212
aromaticity:0,08192
hydropathy:-0,42806

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
704–1062
IPR051934
SSF88874
803–934
SSF88874 SSF88874
IPR037053
810–863
IPR037053
IPR011083
815–862
IPR011083
UYE94917.1
1 1062
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM-pJBB
[NCBI] 		3458551 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE94917.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP114733.1 [NCBI]
CDS location
range 15303 -> 18491
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGACGATTCAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTACTAAAGGCGGGCAAGTTGATGGAAATGTAACTATCAATGGTCTTTTGAAATTAAACGGCGATTATGTACAAACAGGTGGAATGACCGTAAATGGACCTATTGGTTCTACTGAAGGCGTATCCGCCTTAGTTTTTAGATCTATGCGAGGGTCATTTTACGCAAGAGCAACAAATGATACTTCCAATGCCCATCTTTGGTTTGAAAATACAAATGGATCAGAGAGAGGTGTTTTATATTCAAAACCGCAGTCTGAAAATGAAGGCGTAATTACAATGCGCGTTCGTCAAGGAACCGCAGCAGGGGCTCAAAATTCAGAATTTCATTTCATTTCTACTGATGGCGGTATCTTCCAGGCACGCAAATTAACTGCTTTAACTTCTATTAGTACACCAACTATTAGTGTTAATTTAATTAATCATGATTATAAAGCCTTTGGACAATACGATTCGCAATCATTAGTTCAGTATGTTTATCCTGGAACTGGTGAAACTAACGGAGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGCACTATGTGGCATGAGCTTTGTACTGCTCAGACTGGCCAGGCTGATGAAATGTCTTGGTGGACAGGTAATACTCCATCATCTAAACAATATGGCATTCGTAATGACGGACGAATGGCAGGCCGTAATAGCCTTGCATTAGGTACATTCACTACGGGTTTCCCGTCTAGTGATTATGGTAACGTCGGTGTAATGGGCGATAAGTATCTTGTTCTCGGTGACACTGTAACCGGTCTGAAATATATTAAGCAAGGTGTTTATGATTTAGTTGGTGGAGGTTATTCCGTTGCATCTGTTACTCCAGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTATATTTGGTCGCTCAGAAGACCAAGGTGCTACATGGAACATGCCTGGAAACAACGCCGCGTTTTTATCGGTTCAAACACAAGCTGATGAAAACACTGCTGGAGACGGCCAGACACATATTGGCTATAACTCAGGCGGTAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCAAAACTAACATTAATACCCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCCGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTAATAATGTACAGTTTTATGCTGACGGCACTATTTCCTCTATCCAACCTGTTAAATTAGACAACGAATTATTTTTAAATAGTTCTAATAATACCGAAGGCCTTAAATTTGGTGCCCCTAGCAAAGTTGATGGCTCGAGAACTATCCAATGGAACGCCGGGACCCGTGCAGGACAAAATAAAAGTTATCTAACTATGAAAGCTTGGGGTAATGCATTCGACCCTACTGCCGGTAATCGTGAAACCGTATTTGAATTGTATGACGGTCAGGGCTATCATTTTTATTCTCAACGTTTAGCTCCAACGGGTTCTGAAACTGTGGGTTCTCTTCAATTTAGAATTTCTGGCGCTTTACGTGTGGGTGGTGGTATTATATCGGCCGGTTCTATTGTTAGTGAATCAAGTTTAGTTGCAAATAATGGATTATCTGTAAACGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACAGCAAATGCATTGAGAATTTGGAACGCCGAATATGGCGCAATTTTCCGTCGTTCAGAAACGGCATTGCACATTATTCCTACTCTTAAAGACCAAGGAGAAAATGGTGAAATAGGTAATCTTCGTCCATTGAGCATCGCACTTCATAACGGTATGGTTCAAATGCGTCATTCCGTCACGTTAGGTGATGACGGTGCAGGCGGTAATATGGTGACCGTTGATAATGATAGTAAACTTGTTGTTATAACTAGTCATAGTCGCATTTCTCCTAATTACCGTATGCAATTAGGACAATCGGCATATATCGACGCTGAATGTACTGATACTGCACGACCTGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCGTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGTGACGGCGTTTCTACTGGTGCTGTTATAAAGGATCTTGGATGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTATTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGACGGTAATATTACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGATAGATATTGTGTCGAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCGTCATGGAAGGCCAGACGTTTGATACTGACTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAACACGGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGCGGTAATACTAGTTCCGCCGGTGCGCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAATGGTGCTACTGCAGAGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGATGGTGCCCACACTCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
e2960c1e12c40a2d3a02f19336f84ac97b77c1fab5cf3d08332fec62096251c3
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5224
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Escherichia phage vB_EcoM-pJBB, a member of Mosigvirus Park,S.Y., Kwon,H.M. and Kim,J.H. 2019-03-28 — GenBank