Protein

View in Explore
Genbank accession
XZY10464.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDTGNIIDLGIAKGGQIDGNVTIDGTLRVNGPINNFGNFSTSGTITASNIVSATVFRSTSGSFYTRAINDTANAHLWFENTNGSERGVLYSKPQSENEGVITMRVRQGTAAGAQNSEFHFISTDGGIFQARKLTALTSISTPTISVNLINHDSKAFGQYDSQSLVNYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTMWHEICTAQTGQADEMSWWTGNTPQSKQYGIRNDGRMAGRNSLALGTFTTNFPSSDYGNVGVMGDKYLVLGDTVTGLSYKKTGVFDLVGGGYSVASITPDSFRSTRKGIFGRSEDQGTTWIMPGTNAAFLSVQTQADNNNAGDGQTHIGYNAGGKMSHYFRGKGKTNINTQEGVDVNPGILKLTTGGESISFNAATGSINSTLAFRLNKGIIIDGPDNQGFQFNAPTAADGTRSIYWNSGTRAGQNKSPVTVKVWGNSFNASGDRARETVFEVADGQGYHFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFNGQVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYITLSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVEVAGTTANQRITVNMASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTHSHGIALNSDTVDITKPLKVGNAQLGTDGNITSGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIAGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTIAAAFKNIAVNNVSGDTYDIYVYAGTYCNQLTCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGSSFYILFTDKNATDGEATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1237 AA
molecular weight: 132357,48940 Da
isoelectric point:8,19375
aromaticity:0,08407
hydropathy:-0,31795

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
494–629
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
IPR048388
670–743
IPR048388 IPR030392
XZY10464.1
1 1237
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Lubas
[NCBI] 		3448294 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XZY10464.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV806335 [NCBI]
CDS location
range 59557 -> 63270
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATACAGGAAATATCATTGATCTAGGTATTGCTAAAGGCGGTCAAATTGATGGAAATGTAACTATTGATGGAACTTTACGCGTCAATGGACCAATAAACAACTTTGGAAATTTTTCTACAAGTGGTACTATTACGGCAAGTAATATTGTTTCTGCTACAGTATTCAGATCAACATCCGGTTCATTTTATACAAGAGCAATAAATGATACTGCAAATGCCCATCTTTGGTTTGAAAATACAAATGGCTCAGAACGTGGCGTTTTATATTCAAAACCGCAGTCTGAAAATGAAGGCGTAATTACAATGCGTGTTCGTCAAGGAACCGCTGCGGGAGCTCAAAATTCAGAATTTCATTTCATTTCTACTGATGGCGGTATCTTCCAGGCACGCAAATTAACTGCTTTAACTTCTATTAGTACACCAACTATTAGTGTTAATTTAATTAATCATGATTCTAAAGCCTTTGGACAATACGATTCACAATCTTTGGTTAACTATGTTTATCCTGGAACCGGTGAAACAAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGTGCTAAATCAGGCGGAACTATGTGGCATGAAATCTGTACAGCTCAGACAGGACAAGCTGATGAAATGTCATGGTGGACTGGTAATACTCCTCAGTCTAAACAATACGGTATTCGTAATGACGGACGAATGGCTGGACGTAATAGCCTTGCATTAGGTACATTCACTACAAATTTCCCGTCTAGTGATTATGGCAACGTCGGTGTAATGGGCGATAAATATCTTGTTCTCGGTGACACTGTAACTGGCTTGTCATACAAAAAAACTGGTGTATTTGATCTAGTTGGCGGTGGATATTCTGTTGCTTCTATTACTCCTGACAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTATATTTGGTCGTTCCGAGGACCAAGGCACCACATGGATTATGCCTGGCACTAATGCCGCTTTCTTGTCTGTTCAAACGCAAGCTGATAATAACAATGCTGGAGACGGCCAGACGCATATTGGGTACAATGCTGGCGGTAAAATGAGTCATTATTTCCGCGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAGGAAGGTGTAGACGTTAACCCGGGTATATTGAAGTTAACCACCGGCGGTGAAAGTATTAGCTTTAATGCCGCAACTGGAAGTATTAATTCTACATTAGCTTTTCGTCTTAATAAAGGCATAATTATTGATGGACCTGATAATCAGGGATTCCAGTTTAACGCCCCGACGGCTGCAGATGGTACTAGAAGTATATACTGGAACAGTGGTACTCGCGCAGGTCAAAACAAAAGCCCTGTTACAGTTAAAGTGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCGGGCGATCGTGCTCGTGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGATGGGCAAGGTTACCATTTTTATTCTCAGCGTGTGGCTCCAAGTGGCTCTGAAACTACTGGGCCTGTTGTAACCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATTGGCGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGGGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCACAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTAATGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTAGATATCGGTGGAGGTAGATTTAAAGTAGAAGTGGCTGGAACTACTGCTAATCAACGCATAACAGTAAATATGGCATCAGATGCTATTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATTCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGAAACGTCGTTCGTATGCATAGTTACACCCATTCACATGGTATTGCATTAAACTCTGATACTGTCGATATTACTAAGCCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAGTGGTTCAGGAAACTTTGCCAATTTAAATACCACGTTAAACCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACCGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCTACGGTCTTCTTTAAAATAGCCGGTGGTTCTGGATTTAATAGTGGATTATTCACACAATGCAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGCAGCTGCATTTAAAAATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTATGCCGGAACATATTGCAATCAATTAACTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCTGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGCAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACTGGTATTCGTATTAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCAGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGAAGCAACTGTTAACGGTGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACAGGCGAAGTATTAATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGTGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAATGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCTGGTGCTAACCCAAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTGTTAACCAAATGAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGCGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGCTTAAAATCTAATTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTAGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACGCTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
42ebe0343540ed59d5571a4782eaa378d176abc15e80a04f4625e6cdabe6dcdb
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6808
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50