Genbank accession
AIX23211.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLNKLENFIKNTDGRTLYVNPNDLNATDSITNQGTSLTEPFRTIQRALIESARFSYVRGDDNDLIERTTIMVYPGEHPIDNRPGFGIKTVGNSPVAVTPSGELIDPFQAFNLTDASNFDIESSNNVLYRFNSIYGGVVVPRGTSIVGMDLRKTKIRPIYVPNPTDDSVDYSAIFRITGTCYFWQFTIFDGNENGVVFTDPRDFSENNQSRPTFSHHKLTAFEYADGVNPAVESGFELTDLAMYYSKLSNAYNEASGRPIDEKYPSDPGGFSPQRPEFEIVGAFATDPINITRLISGDGFVPDAVITVDTQVPHELNTGTPIKIRGVAISDYNISTKVSAVLSPTRFTYNLSFVRPNLPAEPSVSSATVTVETDTVTGASPYIFNCSMRSVWGINGMHADGAKATGFRSMVVAQFTAISLQKDDRSFVTYNKQARRYDGINVNKTVRGAELSAQSSSTNSATVYHLDPDAIYRPDWGTTHIKMSNDAVIQIVSVFAIGFNQHFASIGGADASITNSNSNFGQFALKADGFKNDAFLKDDKGFLTSFVSPKSAYNPETDDIEIIDWINIDFDLTRSIAFANQLYLTGYTNAEDKPPVVNQGFRIGANYKESLIQRTTVGAGADVTSSVRMCDNILGPGNNQANGSSVARKVYQVLAGPINNTLSLGVHGLLNGESVRVFSSTGDLPENLERGALYYANVVDGENIRIATSESNALNNIFLNIYGGVELRVESRVNDKEAGERGHPVQYDYTNQNWFVHTDANSDIYQYIVANPTSTDGIDFVSIFKRFGDNRALEDKLYRLRYVIPKESRNAKPPTPGYVLQASATTGARNNDDFILQDIGINDYEYNRNPRYIVSCTVIANEVEVRSEIPHNLNVGDKIKIVNVASTNNTGASQIKGFNGEFLVTRVINSREFRYDITDVNGFSRNPGTFTNNINERNILLPRYERKDLQSNVFVYRIETITDFLEGERDGIYHLFLLNGSNPVTETFTDIQYNQPVEDLYPQMDPDNLIQNPPATTTFAKRAPLGDVTIDEQQNSITKESVDKIYKTLNVGIIETATDGTVGAGGTRTTTLTFQREHEFNSVYSYTTLVGGGGYTDGTFYDVKLLSEFGTVWGGASAVVTVTAGTVTAVTIMDPGSGYSAGQTLFIDGTTIGGGTNATISITQADLEDNKHSILQISGGALYNPDSYVVMTSVEDQSSVGVARTSGSPAIIPGMYAYPADSGTGISSTTYNSDTGLTTLVSTGSAGFGLQRGNTFVVFSDNYSYLGKFFVSNVPTPDTLEFYSYRDLGTVSIVGKTGLDVNDANTGSLGENVGVRATPLYDNGVFYLEQSSGTGTQLTVRAEDGGVAGNVDSKMYLGRYFQMGSEIIRVASKNFDGANNNIVTVIRGALGTVVSNLPINTKVKAIRPSALELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTSLPQLQVKQLPDDEIYLVQAQELSCGQVVYTGMSDNGDFYIGNTKYSATSGTQSTFDVPIPTVAGQPGSSNNVVFDEVIINRRLFVSGGETNEVQSQFDGPVKFTQSVTIQNNLFVTGTTQLNRIEITSTENATSSANGGALTIRGGAAIGKDFYVGGEMYTNAYQIEDTSAVLEIGTNQSSKDISVGGSTDTDRVVFNTTKLATGEGAEEVVNADAGVVVEGGLVVRDVIIAKEFRGAGTGGGPGTILLWGGSTSALPDRYLLCNGDTLNKNTYNKLFEAIGYIHGGSGNSFKLPDLRNRFIPGAGSSYAVAAKGGDDSVVLTETQMPRHTHSTSAVNAPHTHPVSFTSGAANAPHKHPAGTGGGGNHNHPSGGTGGGGNHNHPSGGTNNTGNHGHPYSAPGQSKTDVANSNEKNVTSNVNASGAGTGGGGAHSHSVSVNSTSSAHNHPVSVNSGSSAHNHPVSVNSANAPHSHPISGNAGSANAPHVHPIGNTGGTASFDNRPKYYALCYIIQSE
Physico‐chemical
properties
protein length:1955 AA
molecular weight: 209840,98500 Da
isoelectric point:5,15765
aromaticity:0,08900
hydropathy:-0,32348

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1955
IPR037053
ATT
1682–1737
SSF88874
STR
1683–1823
IPR011083
ATT
1684–1741
AIX23211.1
1 1955
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-1681 | ATT 1682-1741 | STR 1742-1955
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI]
1493511 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI]
32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX23211.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019066.1 [NCBI]
CDS location
range 19197 -> 25064
strand +
CDS
TTGCCCCTTAATAAGTTAGAGAATTTCATTAAGAATACGGATGGACGTACTCTGTATGTTAATCCAAACGATCTTAATGCTACTGATAGTATTACAAACCAAGGCACTTCCCTTACAGAACCCTTCAGAACTATTCAGAGGGCGTTAATTGAGAGTGCGCGTTTCTCATATGTGCGTGGTGATGATAATGATCTCATCGAGAGAACCACCATCATGGTGTATCCCGGTGAGCATCCTATCGATAACCGTCCTGGTTTCGGTATTAAGACAGTAGGTAATAGTCCGGTAGCGGTAACTCCTTCAGGTGAATTGATTGATCCGTTCCAAGCATTTAACCTGACTGATGCTAGTAACTTTGATATTGAGTCTAGTAATAACGTTCTCTATAGATTTAACAGTATCTACGGTGGTGTTGTTGTTCCCCGTGGTACTTCTATCGTGGGTATGGACCTACGTAAGACAAAGATTCGTCCGATATATGTTCCCAACCCCACTGATGATTCAGTAGATTACTCAGCGATCTTCCGTATCACAGGTACTTGCTACTTCTGGCAGTTCACCATCTTCGATGGTAATGAGAATGGTGTAGTATTCACTGATCCAAGAGATTTCTCTGAGAATAACCAGTCCAGACCCACTTTCTCACACCACAAACTAACAGCATTTGAATACGCTGATGGTGTTAACCCAGCGGTAGAATCAGGGTTTGAACTTACTGACCTTGCTATGTATTATAGTAAGTTGTCTAACGCATATAATGAAGCATCTGGTCGTCCTATTGATGAGAAGTATCCATCAGATCCTGGTGGTTTTTCACCACAACGTCCTGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTCGCAACTGACCCAATCAATATCACTCGTTTAATCTCTGGTGATGGTTTTGTCCCTGATGCTGTCATCACAGTAGATACACAGGTCCCACATGAACTAAACACTGGAACACCAATTAAGATTCGTGGTGTTGCCATCAGTGACTATAATATCTCTACAAAAGTATCTGCAGTTCTCAGTCCTACTAGGTTTACGTATAACCTATCATTCGTAAGACCTAACCTACCAGCAGAACCTTCAGTATCCTCTGCAACTGTAACCGTTGAGACTGATACTGTAACAGGTGCTTCACCATACATCTTTAACTGTTCGATGAGATCAGTTTGGGGTATCAATGGAATGCACGCCGATGGTGCCAAAGCAACTGGATTCCGTTCCATGGTTGTTGCTCAGTTCACCGCGATCTCCCTTCAAAAAGATGATAGATCCTTCGTTACTTATAATAAACAGGCACGTAGATACGATGGTATCAATGTCAATAAGACTGTAAGGGGTGCTGAACTATCTGCACAGTCATCTTCTACTAACTCAGCAACTGTATACCACCTAGATCCTGACGCTATCTATCGTCCTGACTGGGGTACAACTCACATCAAGATGAGTAATGATGCAGTCATTCAGATTGTGTCTGTATTCGCTATTGGTTTCAATCAACACTTTGCTTCTATTGGTGGAGCTGATGCATCAATCACAAACTCTAACTCCAACTTTGGTCAGTTTGCACTGAAAGCTGATGGATTCAAGAATGATGCTTTCCTCAAAGATGATAAAGGTTTCCTAACATCATTTGTTTCTCCTAAGAGTGCGTATAACCCAGAAACTGATGATATTGAGATCATTGACTGGATCAACATTGACTTTGATCTAACTCGTAGTATTGCCTTTGCTAATCAACTCTATCTAACTGGTTATACTAACGCGGAAGATAAACCACCAGTAGTTAATCAGGGTTTCCGAATTGGTGCCAACTACAAAGAGAGTCTCATTCAGAGAACAACAGTTGGTGCTGGTGCAGATGTAACCTCATCAGTAAGAATGTGTGATAATATTCTCGGTCCTGGTAACAATCAAGCCAATGGTAGTAGTGTTGCTAGGAAAGTATATCAAGTTCTAGCAGGACCTATCAACAATACCCTCTCACTGGGTGTTCATGGACTACTTAATGGTGAGAGTGTAAGAGTATTCTCATCAACAGGTGACCTACCTGAGAACCTAGAAAGAGGTGCCCTATACTACGCAAATGTGGTTGATGGTGAGAATATTCGTATTGCTACTTCCGAGTCTAATGCACTCAACAACATCTTCCTCAACATCTATGGTGGTGTTGAACTTCGTGTTGAGTCTAGAGTTAATGATAAGGAAGCAGGTGAAAGAGGTCATCCCGTTCAGTATGACTACACCAATCAGAACTGGTTTGTTCATACTGATGCCAATAGTGATATCTATCAGTATATTGTAGCCAACCCAACCTCTACGGATGGTATTGACTTTGTATCCATATTCAAGAGATTTGGTGATAACAGGGCACTAGAAGACAAACTATATCGCCTCAGGTATGTTATTCCTAAGGAGTCAAGGAACGCAAAACCACCTACCCCTGGTTATGTTCTACAAGCATCAGCAACAACAGGTGCTAGGAATAACGATGACTTTATCCTACAGGATATTGGTATCAATGACTATGAATATAACAGAAACCCACGTTATATTGTAAGTTGTACTGTTATTGCTAATGAAGTTGAGGTTCGTAGTGAGATTCCACACAACTTGAATGTTGGTGATAAGATTAAAATAGTGAATGTTGCCAGTACAAATAACACTGGCGCATCACAAATCAAAGGTTTCAATGGTGAGTTCCTAGTTACTAGAGTTATCAACTCTCGTGAGTTTAGGTATGATATTACTGATGTAAATGGTTTTAGTAGAAATCCTGGTACCTTCACCAACAACATCAATGAAAGAAACATTCTTCTACCTCGTTATGAGAGAAAGGATCTACAGAGTAATGTATTCGTATATCGTATTGAAACTATCACTGATTTCCTAGAAGGTGAGAGGGATGGTATCTACCACTTATTCCTTCTTAATGGTTCTAACCCAGTAACAGAGACATTCACTGATATCCAATACAATCAACCTGTGGAAGATTTATATCCACAGATGGATCCTGATAACCTTATTCAGAACCCCCCTGCAACCACAACGTTTGCTAAGAGGGCACCCCTAGGTGATGTTACTATTGATGAACAACAGAACTCCATTACTAAAGAGTCTGTTGATAAAATATACAAGACACTTAATGTTGGTATCATTGAGACTGCTACTGATGGCACTGTTGGTGCTGGTGGAACACGTACAACCACACTAACATTCCAAAGAGAGCACGAGTTCAACTCTGTGTATAGTTACACCACACTAGTTGGTGGTGGTGGATATACTGATGGTACTTTCTATGATGTTAAACTACTCAGTGAGTTTGGCACAGTATGGGGAGGTGCTTCTGCTGTTGTTACTGTTACTGCTGGTACAGTTACCGCAGTTACTATCATGGATCCTGGTTCAGGTTATTCTGCAGGTCAGACACTATTCATCGATGGAACTACAATTGGTGGTGGTACTAACGCTACTATTAGTATTACTCAGGCAGACTTAGAGGATAACAAGCATAGTATCCTACAGATTTCTGGTGGTGCTTTGTATAACCCAGATTCATATGTAGTGATGACCAGTGTTGAGGATCAGTCTTCAGTTGGTGTTGCTAGAACTTCTGGAAGTCCTGCTATTATTCCTGGTATGTACGCATATCCAGCAGATAGTGGAACAGGTATTTCTTCAACTACATATAACTCCGATACAGGTTTAACAACACTAGTATCTACAGGTAGTGCTGGTTTTGGTCTTCAGAGAGGTAACACTTTCGTTGTATTCAGTGATAACTATAGTTATCTTGGTAAGTTCTTTGTATCTAACGTTCCAACTCCTGACACTTTGGAGTTCTACTCATACAGAGATCTTGGAACTGTATCTATTGTAGGTAAGACAGGTTTAGATGTAAATGATGCTAACACTGGTTCCTTAGGTGAGAACGTGGGTGTTAGAGCTACACCACTATATGATAACGGTGTATTCTATCTTGAACAGTCTTCAGGTACTGGAACACAACTAACAGTTAGGGCTGAAGATGGTGGTGTGGCTGGTAATGTAGACTCTAAGATGTACCTAGGAAGATACTTCCAAATGGGTTCTGAGATTATCAGAGTTGCTAGTAAGAACTTTGATGGAGCCAATAACAATATCGTAACTGTTATCCGTGGTGCTCTTGGTACCGTTGTTAGCAACCTTCCCATTAATACTAAGGTGAAGGCAATCAGACCTTCCGCACTAGAACTTAGAAGACCTTCTATTCTACGTGCCTCAGGTCACACCTTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTATTCCACTTCATTACCACAACTACAGGTTAAGCAACTCCCAGATGATGAAATTTACCTAGTACAGGCTCAGGAACTATCCTGTGGTCAGGTTGTTTATACTGGTATGAGTGATAATGGTGACTTCTATATCGGTAATACCAAGTATTCCGCAACCTCAGGAACACAATCAACCTTTGATGTTCCCATCCCAACTGTTGCTGGTCAACCAGGTAGTTCTAATAATGTTGTGTTTGATGAAGTTATCATCAACCGTCGTCTATTCGTATCTGGTGGTGAAACTAATGAGGTTCAGTCACAGTTTGATGGTCCTGTTAAGTTTACCCAGTCTGTTACTATTCAGAACAATCTTTTCGTAACTGGTACAACTCAACTCAATAGAATTGAGATCACCAGTACAGAGAACGCAACCAGTTCTGCTAATGGTGGAGCACTAACTATCAGAGGTGGTGCTGCTATTGGTAAAGACTTCTATGTTGGTGGTGAAATGTACACCAACGCATATCAAATAGAAGATACAAGTGCAGTTCTTGAAATTGGTACTAACCAGTCATCTAAGGATATCTCTGTTGGTGGTTCAACTGATACAGATAGAGTTGTTTTTAATACAACTAAACTAGCAACAGGTGAAGGTGCTGAAGAGGTAGTTAACGCAGACGCTGGTGTTGTTGTTGAGGGTGGATTAGTTGTTCGTGATGTTATTATCGCGAAAGAGTTTAGAGGTGCTGGAACTGGTGGTGGTCCTGGTACTATCCTACTCTGGGGTGGTTCTACTAGTGCTCTCCCTGACAGATATCTACTCTGCAACGGAGATACTCTCAATAAAAACACATATAACAAACTATTCGAAGCCATTGGTTATATCCATGGTGGTAGTGGTAATAGTTTTAAGTTACCAGATTTGAGAAATAGGTTTATCCCTGGTGCTGGTAGTTCTTATGCGGTAGCTGCAAAAGGTGGGGATGATTCAGTTGTACTAACTGAAACGCAGATGCCACGCCACACGCACTCAACTTCAGCAGTCAACGCACCACATACTCACCCAGTATCGTTTACTAGTGGAGCGGCAAATGCACCACATAAACACCCAGCTGGCACAGGTGGCGGTGGAAATCATAACCACCCATCAGGTGGCACAGGTGGTGGTGGTAATCACAATCACCCATCAGGTGGCACTAACAATACAGGCAACCATGGACACCCGTATAGTGCTCCGGGGCAATCCAAAACTGATGTTGCTAATTCTAACGAGAAGAATGTAACTAGCAACGTCAATGCCTCAGGTGCAGGAACCGGTGGTGGTGGAGCACACTCCCACTCTGTTTCAGTTAACAGTACATCCTCAGCTCATAATCACCCAGTAAGTGTCAACTCTGGATCTTCAGCTCATAATCACCCTGTTAGTGTTAATTCAGCTAATGCACCACATTCCCACCCAATTAGTGGTAATGCAGGTTCTGCAAACGCACCTCACGTTCACCCAATTGGTAATACTGGTGGTACTGCTTCCTTTGACAATAGACCCAAATACTACGCTCTCTGCTATATTATCCAATCAGAGTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
de882c73cecd71d2bd41b9165d13606527cd291100cd4de2b66ed995e6fdaaab
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8010
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 GenBank