Protein

View in Explore
Genbank accession
UYE98569.1 [GenBank]
Protein name
putative structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MAYVIKGDVNVTGNITVQSKNVGTSITTTGNSTVYLADTSGHVDLPLPSKSDVDYILKQLPLSQYGALNNNAPGVAGTFDGGSTLAYYSAMPVLLEADGSLVYLRPGTNGSSVNYYYTYINNPNASMQPFTTINSYYTGSWKTILFHDSDAKTCLTFEEVGNNVLHLVLTNGTLTKANHQSATIARNLIPYTIMNSIVIGSYMYIVTLYSSVNDLNNPTGIYYNGNDPFEFVLYRIPVSQIQTGSVTTVEQISGITGNTLYGDSQGSQGYIRIADLWQSTIESGNKSWIRYSSALNGVAGYTYTIIGSVKCIFDGTNLIISMNNNTFVRNNSLRSDTRPAFRIFYNVSTKAFTTDLTTGSPLVATGGVSGNITWTHPYSVNSSNIFGNGTAVSDSLNGTWYITENGTQYYIREKYVLSDNYYVYSGKINNFTNKVDAYNVRGRTFNSVVQYNVYADYASRVGDQLMGGIPISTSRVLFSGTGTYEGTKYLKYSKGISDIGTTRTYTYNSFKRGTITGYGPQATRLPLPTATENATYGGVSYCDSSGNVTFFGTVFVEGSVLSAGYQLNPTTLLYDKTISISNTVLTNLKNSILSNQGLSPSSSTIALYYSPNTSYFASVACVTSLNSGGGGNMILASVNCTADTSSVLTATLNTVINNYSDASFISTSTNGTATSEMRRHGGLCVVNYSDFTYVSLPHLINVGVAGDSREYSYAGVKSGNTLTSLIMSNSYHAPDISPGSREYSYIPNYGFGYYVFQDTDQGTKLIFKRCGSTLSEFNSNMASGTGTDTVILAQDVPQGFYLYFTEVTPLFLSGQYFDVPITAIDLSTVQANPGNTTFYVYIKLALGTPSYVVSTTTLPETDTQMFLGTIVTDGTKVATLNIKKVSRLDTYRPSTTQIGSAFPVSTGNPTQTGTITW
Physico‐chemical
properties
protein length:917 AA
molecular weight: 99110,14900 Da
isoelectric point:5,95556
aromaticity:0,11778
hydropathy:-0,11592

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Xanthomonas phage XbC2
[NCBI] 		2978503 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE98569.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP292654 [NCBI]
CDS location
range 79167 -> 81920
strand +
CDS
ATGGCATATGTCATTAAAGGTGATGTGAATGTCACCGGAAATATAACAGTACAAAGTAAAAATGTAGGTACTAGTATCACAACCACTGGTAATAGTACTGTTTACTTGGCTGATACATCTGGACACGTAGACTTACCTTTACCGTCCAAATCTGATGTAGATTACATTTTAAAACAACTTCCTCTATCACAATATGGTGCGTTGAATAACAACGCACCTGGTGTGGCAGGAACATTTGATGGTGGTAGCACACTGGCATACTATTCAGCTATGCCAGTTCTATTAGAAGCTGATGGTTCTTTGGTTTATCTTCGCCCAGGAACTAATGGTAGTTCTGTAAATTATTACTACACTTATATAAACAATCCAAATGCTTCAATGCAACCATTCACCACTATTAATTCTTATTATACTGGTTCGTGGAAGACAATTTTGTTTCATGATAGTGATGCAAAAACATGCTTAACATTTGAAGAAGTGGGGAATAATGTACTTCATTTAGTACTTACGAATGGTACTTTAACTAAAGCAAATCATCAATCAGCAACTATTGCTCGTAACCTTATACCGTACACTATTATGAATTCTATAGTTATTGGTTCATATATGTACATCGTTACACTTTATTCATCAGTTAATGATCTTAATAATCCAACTGGAATATACTATAATGGCAATGATCCATTTGAATTTGTTTTATACAGAATACCTGTTTCACAGATTCAGACAGGTTCAGTAACAACGGTTGAACAAATATCTGGAATAACCGGTAATACACTATATGGTGATTCACAAGGTTCACAAGGTTATATTCGTATAGCAGATTTATGGCAAAGCACAATTGAAAGTGGTAATAAATCTTGGATTAGATACAGTTCAGCACTCAATGGAGTTGCTGGATATACATACACAATTATTGGTTCAGTAAAATGTATTTTTGATGGAACAAATTTAATTATCTCTATGAACAATAACACATTTGTTAGAAATAATTCATTACGTTCTGATACTAGACCAGCTTTTAGAATTTTCTATAATGTTAGTACTAAAGCATTTACTACAGATTTAACAACTGGTTCGCCTCTAGTTGCTACTGGTGGTGTTAGTGGTAATATCACATGGACACATCCATATTCTGTAAACAGTTCAAATATATTCGGTAATGGTACAGCGGTATCAGATAGTTTAAATGGAACTTGGTATATTACTGAAAATGGAACACAATATTACATTCGAGAAAAATATGTTCTTAGTGATAACTATTACGTATATTCTGGTAAAATTAATAACTTCACTAATAAAGTAGATGCTTATAATGTTCGTGGTAGAACATTTAATAGTGTGGTACAATATAATGTATACGCAGATTATGCTTCACGTGTTGGTGATCAACTGATGGGTGGGATTCCTATTAGTACTAGTAGAGTGTTGTTTAGCGGTACTGGTACATATGAAGGTACAAAATATTTGAAATATTCTAAAGGTATTTCTGATATTGGCACAACAAGAACATACACATATAATTCATTTAAACGAGGTACTATTACTGGTTATGGACCACAAGCTACTCGCTTACCATTACCAACTGCTACTGAAAATGCAACATATGGTGGTGTATCATATTGTGATTCTTCAGGAAATGTAACATTCTTTGGAACTGTATTCGTTGAAGGCTCTGTATTATCCGCAGGTTATCAATTGAATCCAACAACTTTGTTGTATGATAAAACTATTTCTATTTCAAATACGGTACTAACTAATTTAAAAAATAGCATATTATCAAACCAAGGATTATCACCATCTTCTAGTACTATTGCGTTGTATTATTCTCCTAATACTTCATATTTTGCGAGTGTTGCGTGTGTAACCAGCCTTAATTCTGGTGGTGGCGGTAATATGATTTTAGCATCAGTTAACTGTACTGCTGATACTTCTTCAGTACTGACGGCAACCCTAAACACTGTAATTAATAATTATAGTGATGCTTCATTTATATCAACATCAACAAACGGTACAGCAACATCAGAGATGCGTAGACATGGTGGTTTGTGTGTAGTTAATTATAGTGATTTTACATATGTATCTTTACCACACTTAATAAATGTTGGAGTGGCAGGTGATTCTCGTGAATATTCATACGCTGGTGTTAAATCAGGAAATACTTTAACTTCATTGATAATGTCTAATAGCTATCATGCACCAGACATTTCACCAGGTTCTCGTGAATATAGCTATATCCCTAACTATGGTTTTGGATATTATGTATTCCAAGACACAGATCAAGGAACAAAACTTATATTCAAACGTTGTGGTAGTACGCTATCAGAGTTCAATTCAAATATGGCTTCTGGTACAGGAACAGATACAGTAATTCTAGCTCAAGATGTTCCTCAAGGATTTTATTTGTATTTTACTGAAGTAACTCCATTATTCCTAAGTGGGCAATACTTTGATGTTCCTATTACAGCAATTGACTTAAGTACAGTACAAGCTAACCCAGGAAATACAACATTCTATGTTTATATAAAATTGGCGTTAGGAACTCCATCTTATGTAGTAAGTACTACAACCTTACCTGAAACTGATACGCAAATGTTTTTAGGAACAATTGTCACGGATGGTACAAAAGTTGCTACGTTAAATATAAAGAAGGTTTCTAGACTAGACACATACAGGCCAAGTACTACCCAAATTGGTTCTGCGTTCCCTGTCAGTACTGGTAATCCTACACAAACAGGAACAATTACCTGGTAA

Tertiary structure

PDB ID
d958255cc61558a23961ced1f3e5e5a56cc114fafea05d78d60a0be8ed9878f0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2313
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of two novel jumbo bacteriophages infecting Xanthomonas vesicatoria isolated from agricultural regions in Mexico Rubi-Rangel,L., Villicana,C., Leon-Felix,J., Amarillas,L., Carrillo-Fasio,A. and Lightbourn-Rojas,L. 2024-07-15 — GenBank