Protein

View in Explore
Genbank accession
AFQ96160.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKLNANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRGTQAILSDNEALIIKNITQGTPLYLRGQDADGTNRWYLGNDNRGTHNLVLKNVKTDVSIAISENLVTVNRTLQIAGQVQPSSFANLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFTGANTFRTMSVISNAAAITLQCASANESLYLLAKDYEGGNLWYLGKGSSGAGVTIYNYTTNTSLVLDAAGVSANKNVRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNATNTFSVRQVINSDGEALALKAKTATTLFIRGLAADGTAKWYVGNGDADNNNNLRLFNYKTGKGLTIGSTFEMNATLAITGQVKPSDWSNLDARYFTQSVANQKFMYAGSTGTGTEVGDSDGIAWNAKTGLYNVTGYSGGSTQLVFQMYQGASSTPSAQLKFNYRNGGFWYRSSRDGFGFEEDFTQIYTEKYKPTPSAIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTDTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGHYGGDSIGGKQRVQASGTAQVSSVAGDHSHTVSGTAASNGDHAHTVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSITNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:782 AA
molecular weight: 83590,39850 Da
isoelectric point:8,64980
aromaticity:0,08824
hydropathy:-0,35026

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterobacteria phage UAB_Phi87
[NCBI] 		1197935 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella enterica subsp. enterica
[NCBI] 		59201 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Salmonella

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFQ96160.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN225449 [NCBI]
CDS location
range 62620 -> 64968
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTGAATAATACCTTTAGAGGTACTCAAGCTATCCTCTCTGACAATGAAGCACTCATTATTAAAAATATCACTCAAGGCACACCACTCTATCTTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGTAATGATAATAGGGGCACACATAACCTTGTATTGAAGAATGTAAAAACTGACGTTTCAATTGCTATTTCAGAAAATTTGGTGACAGTCAACAGAACTCTTCAAATTGCTGGTCAAGTTCAGCCTTCAAGTTTTGCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGCAATAATACTTTTACAGGTGCTAACACATTTAGGACTATGAGTGTTATTTCAAATGCTGCTGCTATCACACTGCAATGTGCATCAGCAAACGAATCCCTGTATCTACTTGCAAAAGATTATGAAGGTGGAAACTTATGGTATCTTGGTAAAGGTAGTTCAGGTGCTGGTGTAACTATCTACAACTATACCACTAACACCTCTTTGGTCTTAGATGCTGCTGGAGTATCAGCAAATAAAAATGTCAGAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGGTATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACAATTGCAAGAACTAATGCGACCAATACATTTTCTGTGCGACAAGTTATCAACTCTGATGGTGAAGCTCTTGCGTTAAAAGCAAAAACTGCAACGACATTGTTCATTAGAGGGTTAGCTGCTGATGGGACAGCCAAGTGGTATGTTGGTAATGGCGATGCCGATAACAATAATAACTTAAGGCTGTTTAACTACAAAACAGGTAAAGGGCTTACCATCGGCTCAACATTCGAAATGAATGCAACTTTAGCAATCACTGGACAGGTTAAACCTTCAGATTGGTCTAACTTAGATGCCAGATATTTTACCCAATCAGTAGCTAATCAGAAATTTATGTATGCAGGTTCCACAGGTACTGGTACAGAGGTAGGTGATAGTGATGGCATTGCTTGGAATGCTAAAACTGGACTGTATAATGTTACAGGTTATAGTGGAGGCTCAACACAGCTTGTTTTCCAAATGTATCAGGGTGCAAGCTCTACTCCCTCTGCTCAATTAAAATTCAACTACAGGAATGGGGGTTTTTGGTATAGGTCATCAAGGGATGGTTTTGGTTTTGAAGAGGACTTCACACAAATTTATACAGAGAAGTATAAGCCAACTCCTTCAGCTATCGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGGATTGTGACATGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTCCCTGGTTTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTGATACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCTACTAACAACACTGGTGCTCATACACATACAGTTGGTGGTCATTATGGTGGTGACTCTATTGGTGGTAAACAACGTGTTCAGGCCTCAGGGACTGCTCAGGTTTCCAGTGTAGCTGGTGACCACTCACACACTGTGTCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAGACCATGCTCACACAGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTATTACTAACCAGTTCTACAAATTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
ee17959693357ffac61264e3ea027e63d2e73590cc66442b535bdf58dcbd7030
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7034
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50