Protein
View in Explore- Genbank accession
- WPD49448.1 [GenBank]
- Protein name
- tail tubular protein B
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MILEGVYPSFLKGVSQQTPQERSDGQLSAQLNLLSDAVTGLRRRGGVKFQAKLAGIPNSSYIRLIDINGVNYIMIVDTVTGTLKIYNFNGSLIKTHQTNYLKASNGKASIRSTVSRNNCFVLNTEQVITKTPIGGTNPTPNPSTMGYISIRSGQFSKMYSVDIKSGTYSVSLQVSTHGTDAALASPEYVATKFMENITADTTLNSRYDVVREGSTVALKAKSATDTNLLVIESGTGSTYIQTSNSSRVQGKQDIIANLPNILDKYIIAVGTVGNSAYYQYNATTSTWKECGVYEAPYKFTNEPIYWYFDDTDTIQVKSLDIQPRAAGDDDNNPLPKFVDFGITGISAYQSRLVLLSGSYVNMSATADFNVYMRTTVEELQDDDPIEVSSTALSAAQFEYAVPYNKDLVLLAQNQQAVIPANSTVLTPKTAVIYPSSKANISMASEPQVVSRSLYYTYQRGTDYYQVGEMIPNDYADAQYYAQNLADHIPLYATGVCTSITGSTTDNMAVFSSDQKELLVHQYLWAGEDRPLMSFHKWELPYDVLHVQFLQEYLVLFMDVGDDLVVGTINVQLNQLDNKPIPFLDIYQYVDIVDGEGTLPEFLPEGELVAAVYSSETMRHAMVQYEIEGTKIKCQFNGRIYLGVPYESSLTLTPPFVKDSKGRVVAGSNSIVVDLTMTFKGTGEFEYHVSDAYGDVFDGETSAQAWSEAQLGYTRVNTVSDVKFPCGTLLSSTEFSIRTTGTTELNIISASYDIRVPNRGRRRL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 763 AA molecular weight: 84202,54200 Da isoelectric point: 4,90062 aromaticity: 0,10092 hydropathy: -0,20459
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
7–761
7–761
1
763
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage YZ2 [NCBI] |
3092555 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPD49448.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR660046
[NCBI]
CDS location
range 21373 -> 23664
strand +
strand +
CDS
ATGATTCTTGAGGGAGTGTACCCGTCATTCTTGAAAGGTGTATCACAGCAAACACCTCAAGAGCGTAGTGACGGACAATTAAGCGCACAGCTTAATTTATTATCTGATGCTGTAACAGGTTTACGTAGACGTGGTGGGGTTAAATTCCAAGCCAAGTTAGCAGGTATTCCTAATAGTAGTTATATACGTTTAATTGACATCAATGGCGTTAATTATATTATGATCGTAGATACTGTTACAGGTACTTTGAAGATTTATAATTTTAATGGTTCTTTAATTAAAACACATCAAACAAATTACCTTAAGGCTTCCAACGGTAAGGCTAGTATTCGTAGTACAGTGTCTCGTAATAATTGCTTCGTATTAAACACTGAACAAGTTATTACTAAGACACCTATAGGCGGTACTAACCCAACACCTAACCCAAGTACTATGGGGTATATCAGTATTAGGTCTGGACAGTTCTCTAAGATGTACTCCGTAGACATTAAGTCTGGAACATACTCCGTAAGTTTACAAGTATCTACTCATGGTACAGATGCAGCATTAGCGTCTCCTGAATATGTTGCTACGAAGTTTATGGAAAACATAACCGCAGACACAACATTAAATAGTCGTTATGATGTTGTACGTGAGGGTAGTACGGTTGCATTAAAAGCTAAGTCTGCTACAGATACTAACTTATTAGTAATAGAGTCTGGTACAGGTAGTACCTATATTCAGACGAGTAATTCTAGTCGTGTACAGGGTAAGCAAGACATTATTGCTAATCTACCTAATATCCTAGATAAGTACATTATTGCAGTAGGTACAGTAGGTAACTCAGCTTATTACCAATACAATGCTACTACAAGTACTTGGAAAGAGTGTGGTGTATACGAAGCACCTTATAAGTTCACTAACGAACCTATTTACTGGTACTTTGACGATACTGATACTATTCAAGTTAAAAGCCTAGATATTCAGCCACGCGCAGCAGGTGATGATGATAATAACCCATTACCGAAGTTCGTGGATTTTGGTATTACAGGTATTAGTGCTTACCAATCACGTTTAGTACTACTTAGTGGTTCATACGTTAATATGAGTGCTACAGCAGACTTTAATGTATATATGCGTACCACTGTAGAGGAATTACAGGATGATGATCCTATTGAGGTGTCTAGTACTGCTTTAAGTGCTGCACAGTTTGAATACGCTGTTCCGTACAATAAAGATTTAGTTTTATTGGCTCAGAATCAACAAGCTGTTATCCCAGCCAATAGTACTGTACTTACACCTAAGACGGCTGTTATCTACCCAAGTTCAAAAGCTAATATTAGTATGGCTAGTGAACCACAGGTAGTGTCTCGTAGCTTGTATTATACATATCAACGGGGTACAGATTATTATCAAGTTGGTGAGATGATTCCTAATGATTATGCAGATGCTCAGTACTATGCACAGAACTTAGCAGACCATATTCCGTTATATGCTACGGGTGTTTGTACTTCAATCACAGGTAGTACTACAGATAATATGGCAGTGTTCAGTTCAGACCAGAAAGAGTTACTTGTACACCAGTACTTGTGGGCAGGTGAAGACCGTCCATTAATGAGCTTCCATAAATGGGAATTACCTTATGATGTGCTTCATGTACAGTTCCTACAAGAGTATTTAGTTCTGTTTATGGATGTCGGTGATGATCTGGTAGTTGGTACTATTAATGTACAGCTAAACCAACTAGATAATAAACCTATCCCATTCTTAGATATTTATCAATACGTAGATATTGTGGATGGGGAAGGTACATTACCTGAGTTCCTACCAGAAGGTGAGTTAGTAGCTGCGGTATATAGTTCTGAGACTATGCGTCATGCTATGGTTCAATATGAAATCGAAGGTACTAAGATTAAGTGTCAATTCAATGGACGTATTTATCTAGGTGTACCTTATGAAAGTTCACTCACACTAACACCTCCTTTTGTTAAAGATAGTAAAGGTCGAGTAGTTGCTGGTAGTAACAGTATAGTTGTCGATCTTACAATGACATTCAAGGGCACAGGTGAGTTTGAGTACCATGTTTCTGATGCTTATGGTGATGTGTTTGATGGTGAAACGTCTGCACAAGCTTGGTCGGAAGCACAACTAGGGTATACGCGAGTAAATACAGTCAGTGATGTTAAGTTCCCTTGTGGTACGTTATTGAGTTCAACTGAGTTCAGTATCAGGACTACAGGCACAACGGAGTTAAATATCATTAGTGCTAGTTATGATATCCGTGTACCCAATAGAGGACGGAGACGTTTATAA
Tertiary structure
PDB ID
6c87d5d9509e0684f78b62ae0661cea3739f915bfe5526200103fb6b8ddcda2e
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50