Protein

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Genbank accession
WLW37460.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MPKFISGRVPVNGPGAAATDRTTFLGLEDAEPNLGLASADNSVITTQTDGTRGISDTPTVTGINATGIVTATTGIITTVNAETVDAGSNLYAVAGVVTTITTTDQIGTASTITNLTSTDVTVTRLNVTDTVGTAGTFTTLVGTISTITRLTVTDTVGTAGTFTDLDVTRLTPTDTVGTAATFTDVTVTRLAPTDTVGTGATFTTAVVTDATVTRLAPTDTVGTGASFTTAVVDRLTPTDTVGTAGTFTDLTVTRLTPTDTVGTAATFATLTLTELTSTSGTLDIDATLVDTTTLRAVTGVVTDLTVDDRIVVSGGATIAGVTTFSSNIQAYAGLRDNDGELGAPGQVLQSTGTGLNWVNAAAGGISIRDEGGVVGTAGSVVDVNFSGPGVTATASGVGATITIGQLDTANGLDGEVQYNNGGTLGGATGFVFNDSNNYVGIGSTNPQRQVTIGGDGTVHGNWYTERTFTTTNIPLDALEYVPKSYVDAIQAGIVIKAAVSAATTTALSGVTYTNGLSGVGAKLFPNVNGALVIDGVNLDIQQRVLIKDQGAGGVGSTVQNGFYEVTRVGSGSTSWELQRANDYDEPDEVVAGAFAFVLEGTRNNGNGFVQLTREPVAIGTSAIEYTQFTAPGQVNAGDGLTKTANTLDVVTADSNAITVNPDSINLTALNPTQSTVSTGATIFVQSISIDQYGRITGVVTSNQLGVAGTDFTGVVKVPPEATSGLNVNGEGALDLTNFPTFTNLNVTGISTQRVIVGTSFTTGSLSVSGISTFEDSANFNDNVKLNIGSGNDLQIYHNGADSFIQDVGTGRLYIQSDGTGVDLQKVGGENLARFIADGAVELYYDNSKKFETKSDGVDITGELQSDTLDVDGLANIQGSLTLQSDLLMGDNDLIKIGDSDDLQISHNGSVSIIDGRFHPIEIRHQSEVHAKFNDDGAVELYYNNSKKLETTGFGATVSGTLFADSVQVGGAATVGATLELDSYLKDFYGQVGAASSVLIGDSSGVKWESIATAALQGPKGEKGQKGEKGVDGTKGQKGEQGVQGIKGQKGELGPQGPQGQKGQKGEQGVVGPTGPQGPAGVDGQKGQKGQKGAQGAQGPKGQKGQKGELGPTGQKGQKGAPGPTGPTGPQGPKGQKGQQGSTGPTGPTGPTGPTGPTGQKGQKGAQGPTGPKGQKGEPGPNNTPSVTITGSGNDVLNFSSNTSNDNRGMSFNNRTAVTADYNDGYLRLNNQNEFGNGVYTPERIRADSGLYVNGSQGISAPGGNYGTVRSTGGGNGGWEGFSVDNRAAFMFANDATGGQYNDQDNEWMFYAERNSYSYVYWNGDWRFRSQSDGLYVRGDVTVASDRRLKENIKPLEGSLDKVLKMRGVSFEWQTEARKEEGEKIGFIAQEMLEVEPRVVKLSGAGPDETTEYYGVSYENLTAHLVEAVKEQNAIINNLKERIETLENQHGPE
Physico‐chemical
properties
protein length:1452 AA
molecular weight: 149720,37880 Da
isoelectric point:4,52964
aromaticity:0,06061
hydropathy:-0,28671

Domains

Domains [InterPro]
DC_0955
STR
586–886
DC_0955 IPR050149 IPR030392 Coil
DC_0955
STR
874–1118
DC_0955 IPR008160 IPR030392
IPR008160
STR
1017–1075
IPR008160 DC_1985
WLW37460.1
1 1452
Architecture
STR
STR
RBD
STR 586-1118 | STR 1122-1180 | RBD 1181-1450 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-8S53
[NCBI] 		3038206 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 8102
[NCBI] 		84588 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WLW37460.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ504982.1 [NCBI]
CDS location
range 19177 -> 23535
strand -
CDS
ATGCCTAAGTTTATTTCTGGTCGCGTACCTGTCAATGGTCCTGGTGCGGCAGCCACAGACAGAACCACATTCCTAGGACTGGAGGATGCTGAACCTAATTTGGGTTTAGCTTCTGCTGACAACTCCGTCATTACTACACAGACGGATGGGACCAGAGGTATTAGTGACACCCCGACTGTAACTGGTATCAATGCAACTGGCATTGTAACGGCCACTACAGGTATTATCACAACAGTCAACGCTGAGACTGTTGACGCAGGAAGTAATTTATATGCTGTTGCTGGTGTTGTTACCACAATTACCACAACAGATCAAATTGGTACTGCAAGTACCATCACTAATTTGACATCTACGGATGTTACAGTTACCCGATTAAATGTTACCGACACCGTTGGTACTGCTGGTACATTTACCACTCTGGTTGGAACGATCTCAACGATCACCAGACTTACAGTTACTGACACTGTAGGAACTGCGGGTACATTTACAGATCTGGATGTAACTAGACTTACCCCAACAGATACAGTTGGTACTGCTGCTACATTTACCGACGTAACTGTCACCAGACTTGCTCCTACAGATACTGTAGGTACTGGTGCTACCTTTACTACTGCTGTAGTAACTGATGCAACGGTAACAAGACTGGCTCCAACTGACACTGTTGGTACTGGTGCCTCATTCACCACGGCCGTTGTTGATAGATTAACTCCAACTGATACTGTTGGTACGGCTGGTACTTTCACAGACTTAACTGTAACTAGACTTACCCCAACAGACACTGTTGGTACTGCTGCTACATTTGCGACATTAACTCTTACTGAACTTACTTCTACATCGGGCACTCTTGATATTGATGCCACACTGGTAGATACCACTACTCTTCGTGCAGTAACTGGTGTTGTTACCGATCTCACTGTTGATGATCGTATTGTTGTCAGTGGTGGTGCAACTATTGCTGGTGTTACCACTTTCTCATCAAACATCCAGGCTTATGCTGGTCTTCGTGATAATGATGGAGAATTGGGTGCGCCTGGTCAGGTTCTGCAATCTACAGGAACGGGTCTGAACTGGGTTAATGCTGCCGCTGGTGGTATTTCGATCAGAGATGAAGGTGGTGTTGTTGGTACTGCTGGATCCGTTGTTGATGTCAACTTCTCTGGCCCAGGTGTAACTGCTACCGCAAGTGGTGTTGGTGCTACAATTACCATCGGACAACTTGACACCGCAAATGGTTTAGACGGTGAAGTTCAATATAATAATGGTGGTACTCTCGGTGGTGCAACTGGTTTCGTCTTTAATGATAGTAACAATTATGTTGGTATCGGAAGTACAAATCCACAGAGACAAGTAACCATTGGTGGAGATGGTACTGTTCATGGAAATTGGTACACTGAAAGAACATTTACAACTACCAACATTCCTCTTGATGCCTTAGAATACGTTCCTAAGTCATATGTTGACGCTATTCAGGCGGGTATTGTTATTAAGGCCGCTGTATCTGCTGCAACTACAACTGCATTAAGTGGTGTAACATATACGAATGGTCTCTCTGGTGTTGGTGCAAAGTTATTCCCCAACGTAAACGGAGCACTGGTAATTGATGGTGTCAACCTTGACATTCAACAACGTGTTCTGATTAAAGACCAGGGTGCAGGTGGTGTTGGTAGTACAGTTCAGAATGGATTCTATGAGGTTACTAGAGTTGGTTCTGGATCAACATCTTGGGAACTTCAGAGAGCTAATGATTATGATGAGCCAGATGAAGTCGTCGCTGGTGCGTTTGCGTTCGTACTGGAAGGTACAAGAAACAATGGTAACGGTTTCGTTCAGCTGACGAGAGAACCAGTTGCGATTGGTACATCTGCGATTGAATATACACAGTTTACCGCGCCTGGTCAGGTAAATGCTGGTGACGGTCTTACTAAGACTGCTAATACTCTTGATGTTGTAACTGCTGATTCTAATGCAATCACAGTCAACCCTGATAGCATCAACCTCACTGCACTGAATCCGACACAGAGCACTGTATCAACTGGTGCTACTATATTCGTACAGTCTATAAGTATTGATCAATACGGTAGAATTACTGGTGTTGTTACATCTAATCAATTAGGTGTTGCTGGAACAGACTTTACTGGTGTTGTCAAAGTTCCTCCAGAGGCCACAAGTGGTCTGAATGTTAATGGAGAAGGTGCTCTTGATCTCACCAACTTCCCAACATTCACTAACCTGAATGTAACTGGTATCTCTACTCAGAGAGTAATTGTTGGTACTTCATTCACTACTGGATCTTTAAGTGTCAGTGGTATTTCCACATTTGAAGATAGTGCCAACTTCAATGACAATGTTAAACTCAACATTGGTAGTGGTAATGACTTACAGATTTATCATAATGGTGCTGACAGTTTTATACAAGATGTTGGCACAGGTAGACTGTATATTCAAAGTGATGGAACTGGAGTAGACTTACAAAAAGTAGGTGGAGAAAATTTAGCAAGATTTATTGCAGACGGAGCAGTAGAACTTTACTATGACAACTCCAAGAAATTTGAAACCAAATCAGACGGTGTAGACATCACTGGCGAACTTCAGTCTGACACCCTGGATGTTGATGGATTAGCAAACATTCAAGGTAGTTTGACCCTTCAAAGTGATCTCTTGATGGGTGATAATGACTTAATTAAGATTGGAGATAGTGATGACTTACAAATTTCTCATAATGGAAGTGTAAGTATAATTGATGGACGTTTCCACCCAATCGAAATAAGACATCAGTCAGAGGTTCACGCTAAATTTAATGATGATGGTGCAGTAGAACTTTACTACAATAATTCCAAGAAACTTGAAACCACTGGTTTTGGTGCCACAGTATCTGGAACTCTATTTGCTGATTCTGTTCAAGTTGGTGGTGCTGCGACAGTTGGTGCTACGTTAGAACTTGATTCCTATCTGAAAGACTTCTATGGTCAAGTTGGTGCTGCATCTTCTGTTCTGATTGGTGATTCTAGTGGTGTTAAGTGGGAATCTATTGCTACCGCTGCACTCCAAGGTCCTAAAGGTGAGAAGGGACAGAAAGGTGAGAAGGGTGTTGACGGAACCAAGGGCCAAAAGGGTGAACAAGGTGTACAGGGTATCAAGGGTCAGAAAGGTGAACTTGGTCCCCAAGGTCCTCAGGGTCAGAAAGGCCAGAAGGGTGAACAGGGCGTAGTTGGTCCTACTGGTCCTCAGGGTCCTGCTGGTGTTGATGGTCAGAAAGGACAGAAGGGTCAGAAGGGCGCTCAGGGTGCTCAAGGTCCTAAGGGTCAGAAAGGCCAGAAGGGCGAACTTGGACCCACGGGTCAGAAAGGTCAAAAAGGTGCCCCAGGTCCTACCGGCCCTACGGGTCCTCAGGGTCCTAAGGGTCAGAAGGGTCAACAGGGATCCACGGGTCCAACAGGTCCTACCGGCCCTACAGGTCCAACAGGTCCTACTGGCCAGAAAGGTCAGAAGGGTGCTCAGGGTCCCACTGGTCCTAAGGGTCAAAAGGGTGAACCAGGACCTAACAACACTCCATCAGTAACAATTACTGGTAGTGGTAATGATGTTCTGAACTTCTCTTCTAACACCTCTAATGACAACAGAGGTATGTCGTTCAACAACAGAACGGCTGTTACCGCTGACTATAATGATGGTTACTTAAGACTCAACAACCAGAACGAATTTGGTAATGGTGTTTATACACCAGAAAGAATCCGTGCTGATTCTGGACTTTATGTGAACGGTAGTCAGGGTATTTCTGCCCCTGGTGGTAACTATGGAACCGTTAGAAGTACTGGTGGTGGTAATGGTGGATGGGAAGGTTTCTCTGTAGATAACAGAGCGGCCTTCATGTTTGCTAATGATGCCACAGGTGGTCAGTACAATGACCAAGATAATGAGTGGATGTTCTATGCAGAACGAAATAGTTATTCATATGTTTACTGGAATGGTGATTGGAGATTCAGATCACAGAGTGATGGTCTTTATGTAAGAGGTGATGTCACTGTTGCTTCTGACCGTAGATTGAAAGAGAACATCAAACCTCTTGAAGGTTCTCTTGATAAAGTTCTGAAAATGCGTGGTGTGTCATTTGAATGGCAGACCGAGGCTAGAAAAGAAGAAGGTGAAAAGATTGGATTCATCGCTCAGGAAATGTTAGAGGTTGAACCAAGAGTTGTGAAACTCAGTGGTGCAGGCCCAGATGAAACAACTGAGTATTATGGTGTATCATATGAGAACCTTACCGCTCACTTAGTTGAAGCTGTGAAGGAACAAAACGCGATCATAAATAACTTGAAGGAGAGAATCGAAACCCTGGAGAACCAGCATGGCCCTGAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
048b1f8a78490a86ee16059f6ed2acaca4e5e591fa13723e145066ab11050e6b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5184
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50