Protein
View in Explore- Genbank accession
- XNS38190.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTFTF
- Protein sequence
-
MALKTKIIVQQILNIDDTTTTASKYPKYTVVLGNSISSITAGELTAAVEAAAGSAAAAKDSEIAAKDSENKAKDSEIQAGIHADASEASATQSAASAAESEKQAKLSQGSAENSAASALESKNFKDASELAAQNAEQSKILAEQAQRAAEAAQSGAQASENKASAFATQAAASSASAGDFAAAAKQSELNAKTSETNAATSEVEAETQAETATTEANRAKAEADRAAQIVDSKLDKEDISGFIKVYKTKEEADADVSSRVLGEKILVWNQTDSKYGWYKVAGTAEAPVLELVETEQKLVSINNVHADDAGNVQITLPGGNPSLWLGEVTWFPYDKDSGVGYPGVLPADGREVLRVDYPDTWEAIEAGLIPSVTEEQWQAGATLYFSTGNGTTTFRLPDMMQGQAFRAAAKGEENAGNIKEQIPYITMINGKAPADDGTITLGNAADKNVWNGVDGEVLLRGAFGLGGAGLILNEPDAVSFFKAMRAFGSGYYRNDSESNPVIPKYSAGFYSKTADTHTFICSAYGNGVTFVATVNDALLDGENPTVHTNTLYGTANKPDLNTDTQGVLGIEKGGTGAINVDQARGALKVPTFMTVLEGGPEQSLVYSPDFTKALKVDNSTEWGLANVADGSPIPLSIKHGGTGAVNASQIRANLNIQGVKCVTSQIPSDFNALSSPDDNLNLLIANNGVWGVQSTKGDIKPLLLERGGTGATDQNGARHNLGLATNHSPVFAGIDLQGLNGTTSGIAVLRNRNAEGTQISYSRVYNEIQGSVAKTTIQTTREGGGTNYFQIDEYGLITNVRAIRCAPSNVGGEGFTVGVVPGGAFTAWRDRPAGMIVEHPSDDVAVNVLKSVRWGGDWVMGIDAARYGAGGCEAHLNVKGTTYTFNDVGYASAVQWVSTSDIRLKAQLKEILSAKEKVKALQGYTYFKRNNLNEDEYSFYSEEAGLIAQDVITVLPEAVYKVEETDYLSISYSGVTALLTNAMKEVMADAEAQEARISNLEAELAELKALVATLVNK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1017 AA molecular weight: 107178,46920 Da isoelectric point: 4,72454 aromaticity: 0,06785 hydropathy: -0,27168
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNS38190.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP925828.1
[NCBI]
CDS location
range 86355 -> 89408
strand -
strand -
CDS
ATGGCACTTAAAACTAAAATTATTGTACAGCAGATTCTGAACATAGATGACACTACAACTACTGCTAGTAAGTATCCTAAATATACAGTAGTTTTAGGTAATTCTATTAGTTCTATTACTGCTGGTGAACTAACAGCGGCTGTTGAGGCCGCTGCAGGATCCGCTGCTGCTGCTAAAGACTCTGAAATAGCAGCTAAAGATTCTGAGAATAAAGCTAAAGATTCAGAAATTCAAGCAGGTATTCATGCTGATGCTTCTGAGGCTTCAGCAACCCAGTCTGCTGCTTCTGCTGCTGAATCTGAAAAACAAGCTAAATTATCTCAGGGTAGTGCAGAAAACTCTGCGGCTTCTGCTTTAGAATCTAAGAATTTTAAAGATGCTTCGGAACTTGCTGCTCAAAATGCAGAGCAGAGTAAGATTTTAGCAGAGCAAGCTCAAAGAGCTGCAGAAGCTGCCCAGTCTGGTGCTCAAGCTTCTGAAAATAAAGCATCAGCATTTGCTACACAAGCTGCTGCATCTTCAGCCTCCGCAGGAGATTTTGCTGCAGCCGCTAAACAATCTGAATTAAATGCTAAAACTTCTGAAACCAATGCCGCGACATCAGAAGTGGAAGCGGAAACCCAAGCTGAAACTGCTACTACTGAGGCAAATCGTGCTAAGGCTGAAGCCGATCGCGCAGCCCAGATTGTAGATAGTAAGTTGGATAAAGAAGATATATCTGGATTTATCAAAGTCTACAAGACTAAAGAAGAAGCGGACGCTGACGTTAGTAGTCGCGTACTAGGTGAAAAGATCCTAGTGTGGAACCAAACTGATTCAAAATATGGGTGGTATAAAGTAGCTGGTACTGCGGAAGCTCCAGTTCTAGAGTTAGTAGAAACAGAGCAGAAGCTAGTTTCTATTAACAACGTTCATGCAGATGATGCAGGTAACGTACAGATTACTCTTCCTGGTGGTAACCCTTCTTTATGGCTGGGTGAAGTTACTTGGTTCCCTTATGATAAAGATTCAGGTGTTGGTTATCCTGGTGTTCTTCCTGCTGATGGTCGTGAAGTTCTTCGTGTAGACTATCCAGATACTTGGGAAGCTATTGAGGCTGGCTTAATCCCTTCTGTTACTGAAGAACAATGGCAAGCTGGTGCAACTCTCTATTTCTCCACTGGTAATGGTACTACTACTTTCCGTCTACCTGATATGATGCAGGGGCAGGCATTCCGTGCTGCTGCAAAAGGCGAGGAAAACGCTGGCAATATTAAAGAGCAAATTCCGTACATTACTATGATTAACGGTAAAGCTCCTGCTGATGATGGTACAATTACTTTAGGTAATGCTGCGGATAAAAACGTATGGAATGGTGTTGACGGCGAGGTATTACTAAGAGGTGCTTTTGGTCTTGGTGGTGCTGGTTTAATTCTTAATGAACCTGATGCTGTTTCCTTCTTTAAAGCAATGCGTGCTTTTGGTTCCGGGTACTATAGAAATGACTCTGAGAGTAATCCAGTGATTCCTAAGTATTCCGCAGGATTCTACTCCAAAACTGCTGACACCCATACCTTTATCTGTTCTGCTTATGGTAATGGTGTTACTTTTGTAGCTACTGTAAATGATGCACTATTAGATGGGGAAAATCCTACTGTACATACGAATACCCTTTATGGTACAGCTAATAAACCAGATCTGAATACCGATACTCAAGGAGTTTTAGGAATAGAGAAAGGAGGTACTGGCGCAATTAATGTAGATCAGGCCAGGGGTGCTTTAAAAGTACCTACCTTTATGACAGTCCTAGAAGGTGGTCCAGAACAGAGTTTAGTATACTCTCCAGACTTTACCAAAGCTCTTAAAGTAGATAATTCTACTGAATGGGGTCTTGCTAACGTTGCTGATGGTTCGCCTATACCTTTATCTATTAAACATGGTGGTACTGGTGCAGTTAATGCCTCCCAGATAAGAGCAAATCTTAACATACAGGGTGTAAAGTGTGTAACAAGTCAGATACCCAGCGATTTTAATGCCTTATCCTCACCAGATGATAACTTAAACTTATTAATAGCTAACAATGGGGTATGGGGTGTACAATCAACAAAAGGTGATATAAAACCCCTACTATTGGAGCGTGGTGGCACTGGAGCAACAGACCAGAATGGGGCTAGACATAATTTAGGCTTAGCGACAAATCACTCTCCTGTGTTCGCTGGTATTGATCTGCAAGGTCTTAATGGAACAACTTCCGGTATAGCTGTATTGAGAAACAGAAATGCAGAAGGAACTCAAATCTCGTACTCTCGAGTTTATAACGAGATTCAGGGAAGTGTTGCAAAAACAACAATTCAGACGACAAGAGAAGGTGGCGGAACTAATTATTTCCAGATTGATGAATATGGGCTTATTACTAATGTTAGAGCAATAAGATGCGCGCCGTCAAATGTTGGTGGGGAGGGTTTTACAGTTGGCGTTGTTCCTGGTGGGGCGTTTACAGCTTGGAGAGATCGCCCTGCTGGAATGATTGTAGAGCATCCTAGTGATGATGTTGCGGTTAACGTCTTGAAATCTGTCCGTTGGGGCGGAGATTGGGTTATGGGTATTGACGCTGCTAGGTATGGCGCTGGAGGTTGCGAAGCTCATTTAAATGTAAAAGGAACTACATATACATTTAATGATGTTGGTTATGCTTCTGCTGTTCAATGGGTTAGTACATCTGATATTCGCCTTAAGGCTCAATTAAAAGAAATACTATCCGCTAAAGAAAAAGTCAAAGCTCTTCAAGGCTATACGTACTTCAAACGAAATAATTTAAATGAGGACGAGTATTCCTTTTACTCGGAAGAAGCTGGTCTTATTGCTCAGGACGTCATAACTGTTCTACCAGAGGCTGTTTATAAGGTAGAGGAAACAGATTATCTTTCAATTAGCTATTCTGGTGTAACCGCATTGCTTACCAATGCAATGAAGGAGGTAATGGCAGATGCAGAGGCCCAGGAAGCTCGTATCAGTAACCTAGAGGCAGAACTGGCAGAGTTAAAAGCTCTAGTAGCCACTCTGGTAAATAAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
06268b359a6749ceeea94e008f839104727d609fa9b4ba9a9ebf9f378281a525
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50