Protein

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Genbank accession

YP_009323184.1 [GenBank]

Protein name

baseplate wedge subunit

RBP type

Evidence RBPdetect2

Probability 0,93

Protein sequence

MALFYQSGRVSRFAVGTPGFSTNRDLTLNVSGAIGIETTKPRGSIDTPEISIRGPIIDSGINTGGLGYFLSQDVEGVKWVAASPEDLTFIRVFEDNVQVGVSSFSGLNFISNDSSLFDIKESPIGPNIADINFNTYWIRTEYGNNAGISTGYGPDGTYASLPGYGTSEAVGVTSVGIGTDNPQDDFQVGIGSTGVTINGPEGKLEAEIIKAKNLELDGNITVRSLVVDPGIATFRGNIDAQGISSFTGDVIAGFATIQELYVNDLEVELFRAGVSTLGFGQSASSFTIVENSLEVQGAIGTFINDLYVGNDLYVAGDTFFNQINAENIQVTGIATLNNVEGNTGIFTSFEVTGITTLNQLEFNTGVGTDLQLESSTIGVLTATDVSAGVATIGFANIDDANISGIVTVTEVDVEEIDIERAQVGILTITEGLSVTGTSTFVGLVTVTGDAFIDGDLTVTDQFTVQDLGAENLEVTGIGTIVNLESNVGIITTLFTEGSVNTGVGTFNVVEANDIQSGTGTIGGVGFESGRLEGTELDFDIGRIGILTGDLLSYGIGTFRDRLDSPGISNIAVAIGNTLNYDSTSQINGVTFGDELVDIFNRDLRVTGITTFTGVGTFGSDLYVKEDLFVGGELSFEQLTGTNLQVLGIATVNQLDLNTGIGTFLDLEFLQVGVATITNLLGTISTITRMDSGTVAVTTDPGKYPTSDGQFYADRSFIEFSNALDSRTTDFVARETADIQGTLEVVGLSTFDSDIDVNADINVSGLTTTNFLFAGVGTILLLDTDFIDSDEINAGIITTQDLVVTGSADFQGDVVVDIGGTANITNANIGFASVTEEVVGTSTVGFLSATDANIGVATVGLLSATDAEIEDLEVNTFRAGIATVGFGSFGTDPNEGSLYVTGINTFVGFTTFTGEVYVDGDLTVSGITTFKQLDAEQSQIGILTTKTLLDSNGLIDAENVAISTNLTVSGLTTLTGFTTTSDVIVGGGLTVVGDTTFLGIVSITDTLFVNQEITGIATVNNLNFNVGVGSTLSVGFLTATDLYVAGVSTFVGVGTFQNDLYVSKDLFVERNIVAAAISAENYFASGVSTFSNTIIDGALGVTSSVGIAKTLIVGGDVVVGGGITFEGDTELIGNVNVLGIATFNELNFDVGVGNTLTLEDLNVNGTINANGAGVATIGGSPSFENLTVTGITTLGFTTVQGNLNVTGDLIVGDDIVFDEATLRNINVSGLSSLNSVGYNVGIGSTLTIEKKLTVEGYTDLKGEVRVGGASTFVGFATFQDGLSVLGNLNVTGDIVSSDATYGDLTVTNTLTSDNNLQGNIGNFKELTVTDDFKSNGTATLFTVGVQTVSISTELSVSGLTTLTGEFEFNEAEGYELTVEKLNVNADGEVNLPGVAFTNKDAVFPNLEVIGVSTFKGFVDVNSDVDISGITTIGTNIKIDGGARRIDVGGSFIQGASAIPFQEAEVSSGKATFTRLIVTNNSDESTFAGDVEITGELQVSSASTFASITAQSIDSIGSVDIGDNLTVDNNLEVKERTDLKDLYVSGIASLNGASFGDGGEATFEKINVTGLSSLTSVSVSETLGVSGLTTMTDLNVSGVATIGLTSTTNLQFTNGDGYELEVYSLTVPTGGFVSLPGIPVSDGGAQFSELKVTGVSTFSGIATFSDSIYVNGDLVVEGNQVFSGISGEDINVTGILTTQSFNVGGASTFVGVGTFQNDLYVADDLFVKRDLLVGGAATVGTLTATDARFQNVIVDGNLTGASDGSAIIIDGGSVISGIVTIGPASITLNGLPGQEIIEIGTGSGNVIAGLNTFTNDPSHVKVDEGRFNTFITVSGAGSTSTFEGDLDVEGDITVKGSQVFEGGAQAQDFNVSGITTTENLKVNSESTFAGVGTFQDNLFVADDLFVARNANIVGIITAQDLNSTSDRRVKENIKPIDDALNKVTQLNGITFSFINTGTKSAGVIAQEVEAVFPDMVKGDFPKSVNYNGLIGALIESVKELKEQNEELRSRIEKLES

Physico‐chemical properties

protein length:	2014 AA
molecular weight:	208789,31310 Da
isoelectric point:	4,05003
aromaticity:	0,07448
hydropathy:	0,20924

Domains

Domains [InterPro]

DC_0407
STR
125–345

DC_0407 DC_0407 DC_0407 DC_0407 DC_0407 DC_0407 DC_0203

DC_0407
STR
1120–1261

DC_0407 DC_0407 DC_0407 IPR030392

IPR030392
CHP
1923–1975

IPR030392 Coil

YP_009323184.1

1 2014

Architecture

STR

RBD

STR 125-345 | STR 515-708 | STR 829-947 | STR 1017-1769 | RBD 1895-2014

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0407	STR	DC_0407	125	345	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	515	708	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	829	947	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	1017	1136	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	1120	1261	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	1255	1439	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	1430	1615	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	1602	1701	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0407	STR	DC_0407	1695	1769	Novel HMM	DC_0407	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0203	RBD	DC_0203	1895	2014	Novel HMM	DC_0203	C-terminal	Low	Positional only	178 proteins / 178 hits
IPR030392	CHP	DC_0088	1923	2009	InterPro cluster	Intramolecular chaperone auto-processing domain	C-terminal	High	Text match	3502 proteins / 3959 hits
IPR030392	CHP	DC_0088	1923	1975	InterPro cluster	Intramolecular chaperone auto-processing domain	C-terminal	High	Text match	3502 proteins / 3959 hits
Coil	Unmapped	-	1988	2008	Coils	Coil	-	-	-	-

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage S-CAM7 [NCBI]	1883368	Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Mazuvirus > Mazuvirus scam7
Host	Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI]	32051	Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

YP_009323184.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

NC_031927 [NCBI]

CDS location

range 200018 -> 206062
strand +

CDS

ATGGCATTATTTTATCAGTCAGGCAGAGTAAGTAGATTCGCAGTAGGTACACCTGGGTTTTCAACCAACAGGGACCTAACTCTTAATGTGTCTGGCGCTATTGGTATTGAAACTACTAAACCTAGGGGGAGCATTGATACTCCAGAGATTAGTATTAGAGGACCAATTATTGACTCAGGAATCAATACAGGTGGTTTAGGATATTTCTTATCACAGGATGTAGAAGGTGTTAAGTGGGTTGCTGCTTCACCAGAAGACTTAACATTTATTAGAGTATTTGAAGATAATGTACAGGTTGGCGTTAGTTCCTTCAGTGGACTAAACTTCATATCAAATGACTCTTCATTATTTGATATTAAAGAAAGTCCAATTGGTCCCAATATTGCGGACATTAATTTTAATACATACTGGATTAGAACCGAGTATGGTAATAACGCAGGTATTTCAACTGGCTATGGACCAGACGGCACCTATGCTTCCCTCCCTGGTTATGGAACCAGCGAAGCAGTAGGTGTTACTTCTGTTGGTATTGGTACAGACAATCCACAAGATGACTTCCAAGTTGGTATTGGATCCACTGGTGTTACTATCAATGGACCTGAAGGTAAGCTAGAAGCAGAAATTATTAAAGCCAAGAACCTTGAGCTTGATGGTAATATTACTGTTAGATCACTAGTTGTTGATCCAGGTATTGCTACATTCCGTGGAAATATTGATGCTCAAGGTATCTCTAGCTTCACTGGGGATGTTATAGCTGGGTTCGCTACTATACAGGAGCTATATGTAAATGATTTAGAGGTTGAATTATTCAGGGCAGGTGTATCAACATTAGGTTTTGGACAATCGGCATCTTCATTTACTATTGTAGAGAATAGTTTAGAGGTTCAGGGTGCTATTGGTACATTTATCAATGATCTATATGTCGGAAATGACCTTTATGTTGCTGGTGATACATTCTTCAACCAGATCAATGCCGAAAATATTCAAGTAACAGGCATTGCGACATTAAATAATGTTGAAGGAAACACGGGGATCTTCACTAGCTTTGAAGTAACAGGGATCACCACACTAAATCAGCTTGAGTTTAATACGGGAGTAGGTACTGATTTACAGTTAGAGTCTTCAACTATTGGTGTATTAACAGCGACTGATGTTAGTGCTGGTGTTGCTACTATTGGCTTTGCTAATATTGATGATGCTAATATCAGTGGTATCGTAACAGTAACCGAAGTTGATGTAGAAGAGATTGATATTGAGCGTGCCCAAGTAGGCATCCTAACAATCACTGAGGGTCTATCAGTAACTGGTACCAGTACCTTTGTTGGTCTAGTAACCGTAACTGGCGACGCATTCATTGATGGTGACCTAACAGTTACTGATCAGTTCACAGTACAAGATCTAGGAGCAGAGAACCTAGAAGTAACTGGTATTGGTACCATTGTAAATCTAGAATCTAATGTTGGTATTATCACCACATTGTTCACAGAAGGTTCTGTTAATACTGGTGTTGGTACATTCAATGTTGTTGAAGCCAATGATATTCAGTCAGGCACTGGTACTATTGGTGGTGTTGGCTTTGAGTCTGGTAGGCTAGAGGGAACTGAACTAGATTTTGATATTGGTCGCATCGGTATTCTAACTGGTGACCTACTCAGTTATGGTATTGGTACATTTAGAGATAGGCTAGACAGCCCAGGCATCTCTAATATTGCCGTTGCTATTGGTAATACTCTAAACTATGATAGCACATCACAGATTAATGGTGTTACATTTGGTGATGAGTTAGTAGATATATTCAATAGAGACCTAAGAGTAACTGGCATAACAACCTTTACTGGTGTGGGTACATTCGGATCAGATCTATATGTAAAAGAAGATCTATTTGTTGGTGGTGAACTAAGTTTTGAACAACTAACAGGTACCAACCTACAGGTTCTAGGTATCGCAACAGTTAATCAACTAGATCTAAACACAGGTATTGGTACCTTCCTAGACCTAGAGTTCCTACAAGTTGGTGTTGCTACTATCACCAACCTACTAGGAACGATCTCAACAATCACCAGAATGGACTCTGGTACTGTTGCTGTTACTACTGATCCAGGTAAATATCCAACATCAGACGGTCAGTTCTATGCTGATAGATCATTCATTGAATTTTCTAATGCCCTTGATAGTCGCACCACAGACTTTGTTGCTAGAGAAACAGCAGACATCCAAGGTACATTAGAAGTTGTTGGTCTATCAACATTCGATTCTGATATTGATGTAAACGCAGATATCAATGTATCTGGTCTAACTACAACCAACTTCCTATTCGCTGGCGTAGGTACAATCCTACTATTAGATACAGACTTCATTGACTCTGATGAGATCAACGCAGGTATCATTACAACCCAAGATTTAGTTGTTACAGGTTCTGCTGACTTCCAAGGAGATGTTGTTGTAGACATCGGTGGTACAGCTAATATCACCAACGCAAACATTGGGTTCGCTAGCGTCACTGAGGAGGTCGTAGGAACCTCTACAGTAGGCTTCTTGAGTGCTACTGATGCGAACATCGGCGTAGCAACTGTCGGGCTTCTAAGCGCCACAGATGCAGAGATAGAAGACCTTGAGGTTAATACATTCCGTGCTGGTATTGCTACGGTAGGCTTCGGTTCATTCGGCACTGATCCAAATGAAGGTTCCCTATATGTAACGGGTATCAATACATTTGTTGGCTTCACTACATTCACTGGAGAGGTTTATGTTGATGGTGACCTAACAGTATCAGGTATTACAACATTCAAGCAGTTGGATGCGGAACAATCACAGATTGGTATCCTAACCACCAAGACTCTACTAGATTCTAATGGTCTAATCGACGCAGAGAATGTTGCTATCAGCACAAACCTAACAGTTTCTGGTCTAACAACTCTAACTGGATTCACTACTACTAGTGATGTTATCGTTGGCGGTGGACTAACAGTTGTTGGTGATACAACATTCCTAGGAATTGTATCTATTACTGATACATTATTCGTCAACCAGGAAATCACTGGTATTGCTACTGTAAACAACCTCAACTTCAATGTTGGTGTTGGTTCTACGTTGTCTGTAGGCTTCCTCACTGCTACTGACCTATATGTTGCTGGGGTTTCTACCTTCGTTGGTGTAGGCACCTTCCAGAACGACCTATACGTCTCTAAAGACCTCTTTGTTGAGCGTAATATTGTAGCTGCTGCTATCTCCGCAGAGAACTACTTTGCTAGTGGCGTATCAACATTCAGTAATACTATTATTGATGGGGCACTTGGCGTTACTAGCTCTGTTGGTATTGCTAAAACTCTTATTGTTGGTGGTGATGTAGTTGTTGGTGGTGGTATTACTTTTGAGGGTGATACCGAACTAATAGGTAACGTTAATGTCCTAGGTATCGCAACATTCAATGAGCTTAACTTTGACGTTGGCGTAGGAAATACACTTACATTAGAAGACCTCAATGTTAATGGGACTATCAATGCTAATGGAGCTGGTGTTGCTACTATTGGTGGCTCACCATCCTTTGAGAACCTAACTGTTACTGGGATTACTACACTAGGATTTACCACAGTTCAAGGTAACTTGAATGTTACTGGTGACTTAATTGTCGGTGATGATATTGTATTTGATGAAGCCACTCTAAGGAACATCAATGTTTCTGGCTTATCATCTCTAAATTCAGTAGGTTATAATGTTGGTATTGGTAGTACCTTAACTATTGAGAAAAAGCTTACTGTAGAAGGATACACTGATCTAAAAGGTGAAGTAAGAGTTGGTGGAGCGTCAACATTTGTTGGGTTTGCAACATTCCAAGATGGATTATCTGTTCTAGGCAACCTTAATGTTACTGGTGATATTGTCTCTAGTGATGCAACTTATGGAGACCTAACGGTAACAAATACATTAACATCAGACAATAATTTACAGGGTAATATAGGTAACTTCAAAGAACTAACAGTAACTGATGATTTCAAATCCAATGGAACAGCTACTTTATTTACAGTAGGTGTTCAGACAGTATCTATCTCAACCGAATTATCTGTTAGTGGTTTAACTACACTCACTGGAGAATTTGAATTTAATGAGGCTGAAGGTTATGAACTAACAGTAGAGAAGCTCAACGTAAATGCTGATGGTGAGGTTAATCTTCCTGGTGTTGCCTTTACAAATAAGGATGCAGTATTCCCCAACCTAGAAGTGATTGGGGTATCTACATTCAAGGGATTCGTGGATGTCAATTCTGATGTTGATATCTCAGGCATTACGACTATAGGGACAAATATTAAAATCGATGGTGGTGCTAGAAGAATTGATGTAGGTGGTTCATTTATCCAGGGTGCTAGTGCAATCCCATTCCAGGAAGCTGAAGTTTCATCTGGTAAAGCTACATTTACAAGATTAATTGTAACTAATAATTCAGATGAATCAACATTTGCTGGTGATGTTGAAATTACAGGTGAACTTCAGGTTAGTTCAGCAAGTACCTTTGCATCTATTACTGCACAATCAATTGATTCTATTGGTAGCGTAGATATTGGAGACAATCTAACAGTAGATAACAACCTAGAAGTTAAGGAAAGAACTGACCTTAAAGATCTATATGTAAGTGGTATTGCTTCACTAAACGGTGCTAGTTTTGGTGATGGTGGTGAAGCTACCTTCGAGAAGATCAATGTAACTGGTCTATCATCACTCACATCAGTAAGTGTATCAGAGACCCTTGGGGTTAGTGGTCTAACCACTATGACTGACTTAAATGTTAGTGGTGTAGCAACAATTGGTCTAACATCAACAACTAACCTACAATTTACTAATGGGGATGGTTATGAACTAGAAGTTTACAGCCTCACAGTTCCTACTGGTGGTTTTGTAAGCCTTCCAGGAATTCCAGTCAGTGACGGTGGAGCACAATTCTCCGAACTTAAAGTCACTGGAGTATCGACATTCTCTGGTATCGCAACATTCTCTGATAGCATTTATGTAAATGGTGACCTGGTTGTAGAAGGCAACCAAGTATTCTCTGGTATTAGTGGAGAAGACATTAATGTTACTGGTATTCTTACTACACAAAGTTTTAATGTTGGTGGGGCATCAACGTTCGTTGGTGTTGGTACTTTCCAAAACGATCTGTATGTAGCTGATGATCTATTCGTCAAGAGGGATCTCTTGGTGGGTGGTGCTGCAACCGTAGGTACTCTAACTGCAACCGATGCACGTTTCCAAAACGTAATTGTTGACGGCAACCTTACAGGAGCCAGTGATGGTTCAGCCATTATTATTGATGGTGGTTCAGTAATTAGTGGTATTGTAACTATTGGACCAGCTTCAATTACATTGAATGGTCTTCCAGGACAAGAAATAATTGAAATTGGAACTGGTAGTGGAAATGTTATTGCTGGTCTCAATACATTTACAAATGACCCATCCCACGTCAAGGTTGATGAGGGAAGATTCAATACATTTATTACTGTATCGGGTGCGGGTTCTACTTCAACCTTCGAGGGTGATTTAGATGTTGAGGGGGACATTACTGTAAAGGGTAGTCAAGTATTTGAAGGTGGCGCACAGGCACAAGACTTTAATGTTAGTGGTATTACTACAACAGAAAACTTGAAAGTTAATAGTGAATCAACTTTCGCAGGTGTTGGTACTTTCCAAGACAATTTGTTTGTTGCTGATGATCTATTCGTAGCAAGAAATGCGAATATTGTAGGTATTATTACTGCCCAAGATCTTAATTCTACATCTGATAGAAGGGTCAAAGAGAACATTAAGCCCATTGATGATGCCCTCAATAAAGTAACTCAACTTAATGGTATTACATTTAGCTTTATTAATACTGGTACAAAGTCTGCTGGTGTTATTGCACAGGAAGTTGAGGCAGTATTCCCCGATATGGTCAAGGGAGATTTCCCCAAGTCTGTTAACTACAATGGATTGATCGGTGCTCTTATTGAATCCGTTAAGGAGCTTAAGGAGCAGAACGAGGAGCTACGAAGTCGAATAGAAAAGTTGGAATCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

dcddaca4447bd8e68dd4810a491461be5fa34ec72e34d4d3204035694529cbee

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,4498

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence