Protein
View in Explore- Genbank accession
- UJP30165.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEATDLSGAIVRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKINNGSTLVLEMGVGSNDVYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMIAGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWNTNNLDNWVEWRRVGSPNRGNAPEYYVVKNDAATDADASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETNQDTGATGPSGSILVSMKQIFDSSAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESSGNVMEVGAFGVGGAGKSIVDITSDVDLMNRLKAIGGTTFRANVKTVNGKAEYTGSPYYSHGAGFFSRTGDTMAALNIDYSSGNVRVFAINDRGLADGKVSYNMLYGTSNKPNADDNDFVSKSRGGTFGADVTVSGDITANTVSGRVLKLSGGGAAYVPPSQGAYISWNKENGSGRTDFINHRSTASTVPGGFDFWNYEGNTSNMRHLAQIRNTGDLVLFPSDISKAVTFQTDGNIVGGTLFGGNLNNYLSNLTGTANSKVSKSGDTMTGRLNVYQSDTNAGAQAIYIKGVQHTPLVLERNTDANLSIAFRLTGVNPILQRKLGLAKDGTLRWGTGDNQTDNALVFDQNSIGMVRVNMTGGYLGPEVAEDIGGRTLSIDDLFLDSNDVGTRRVYSCLAQGPGANITGMPPALTNLNGDFLLIVEKMRSAAGVDFRNKQTFISGRNNKTYFRYGAGTGTTSATAVNWTPWEEVITTSNANGILPISSGGTGANTAADARNNFNLGLGQTATFGGLIVNGVGNNDPVVTFKNGAIIREAQGGSTGALIMSASATAAASAKYIAFRPFGDSSGSEIRVKANGSEPLLEWSYGPGIRSNDSGAFVIYAKTGQALHLRPNGDSSNQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKMAIGKSNSFTVMVSANTNNQINPADTFSDIFKVDANGNQTVYGNSQVNRQLTVSSSATVNGVINANGGIIVPTAKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGSLDVTGTRLKTWRLEVDGGGTVLGGTIDVAGKAVFSKDILVEKQLDVRGAGACHLRFSKADGSEKGLIYADDDKNVSIRSGGDNGPSWNFWSSGSCQFPGAISNYNGISSTTYYPGGNKNDYLNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNYHQAILNVNGYGEDDSFYFRSGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYVLHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1535 AA molecular weight: 162335,00460 Da isoelectric point: 5,97619 aromaticity: 0,07557 hydropathy: -0,32306
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage Kpn6N [NCBI] |
2894286 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UJP30165.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OK631811.1
[NCBI]
CDS location
range 56936 -> 61543
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATTGTGTTAAATACCCATGGGCGTACTCTCGCTATCTACACCAAAGATGAAGCTGATAATGTTGTTCAGCTTGCCGGTAAAGGTGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTAGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTAACTATTTCTCCGAATAAAGCAATCAATTTTGAAGCTACGGATTTAAGCGGAGCAATAGTGCGTCATATCGTCGGCAAATGTGCTACTAATGATGGCTGGTACATTGGTGCCGGCGGTACAAGCAACAGTGGTATTCTTGAAATCGGTACTATTGATGATGGTGCTGAAACCATCCAATTTGTGCAACGTGGCGCAGGTAATGTTGAAGCCCGAAAATTAGTCTTGCTTGATGGTTCAGGTAATACTACTCTTCCTGGCGATTTAAGATTATCCACTAATAAAACTGTTAAAATTAACAATGGAAGTACACTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCAACGAGGTGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCTCAGGTTTATTACGCTATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACAAATGTGGAAAACAATCGTCAAGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACCGCTGGAACTCCGCGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTGCAGGTGGCATTGATTCTGGACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGCTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAACACTAACAACTTAGATAATTGGGTTGAATGGCGTAGGGTTGGTTCTCCTAATAGAGGAAACGCTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACTGATGCAGATGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGAAATGGGCTTTATGTTACAGTGCTAAACACTGCCGGATACAACGGTCAAGATAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCAACCAAGATACTGGTGCTACTGGACCGTCTGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGACAGTTCCGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACGGGTACTCTTCCGGTTAACCGCGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCCCGAAATAACCTGGGTCTTAGAACTGCGGCTGTTCGTGATGTCGGTGAATCTAGCGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCATTTGGTGTTGGCGGCGCCGGAAAATCAATTGTTGATATTACATCCGATGTCGATTTAATGAATCGCCTTAAAGCTATTGGTGGTACAACATTTAGGGCTAACGTTAAGACAGTAAATGGGAAAGCTGAGTATACCGGGTCTCCTTATTATTCGCATGGAGCAGGATTCTTTTCTAGAACCGGCGATACAATGGCTGCTCTTAATATCGATTATTCATCCGGTAATGTCAGAGTATTTGCTATAAATGACCGCGGATTGGCAGATGGTAAAGTAAGCTATAACATGCTTTACGGAACGTCAAATAAACCTAATGCCGATGATAACGACTTCGTATCTAAATCCCGTGGCGGTACTTTTGGAGCTGATGTTACAGTCAGTGGTGATATTACTGCTAATACCGTCAGTGGTAGGGTGTTAAAACTATCCGGTGGCGGTGCAGCGTATGTTCCACCTTCTCAAGGTGCATACATATCTTGGAACAAAGAAAACGGGTCAGGTCGTACTGATTTTATTAACCATCGTTCAACTGCTTCAACTGTTCCTGGCGGATTTGATTTTTGGAACTATGAAGGTAATACGAGCAACATGCGTCATCTGGCGCAAATTAGAAACACTGGGGATTTAGTATTATTCCCTTCTGACATATCTAAAGCTGTGACGTTCCAGACTGATGGAAACATCGTTGGTGGTACTTTATTCGGTGGAAACTTAAACAATTATTTAAGTAATTTAACCGGAACTGCTAATAGCAAAGTATCCAAATCGGGTGACACCATGACTGGCAGGTTAAATGTCTACCAATCTGATACAAATGCTGGAGCCCAGGCTATATACATTAAAGGCGTTCAGCATACACCATTAGTTCTTGAAAGAAATACTGATGCAAACTTATCAATAGCGTTCAGATTAACTGGTGTCAATCCAATTCTTCAACGTAAACTTGGTTTAGCTAAAGATGGAACTCTTCGTTGGGGAACCGGTGATAACCAAACGGATAATGCTTTAGTATTTGACCAAAACAGTATTGGAATGGTTAGAGTTAACATGACCGGAGGTTATCTCGGTCCGGAAGTCGCCGAAGACATCGGTGGAAGAACTTTATCTATCGATGATCTTTTCTTAGACTCTAACGATGTTGGTACTCGCAGAGTTTATTCATGCTTAGCTCAAGGTCCTGGCGCAAATATTACTGGAATGCCTCCTGCATTGACTAATCTGAATGGTGATTTCCTTCTTATTGTTGAAAAGATGAGATCAGCAGCGGGCGTAGATTTCCGTAATAAACAAACGTTTATATCTGGACGTAATAATAAAACCTACTTTAGATATGGTGCTGGAACAGGAACTACTTCTGCGACTGCTGTCAATTGGACGCCGTGGGAAGAAGTAATAACTACATCAAACGCTAACGGTATTTTACCAATTTCGTCTGGTGGTACTGGGGCTAATACTGCAGCCGATGCTCGTAATAATTTTAACTTAGGTTTAGGGCAAACTGCGACGTTTGGCGGATTAATTGTTAACGGTGTTGGAAATAATGATCCGGTAGTCACGTTTAAGAATGGTGCTATAATTCGGGAAGCTCAAGGTGGTAGTACTGGTGCATTGATCATGTCAGCTTCTGCTACAGCCGCAGCATCAGCGAAATATATTGCCTTTAGACCATTCGGTGATTCTTCTGGGTCTGAGATTAGAGTTAAAGCTAACGGTTCTGAGCCTCTGCTTGAGTGGTCCTATGGCCCGGGTATTCGTTCAAACGACTCTGGTGCTTTTGTTATCTACGCAAAAACAGGCCAGGCGCTTCATTTAAGACCAAATGGTGATAGCTCTAATCAAGCCACAGTTATTGACCAAAACGGTAAAATGACAGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCCCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACTTGAACGTTTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGCAAAAACTCTGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCAGGAAAAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCATTTACCGTTATGGTATCTGCAAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCTGACACGTTTAGCGATATATTCAAAGTTGATGCTAACGGAAACCAAACTGTTTATGGAAACTCTCAAGTCAATAGACAATTAACGGTATCAAGCTCAGCGACAGTTAATGGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTGCCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACACAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGACAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGACACGTATCTTCCGTTAGCAGGTGGTACCGTAACTGGTAGCTTAGATGTTACAGGAACTCGACTCAAAACGTGGCGCTTAGAAGTAGATGGTGGCGGAACTGTACTTGGCGGAACTATTGATGTTGCCGGTAAGGCAGTGTTTTCTAAAGATATTTTAGTTGAAAAGCAATTAGATGTTCGAGGTGCTGGAGCTTGTCACTTACGCTTTAGTAAAGCTGATGGTTCTGAAAAAGGACTAATTTATGCTGACGATGATAAAAATGTTAGTATTAGAAGTGGCGGCGACAACGGTCCGTCATGGAATTTCTGGTCTAGCGGTTCATGTCAATTCCCTGGAGCCATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTTATTACCCTGGTGGTAATAAAAACGACTATTTAAACACAGCAGGATTAGTATCTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCGTTATATTTCCAAGAATATGTAGGAAACTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGATACGGCGAAGACGATAGCTTTTACTTTAGATCTGGCGGTGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGGTCATTCGATAACGTAGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAAACACTGAGCGGTAATACGTATGTGCTTCACAACACATCTGGCGGTACTACCCGTTCTGCGGGTTTAATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAGGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCTCTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
dddc2fc7649857f5dcf06bae1b7465c0b10d25c58eb663fe8427f1ab309c4216
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Environmental Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca bacteriophages and their therapeutic applications | Weber-Dabrowska,B., Zaczek,M., Lusiak-Szelachowska,M., Laczmanski,L., Owczarek,B., Orwat,F., Lodej,N., Kaszowska,M., Gorski,A. and Lobocka,M. | — | — | GenBank |