Protein
View in Explore- Genbank accession
- AZF92758.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein and host specificity
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MLLTIHDNNLQKVAYIDNDKQSTLNFFNDKWTRLLESGTSVFEFSVFKKSITSNYNVETAYKYLNERAFVSFKYKGRSYLFNVMKVEEDENIIRCYCENLSLELLLEYRGAYKASKPMTFKEYFDDWGMGQVAKLTLGVNEVSDQKRTLEWEGQETTLARLISLARNFDAEIEFETKLQPNSQLDVFVLNVYKAHDGINQGVGRRRSDVILKYGKNINGIKRSVDKTQIYNMTTPYGRKDDTKKETKRISDPVTIQNPVVVPSARVEKRYAGGDLTYAGHTLSASLVQTIFNLCVQRNLLPSGVISQLYLESFWGSSNVARRDNNWSGMTGGAQTRPSGVVVTTGSPRPASEGGTYMHYASVDDFMKDYTYLLAEQTSGGRKMYGVKGKQNIEEYTKGLFRIGGALYDYAAAGYNHYIYLMRDIRSGINRSNGNILDKLDDLWRQPDNQVTQPNQPITRTVKAEKVIAVLNEMQGLKGRRVGNGQCYALAAWYSMKLGGPGLGAGVTGKSGVIGAGMAAAKIGTDYAWDRFGWSVIRPTSVDQLKPGALANIKAYNSFLGTTVWGHNSIIIANNGSTVTVLEQNYAGRQYVVQNSYPASAYLGAIETLCYPPELREGKTVEGRTETVSSPNFEVQKVEIPPIDVEVTSESTAALTIDSKRKQEWKNDKGQVEFYLENGSLYAPISKELYPSILTGKENDDNWIRKDMEIDTDSEDVLISTALRNLRKFCYPAITYEVDGFLDLDIGDTVKIQDDGFKPMLILEARVSEQEISFSNPVENKTVFANFQALQNKVSDSLLSRMAKLAEQAIPYELKLSTDKGTTFKNSIGQSVLKATLEKNGEVYQPIFFYKNGDSIIGTGNQLVVKPTDFENTLQVTVEAYLDDELVATAEVTFTDVSDGEQGPKGDRGNDGLPGKDGVGLKTTTITYGLSDSDSTQPTDWTSQPPTLIKGKYLWTKTVWTYTDSSSETGYQKTYIAKDGNKGNDGIPGKDGVGIRNTTITYAAGTSGTVAPTSGWSSQVPNVPESNYLWTKTVWEYTDNTNETGYSVAKMGEQGPKGDRGIQGLQGPRGDQGIPGPKGIDGTDAPTIFVKSYTYSAGSKAYIKLTGPNAFEQTLYYSRGHNVWVLDATTHKLKEFVHCDTYITMSFNHNGVNITLADYLNSITDSIVAIAASDADAVDQNFRDVLNKMGGNPELGTWSGRTGHVFIGMSKRSDGTWPLQPRQGYEVAIQEDGSAPEIGCTLSIGGIVANGADGKTQYTHIAYANSADGSKDFSTSDSNRAYIGMYVDFNINDSTNPSDYSWTLVKGADGTQGVPGKPGADGKTPYFHTAWAYSADGTDGFTTVYPNLNLLEGTATFDGMNPNSSDNSVSAITKTKISGIANTVMDVKTSGNAFAVGFYTQKGYNITAGQTITISFIAKASSDTSLFVGFEHFPSGHKTFTISTKWELYTYTFTATTSGTPTFVMYGWDMVAGQGFQLYNPKAELGSVATPWMPSASEVTTADYPSFIGQYTNYTQVDSPNPRDYTWSLIRGNDGKQGPQGPKGDRGIPGIKGADGRTQYTHIAYADTISGSGFSQTDVNKAYIGMYQDFNAEDSKNPQDYRWSKWKGSDGRDGIPGKAGADGRTPYVHFAYADSADGQKGFSLTQTGRKRYLGVLTNFFKEDSTNPSDYTWNDTAGSISVGGRNLLVKTNQGITNWNWQLSDGDKSVEEVKVDGIRAVKLIKGSTAANTGWNFIEYNGLLRELIQPKSKYVLSFDVKPSVDVTFYATLARGDFNEPLTDTVAMPKALANQWNKVSCVLTSKETLPNIAWQVVYLAGMPTTNGNWVIIKNIKLEEGDIPTQWTPAIEDIQDEIDSKADAAMTIEQINALNERAGIIKAEMEAKASAEILNNWIKNYQDFVKANETERAAAEKALVSSSQRVSTIAKELGELSDRWNFIDTYMNSSNDGLVIGKNDGSSSMMFNPNGRISMYSAGEEVMYISQGVIHIENGIFSKTIQVGRYREEQYHLNPDMNVIRYVGGF
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2020 AA molecular weight: 222409,52250 Da isoelectric point: 5,37148 aromaticity: 0,10347 hydropathy: -0,46644
Domains
Domains [InterPro]
DC_0558
ATT
1–413
ATT
1–413
IPR002901
ENZ
274–415
ENZ
274–415
IPR002901
ENZ
296–403
ENZ
296–403
IPR008979
STR
1362–1461
STR
1362–1461
DC_1328
STR
1440–1608
STR
1440–1608
1
2020
Architecture
ATT 1-413 | STR 414-2020
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage CHPC933 [NCBI] |
2365053 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Streptococcus thermophilus [NCBI] |
1308 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZF92758.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH937476.1
[NCBI]
CDS location
range 15390 -> 21452
strand +
strand +
CDS
ATGTTATTAACGATTCATGACAATAATCTACAAAAAGTAGCTTATATAGATAACGACAAACAGTCTACTTTAAACTTCTTCAACGATAAATGGACTCGTTTGCTTGAAAGCGGAACATCAGTTTTTGAGTTTTCGGTTTTCAAGAAAAGCATTACATCTAACTATAATGTAGAAACTGCTTATAAATATCTTAATGAGAGAGCTTTTGTCAGCTTCAAATACAAGGGGCGCTCATACCTTTTTAATGTCATGAAGGTTGAAGAAGATGAGAACATCATCAGGTGCTACTGTGAAAACTTGAGCCTTGAATTACTATTAGAGTATCGAGGTGCTTATAAAGCATCAAAACCTATGACATTCAAAGAGTATTTTGACGACTGGGGAATGGGACAAGTCGCTAAATTGACTCTTGGTGTTAACGAGGTTTCTGATCAAAAGAGAACTCTAGAATGGGAAGGACAAGAAACTACTCTTGCTCGACTGATTTCGCTAGCTCGAAACTTTGATGCTGAAATTGAGTTTGAGACAAAATTACAACCAAACAGCCAACTTGATGTGTTTGTCTTAAACGTTTACAAGGCTCATGATGGTATAAATCAAGGTGTTGGTCGAAGACGCTCAGATGTCATTTTGAAATATGGAAAAAACATAAATGGCATTAAGCGTAGCGTTGATAAGACTCAGATTTATAACATGACAACTCCTTATGGACGAAAAGATGATACTAAAAAAGAGACCAAGAGAATCTCCGATCCAGTTACTATTCAAAATCCAGTTGTAGTTCCATCGGCTAGAGTTGAAAAAAGATACGCTGGAGGTGACTTGACTTATGCAGGACACACGTTAAGTGCTAGTTTGGTGCAAACCATTTTTAATCTATGTGTTCAGCGAAACCTTTTGCCATCAGGCGTCATATCTCAGCTCTATCTTGAGTCCTTTTGGGGTTCATCTAATGTAGCAAGACGTGATAATAACTGGAGTGGTATGACTGGTGGTGCACAAACGCGTCCATCTGGTGTCGTTGTAACCACGGGTAGTCCTAGACCAGCTAGCGAGGGCGGAACGTATATGCACTATGCTAGCGTTGATGATTTTATGAAAGACTACACTTATCTACTCGCAGAGCAGACAAGTGGTGGTCGCAAGATGTACGGTGTCAAAGGCAAGCAGAACATCGAAGAATACACAAAGGGGCTCTTCCGAATTGGAGGAGCTCTTTACGACTACGCTGCGGCTGGATACAACCACTATATCTATCTTATGCGAGATATCCGAAGCGGCATCAATCGTTCGAACGGTAACATTCTTGATAAACTAGATGATTTGTGGAGGCAGCCAGATAATCAAGTTACCCAACCTAACCAACCAATAACGAGAACTGTTAAGGCTGAGAAAGTTATCGCCGTCCTAAACGAAATGCAAGGTTTGAAAGGTCGTAGAGTAGGTAACGGTCAATGTTATGCATTAGCAGCTTGGTATTCTATGAAACTAGGTGGCCCAGGTCTCGGTGCTGGGGTTACTGGCAAGTCTGGTGTAATTGGTGCTGGTATGGCTGCAGCAAAGATTGGTACTGACTACGCTTGGGACAGATTTGGCTGGAGTGTCATCAGACCTACCAGCGTTGACCAATTAAAACCTGGGGCTCTCGCTAATATAAAGGCATACAACTCATTTCTAGGTACGACTGTTTGGGGACATAATTCAATTATCATCGCTAACAACGGTAGCACAGTTACTGTTTTAGAACAGAACTACGCAGGTCGGCAATACGTTGTCCAAAATAGCTATCCTGCCAGTGCTTATTTAGGCGCTATTGAGACACTATGTTATCCTCCCGAATTGAGAGAAGGGAAAACTGTTGAGGGTAGAACTGAAACTGTTAGCTCTCCAAACTTTGAAGTGCAAAAGGTAGAGATTCCACCTATCGACGTTGAAGTAACCTCTGAAAGCACAGCTGCACTCACTATTGATAGCAAGCGAAAGCAAGAATGGAAGAACGATAAAGGTCAAGTTGAATTTTACCTTGAAAACGGTTCGCTATATGCTCCTATTTCTAAAGAGTTGTACCCATCCATTCTAACAGGTAAAGAGAATGACGATAACTGGATACGTAAGGATATGGAAATTGACACGGATAGCGAAGATGTGCTTATTTCGACAGCTCTTAGAAATCTACGCAAATTCTGTTACCCAGCTATCACTTATGAAGTCGACGGTTTCCTTGATTTAGATATTGGTGACACAGTTAAAATCCAAGACGACGGTTTCAAGCCTATGCTTATTCTTGAAGCTCGTGTCAGCGAACAAGAGATTAGTTTCTCTAATCCAGTAGAGAACAAAACAGTGTTTGCTAACTTCCAAGCACTTCAAAACAAGGTTTCAGACAGTTTGCTATCACGCATGGCTAAACTAGCTGAGCAAGCCATTCCTTACGAGTTGAAACTTTCAACTGATAAAGGTACTACGTTTAAAAATAGTATTGGTCAAAGCGTGCTAAAAGCAACACTTGAAAAAAACGGTGAAGTTTATCAACCAATATTCTTCTATAAAAATGGTGATTCCATTATCGGTACTGGCAATCAGTTAGTTGTTAAACCAACAGATTTTGAAAACACCTTACAAGTTACCGTTGAAGCATACCTTGATGATGAGTTAGTAGCAACTGCAGAGGTTACATTCACTGATGTATCAGATGGTGAACAAGGTCCTAAAGGTGACCGTGGTAATGATGGTTTGCCAGGCAAGGACGGGGTGGGCTTAAAAACTACTACCATAACTTACGGCCTGAGTGATTCTGATTCTACTCAACCTACTGACTGGACTAGTCAACCACCAACTTTAATTAAAGGGAAATACCTTTGGACCAAAACAGTATGGACATATACTGACTCATCTAGTGAGACTGGCTATCAAAAGACTTATATTGCTAAAGATGGTAATAAAGGTAATGACGGTATACCTGGTAAGGACGGAGTTGGTATACGTAATACCACAATTACTTACGCAGCAGGCACATCTGGGACAGTAGCACCAACGTCTGGTTGGAGTAGTCAAGTGCCTAATGTACCTGAGAGTAATTACCTTTGGACTAAAACAGTATGGGAGTACACTGATAACACTAATGAAACGGGATATTCAGTTGCCAAGATGGGAGAACAAGGCCCGAAAGGTGACCGTGGTATTCAAGGTTTACAAGGTCCAAGAGGTGACCAAGGTATACCTGGTCCTAAAGGTATTGATGGTACTGATGCTCCAACGATTTTCGTTAAGTCCTATACATACTCAGCAGGTTCAAAGGCCTATATTAAACTGACTGGGCCAAATGCTTTTGAGCAAACCTTATATTACAGCCGAGGACACAATGTGTGGGTTCTTGATGCTACAACACATAAACTCAAAGAGTTCGTACATTGTGATACCTATATAACCATGTCATTTAATCATAATGGTGTTAATATAACATTGGCTGACTACCTAAATAGTATTACAGATAGTATTGTCGCAATTGCAGCATCGGATGCAGACGCAGTTGACCAAAATTTTAGGGATGTGCTTAACAAAATGGGTGGTAATCCAGAACTTGGAACATGGAGTGGGCGAACTGGTCACGTCTTTATAGGCATGTCCAAGCGGTCTGATGGAACCTGGCCACTGCAACCACGACAGGGGTATGAAGTAGCCATACAAGAAGATGGATCAGCACCAGAAATTGGATGCACTCTGTCAATAGGAGGAATAGTTGCTAATGGAGCAGACGGTAAAACACAATATACCCATATTGCATACGCGAATAGCGCAGATGGAAGTAAAGATTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTGCCTATATCGGGATGTACGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCAATCCGAGCGATTACTCATGGACACTTGTTAAAGGTGCTGACGGTACTCAAGGTGTACCAGGAAAACCTGGGGCTGACGGGAAGACTCCTTATTTCCATACGGCGTGGGCTTACAGTGCAGATGGTACCGATGGTTTCACGACTGTTTACCCTAATTTGAATTTGTTGGAAGGGACCGCTACGTTTGACGGAATGAACCCTAACTCTAGTGATAATTCGGTTAGTGCTATTACAAAAACTAAAATATCAGGAATTGCTAATACAGTCATGGACGTAAAAACAAGCGGAAATGCTTTTGCCGTTGGTTTTTATACACAAAAAGGTTATAACATAACCGCTGGGCAGACCATTACTATTTCATTTATAGCAAAAGCATCAAGTGACACAAGTCTTTTTGTTGGATTTGAACATTTTCCAAGTGGACATAAAACGTTCACAATAAGCACAAAGTGGGAACTTTATACTTATACATTCACAGCAACAACGTCAGGAACTCCAACTTTTGTGATGTACGGGTGGGATATGGTAGCAGGGCAAGGATTCCAATTATACAACCCTAAAGCGGAACTAGGTTCAGTTGCTACCCCTTGGATGCCCTCGGCTAGCGAAGTCACAACTGCTGATTATCCAAGTTTCATCGGACAATATACAAACTATACACAAGTAGATAGTCCTAATCCTCGAGATTACACTTGGAGCCTCATTCGAGGTAACGATGGTAAACAAGGACCACAAGGTCCTAAAGGTGACCGAGGGATACCAGGGATAAAAGGTGCTGACGGAAGAACGCAGTATACCCACATAGCTTATGCTGATACAATTTCAGGTAGTGGCTTTAGTCAAACAGATGTCAATAAAGCCTATATTGGTATGTATCAAGACTTCAATGCCGAAGATAGCAAAAATCCACAAGATTATCGTTGGTCTAAGTGGAAAGGTAGTGATGGACGAGATGGTATTCCAGGAAAAGCTGGGGCTGACGGACGTACGCCTTACGTCCATTTTGCTTATGCCGATAGTGCCGATGGTCAAAAGGGTTTCAGTTTGACACAAACTGGACGCAAGCGCTATTTAGGTGTGCTTACCAACTTCTTCAAGGAAGACAGTACTAATCCTTC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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
5dc5418f04789f2e6ecafc6ec0a17efacf35c26bb2ecc7c1484507edba115aca
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| A comparative genomics approach for identifying host-range determinants of bacteriophages infecting Streptococcus thermophilus | Szymczak,P., Rau,M.H., Monteiro,J.M., de Pinho,M.G., Filipe,S.R., Vogensen,F.K., Zeidan,A. and Janzen,T. | 2019-05-29 | — | GenBank |