Genbank accession
QBX26466.1 [GenBank]
Protein name
hyaluronidase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MLFLLNKDIRTVKWNGLPLHETSSAIVKETLNGDFTLSIRYPITDSGIYKQIKEDMLIKAPVPVLGFQLFRIKKPIENDDSLDITAYHISDDIMQRSIEPISVANLTCGMALSQMVQNTKSNLGDFSFTSDVTDRRTFNTNEVKTRYAVLMDGAHSIIGTWEGELIRDNLALTIKKNRGENRGVVITTHKNLKSYKRTKSTQSIITRIHAKSTFKPDGKDKDQTIKITVDSPLITFYPYINEKEYENNTLKSIEELRKWAEAKFKNEGIDKLSDAITIEAYELDGQVVHLGDTVNIKSLKHGIDIPKKAVAYEFDALTQEYISITFDDKPMVGASTSNSAISTVANEILDSGFTLQEVAIEKALRNANTAFDAEFTKQKDSILDDIEKVKASAEVYADGIRQAIEGKIADVDSKVLSNEALNEDRYNVVLTKANSSRDLANHALEVCKEVKETTNTVLTGTLNYKKEAIAEANRLVELSKNSLLNQITTVESSIDKLKGVITNKVSKTDFDAIKNTVEQQRTEISQANDKINLKAEKTYVENIKQTTSEALQRISENALAISKTKADLQVAVDAIKTKVSQTDFNQTTNRLASTETTIKIQAGEIAKRLTSSQVETVINLKGFQTKSDVDKNILDRGYVTNSSVQNLVRETSNSFTRTISETKALIPTSVSHRNLASGSSDSWTSYKEINSKLNWIQTLGKIPYGDSTGIYSGTKINLFVYISVDNVVLDSTVTPRIILQGPGYKKSDNSAVWSIHSNPFHTSWSTTLKTGTNYHLIKISRIVTDEMFNNFKNFELQFRIDGASSGKFHWRALMITTGDIFPNYWTKPIEDLTTVTAFNEVKDTLVSHTRTISEQGKTISQVVQTSEGLITRVSDLIDNQNLVYDPTNFSKYREREPNSNLVMTGTNEYKLLRIAQSGRATNGWRGFQMPLHSQKFVAGEKLSYRVNLWIDVLPDGKVGFEIKSGNSIGGFTISPTRTGAAQIFTGTFTINKTVTKTDDFGLHIWLEKNGTVAVGQISIVRGSQPPNNFVDSTSFQQIATESLVQQHQGSYSIQNLTNAGSLISGINLGANGINRIIGKATHITGDTLIDRAVIKSGMIDKLKTSNFESGSVTTMVLASNSVTADKIVVDQAFFNKLVANEAYLRQLFAKNAFINSVQSVRIDASQIKSGLLSGDRIQGGTITGTTISGGLLTGETKIKLGAYGSFDAINGGLQINVPRQFNSKDGLGVQFIGSYGRGDNVPYGLFIYKDSDFTTGNTASDSDDFLLTVEGYIKAKGIGWLKYGKSSINGSTTGTISYWNSNNVSLDFGGSGNDIYYSYNGKAYSLWQIVNQHFSDKNLKENIGLSNYKALDFIKRFQFKEYDWKKIGNRIQKAHTKIGLIAQDIQQIDSSLVYENGGFLNLDNTRLTNIALKGIQELILDIRKLNKRLEMLEDEHRFNPSISNGVAD
Physico‐chemical
properties
protein length:1448 AA
molecular weight: 160550,12940 Da
isoelectric point:8,47974
aromaticity:0,07942
hydropathy:-0,35642

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan320
[NCBI]
2548107 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX26466.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448907 [NCBI]
CDS location
range 27427 -> 31773
strand +
CDS
ATGTTATTTTTGTTGAACAAAGATATTAGAACTGTAAAGTGGAATGGATTACCTCTTCATGAAACCAGCTCTGCTATTGTAAAAGAAACCCTGAACGGTGATTTCACCTTATCTATTCGCTATCCAATTACTGATTCTGGTATCTATAAACAAATAAAAGAGGATATGCTTATCAAGGCTCCTGTACCTGTCTTAGGATTCCAGTTATTTCGTATTAAAAAGCCAATTGAAAACGATGATAGTTTGGATATAACCGCCTACCATATTTCAGATGATATTATGCAACGGTCTATCGAACCAATTAGTGTTGCTAATCTTACTTGTGGTATGGCCTTATCCCAAATGGTTCAAAATACTAAGAGCAATCTTGGTGATTTTTCATTTACGAGTGATGTTACAGATCGCCGTACTTTCAATACAAATGAAGTAAAGACACGCTATGCTGTCTTAATGGATGGTGCCCATTCTATCATAGGAACTTGGGAAGGGGAGTTGATTCGTGACAATTTGGCTCTGACAATCAAGAAGAATAGAGGTGAAAATAGGGGTGTTGTCATAACAACACATAAGAATCTAAAGTCTTACAAGAGAACCAAATCAACTCAATCAATCATTACTCGTATTCATGCAAAATCAACATTTAAACCAGATGGTAAAGATAAAGACCAGACAATTAAAATTACTGTCGATAGTCCTCTAATCACTTTCTATCCATATATCAATGAAAAGGAGTACGAAAATAATACTCTTAAAAGCATTGAGGAGTTAAGGAAGTGGGCTGAGGCTAAGTTTAAGAATGAAGGAATTGATAAGTTATCGGATGCTATTACGATTGAAGCCTATGAACTCGATGGGCAGGTTGTACATTTAGGGGATACCGTAAATATCAAGAGTTTGAAACATGGGATCGATATTCCCAAAAAGGCAGTTGCTTATGAATTTGATGCACTGACACAAGAATATATCTCGATTACTTTTGATGATAAACCAATGGTAGGTGCTTCAACTTCAAATAGTGCAATTTCAACTGTCGCAAATGAAATTTTAGACTCTGGTTTCACATTACAAGAAGTCGCAATTGAAAAAGCTTTGAGAAATGCGAACACAGCATTTGATGCCGAATTCACTAAACAAAAAGATTCAATTCTAGATGATATTGAAAAAGTCAAAGCTAGTGCAGAAGTTTACGCAGATGGTATTCGTCAAGCGATTGAAGGAAAGATTGCTGATGTTGATTCTAAAGTTCTGTCTAATGAAGCACTAAATGAAGATAGATACAATGTTGTGTTGACTAAAGCAAATAGTAGTAGAGATTTAGCTAATCATGCCTTAGAGGTCTGTAAAGAAGTCAAAGAAACTACTAATACAGTATTGACAGGTACCTTAAATTATAAAAAAGAAGCCATTGCTGAAGCAAACCGTTTAGTTGAACTCAGCAAGAATAGCTTATTGAATCAAATTACGACAGTAGAATCTTCAATTGATAAGCTTAAGGGGGTTATTACTAACAAGGTTTCAAAGACAGACTTTGATGCTATCAAAAATACCGTAGAGCAACAACGAACGGAAATATCACAAGCCAATGATAAAATAAATCTAAAAGCTGAAAAGACCTATGTAGAAAATATTAAACAAACAACTAGTGAAGCACTCCAAAGAATATCAGAGAATGCATTAGCAATATCTAAAACTAAAGCTGATTTACAAGTTGCTGTCGATGCTATAAAGACTAAAGTATCACAAACAGATTTTAATCAAACGACAAATCGACTTGCTAGTACTGAAACAACAATTAAAATCCAAGCAGGTGAAATAGCCAAACGATTGACCAGTAGTCAGGTAGAAACTGTAATCAATTTAAAAGGATTTCAAACTAAATCAGATGTTGATAAAAATATTTTAGATAGAGGTTATGTAACGAACTCTAGCGTGCAAAACTTAGTTAGAGAAACATCTAATAGTTTCACTCGGACTATTAGTGAAACTAAAGCTTTAATACCAACTAGTGTTTCTCATCGAAACTTAGCATCTGGGTCCAGTGATAGTTGGACTTCATACAAAGAAATAAACTCGAAACTCAATTGGATTCAAACATTAGGAAAAATTCCTTATGGTGATTCGACTGGCATTTATTCAGGGACAAAAATCAATCTATTTGTTTATATTTCTGTCGATAATGTTGTATTAGATTCAACTGTTACTCCTAGAATTATCTTACAAGGTCCAGGCTATAAAAAATCAGATAATAGTGCTGTATGGAGTATTCATTCTAATCCCTTTCATACCTCTTGGTCTACTACATTAAAAACTGGTACAAACTACCATCTTATTAAAATTTCTCGAATCGTAACAGATGAGATGTTCAATAATTTTAAAAACTTTGAATTACAATTTCGTATTGATGGAGCAAGTTCAGGTAAGTTTCATTGGAGAGCTTTAATGATTACTACTGGAGATATCTTTCCAAATTATTGGACTAAACCTATCGAAGATTTAACAACTGTAACGGCTTTTAACGAAGTAAAAGATACTCTAGTTAGTCATACAAGAACTATTAGTGAACAAGGCAAAACAATTAGTCAGGTTGTACAAACATCCGAAGGACTGATTACAAGAGTCAGTGATTTAATTGATAACCAAAACTTAGTATACGATCCAACCAATTTTAGTAAATATAGAGAACGTGAACCGAATTCGAATTTAGTTATGACTGGAACTAATGAATACAAGCTGCTAAGAATTGCACAAAGTGGTAGGGCAACAAATGGTTGGCGTGGTTTCCAAATGCCTCTTCATAGTCAAAAATTTGTTGCTGGTGAGAAACTTTCTTATAGGGTCAATTTATGGATAGATGTACTACCTGATGGAAAAGTTGGTTTTGAAATCAAATCAGGTAACTCAATAGGAGGTTTCACCATCAGTCCGACTAGAACGGGCGCAGCTCAAATTTTTACAGGAACTTTTACGATAAATAAAACTGTGACAAAAACAGATGATTTTGGGCTACATATTTGGCTAGAAAAGAACGGAACTGTGGCAGTTGGCCAAATTTCAATTGTTCGAGGTAGTCAGCCACCTAATAACTTTGTAGATAGTACATCCTTTCAACAAATTGCAACAGAAAGTCTTGTTCAGCAACATCAAGGTTCCTATTCGATTCAAAATTTAACTAATGCCGGATCTTTAATTTCAGGGATTAATTTAGGTGCAAATGGAATCAATCGAATTATTGGCAAGGCAACTCATATCACTGGGGATACTTTAATTGATAGAGCAGTCATTAAATCAGGAATGATTGATAAATTAAAGACATCAAACTTTGAATCTGGGTCTGTAACTACTATGGTATTAGCGTCAAATTCAGTAACTGCAGATAAAATTGTCGTGGATCAAGCGTTTTTTAATAAGTTAGTTGCAAATGAAGCTTATTTACGACAGCTGTTTGCTAAGAATGCTTTTATCAATAGTGTACAAAGTGTTAGGATTGATGCTAGTCAAATAAAGTCAGGCTTACTAAGTGGTGACAGAATTCAGGGTGGCACAATAACTGGAACCACAATTTCTGGTGGATTATTAACTGGAGAAACAAAAATTAAGTTAGGTGCTTATGGTTCATTTGACGCTATTAACGGTGGATTACAGATTAATGTTCCTCGTCAGTTTAATTCTAAAGATGGTTTAGGTGTACAATTTATAGGTTCTTATGGCCGAGGGGACAATGTTCCTTACGGCTTATTTATTTACAAAGATTCAGATTTTACTACTGGAAACACTGCAAGTGATAGTGATGATTTTCTATTGACGGTCGAAGGATACATTAAGGCAAAAGGAATTGGCTGGTTAAAGTATGGCAAAAGCAGCATTAATGGCTCAACTACAGGCACCATTAGTTATTGGAATTCTAATAATGTATCTTTAGATTTTGGTGGATCAGGAAATGATATTTACTACTCATATAATGGAAAGGCTTATAGCTTATGGCAAATTGTTAACCAACATTTTTCTGATAAAAATTTAAAAGAGAATATAGGCTTATCTAACTATAAAGCACTCGATTTTATCAAAAGATTTCAATTTAAAGAGTATGACTGGAAGAAAATAGGGAATCGTATTCAAAAGGCTCATACCAAAATTGGACTCATCGCTCAAGATATTCAACAAATTGACTCATCACTTGTGTATGAAAATGGTGGTTTTCTGAATCTTGATAATACAAGATTAACGAATATCGCTTTAAAAGGAATTCAAGAGTTAATACTTGATATTCGAAAATTAAATAAACGATTGGAGATGTTAGAAGATGAACACAGATTTAATCCATCAATTAGCAATGGAGTCGCTGACTAA

Tertiary structure

PDB ID
ab0ea416858e032b2ef52e241b54ad58602189a762142e25ff416c96bfd2794a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7130
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. 2018-12-20 GenBank