Protein
View in Explore- Genbank accession
- UGO52669.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MAIYDAGTASLAADGTVTGVGTTWRQPLTLIRVGATMIFNTTPASIVTIAEIISDTEIRVFNDKGFTAPTGTQYSILAHDGITVQGLAQDVAETLRYYQSNETEVAAAVDAFNQFDADAFQQNVTNVNNQSQQVASDALQVSADKADVQSSLSQAEAARDAAGLSASNAASSAQSAESAAQSVSGALIGSFQSGVTIQSATQQVIDISSGIAVPYIWAGALPKTVPANSTPESTGGVSSSGWVPLSFADRNVDNLSILRGLVPLRDGERVYVSSHSGTSMLGGGWFYYDANDSTSTDDDGVVIVTTGNHRWKRDLSLIEGLSPMMFGALMNAPYIDGNTIQGTPYPKAPSMGAADLTGVSNDGVAMQKCYTASIKLNKKILIDRPIYIGTTRVNVSGERFSGQTIRIEGTATPRRCLIYTSGNGGFIVSPWGHNMFVKNIGFRNADADYNGSPLISGNDSGQGGGGKQYTIDNVEFYHYKYALSTLTFVSKISNVYMYDCTYGIGLSGNTSTALDSVWAHHCDVGFLWGYGINTTTLEPVAGGFPVMYVTATNIAADGCLTPHKIGGQLRSVNIVGAGVEGVNGDTVFDFSDYGGDDDQFGFDVKGFSCWIQSSMNTGVLRMIKLPANESRMPVGSIRFSDGYFKSDYALMIMENTISNPTAEGNSVHFGDDFRIINSQYTGSFSKSTLRSTKVGNVTYGESPVEARNSYNGTTLSAVHVTSGMDFNQVRTEDATLLLPYNRALDILLTTVGEESRYGSTFIAGELSLIPINKNGLGGQESGGIIQFSLSGSTKANVSSGIPWYNKIAKSTGSKSTSLDGVSITKYVTGGQTFLRILTPTASVSTFLCHLKLTYSGFAHFYDKRWQVRAI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 870 AA molecular weight: 92570,11490 Da isoelectric point: 5,16970 aromaticity: 0,09310 hydropathy: -0,10253
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoD_Opt-719 [NCBI] |
2902671 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UGO52669.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL539451.1
[NCBI]
CDS location
range 27490 -> 30102
strand -
strand -
CDS
ATGGCAATTTATGACGCGGGAACAGCATCGCTTGCAGCTGACGGAACTGTAACTGGTGTTGGTACTACCTGGAGGCAGCCGTTAACTCTAATTCGAGTTGGCGCAACAATGATTTTCAATACCACGCCAGCAAGTATTGTTACCATTGCTGAAATAATCAGTGATACCGAAATTCGAGTTTTTAACGACAAGGGATTTACCGCTCCGACTGGTACTCAGTACTCAATTCTTGCTCACGACGGGATTACTGTTCAGGGACTTGCTCAGGATGTTGCTGAAACCTTGCGTTACTATCAGTCAAATGAGACTGAAGTCGCAGCAGCTGTTGATGCTTTTAATCAGTTTGATGCTGATGCATTCCAGCAAAATGTCACAAACGTAAACAACCAGTCTCAGCAGGTTGCCAGTGATGCCTTGCAAGTATCGGCAGATAAGGCAGATGTTCAGTCCTCATTATCTCAAGCTGAGGCGGCGAGGGATGCAGCGGGTTTAAGTGCATCTAACGCAGCATCCTCTGCTCAAAGTGCTGAGTCAGCAGCTCAGTCAGTTTCTGGTGCTCTCATTGGCTCATTTCAGTCTGGCGTAACTATTCAATCAGCAACTCAACAGGTAATTGACATTTCATCTGGTATTGCTGTCCCTTACATTTGGGCGGGCGCGCTTCCTAAAACCGTCCCGGCTAACTCAACCCCTGAGTCAACTGGAGGGGTTTCATCTTCTGGATGGGTGCCTTTGTCATTTGCTGATCGTAATGTTGATAACTTATCTATTTTGAGGGGCTTGGTGCCACTTCGTGACGGTGAGCGGGTTTATGTATCTAGTCACTCAGGGACTAGCATGCTTGGCGGTGGCTGGTTCTATTACGATGCCAATGATTCAACCAGCACAGATGATGATGGTGTTGTTATTGTCACTACCGGAAACCACAGATGGAAGCGAGATCTTTCATTGATTGAAGGCTTGTCACCAATGATGTTTGGTGCTCTGATGAACGCGCCATATATTGATGGAAATACAATCCAAGGTACGCCATATCCAAAAGCACCAAGCATGGGCGCCGCTGATTTGACTGGCGTGTCTAACGATGGCGTTGCTATGCAGAAGTGCTACACAGCATCAATCAAATTAAACAAGAAGATTCTCATTGATAGGCCTATCTACATTGGCACAACAAGGGTCAACGTATCTGGTGAGAGGTTCTCAGGACAGACAATTAGGATTGAAGGTACAGCAACTCCTAGGAGGTGTTTGATTTACACATCTGGCAATGGTGGCTTCATTGTTTCGCCTTGGGGTCACAATATGTTTGTTAAAAACATTGGCTTCAGGAACGCAGATGCTGATTATAACGGCTCACCTCTAATTAGCGGAAATGACTCAGGTCAAGGTGGTGGCGGCAAGCAGTACACAATAGATAACGTTGAGTTTTATCATTACAAGTATGCATTATCAACACTGACATTTGTTTCTAAAATTTCAAATGTATACATGTACGATTGCACATACGGCATTGGACTTTCAGGTAATACAAGTACCGCCCTTGATTCTGTATGGGCACACCACTGTGATGTTGGCTTTCTTTGGGGTTACGGCATTAACACAACAACCCTGGAGCCTGTAGCTGGTGGTTTTCCTGTTATGTATGTCACTGCGACAAACATAGCTGCTGATGGTTGCTTAACTCCACACAAGATTGGTGGCCAGTTAAGGTCTGTTAATATCGTAGGTGCTGGGGTTGAGGGTGTTAATGGAGATACTGTATTTGATTTCTCCGACTATGGTGGTGATGACGATCAGTTTGGATTTGATGTAAAGGGGTTTTCTTGCTGGATTCAATCAAGCATGAACACTGGAGTCCTTAGGATGATAAAATTGCCAGCTAATGAAAGTAGAATGCCAGTTGGATCGATACGTTTTAGCGATGGTTATTTCAAGTCTGATTACGCCTTGATGATTATGGAAAACACCATTTCAAACCCAACTGCAGAAGGTAACTCTGTTCATTTTGGTGATGACTTCAGGATTATTAACAGTCAATACACTGGTTCATTCTCAAAGAGCACGTTGAGGAGCACTAAAGTTGGCAACGTGACATATGGCGAGTCACCAGTTGAAGCAAGGAACTCATATAACGGAACTACGTTATCTGCTGTTCATGTTACTAGTGGAATGGACTTCAATCAGGTCAGAACTGAGGATGCTACTTTATTGCTGCCTTATAACAGGGCGCTTGATATCCTTCTTACTACAGTTGGTGAGGAGTCCAGGTATGGGTCAACATTTATTGCTGGAGAGTTGAGCCTTATACCAATTAATAAGAATGGATTAGGCGGTCAGGAATCAGGAGGTATTATTCAATTTAGCTTATCTGGAAGCACTAAGGCCAATGTCTCATCAGGAATACCTTGGTATAACAAGATAGCTAAGTCGACTGGCTCAAAAAGCACTTCTCTTGATGGGGTTTCTATTACTAAGTACGTGACTGGTGGTCAGACATTCCTGAGGATTTTAACACCAACTGCATCGGTAAGCACATTCCTTTGCCACCTTAAATTAACATATAGTGGATTTGCTCACTTTTATGATAAAAGGTGGCAGGTTAGAGCAATATAA
Tertiary structure
PDB ID
d70d9091e844a5ea97a92a23f3627ca56e316d31c577c4d507b8be153b6c98cf
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50