Protein
View in Explore- Genbank accession
- XTS04180.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPRTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMLSVTKSINDIGAKLDDLAITMIEVADKLEVGFDGVSRSVKTMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRALGGTARGFNDTAGAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKIGGSLPIMYAALASNIFVLQSAFEQLKLGDQLNRLEKFGVIVGTQTGTPVQSLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLTTFQKQQAYANAVIAESTRRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRKIQQAAAKYLGPVIDSINAVFYTSQASVSAEAARAQEQTNKQIDPTNVGAVALSLAASEDGYNKALDMYKESLDKRNKLKSEFDKRMNQADFFTKAAIRQVSEGIPVGLAAAGASEANKKFVEETAAMGLQITRLSKEVDDSTENLNAWKSAYQAAGDAASKASPEFQKQINLQRDATDPGAVYDFNSTVLKGLTEQQKAYNQTKKTASDLANDIQNVAQNTDTAAKTSATLVDAIKNIESLSLGTGKSADEYVKNLNLGYNTLSEMKTASQALSEYVKLTGNETKNQLAVQQKIADVYNQTKDKEKAQEAGRRLELQQLEEQEAALRRVLQTNQGNKAVEKEIEKIQLEKLKLTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNDRTMTSTQYRLAQLKLELTIEEEKYEWYLKQADKQKEAEQSRRAQAQISRELWEAEKQATATHVSALMDALEVSQTQRNVTGQSQILTERLSILQQQLELSKGNTEEEIKYRNEIYKTSAALEQLRKQRDSQMQQQVGSSVGAVYTPTTGLSGEDKDFADMQNRMASYDQAISKLSELNSEATAVAQSMGNLTNAMIQFSQGSLDTTSLIASGMQTVASMIQYSTSQQVSAIDQAIAAEQKRDGKSEASKAKLKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGALALAQASSASSMSSIADSGADTTSYLTLGERQKNIDVSMSANAGELSYIRGDQGIGSANSFVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVVTPMVPMKATPNDELKASSNSTSGRPIILNISAMDAASFREFASSNSSALRDAVELALNENGASLKTLGNS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1226 AA molecular weight: 132453,17060 Da isoelectric point: 5,53307 aromaticity: 0,05220 hydropathy: -0,41191
Domains
Domains [InterPro]
IPR056207
TAS
1–81
TAS
1–81
Coil
Unmapped
515–535
Unmapped
515–535
1
1226
Architecture
TAS 1-81 | STR 82-1188 | TAS 1189-1224 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage PK7 [NCBI] |
3421153 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Salmonella enterica [NCBI] |
28901 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XTS04180.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV611632.1
[NCBI]
CDS location
range 93814 -> 97494
strand +
strand +
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAATTACTAATAGACGTTAAGCAGAAGGGGGCAACTCGTACTGCAAAGTCTATTGAAAACGTATCTGATGCGTTGGAAAATGCTGCTGCTGCTTCCGAACTGACAAACGAGCAGTTAGGTAAAATGCCCAGAACTCTTTATTCCATTGAGAGGGCAGCAGACAGAGCAGCGAAAAGTCTTACTAAAATGCAAGCTAGCAGAGGTATGCTTAGTGTTACTAAATCTATTAATGATATAGGAGCTAAGTTAGACGATCTTGCTATTACAATGATTGAAGTAGCAGATAAATTAGAAGTCGGATTTGATGGAGTTTCTAGATCTGTTAAAACAATGGGTAATGATGTTGCAGCTGCAACAGAAAAAGTCCAGGATAGATTATATGATACTAATAGAGCATTAGGTGGCACAGCTAGGGGTTTTAATGACACTGCTGGTGCCGCTGGTAGAGCTTCTAGAGCTATTGGTAATACTTCTGGTTCAGCACGCGGTGCAACTCGTGATTTTGCAGCAATGGCTAAGATCGGTGGTAGTTTACCTATTATGTACGCAGCCCTTGCTTCCAACATCTTCGTTTTGCAATCTGCATTTGAACAACTTAAACTAGGTGATCAGTTAAATCGTCTAGAAAAATTTGGTGTTATAGTAGGTACTCAGACAGGTACTCCTGTTCAGTCTCTTGCTAGATCACTACAAGAGGCTGCCGGCTATGCAATCTCTTTTGAAGAAGCTATGAGGCAAGCATCCTCAGCATCCGCTTATGGATTTGATGCTGAACAACTTAATAAATTTGGTTTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCGGTTCTTGGCGTTGATATGACTGATGCACTTAACCGTGTAATTAAGGGTGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTAGACGAACTTGGTGTTACTATTCGTCTTAATGATGCTTATGCTGACTATGTTAAACAATTGAACGCTGCTAACACAGGTATAACTTATAACGTTAATAGTCTTACCACTTTCCAGAAACAGCAGGCATATGCTAATGCTGTTATAGCAGAATCTACCAGACGTTTTGGGTACCTAGATGAGGTTTTACGTGCTACTCCATGGGAGCAGTTTGCTGCTAATGCTGATGCCGCCTTGAGAAAGATTCAGCAGGCTGCTGCTAAGTATTTAGGGCCAGTAATTGATTCTATCAATGCCGTGTTTTATACCTCACAGGCTTCAGTGTCCGCAGAGGCAGCTAGGGCACAAGAACAAACCAATAAACAAATAGATCCTACTAACGTTGGTGCTGTTGCTTTAAGTTTGGCCGCTTCTGAAGACGGCTATAATAAAGCCTTAGATATGTATAAGGAATCTCTTGATAAGCGTAATAAGCTAAAATCCGAGTTTGATAAACGAATGAATCAAGCGGATTTCTTTACAAAAGCAGCTATACGTCAAGTTAGTGAAGGTATTCCTGTCGGTCTTGCAGCTGCAGGTGCTTCTGAGGCTAATAAAAAGTTTGTGGAAGAGACAGCTGCTATGGGTCTGCAAATAACTAGGCTGAGTAAAGAAGTAGATGATTCTACGGAAAACCTCAATGCATGGAAATCAGCATATCAAGCAGCTGGAGATGCTGCTTCAAAGGCTAGCCCAGAATTTCAAAAGCAGATTAATCTACAGAGAGATGCTACAGATCCTGGTGCTGTATATGACTTTAACTCTACAGTATTAAAAGGACTAACTGAACAACAAAAAGCATATAATCAGACTAAGAAAACAGCCAGTGACTTAGCTAATGATATACAGAACGTTGCTCAGAATACAGATACTGCGGCTAAAACTAGCGCTACTTTAGTAGATGCTATAAAAAACATAGAATCTCTATCTCTAGGTACTGGTAAGAGTGCTGATGAGTACGTTAAAAATCTCAACCTAGGCTACAACACTCTGTCTGAAATGAAAACTGCGTCTCAGGCCTTATCTGAGTACGTTAAACTAACTGGTAATGAGACTAAGAACCAGCTAGCAGTTCAACAGAAGATAGCTGATGTATATAACCAAACTAAGGATAAAGAAAAAGCACAGGAAGCTGGTAGGCGTTTAGAACTCCAACAGTTAGAAGAGCAAGAAGCTGCTTTACGCCGTGTTCTTCAAACAAACCAGGGAAATAAAGCTGTTGAGAAAGAAATTGAAAAAATTCAGCTGGAGAAACTTAAGCTTACTAATCAGGGTATGGAAGCCCAGAAAAAGGTCAAGGATTACACAGATAAAATTCTGGGTGTAGATCGTGAGATAGCTCTTCTGAATGACCGTACTATGACTAGCACTCAGTATAGATTAGCACAGTTAAAGCTAGAACTAACTATAGAGGAAGAAAAATATGAGTGGTACTTAAAACAAGCGGATAAACAAAAAGAGGCAGAACAGTCTAGACGTGCTCAAGCACAGATAAGTAGAGAGTTATGGGAAGCAGAGAAACAAGCTACTGCTACTCATGTATCCGCCCTTATGGATGCCTTAGAGGTTAGCCAAACGCAGAGAAATGTCACTGGTCAGTCCCAGATTCTCACTGAAAGGTTATCCATTCTGCAACAACAGCTGGAGCTGTCTAAGGGCAATACTGAGGAAGAAATTAAATATCGTAATGAGATTTATAAAACTTCAGCAGCCTTAGAACAGCTTAGGAAACAGAGGGATAGCCAGATGCAGCAACAGGTAGGGTCTTCTGTAGGTGCTGTATATACTCCTACAACTGGACTATCTGGAGAAGATAAAGATTTTGCTGATATGCAAAATAGAATGGCTTCTTATGACCAGGCAATCTCTAAATTATCTGAGCTAAACTCTGAAGCAACCGCTGTGGCTCAAAGTATGGGTAATCTAACTAATGCCATGATCCAGTTCTCCCAGGGATCTTTAGATACTACTTCCCTGATTGCTTCTGGTATGCAGACTGTGGCCTCTATGATTCAATATAGTACTAGTCAACAGGTTAGTGCAATTGATCAGGCTATTGCAGCAGAGCAAAAACGCGATGGTAAATCAGAAGCATCTAAAGCTAAGTTGAAGAAGCTGGAAGCTGAAAAGCTGAAGATTCAACAAGACGCAGCTAAGAAGCAGATTATCATCCAAACTGCAGTAGCTGTAATGCAGGCGGCAACAGCTGTTCCATACCCGTTCTCTATCCCTCTGATGGTAGCGGCAGGTTTGGCAGGTGCTCTGGCCCTCGCCCAAGCATCCTCTGCATCGAGTATGTCGAGTATTGCTGATTCGGGAGCTGATACAACTAGTTACTTAACCTTAGGAGAGCGTCAAAAGAATATAGATGTGTCCATGTCTGCTAATGCAGGTGAACTATCTTATATTCGTGGCGATCAAGGTATAGGTAGTGCCAACTCTTTCGTTCCTCGTGCTGAAGGTGGTAATATGTACCCAGGGGTTAGTTACCAAATGGGTGAACATGGTACAGAAGTAGTTACCCCTATGGTTCCTATGAAAGCTACACCTAATGATGAGCTAAAAGCCTCATCTAACTCAACTTCAGGAAGACCTATCATCTTGAATATTAGTGCTATGGATGCTGCAAGTTTCAGAGAGTTTGCTTCTAGTAATAGTAGTGCTCTAAGAGACGCAGTAGAATTAGCTCTGAATGAGAACGGTGCTAGTCTGAAAACATTAGGAAACTCTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
0a4f2bfaadeee17ebc41284b5c23dc9643cc544eafba3703e5667a66a4abe1c1
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50