Protein
View in Explore- Genbank accession
- QBZ70663.1 [GenBank]
- Protein name
- putative virion structural protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MIKQDIPLYKLDLTGKSEFNHVKLQAGSRFDVAQHQIVIPPGAPFYQKSMKITDPAGKLLVLGEDYEFYGIMNKLTAFTAQPVGLFVRFLKDEIREWVWDYQVVGNFNKLTTEILNMLHSIYEDDRYVLYENIKNKPLWFDPEVHQHDLTYDIFGFTDLARELTRVANIQGTQKSAAVGFLETFRDHIDFYCDSYRELLQGIITNHASHKYDQHAVRKEHIGLALVDNNLTATLEETLEGLRDDLFITPYNAALAVTAAAGRNDKLYPSGKLPLLRYGSDTFIPPTISGSFEGLGAQTRRVGGLVESDGTMLILQHRNNGKYRGLYFVRCANWMSQSAEYEFTSYMYTHPTATADGATLDTIINGSNRYIMVVGDAVKNIWYYAETHGTFNPDRHILRRISGPWVTEDLANRPNQWNLNAETKCVVLADENYAEGWSIIQTYNISTFNERRTLPHTPNWYWDRSINIDNAGYSIIYFKGLSALGVRCRIDYTHEVFGNKNDHYFTPWWPEVDDDGTGGKGANIHSLFARYTRPTKYLWMHRSLHAMWLKSAANTFNLRLTITGIDDAGVSGRRFMFPTFRGQLRFEQIGAEQWCHITPHEDMTMPLINPDDRNDTNPTYKKWIESINAYEYPDSADRIGSFVVDREFLHFSDGFGNSIFPSVYCMLKTPYLKDADAIYRQPPPGSVTRFYKEGDGRLVFNEANPLGMTESFVLQRWLSADTTNYAQTGFLIKQNTPDGPEWIFRHSRFANSNWTHLRPTVSSSFGGKAYSHWPFLSSVRKTNLGQQVRMSQSVPPPNGVSANNSYTHLFGASCNTTVMGTNKGFNSEGTRADYLLPWTTVTSIVGNDVQFQHQEVFNVKRLVEQDLLALFTPFGYTLSDIRKTWSISQTMDPSGAIKFVAAVNRLVGRDLRMAFVIGTVTGQGATSTTDGYKLWADAKWTSLSPVTDRLINDVVELGTGYSYWDQNSKDSAKLNHGLCLTIPWESRSPDGSVASANSYTIYLRQCQGYFPSGGDDMAAVVIEVSADSRTILNHQNTYGSMWTMTNSLEPIPETGIIRTQWAIEVFEGSAIAGGPINSTRVYDGIAGDTYSQSGGYIGATNIITPAYTVYFNQIKNILLAGKMYDIPSTYIDILDQDPSPAGKTYYVYVYYSNNVAEYIISPTVRPESSVQSMIATVICGPTQIDRIIPYNRFSMNGVVISAKRQGSAILASSGSSEGVGDTSTILLDNDFIP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1232 AA molecular weight: 138674,21120 Da isoelectric point: 5,86274 aromaticity: 0,12094 hydropathy: -0,32573
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Edwardsiella phage pEt-SU [NCBI] |
2562142 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBZ70663.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK689364
[NCBI]
CDS location
range 84589 -> 88287
strand +
strand +
CDS
ATGATCAAACAAGATATTCCTCTTTACAAGTTAGATCTCACAGGAAAGAGTGAGTTTAACCATGTTAAGTTGCAGGCAGGATCTCGTTTTGATGTCGCTCAACACCAAATCGTAATTCCACCAGGAGCACCGTTCTATCAGAAATCGATGAAGATTACTGATCCGGCAGGTAAGCTTTTGGTCTTAGGTGAAGATTACGAGTTCTACGGCATCATGAATAAGCTGACGGCGTTTACAGCTCAACCCGTTGGTTTGTTCGTTCGTTTCTTGAAAGATGAAATCCGTGAGTGGGTTTGGGATTATCAGGTAGTAGGGAACTTTAATAAGTTAACCACCGAAATCCTGAACATGCTACACTCCATTTATGAAGATGACCGTTATGTCCTGTACGAGAACATCAAGAATAAACCGTTGTGGTTTGATCCTGAGGTTCACCAACACGATTTAACTTATGATATCTTCGGCTTTACTGATTTGGCTCGTGAGTTGACCCGTGTTGCAAATATCCAGGGGACACAGAAATCAGCCGCAGTTGGTTTCTTAGAAACATTCCGAGATCACATTGATTTCTATTGTGATTCTTATCGTGAATTACTACAGGGTATCATTACTAACCACGCCAGTCACAAATATGACCAGCATGCTGTTCGTAAAGAACACATTGGGCTTGCATTAGTGGATAACAACCTCACAGCGACTCTAGAAGAGACGTTAGAAGGTTTACGTGATGATCTATTCATTACTCCATACAACGCAGCCTTGGCTGTTACAGCGGCAGCTGGACGTAACGATAAGTTATACCCATCAGGTAAACTTCCTTTACTGCGATACGGTTCTGATACCTTTATTCCTCCTACCATTTCTGGTAGCTTTGAAGGACTAGGTGCCCAAACCCGCCGTGTAGGTGGATTAGTCGAGTCAGATGGTACGATGCTGATTCTTCAACACCGCAATAACGGTAAGTATCGTGGGTTGTATTTTGTACGGTGTGCAAACTGGATGAGTCAAAGTGCCGAGTATGAGTTTACTTCATACATGTATACTCACCCAACAGCTACCGCAGATGGAGCTACCCTAGATACTATCATTAACGGGTCTAACCGTTACATTATGGTTGTGGGTGATGCAGTTAAAAACATCTGGTACTACGCTGAGACACACGGAACGTTCAACCCGGATCGTCATATCCTCCGTCGCATTAGTGGACCTTGGGTAACCGAAGACCTGGCTAACCGCCCAAACCAGTGGAACCTCAACGCCGAAACTAAATGTGTGGTGCTTGCGGATGAAAACTACGCCGAAGGCTGGTCAATCATCCAGACATACAACATCAGTACGTTTAATGAACGTCGTACTCTTCCACATACACCAAACTGGTATTGGGATAGATCGATAAACATCGATAACGCAGGGTATTCCATCATTTACTTTAAAGGGTTGAGTGCTCTGGGTGTTCGTTGTCGTATTGATTATACCCATGAAGTTTTTGGGAATAAAAACGATCACTATTTCACGCCTTGGTGGCCAGAAGTTGATGATGACGGTACAGGTGGTAAGGGTGCTAATATTCACAGTTTATTTGCGCGGTACACTCGACCAACTAAATATCTTTGGATGCACCGTTCCCTCCATGCCATGTGGTTAAAGTCTGCGGCAAACACATTTAACCTTCGATTGACTATCACGGGTATCGATGATGCCGGTGTGTCTGGAAGACGGTTCATGTTCCCGACATTCCGTGGTCAATTACGATTTGAACAAATTGGTGCTGAGCAATGGTGTCATATCACTCCGCATGAAGATATGACCATGCCATTGATAAATCCAGATGACAGGAACGATACCAATCCGACCTATAAAAAATGGATAGAAAGCATCAACGCATACGAATATCCCGATAGTGCGGATCGTATCGGTTCTTTTGTGGTTGATAGAGAGTTCTTGCATTTCTCGGATGGGTTTGGTAACTCTATTTTCCCTTCGGTATATTGCATGTTGAAAACACCTTACCTTAAAGATGCTGATGCAATATACCGTCAGCCTCCTCCAGGATCTGTCACTCGTTTCTATAAAGAAGGTGATGGCCGGTTAGTTTTCAATGAAGCAAACCCATTGGGAATGACAGAGTCCTTTGTACTTCAGCGTTGGTTAAGTGCCGATACCACTAACTACGCTCAGACAGGGTTTTTGATTAAGCAGAATACCCCTGATGGTCCTGAATGGATATTCAGGCATTCCAGATTTGCTAATAGTAACTGGACCCACCTCCGCCCTACTGTTTCTTCTTCGTTTGGCGGAAAAGCGTATTCTCACTGGCCGTTCTTGTCCTCAGTTCGTAAAACAAACTTAGGTCAACAAGTCAGGATGTCTCAATCGGTTCCACCTCCTAATGGGGTATCTGCAAATAACAGTTATACTCATTTATTTGGTGCGTCATGTAACACAACGGTGATGGGGACCAACAAAGGGTTTAACTCTGAAGGAACACGTGCTGACTATCTGTTGCCGTGGACCACAGTAACCTCCATTGTTGGGAATGATGTTCAATTCCAACATCAGGAAGTGTTTAACGTTAAACGACTTGTTGAACAAGATCTTCTTGCCTTATTTACGCCGTTTGGTTACACACTTAGTGATATACGCAAGACCTGGTCAATTAGTCAGACCATGGACCCAAGCGGAGCTATTAAGTTTGTTGCTGCGGTCAACCGTTTGGTCGGGCGTGATCTCCGAATGGCATTTGTTATTGGTACCGTAACTGGCCAAGGTGCAACAAGCACTACCGATGGTTATAAACTATGGGCTGATGCTAAATGGACTTCGCTGTCCCCTGTTACTGATAGACTGATCAATGACGTTGTTGAGTTAGGAACAGGATATAGTTATTGGGACCAGAACAGTAAGGACTCTGCTAAGTTAAACCATGGGCTGTGCCTAACAATTCCTTGGGAGAGTCGATCCCCTGACGGCTCGGTTGCAAGCGCCAATAGTTATACCATTTACCTGAGACAGTGCCAAGGATACTTCCCATCTGGCGGTGATGATATGGCCGCTGTTGTTATCGAGGTAAGCGCTGATTCAAGAACTATTTTGAATCATCAAAATACCTACGGTAGCATGTGGACAATGACCAACTCTTTGGAACCAATCCCAGAAACTGGTATTATCCGTACTCAATGGGCTATTGAGGTATTTGAGGGATCTGCCATTGCAGGCGGTCCAATTAACTCAACCCGTGTCTATGATGGTATTGCTGGTGATACGTACAGTCAATCTGGCGGATACATCGGGGCGACTAACATCATCACTCCTGCTTATACTGTTTACTTTAACCAGATAAAGAACATCCTGCTTGCGGGTAAGATGTACGATATCCCGTCGACCTATATCGACATACTTGATCAAGATCCGTCCCCTGCTGGTAAGACTTATTACGTCTACGTGTATTACTCCAACAACGTTGCTGAATACATTATTAGTCCAACCGTCAGACCAGAGTCATCAGTTCAATCGATGATTGCCACTGTAATTTGTGGACCTACTCAGATTGACCGCATTATTCCATATAACCGTTTCTCTATGAACGGTGTGGTAATTTCGGCCAAACGTCAAGGTTCTGCAATCCTTGCATCCAGTGGTTCGTCAGAAGGTGTTGGAGATACTTCCACCATTTTACTTGATAACGATTTTATTCCGTAA
Tertiary structure
PDB ID
7044642fc20aaa2f742566eee81921753193c03f3e7bd9c7ff0cec563c503837
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50