Protein
View in Explore- Genbank accession
- XHB06895.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSQLNSIDTIRSEDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMIGDLGIVKLLYGGKAVFDPTDSSEITIGDILKAFKINSNGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAVSNTFREAQTILSNNETLIVKNITKGVALYIRGKDADGTNRWYLGNDQNGTDNFVLKNVKTGVSIAMLENLASVNSTLQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGENTFSKAVSVVANKAAIMLQNKDLNSELFILARDSEYNNLWFIGKGDTSSDITFYDYKGGTSITLNSSGAVFNKNVKITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFNGVQKVVTDNEALIVKNSTQNRPLYIRGVDTANVSRWWVGVGGADTNDVTLNNSFSGTQLVLGNSSASINKTLSLAGQVQPSDWSNIDARYYGKAEADAKYIWSTSRGAVREEDGSVAWNQPSGIYTELIKGGGSSRLVLNLFTNASTSTPSAQLRFDYRNGGMWYRTARDAFGFEAEWSKVYTEAQKPTPSEIGAYTKAETDQKIAEAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVALSVGNLPSHTHSFSATTSTFDYGTKYTDGQGAHDHDRGNMEIHGDFGFFRSDASSFYTASGSFAISGSQASRGYTGNNFTYGTPVNFYASRTWTGRTSWVGAHAHGVGIGAHNHTVSGNTGVTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 791 AA molecular weight: 86022,13500 Da isoelectric point: 7,19465 aromaticity: 0,09987 hydropathy: -0,37838
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage GEP101 [NCBI] |
3289857 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB06895.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ036202.1
[NCBI]
CDS location
range 21745 -> 24120
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTCAACTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGAAGACCTATTGCACATCAGAGTTAAGAAAAGACCTGAAATGTTGGGCGATGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCTTCCTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGGAGTACTATGATTGGGGATTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTACGGTGGCAAGGCTGTATTTGACCCAACAGATTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATATTTTAAAGGCTTTTAAAATTAACTCAAATGGTCTTAAACTCACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGCATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATTCAAGATTGGCTGTAAGTAACACCTTTAGAGAAGCTCAAACTATTCTCTCTAATAATGAGACTCTTATTGTTAAAAATATCACAAAAGGTGTAGCACTCTATATTCGCGGTAAAGATGCTGATGGTACTAATAGATGGTATCTTGGTAATGACCAAAATGGTACAGATAATTTTGTATTGAAGAATGTAAAAACTGGTGTCTCAATTGCTATGTTAGAAAATTTAGCGTCAGTCAATAGCACTCTTCAAATCACGGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGACGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAATACTTTTAGCGGTGAAAATACATTCAGTAAAGCTGTTTCCGTAGTAGCTAATAAAGCTGCTATCATGCTACAGAATAAAGACTTAAATAGTGAGTTGTTCATCCTAGCAAGAGATAGTGAATACAATAATCTATGGTTTATTGGTAAAGGAGATACCAGTTCTGATATCACATTCTATGATTACAAGGGTGGTACATCTATTACCTTAAACTCGTCTGGCGCAGTATTTAATAAGAATGTAAAAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAATGGTGTGCAGAAAGTTGTTACGGATAATGAAGCCCTAATTGTGAAAAACTCTACTCAGAACAGACCATTGTATATCCGTGGTGTGGACACTGCTAATGTTTCAAGATGGTGGGTAGGTGTTGGTGGGGCAGATACTAATGATGTAACCCTAAATAACAGTTTTTCTGGCACTCAGTTAGTTTTAGGTAACTCATCTGCAAGTATCAATAAGACATTATCTCTAGCTGGACAGGTTCAACCAAGTGACTGGTCTAACATTGATGCAAGATATTACGGTAAAGCCGAAGCCGATGCGAAGTATATCTGGTCAACATCCAGAGGCGCAGTAAGAGAAGAGGATGGTAGCGTAGCTTGGAATCAACCTTCAGGAATCTATACAGAGCTTATCAAGGGTGGTGGTTCGAGCCGTTTAGTATTAAACCTCTTCACGAACGCCTCAACCTCTACACCATCTGCACAATTGAGATTCGATTACAGAAATGGTGGAATGTGGTACAGAACAGCCAGAGACGCATTTGGTTTTGAGGCTGAATGGTCTAAGGTTTACACTGAAGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCAGAAGCGATTAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCTAATGGCTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAGCGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCATAGTTTCTCTGCTACCACTTCGACGTTTGATTATGGCACTAAGTACACAGATGGTCAGGGTGCTCACGACCATGATAGAGGTAATATGGAAATTCATGGTGATTTTGGTTTCTTCAGGAGTGACGCATCAAGCTTCTACACTGCTAGTGGGTCTTTTGCTATCTCAGGTTCACAAGCATCTAGGGGGTACACAGGTAATAACTTCACTTATGGTACTCCTGTTAACTTCTATGCCTCTAGAACTTGGACAGGTAGAACAAGTTGGGTAGGTGCTCATGCACATGGTGTAGGTATTGGTGCTCACAACCATACGGTAAGTGGTAACACTGGTGTTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGCTAATGGCTTGGGTAAGGACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
50f8559ec571fbcc1ef1338db8d9ce539a7754eb1afd1d824bb55e32acf455ab
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50