Protein

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Genbank accession
CAL9954940.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPRKQSTNRNVGNVQKFVGTSYDEMKALYDNLDALLALETGVQYTLRYLGPSAGDAPSTREDGSPIQDGDYFFDTDADALVYYDAVDDIWFAVDPSEVIQARDEAIAASIVAGQAKDNAELAANNARLSENTAKVYETNAEASKDAAGLSEMSAGLSATDAATYAAQSAIDASNTAADVMTTNADVVTTTDNAATTSTHAINAKNSETAAALSAQQAEQAFDSFDDRYLGTFSTPPTTDNDGDPLVKGATYYNSVELAVYYWNGAVWEAPDKSASDSADAAAASAATATTKAGEASNAATTALNAQTAAKSSENAAQSSQNAAEAAEVGAELAESNAATSEANAAESETVARASENNAANSAASAKENADRSEQHAAGGKGLTLAIRDALRAQRKREYTGSGFTEWGNQYDYNDGDPVQHGLWTYYGSTGSANELGLGADPSVDPNNLQGESRTDYPIANVDGVEMSLIGSTTSTPAYKNANKILFPTAPDGSKTLNESTGEVRKYHDLAGVGTPYEAHTVDFDGSTYIDLVASPYVMPVGSKVEFKFKLNDVSGYQYLFDTQNLTRVYIYKTTGTNNLLWGGFGSTIKVNGVDISTNTFAVEAGVEYHIEATTNATSNIDRIGAKSAGGVLSDFARGQIWDITLASSEDGVEPITYNTVTTQPKDDAAPVVSEIDAGDNPDMPTGYMPFYQDAGYVTIPEFPLADSMNISMVMRPDNDTELMVFGQNPEGQTMRLYWYNDTSSGLFRIAAGSGTSLTFDPLVAGRVYVTEVQIRKNVGASDYTVTAQVNGVIKTQSNVTFGHNTFDSFTLGSEEGVKNNNRWDGAIFGFGIEYPDAPDLNRTYGSVEVDDPAGRLTVEDDLGFGTEDWTPEFDGFNNVIVPPVMNFTGIARELEMTVVPDNVGSSWRIGQTFSKDGEVNRFYLRYDASGTITAGIGNATIQSVLNMTVGETYNFKFICDNSLNIELFVNGVSTITGTTSFRADFVLDNFYLGAAGTADSGPSEHLNGKLTNVRITDPNSVANSRHYPLVINQPTQPDTLIAEDAGYDKDTAPFYTPSYSNTDGWVEIPEITLGSGDAIKLKFQWEDEGKAYDGILDNASVPSLHLRIHNDGRLRWTNHGTLRVNGTVYTDGSFYPVSGEVYEVEIALDRNLTLARIGRLYNGNHWSGKIWDIEFTDNTDPTNSRYYPSVDYRVDGDTSGTVLDETHGLLSDSFSDGRWVESAAGTINGESLTITSSFGSGRVGTFPSPAINGVDVTVSFDVVSYSGTTNGGRVIVYRNGSQDGNLGTFDSSDVGTRVTLTANPTGNYGSDGNDVVFYVDASGISFEVANVEVSANNNGTLVNFPSGSEWTLAQVDGASDGTLENFTAGLEWNNDLPITDGTMVGFAQPWHHETGRYIGSIIGETTQAVWDVQDSQKAFHDVKYNADFHVITSRKDLVFLETWLEKVEGFVRPYGNVQFGGSSHDGVTLVPVTNFKAQGYSAFGEWDENTVGKVADWDAMTPTQKSVWASNPKNNLVFNPEDNEYYQDSYRIRTVEGLGDEWACVRPTIASTGTPTWLGYAQSGTNSRYIVQRGQREDTRDWYKDNTVSGTIFGGTNRSGFNDDEPTIFQNTEGANTSSANGKCFAMPIALVQRLNQGAYHPTYNPQGCDGFISSGGGSLARWYVSTLFRDATTTENCFRLRVGYPAIDGFRYGHGFIGSAGGSGRADQYKYYDAIYAGQVEDLRLNANKQDKQELLTDAVRRGVRGETRGKGKVPFTTVQTADQAATGSPTSAFDGIDTSHITVGDMCWAEDAAGDYQRRTITYAGSNGTISFNETIQGRKSDSKLIHERELSAEYDSLPWVDLIGDPERIAATFPDGVVGQWIPDLTTGNSDRDLNRKGIVLTGTLFTENDGASWTVESKAINSTTNTVNTFLDSSLLRLYLLTYEALSDFTESDDNLAVVGDLGDVYNAKFYTIERGNRIAPSLLGVILKDNRDPTHHQLRVNSYSIHPANGDLDGGSGYLPIHEPIRLPAPANDSDAVKALPHLVEKDGLLYVQWHGTQLFYDAAGTVGNEWGDTFAGTTFTNAYGKISIVDGEDTKPDENGNTVKVVTHTETIPIGIANHNQDI
Physico‐chemical
properties
protein length:2109 AA
molecular weight: 227468,22870 Da
isoelectric point:4,42141
aromaticity:0,09768
hydropathy:-0,42632

Domains

Domains [InterPro]
IPR013320
880–1017
IPR013320
CAL9954940.1
1 2109
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage D502
[NCBI] 		3105266 Viruses > unclassified bacterial viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL9954940.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ195716.1 [NCBI]
CDS location
range 2364 -> 8693
strand +
CDS
ATGCCACGTAAACAGTCAACCAACAGAAATGTTGGTAATGTACAAAAATTCGTAGGGACATCCTACGATGAAATGAAAGCCCTTTACGATAATCTTGATGCGTTGTTGGCATTGGAAACAGGTGTCCAGTACACATTACGTTACTTAGGCCCATCTGCCGGAGATGCTCCGTCAACTCGTGAAGATGGTTCACCAATCCAAGATGGTGATTATTTCTTTGATACAGATGCGGATGCCTTGGTGTACTACGATGCAGTTGATGACATTTGGTTTGCAGTTGACCCAAGTGAAGTTATTCAAGCTCGTGATGAAGCTATTGCTGCATCTATCGTTGCAGGCCAAGCAAAAGACAATGCAGAATTAGCGGCAAACAATGCACGCTTATCTGAAAATACTGCAAAAGTGTACGAGACCAATGCTGAAGCATCAAAGGATGCAGCAGGGTTGTCTGAAATGTCTGCAGGCTTGAGCGCAACAGATGCCGCTACATATGCAGCACAATCAGCAATTGACGCGTCAAATACTGCCGCAGATGTCATGACAACAAATGCAGATGTGGTGACTACAACAGATAACGCTGCGACAACTTCTACCCATGCAATCAATGCAAAAAATTCTGAGACGGCTGCAGCTCTTTCAGCTCAACAAGCAGAACAGGCATTTGATAGTTTCGATGACCGTTACCTGGGTACGTTTTCTACCCCGCCTACAACAGACAATGATGGTGACCCTCTAGTAAAAGGCGCTACTTACTACAACTCTGTGGAATTAGCGGTGTACTACTGGAATGGTGCTGTATGGGAGGCACCTGATAAGTCTGCATCTGATTCGGCTGATGCGGCAGCAGCGAGTGCAGCCACAGCTACAACTAAAGCCGGTGAAGCGTCAAACGCAGCAACTACAGCTTTAAATGCACAGACAGCGGCAAAGTCTTCTGAAAATGCAGCGCAGTCTTCACAGAATGCAGCGGAAGCGGCAGAAGTGGGCGCAGAACTTGCTGAGAGTAACGCAGCAACAAGTGAAGCCAATGCTGCTGAATCAGAAACTGTTGCTCGTGCAAGCGAAAACAACGCGGCTAATTCGGCTGCTTCTGCCAAGGAAAATGCTGACCGTTCTGAACAACATGCTGCGGGTGGTAAAGGTTTGACTTTAGCCATACGTGACGCACTTCGTGCCCAACGTAAGCGTGAATACACAGGTTCAGGTTTCACGGAGTGGGGTAATCAGTACGATTACAACGATGGAGACCCTGTACAACACGGGCTATGGACGTACTACGGTAGTACGGGTTCAGCAAATGAACTGGGTTTAGGTGCAGACCCTTCAGTTGACCCTAATAACTTACAAGGGGAGTCTAGAACTGATTACCCTATTGCAAACGTTGATGGTGTGGAAATGAGCCTCATCGGTTCAACTACATCTACACCTGCGTATAAAAATGCAAATAAAATCTTATTCCCAACAGCACCAGACGGTTCTAAGACACTAAACGAAAGCACAGGTGAAGTACGTAAGTACCATGACCTAGCAGGTGTGGGTACTCCATACGAAGCTCATACGGTTGACTTCGACGGCTCTACTTACATTGACCTAGTAGCCTCGCCTTACGTGATGCCTGTAGGTTCTAAGGTTGAGTTTAAGTTTAAGTTAAATGATGTGAGTGGCTATCAATATCTATTTGATACGCAAAATTTAACGCGAGTTTACATCTACAAAACAACAGGAACTAATAATCTTTTATGGGGTGGTTTTGGTTCTACCATAAAGGTTAACGGCGTAGATATTTCAACTAATACATTTGCTGTAGAGGCTGGTGTTGAATACCATATTGAAGCAACTACAAACGCTACATCAAACATAGACCGTATTGGCGCTAAATCAGCAGGTGGCGTATTAAGTGATTTTGCGCGTGGTCAAATCTGGGATATCACTCTAGCTTCTAGCGAAGATGGTGTTGAACCGATTACGTACAACACAGTAACTACTCAACCTAAAGATGATGCAGCTCCTGTAGTGTCTGAGATTGATGCAGGTGACAATCCTGACATGCCGACTGGTTACATGCCTTTCTATCAGGACGCTGGTTACGTAACTATTCCAGAGTTCCCACTGGCTGATAGCATGAATATTAGTATGGTTATGCGACCTGATAACGACACTGAACTGATGGTATTCGGTCAGAACCCTGAAGGACAAACAATGCGTTTGTATTGGTACAACGATACATCATCAGGGTTATTCAGAATTGCAGCAGGTTCAGGGACAAGTTTAACTTTTGACCCTCTGGTGGCAGGTCGTGTTTACGTTACAGAGGTACAGATTCGTAAGAATGTAGGTGCAAGTGACTACACGGTTACAGCACAAGTAAATGGGGTTATTAAAACTCAGTCCAATGTTACGTTTGGTCATAACACATTTGATTCGTTTACCCTAGGTTCAGAAGAAGGTGTCAAGAACAATAACCGTTGGGACGGTGCTATCTTCGGATTTGGTATTGAATACCCTGATGCTCCAGACCTTAACCGTACCTACGGTTCAGTTGAAGTTGATGACCCTGCGGGACGATTGACTGTAGAAGATGACTTAGGTTTTGGTACGGAAGATTGGACACCTGAATTTGATGGTTTTAATAACGTAATTGTACCACCAGTAATGAACTTTACTGGTATAGCACGGGAACTTGAAATGACAGTAGTTCCCGATAATGTCGGTTCATCATGGCGTATAGGTCAAACGTTTTCTAAGGATGGTGAAGTTAACCGTTTTTATCTCCGTTATGACGCATCTGGAACGATTACAGCGGGTATTGGTAACGCAACAATACAGTCAGTTCTTAATATGACTGTTGGTGAAACATATAACTTTAAGTTCATATGCGATAATTCACTTAATATTGAACTGTTTGTTAATGGAGTTAGTACCATAACAGGTACTACATCATTCCGTGCAGACTTTGTTCTTGATAATTTCTATCTGGGTGCTGCGGGTACAGCAGATAGTGGTCCGTCAGAACACTTAAATGGTAAACTTACGAATGTACGTATTACTGACCCCAATTCAGTTGCTAACAGTCGTCACTATCCACTAGTAATCAATCAGCCTACACAGCCTGATACATTGATTGCAGAGGATGCGGGTTACGATAAAGACACAGCACCTTTCTATACCCCTTCTTATTCTAACACTGATGGTTGGGTAGAAATTCCAGAGATTACACTGGGTTCAGGCGATGCTATTAAACTGAAATTCCAATGGGAAGATGAAGGTAAGGCATATGATGGCATTTTAGATAATGCAAGCGTACCTTCATTGCACTTAAGAATACACAATGATGGTAGATTACGATGGACTAATCACGGCACGTTACGTGTTAATGGCACTGTGTATACAGATGGTTCATTTTATCCAGTATCTGGTGAAGTGTATGAAGTAGAAATTGCACTTGATAGAAACCTTACACTTGCAAGAATAGGAAGACTTTACAATGGTAATCATTGGTCTGGTAAAATCTGGGATATCGAGTTCACAGATAACACAGACCCTACGAACTCACGTTATTACCCATCAGTAGATTACCGTGTAGACGGTGATACTTCTGGTACTGTTTTGGATGAGACTCACGGTTTACTGTCTGATTCATTCTCAGACGGTCGTTGGGTAGAAAGTGCAGCAGGAACTATTAACGGTGAATCATTAACAATTACATCTTCTTTTGGTTCAGGTAGAGTGGGCACATTCCCATCCCCTGCGATAAATGGTGTTGATGTTACAGTCTCATTTGACGTAGTTAGTTACTCAGGCACTACGAACGGTGGACGTGTCATCGTGTACCGTAATGGTTCTCAAGATGGCAACCTAGGCACATTTGATAGTTCGGATGTAGGTACTCGCGTCACACTTACAGCGAACCCTACTGGTAACTATGGCTCTGATGGTAATGATGTTGTTTTCTATGTAGATGCTTCTGGTATTTCTTTTGAAGTAGCTAATGTAGAGGTATCAGCAAATAACAACGGTACTCTAGTTAACTTCCCAAGCGGTTCAGAATGGACACTTGCTCAAGTAGACGGTGCTTCAGATGGTACGTTAGAGAACTTCACAGCAGGTTTAGAGTGGAACAATGACCTACCTATTACTGACGGTACAATGGTTGGCTTTGCACAACCTTGGCATCACGAAACAGGTCGTTACATTGGCTCCATAATTGGTGAAACTACTCAAGCAGTATGGGACGTTCAAGACTCTCAGAAAGCTTTCCACGATGTGAAATACAATGCCGACTTCCACGTGATTACATCACGTAAGGACTTGGTGTTCTTGGAAACTTGGTTAGAGAAAGTAGAAGGGTTTGTTCGACCTTACGGTAACGTACAGTTCGGTGGCTCTAGTCATGATGGTGTTACCCTGGTTCCGGTTACTAACTTCAAAGCTCAAGGCTACTCAGCGTTTGGTGAGTGGGACGAGAACACAGTTGGTAAGGTTGCTGATTGGGATGCAATGACCCCAACACAGAAATCTGTATGGGCAAGCAACCCTAAGAACAACTTAGTGTTCAACCCAGAAGACAACGAGTACTATCAAGACTCATATCGTATTCGTACAGTAGAAGGTTTAGGTGATGAATGGGCTTGTGTTAGACCAACAATTGCATCAACAGGTACACCTACATGGCTTGGTTACGCCCAATCAGGTACAAATAGTCGATACATAGTTCAACGTGGACAACGTGAAGATACTCGTGATTGGTATAAGGACAATACAGTATCGGGTACTATTTTTGGGGGTACTAACCGTTCTGGATTTAATGATGATGAACCAACCATTTTCCAGAATACAGAGGGTGCAAACACTTCTTCTGCTAACGGTAAGTGTTTTGCTATGCCCATCGCACTAGTGCAGCGTTTGAACCAAGGTGCTTACCATCCAACGTATAACCCACAAGGCTGTGATGGGTTTATAAGTTCAGGGGGCGGTAGTTTAGCACGGTGGTACGTTAGTAC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Tertiary structure

PDB ID
d09e9a5b1dba69ff2e674c6e09bea0853090fb9eb34db9d1d776ef0546f748f8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5281
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50