Protein

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Genbank accession
WDS60881.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNTLRYERPVESNTNTPNTLVQRDADGNFSAAVVTASLIGNASTATRLDQTRQIQLSGDVTASGNFDGSQNLNLSSALSLVSTLPHYLQDNDPSITRVFTEVTVDQKGRVVNARTPAQMDLAAYGLDGSATSDPDLAQPWNPNLEAIADETATGFYVRTGAGTLEVRQILAESADIVVSNGTGVSGNPNLSLAVQAGLTAGDYNTESLTSVTQAGGNGEPFGTETVNAVKFTCDNHGRLSSATNVPIATATEGSKYASYAAGTSYARYDIIENASKVYQAYQAISAGAGAPTHTSGDNGGWRYLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAALAVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLFGANNTGDGGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGAVAQTLDKTGDGNLTFQLTQNSGDARNLSILSTNAGAGTSTVTITAEDVVDIDASDANGKVHIENSRFQGAYIATTDATMNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTMTVDDVVLTLGGDTAPASDDNLDRGVEFRYYDSQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNSSETFTGTDSGLIAGNIKLTTGTASSSNTTGDLVVAGGAGITGAVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNASIGGVTDITGNLNVNTNKFNVVAASGNTTVAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGDLHMESTNDITVAKNAGTGVWEIQSNDYGALRLDGGAYVAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTLRAHGGAGIERTLHVGGTGSNEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNTEINGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASSSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEIFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDAVQINDTLGVSDVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAGIGKNLAVGEGLRVYGATELTGSLDLNSSADISGALVTHDNVTINADNKMFKIQTNGAVDKFTVDTDNGNTDIRGTLDVGGDVTAESNLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPSTNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSANQFAFLTNATNSSEVLTGTDSALRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQITSNVAQGITPLVITSTTKVNNLNVDFLDSMTTASANTASTIVNRDASGNFAAGTITADLVGNASTATTLETARTITVDGVVDGNVSFNGSADVTISTTFNDSDITALAAQTGTGLVVRTGTGTYARRSVTATASSGVTITNGDAVSGNISINVASASTNSANNLVLRDGSGNFAAGTITASLTGNVTGDVTGDLTGDVTGDVTGNVTGNVTGNVTGTVSDISNHDTGDLAEGTNLYYTDARADARIAAADTDDLSEGSTNLYFTDARADARIAAADTGDLTEGTNLYYTEARVQTQLDNAYEQLRAMLNNLATATTLTLALSGDPTPGDVTALDNSSLSGGTGYNTATGVATTSSGSGTGLTVDITASGGIITAVVINDDGTGYAVGDTITISTGNADATIDVSAVIEMAVGDTVTGGTSGTTAVITAVGTNQITVDTVDGFFKKTETVSAGDVSNLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1816 AA
molecular weight: 186422,56120 Da
isoelectric point:4,15018
aromaticity:0,05727
hydropathy:-0,18519

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–196
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
WDS60881.1
1 1816
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-BM1
[NCBI] 		3021412 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WDS60881.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ319120 [NCBI]
CDS location
range 21046 -> 26496
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCTCAGGAATGGGCGAACGCGAATCCAACTCTTGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACGGGTCGTATCAAGATTGGTGATGGCGTTACAGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTTGAATCTAACACTAATACACCGAATACTCTTGTTCAAAGAGATGCAGATGGTAACTTCTCTGCGGCAGTTGTTACTGCTTCTCTAATCGGCAATGCTTCTACCGCAACTCGTCTTGATCAAACTCGTCAGATTCAGTTATCTGGAGATGTTACTGCTTCTGGAAACTTTGACGGTTCTCAAAACCTGAACCTGTCTTCGGCATTGAGTCTTGTTTCTACTCTGCCACACTATTTGCAAGACAACGATCCTAGTATTACTCGCGTCTTCACTGAAGTAACAGTCGATCAGAAAGGTAGGGTTGTAAATGCTAGAACTCCTGCTCAGATGGATCTGGCAGCATATGGTTTGGATGGTTCGGCAACTAGTGATCCTGATCTTGCACAACCTTGGAATCCAAACCTGGAAGCAATCGCAGACGAAACTGCTACAGGTTTCTATGTAAGAACTGGTGCTGGCACCCTGGAGGTAAGACAGATTCTTGCTGAAAGTGCTGACATCGTTGTTTCTAACGGTACTGGTGTTTCTGGTAACCCCAACCTTTCTCTTGCTGTTCAGGCAGGTCTTACTGCTGGTGACTATAACACAGAGAGTCTTACATCTGTAACTCAAGCAGGTGGTAATGGTGAACCATTCGGTACAGAGACCGTAAACGCAGTCAAGTTTACTTGCGACAATCATGGTCGCTTATCAAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACTGAAGGTAGTAAGTATGCTAGCTATGCTGCAGGTACATCGTATGCACGATATGACATTATTGAGAATGCCTCAAAAGTTTACCAAGCATATCAGGCAATCAGTGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATACCAGTGGTGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTTCATTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACAACAACGGGCATGTCACCATCGCTGCATTAGCAGTAGATAATACTCAACTACAAAACAATAGAGTCTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGACTTTGAACTTGATCAGGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAACTATCTTAACTATATCAAAGTTAATGATACGAGTGGCAATCTTCTGTTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGTGGCGCTGGTGAGATTGATGTTAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCTGATATTACTCTTGACGGAGCAGTTGCTCAGACATTGGATAAAACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAACACAAAACTCTGGAGATGCTAGAAACCTCAGCATCCTCTCTACAAATGCTGGAGCTGGCACAAGTACAGTTACAATCACCGCAGAAGATGTTGTTGATATTGATGCATCTGATGCAAATGGTAAGGTTCACATTGAAAACTCTAGGTTCCAAGGTGCTTACATTGCGACAACAGACGCAACAATGAACCTTGACCCTGGCGATGACCGTGCTGTAACTGGCACCGTTCGTGTCTGGGGTGACCTCCAAGTTGATGGAACGACAACAACTGTTAACTCAACAACCATGACGGTTGATGATGTTGTTCTTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGCATCTGACGACAACCTCGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTACTACGATTCTCAGGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGACACTAACTATACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATTCTTCCGAAACTTTTACTGGTACTGACTCTGGTCTTATTGCTGGTAACATTAAGTTAACAACTGGAACTGCATCCTCTTCCAATACAACTGGTGACTTGGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTACTGGTGCAGTCAATATCGGCGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACCTTCCGTGCTAACAGCACTTCTCGCTTTGATGACAACATCGTCCTGCAAGGTGCATCTAAGACCCTGCAACTGAACAACGGTTCTGGAACTACAAAGATTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAATGCAAGCATCGGTGGTGTAACTGACATCACAGGCAACCTCAACGTCAATACTAATAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACTACTGTTGCTGGCACTCTGGGTGTTACAAACATTGCGACATTCTCTAACGATATTGATGCAAACGCCAACATGACGCTTGCTGGTGACCTTCACATGGAGAGCACCAATGACATCACCGTTGCTAAGAACGCTGGCACTGGTGTATGGGAGATTCAATCTAACGACTACGGTGCTCTCCGTCTTGACGGTGGTGCTTATGTTGCTGGTGATGCTCTGATTGATGGAACATTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTCTGAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACGTTGGTGGCACAGGTTCTAATGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGCGATACCGTTAAGTTCTCTGTCCTGGGTGCATCTGGTAACACCGATATCCAAGGCACACTCGATGTTGCTGGTAATACCGAAATCAACGGCACTCTTGATGTTGATGCAGATTTCGCTGTTAGAAACGGTACAACCGACAAGTTCTTCGTTGATAACGTAACTGGTAACACCGATATCCAAGGCACTTTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAACACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTTCTGGTCCAAGGCAACTCCGAGTTTAACGGCACAGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCCGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTTCCTCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAATCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAACGGTAATACAAACATCATCGGCACACTGACTGTTGGTGATGCAGTTCAGATCAATGATACCTTGGGTGTCTCTGATGTTGTAACCTTCACAAGAAACACTCAGCAAACTCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACAGGTGGTGCTGGTATTGGTAAGAACCTTGCTGTTGGTGAAGGTTTGAGAGTCTATGGTGCTACCGAACTAACTGGTTCTCTTGACCTGAACAGCAGCGCAGACATCTCTGGCGCTTTGGTAACGCATGACAACGTTACTATTAACGCTGACAATAAGATGTTCAAGATTCAGACCAACGGTGCTGTTGATAAGTTCACTGTTGATACTGATAATGGCAACACAGATATTCGTGGAACCCTGGATGTTGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCTAACCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTGTTAATGGCACAACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCATCGACTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTTGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCCTGACAAATGCAACTAACTCCTCTGAAGTTCTTACTGGTACAGATAGTGCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGCGCTGGGACATCTCTTGATGTTGATGCCAATGCCAATATTGATGGGACCCTGACTGTTGATGGGCAAATCACATCCAACGTTGCTCAAGGCATAACACCTCTGGTCATCACATCCACTACCAAGGTCAACAACCTGAACGTTGACTTCCTGGATAGTATGACAACCGCAAGTGCAAATACTGCATCTACGATTGTTAATCGTGACGCTTCTGGCAACTTTGCTGCAGGAACCATTACTGCTGATCTGGTTGGTAATGCTTCTACAGCAACTACCTTGGAAACTGCAAGAACAATCACCGTTGATGGTGTCGTCGATGGCAACGTTTCCTTCAACGGTTCTGCCGATGTAACCATCTCTACCACGTTTAACGACTCTGACATCACTGCGCTGGCAGCACAGACAGGTACAGGTCTGGTGGTAAGGACTGGTACAGGCACCTACGCAAGGCGCTCTGTGACCGCTACAGCGTCCTCTGGCGTCACTATTACTAATGGTGATGCTGTTTCTGGTAACATCAGCATTAACGTCGCTTCTGCGTCCACTAACTCGGCAAACAACCTGGTCCTCCGTGATGGTTCTGGTAACTTTGCTGCTGGTACAATCACAGCATCCCTGACTGGTAACGTCACAGGTGATGTAACAGGTGATTTAACTGGTGATGTCACAGGTGATGTCACAGGTAACGTTACTGGTAATGTCACGGGTAATGTAACTGGTACAGTTTCTGATATTAGTAATCATGACACTGGCGACCTGGCAGAAGGCACAAATCTGTATTACACAGATGCTCGTGCTGATGCTCGTATCGCTGCAGCAGATACCGATGACCTGAGTGAAGGTTCTACTAATCTTTACTTCACCGATGCACGTGCTGATGCTCGTATTGCCGCTGCTGATACTGGTGACCTGACAGAAGGCACGAACCTGTACTACACAGAAGCAAGAGTTCAGACACAACTTGATAATGCATATGAGCAACTGAGAGCGATGCTTAACAACCTTGCTACCGCTACAACTCTGACCCTGGCACTGTCTGGTGATCCTACTCCTGGTGATGTAACTGCTCTGGACAACTCTTCTTTGTCTGGCGGTACAGGTTATAACACCGCAACTGGTGTTGCTACTACATCCAGTGGTAGTGGCACAGGTTTGACCGTAGATATCACTGCATCTGGTGGTATTATCACCGCTGTTGTAATCAATGATGATGGAACTGGTTATGCTGTTGGTGACACTATCACCATTTCTACTGGTAATGCAGATGCAACTATTGATGTCTCTGCTGTTATTGAAATGGCAGTTGGTGATACCGTTACTGGCGGTACATCAGGCACCACCGCTGTTATCACCGCTGTGGGCACTAATCAGATTACTGTCGATACTGTCGATGGATTCTTCAAGAAGACTGAGACCGTATCTGCAGGTGATGTTTCCAACCTTACAATCTCCTCATTCGCTTGA

Tertiary structure

PDB ID
10e4c784ffb7e6f029f1ef49b17e87bb21ee91657a9b11a949d766be41b6d247
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5329
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50