Protein

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Genbank accession
WGH49928.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSSIKVPDTISKLSPDDSYPVVEGVDVGGFPELQAKVTEHETKITTNVDAIKALEPVGKTFTFVGKTTPTYTNAPHGNYVVSIRALQNSIDVYGPLHDNLLDGTIFTIHNEDFTDTIKLRPGDSAYTFEYASMINMLPETFATYVYRSDKKVFVQLESGYLPTSKVNLSSTIKSQIEADGYIRSFPVDGDGGTHSLGANAFEFEGATISQGSKPNIAKVTITGGGSGTVISLKDKENTTWSPVSNIYFPQAEFNQDGTWTKVTFPVGSNGITMIDKDGDSAPNITSATFNNMNITHDGNGNAVINQQTGIDVGAGGNTYNAIEKINFNNMNPTVDSQDGSLYLTPTASGSIDVEDLDAPNSFIDAANLKFHHTNITSDPNDQDALILTPYIKMGGHHTNNITLDDNFVFKDDGSNNGTLEIKHGAFEKGQAPGFFSYLKSNEFVRTNNPDYTDDENYKYKAGIFPTELSVTPNAFLNIDMTKKELQLQEVDMLDPNVTGGTDFLIIFRAAMVGKAMTSGRISTVVIDDATNKPLLDISGNPFIFSKWVDVGDDLGVMHSLGIANFKGVRGITFHVNTSWDLQEFPLELGNRTNGGTCVMAQALTSTSRTGEALQQYELDTNQSVMFDTYHLGKDHYNIHTAIDDRDPLDIALSADQHLKLPDGAFVYSKYGNLITTTNNVLEISGIPNVNSDFALVKTFSADETLAMKGKDINVTMNISNPTVGVDLYLAIWEGAPNEYTYDFIKGRNQNGSPMTAANWVIKDILYHDSKPDNAYYNINKTFTIPRGVSDTNYAIVIVPSSEVYSDSIKIKDLQVDVAEPFNTYYIHGLKDKNESHLIYDPGYVRFWLANLYYASFRYTMDSKETPYPCGYVIRGKGPVVQDQTYNMVPGSVNNKGEGGMKFLEDGIANLNTKLLLWSEKDHNTTATFWWAKVMPDGTFSEIPETRTVFNVESGWKEVQCKMKEANVKVAADEILVLRGMSSELDGAFLESTDKSNPLVITDVIFTGLVSSSLYDDPELISSPMDAKLQVDRRVFEFSNNQSPNIVIDLNIEDGVELANYSAVHMSNNKVIPLTNAEFSYDSVLKKLTVHVGNNVTEGKIYLEFWG
Physico‐chemical
properties
protein length:1106 AA
molecular weight: 121810,55900 Da
isoelectric point:4,70140
aromaticity:0,09855
hydropathy:-0,31474

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudoalteromonas phage vB_PtuP_Slicky01
[NCBI] 		3038240 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WGH49928.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ508958 [NCBI]
CDS location
range 20846 -> 24166
strand +
CDS
ATGAGTTCAATTAAAGTACCAGATACTATATCAAAACTAAGTCCCGATGACTCATACCCTGTAGTAGAAGGGGTAGATGTCGGAGGATTCCCAGAGTTACAAGCTAAAGTAACAGAACATGAAACAAAGATTACAACCAATGTAGATGCCATCAAGGCATTGGAACCTGTAGGTAAGACCTTTACCTTCGTGGGTAAGACAACACCTACATACACAAATGCACCACATGGTAACTATGTTGTTTCCATTAGAGCCTTACAGAATTCAATAGATGTATATGGCCCTTTACATGACAACTTACTAGACGGTACTATCTTTACAATACACAATGAAGACTTTACAGATACTATTAAACTAAGACCTGGGGATTCTGCATATACATTCGAGTATGCATCAATGATTAACATGCTACCAGAAACCTTTGCTACTTATGTATATAGGTCTGATAAGAAAGTATTCGTACAGTTAGAGAGTGGTTATCTCCCTACGTCTAAGGTTAACTTAAGTAGCACAATCAAGAGTCAGATAGAAGCTGACGGTTACATTAGAAGTTTCCCTGTTGATGGTGATGGTGGTACTCATAGCTTAGGTGCTAATGCCTTTGAGTTTGAAGGAGCTACAATATCACAAGGTTCTAAACCTAACATAGCTAAGGTAACTATTACTGGTGGTGGTAGTGGTACAGTTATATCCCTTAAGGACAAAGAGAATACTACATGGAGTCCTGTTAGTAACATATACTTCCCTCAGGCTGAGTTCAACCAAGATGGTACTTGGACAAAGGTAACATTCCCTGTAGGTTCCAATGGTATAACTATGATAGATAAGGATGGTGATTCAGCCCCTAACATTACTAGTGCTACGTTCAATAACATGAATATAACACACGATGGTAATGGTAATGCTGTGATAAACCAACAGACTGGTATTGATGTAGGTGCAGGTGGTAATACATATAATGCTATTGAGAAGATTAACTTCAATAACATGAACCCTACTGTGGATTCACAGGATGGTAGCTTATACTTAACCCCCACGGCCTCAGGATCTATAGACGTTGAGGACTTAGATGCCCCTAACTCTTTCATTGATGCAGCTAACTTAAAGTTCCATCATACTAATATAACTTCTGATCCTAATGACCAAGATGCTTTAATCCTGACCCCTTACATTAAGATGGGTGGACATCATACTAATAACATAACCTTAGATGATAACTTTGTATTTAAGGATGATGGTAGTAACAATGGAACCTTAGAGATTAAGCACGGTGCCTTTGAGAAAGGTCAAGCACCGGGATTCTTTAGTTACCTTAAGAGCAATGAGTTCGTTAGGACTAACAATCCTGACTACACAGATGATGAAAACTACAAGTATAAGGCTGGTATATTCCCTACGGAACTTTCAGTAACCCCTAATGCTTTCCTCAATATAGATATGACTAAGAAAGAACTACAGTTACAGGAAGTTGATATGTTAGATCCTAATGTAACTGGTGGTACTGACTTCCTTATAATCTTTAGGGCTGCTATGGTAGGGAAAGCTATGACATCAGGTAGGATTTCAACTGTAGTTATAGATGATGCAACTAATAAACCTCTGTTAGATATCTCAGGTAATCCATTTATATTCTCTAAGTGGGTAGATGTTGGTGATGACCTAGGTGTTATGCATTCTTTAGGTATTGCCAATTTCAAAGGTGTACGAGGGATTACATTCCACGTGAATACCTCATGGGATCTACAGGAATTCCCATTGGAGCTAGGTAATAGAACTAATGGTGGTACCTGTGTAATGGCTCAGGCTTTAACATCTACTTCTAGAACTGGTGAAGCATTACAGCAGTATGAGTTAGATACTAACCAGAGTGTTATGTTTGATACATATCACTTAGGTAAAGATCATTATAATATCCATACTGCTATTGATGATAGAGATCCTTTAGACATTGCGTTATCAGCAGATCAACATCTTAAACTACCTGATGGTGCTTTTGTATACTCTAAGTATGGTAACTTAATTACTACCACTAACAATGTCTTAGAGATATCAGGTATCCCTAATGTTAATTCTGACTTTGCTTTAGTTAAGACCTTTAGTGCCGATGAGACTCTAGCAATGAAAGGGAAAGATATAAATGTAACTATGAATATTAGTAACCCTACAGTTGGTGTTGATTTATACCTAGCTATCTGGGAGGGTGCTCCTAATGAATATACATATGACTTCATTAAGGGTAGGAATCAAAATGGTAGTCCTATGACAGCAGCTAACTGGGTTATTAAAGATATTCTATATCATGATTCTAAACCAGATAATGCTTACTATAATATAAATAAAACATTCACTATCCCTAGGGGAGTTTCAGATACCAACTATGCTATTGTAATAGTTCCATCTTCTGAGGTTTACTCTGATTCCATTAAGATTAAAGATCTTCAGGTAGATGTAGCTGAGCCATTCAATACATACTACATACATGGCCTCAAGGATAAGAATGAAAGTCACTTGATCTATGATCCTGGGTATGTAAGGTTCTGGTTGGCTAACCTATACTATGCTAGCTTTAGGTATACTATGGATTCAAAGGAAACTCCATACCCTTGTGGTTATGTTATTAGAGGTAAAGGTCCTGTAGTACAAGATCAAACTTATAACATGGTACCTGGTTCAGTTAATAATAAAGGTGAAGGTGGTATGAAGTTCTTGGAGGATGGTATTGCTAACTTGAATACTAAGTTACTACTTTGGTCAGAGAAAGATCATAACACCACTGCTACATTCTGGTGGGCTAAGGTAATGCCTGATGGTACATTCTCAGAAATACCTGAGACTAGAACTGTTTTTAATGTAGAGTCTGGATGGAAGGAAGTACAATGTAAAATGAAGGAAGCTAATGTTAAAGTAGCTGCTGATGAGATCTTAGTACTACGTGGTATGAGTAGTGAGCTTGATGGGGCTTTCCTAGAATCTACTGATAAGAGTAATCCTTTAGTTATTACTGATGTAATCTTTACAGGTTTAGTATCAAGTAGTCTATATGATGATCCTGAGTTAATCTCTAGTCCTATGGATGCGAAGTTACAGGTTGACAGGAGAGTATTTGAATTCTCTAATAACCAATCACCTAATATAGTAATTGATTTAAATATAGAAGATGGCGTAGAACTGGCTAACTATTCAGCAGTACATATGTCTAACAACAAGGTAATACCATTAACAAACGCTGAGTTTAGTTATGACTCAGTACTCAAGAAGCTGACTGTGCATGTAGGTAATAATGTTACAGAGGGTAAGATTTACTTAGAATTTTGGGGGTAA

Tertiary structure

PDB ID
66708298133654e036850acf4c349248d9b8ea49b984b2831a57ff9943dd7714
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4043
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecogenomics reveals distinctive viral-bacterial communities in the surface microlayer of a natural surface slick Rahlff,J., Wietz,M., Giebel,H.-A., Bayfield,O., Nilsson,E., Bergstrom,K., Kieft,K., Anantharaman,K., Ribas-Ribas,M., Schweitzer,H.D., Wurl,O., Hoetzinger,M., Antson,A. and Holmfeldt,K. 2023 — GenBank