Protein

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Genbank accession
XHB06895.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSQLNSIDTIRSEDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMIGDLGIVKLLYGGKAVFDPTDSSEITIGDILKAFKINSNGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAVSNTFREAQTILSNNETLIVKNITKGVALYIRGKDADGTNRWYLGNDQNGTDNFVLKNVKTGVSIAMLENLASVNSTLQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGENTFSKAVSVVANKAAIMLQNKDLNSELFILARDSEYNNLWFIGKGDTSSDITFYDYKGGTSITLNSSGAVFNKNVKITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFNGVQKVVTDNEALIVKNSTQNRPLYIRGVDTANVSRWWVGVGGADTNDVTLNNSFSGTQLVLGNSSASINKTLSLAGQVQPSDWSNIDARYYGKAEADAKYIWSTSRGAVREEDGSVAWNQPSGIYTELIKGGGSSRLVLNLFTNASTSTPSAQLRFDYRNGGMWYRTARDAFGFEAEWSKVYTEAQKPTPSEIGAYTKAETDQKIAEAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVALSVGNLPSHTHSFSATTSTFDYGTKYTDGQGAHDHDRGNMEIHGDFGFFRSDASSFYTASGSFAISGSQASRGYTGNNFTYGTPVNFYASRTWTGRTSWVGAHAHGVGIGAHNHTVSGNTGVTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:791 AA
molecular weight: 86022,13500 Da
isoelectric point:7,19465
aromaticity:0,09987
hydropathy:-0,37838

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–266
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–219
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388
XHB06895.1
1 791
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-266 | STR 267-276 | ATT 277-357 | STR 358-382 | ATT 383-471 | STR 472-787 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage GEP101
[NCBI] 		3289857 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli ATCC 35150
[NCBI] 		1389955 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB06895.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ036202.1 [NCBI]
CDS location
range 21745 -> 24120
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTCAACTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGAAGACCTATTGCACATCAGAGTTAAGAAAAGACCTGAAATGTTGGGCGATGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCTTCCTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGGAGTACTATGATTGGGGATTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTACGGTGGCAAGGCTGTATTTGACCCAACAGATTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATATTTTAAAGGCTTTTAAAATTAACTCAAATGGTCTTAAACTCACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGCATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATTCAAGATTGGCTGTAAGTAACACCTTTAGAGAAGCTCAAACTATTCTCTCTAATAATGAGACTCTTATTGTTAAAAATATCACAAAAGGTGTAGCACTCTATATTCGCGGTAAAGATGCTGATGGTACTAATAGATGGTATCTTGGTAATGACCAAAATGGTACAGATAATTTTGTATTGAAGAATGTAAAAACTGGTGTCTCAATTGCTATGTTAGAAAATTTAGCGTCAGTCAATAGCACTCTTCAAATCACGGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGACGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAATACTTTTAGCGGTGAAAATACATTCAGTAAAGCTGTTTCCGTAGTAGCTAATAAAGCTGCTATCATGCTACAGAATAAAGACTTAAATAGTGAGTTGTTCATCCTAGCAAGAGATAGTGAATACAATAATCTATGGTTTATTGGTAAAGGAGATACCAGTTCTGATATCACATTCTATGATTACAAGGGTGGTACATCTATTACCTTAAACTCGTCTGGCGCAGTATTTAATAAGAATGTAAAAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAATGGTGTGCAGAAAGTTGTTACGGATAATGAAGCCCTAATTGTGAAAAACTCTACTCAGAACAGACCATTGTATATCCGTGGTGTGGACACTGCTAATGTTTCAAGATGGTGGGTAGGTGTTGGTGGGGCAGATACTAATGATGTAACCCTAAATAACAGTTTTTCTGGCACTCAGTTAGTTTTAGGTAACTCATCTGCAAGTATCAATAAGACATTATCTCTAGCTGGACAGGTTCAACCAAGTGACTGGTCTAACATTGATGCAAGATATTACGGTAAAGCCGAAGCCGATGCGAAGTATATCTGGTCAACATCCAGAGGCGCAGTAAGAGAAGAGGATGGTAGCGTAGCTTGGAATCAACCTTCAGGAATCTATACAGAGCTTATCAAGGGTGGTGGTTCGAGCCGTTTAGTATTAAACCTCTTCACGAACGCCTCAACCTCTACACCATCTGCACAATTGAGATTCGATTACAGAAATGGTGGAATGTGGTACAGAACAGCCAGAGACGCATTTGGTTTTGAGGCTGAATGGTCTAAGGTTTACACTGAAGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCAGAAGCGATTAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCTAATGGCTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAGCGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCATAGTTTCTCTGCTACCACTTCGACGTTTGATTATGGCACTAAGTACACAGATGGTCAGGGTGCTCACGACCATGATAGAGGTAATATGGAAATTCATGGTGATTTTGGTTTCTTCAGGAGTGACGCATCAAGCTTCTACACTGCTAGTGGGTCTTTTGCTATCTCAGGTTCACAAGCATCTAGGGGGTACACAGGTAATAACTTCACTTATGGTACTCCTGTTAACTTCTATGCCTCTAGAACTTGGACAGGTAGAACAAGTTGGGTAGGTGCTCATGCACATGGTGTAGGTATTGGTGCTCACAACCATACGGTAAGTGGTAACACTGGTGTTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGCTAATGGCTTGGGTAAGGACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
50f8559ec571fbcc1ef1338db8d9ce539a7754eb1afd1d824bb55e32acf455ab
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6841
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50