Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D7S9U2 [UniProt]
- Protein name
- LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MNINKVSQAVTNQLPDFISSEYELFSKFIEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLNYLDIDQLDVDILDGQTVLVENIDKDSTRIAVESVDQFLAQNGTILIGDEIIFYEDVISAPNIAISPGISYQQVLLKSIELQSPLSQFDDVKRDFVLLSQDRPVAPPTAKHLLVRTYSRYLVPEVDFQVSGNSIVFTEAPRTALTSDGADETSIQFLSGFLENSIIDLDDISPSFGDGITKFRITSGGEKFVPEVDEYVIAYYDGRLLLPKIDYVFDKDLFIFRSLVPLKGRRLDLFYIDAPIPSFGTGSFANARVNDDGKIYSVVTKNAGSGYRFEYPPSINIESESGSGAAAVALINGVKNLQLISGGIGYSDTNPPVVQIESPTKDGSTVAIITATVENGSVSKLTLENSGSGYTSVPRISFKQPGGAVVSTPTIVNGSISGTIDIISTGSGYSTPPEIYIDEPTGPNGIKASLRTNLSSDGEVASVTILNPGQGYETVPRIKIIEPVGAQVLETVVDADGRLINIELLDGGSGYSDVPSVYIIDDRVSNTGQYLGGSGAKATASIFNGRITDINVTEFGTGYSQEFPPRVVIQAPPQASASVDIGINEITGFEVLESGSGYSKAQFLGCARAASAITGYTEDGNAIFKSNTSASAATIDTEVKCLDAVFVKRILDKYTEQLLPDVPKLDYNAIDVRTAIKNIKSFYSTKGTTFSIEYLFKLLYGESVSVSYPKDQIIKPSAATWSINTILRATLVSGDPRNIQDALIQQEADIADINVKDASALVENYIAIETANITIYELVLSEETIKGSFVVPYKTRLAEPLDENTSIITVDSTIGWPERNGEFVLGGTEVVQYKEKSLNQFIECTRGSAGSIGGVGNSRVWDSATEVTSNFRVYLNKGTSQEVVMNIVGIVDAQQTNLTDTGSYYLPGDKLTVAKLGGTGEQPLLTTWLYNVKKLIEIESITFGGINDRFATVTCSNNHGLLVGDEVTIYGANPILYNGTFTVTSRDTDTVFQYQLPQTALVEPQGNILVSVNLNKGKSIDTAINNNISVYTTNIQNSFFNDNYVYVASTGIPNYNVGPFPGSALFPGNQRKLNRFPQSPVTISTKDAITPGPIGTWVNGVSIWSYKSTSSKTFGPIVDVSITNSGQGYDAASPPNITISGGGGSGATAEVIVNGSVTNIEVEDGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGSVSNILITNGGTGYTSQPTITVVGGGGTGATASALVRGPIKSVNLLSQGTSYTSTPNVLISSGTGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGSGYTTAPEVQIQGEGFGAKARAIIDTEGENAGRVTGVEILNRGIGYVQGTTVINLTSIGQDAQFNANVFQWTYNLQETATFDSSQGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFENTSGQIKEQETQLEHSPIIGWAFDGTPIYGPYGYQDPTDQTSDLIRVSSSYRLKTNLVYDQITNPNPYRIEGSPLSVDPAGTFIEDYVYSFASGDLDQYNGRFCKTPEYPEGRYCYFVTIDNTEDGNPVFPYVLGPSFNSVVDSWNLVDSAIQQNIPRGVVRFRDPYQNVDIDVERIPNASTNALTLENGDLLLFEVEDENRDGIISQDETDDPDQILEEPPLQIFDYFPKVKVESKVDIEVETISRFENASITDFVIENAGENYQVNDKLIFNNDGTGGTGASARISRINGENIISYDYEYVNGRNYGVLRTEQPHNLVEGDTIFIDYEENIETTNKTFVVRQFRGIEQIVIDQTGSGYNDEIPPTIIIDGDGESAELEAVVDSVGSIKNVNILNSGNGYTENPRVILSHPQVFKKADYFVTKIDNQEYVKVNDCFVNESKESFICGKTLDDGGNTVAFVAKLSAGGVKEWQKTLELNSGLQYAEFQKVYVNGNNVWVVGVNKPNISILNAYNPDIIVAKYTQSNDGLSATLQFQKAYAGISGGTRSDNVTKIVPLGEDRVAIAGYTDTNSSSPYDGFIAILDAVGTFNVKRKISSTNLSEKVVDVAFDSSGTVYAILETATSKNAADINFAIARLTLSSTALTINWVKEIKNNAYSFLNTSLTIDEFDEMYVSSTLQLKSDDTTRDSFWVGKFNTDGVNLWNYRYLAPGRDINLVQKSKIDIFNELNVAFTRTNHLTDKKTVDTVKLNYKGEIVNHVTTDFIDNTVEGITAHAMDVDVSGDVYIFGQTSWNRNEAIFSFDTDLSDTTEHHTLTTIGLNNSVVNENSILKIYGFQTGQPTIWENSAAKVAGTSLGDALSDDFTIDFLLYKDNTNGNAETLVANQQTLLSIGDATDTTGGLWLYYNTDGSADNGRVELVVANSSNTIASSAAAVGTNSNLFANDTWQLISLKKEGNNFKVYINGVEQISGNVNNTSLGSKDIHIGNIPGFAGTGGFIEDNQGQFFIDALRIRNRGVAVTYPSDFTTLPSAGAIALNHTWVDTAWFDQQLSRYDYIDYLGFGYKVDKNADADRLGTFDNLINSDYGFVRTSVGAVTGSSLVITTTGYALGESGLQTLDYSDAATTMSEGTVTLTYSRDIWSSRTSTVPSPGSQKLKVTANVRDRYYFKTFDIVKIDNVQELTINQQFAFTVGAKLLLKNGETFVNSGYITKVDYENLKVFVAINNNDWDNDIDVYELSTEQFNEQDTFGITGPVPNDINEIRQTFPEVNNTTPGTFDIDLSNYDAPEEVGGTNNLDQYAKFKSFSEFDYSVRIDEVGGSSTYSVGSVVVLEPGQITWNASYSTAQITGLTGVLKITLIANLAKILQVTSVSNSDIVYVISNTLHYLTEGEQLYIDGNPSRTVNSVVYDEYDGSFPVDEIISPVEFTYKLLQTAVSLPSSNASSVSVFVKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLLGGNLSFSKDPVYKLEYSFNSIERIGTPGVTGQGVPTPSVKLKVTRDVITNISYYFDPSRTGEDSPIIPESYLDVTFSPYVGTFTITSTSGGTITRGDDVFRFLLVNQPERAATTANASYSTSSVKAVGSIGQIRIVNPGGFYTKLPVVSRIQSTRNIERVEIEDPGTEYAVGVYTGVPIQGDGEGGIVAITVADGTDDEGGLIPGQIQRVVVTSPGKGYTTAFIDIESVNGILGPGLTGSGAIVNVIIPPFGTGASIFTLGEEIGKIKNLKNNNFGFDYPHDYTLRPEITFPINAQLTATSILDSITVTNPGSGYTQAPEVVIIGGGGSGAIAEATIKNGRLNTIEVKDPGAGYSSQPSVQLKSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIQNGAEVTLNVIDTGDGIEFPLAAGAIGRLNGTTTYYAIAGTENSLEDDQLKIALTAANAELGDSINFVNAGTGRQQVLTSSFGATAEANVVTSTFLEGELVYQGISLDFATATGYVSTNSGWQVGPRILKLVDYTGTFVEGERITGVISKSSGIISTLKIARGVLEVGSITKTTGQFIDDVGKPSEIVQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINEWKDILIRNVHPASFKVFGELSISDYTTIPNKATDFELTKSVQLANEAIVPNIQNFTLVEPIYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISNLFDGVRTAFPLTVNNGDPVIANANQLVVILNGVVQTPEVAFEIQSDSIVFSEPPQPPASVRYVNVEIQQIPTVDITFSSISGIFPNIGNTLTGTGSGAKLTVTKVVGNTVSGFFTVGTAFTSNELVLGNTTGFASLFASQTDVVNNGLFIFGESITNLEGNTAVIEDVNLESGSETPLAKLRYGVGISTTSLEVINYTSTVDEPQNVPAGTFVVNQDYQIGREIVRIISITQNADSSTLIVERARLGTSAGSIQQDTPFYGTSITITNKLTLSKTAGTYQSTPGLYDIVLNDVIVAAQSGVVARITSTSPYRDPATNAVVEQVEISEGSSFFALLFDRLSSVTYPNIVLDDISQSQISVVEFDDNVTDFNTKFPENELVTNYVLPYDNETGDFEDNEFIKNFKIEYGNKTGNFVSSENLTVRKLSLTNEVGDGFFSAGQVLRTQDTKAQIIGYNQARKTVFLGKIGRTQSNGADYHEVVFNNSAQLDTAQKKYGSASLLLANTTTDYVSVATSSEFGFGTGEFTLECWIRPTTVVGTQYILDLRASAADTAPKLYLEGDELRYGSAGTDHITGGTLIANTWHHVSVAKSGTTTKLFLDGIQVGSDFTDNNDYGSSQPIIIGADYANANSIDGHIDELRVSNSARYTAAFTPRNGMFQGDVNVVLLIHFDGADTQTYTEDWSGSQDFTFGELLNNDAILATTNANGGAVVAGFTGNSQRYLDAANLLEANKNFIAKEVVYLTKQQYPSLVIPGGDINCEDDIRDVVQQICEDLRNGSNSHMWDAAAIYVDRTVPAAVTLNHIETEVEETIWAYNKVGDMIPYIVNNVLWTVSGSHGVSQFTDTTITDSNNTVYTQFTPTAATYDPATGDMVLTIGAHSLTTSNQIKIDGGSIVFTCDSDDNATQHAYPRIDDPFYNKVIGIDAVDATTITVNVGESPEDAQFVHTFVSADTNAISVLNYTTGDCADVVSTADNLLNILVDTLDQANQVTPVDHLGGVTRVEPEYEYLGGTVDGFYEVPFAADYNDTGSNTLYSNIIGTLDMNRFYDAANLIRANRAAIVDKASYDLIQRYPDLALDMPRNEDGSGDGTDRCKVDLGLILDAIANDIEIGGNLKTVTASKFYIGANNRLLHIRLQIWQSVYAHTRLAYYAKQAITGDLDNTNTNALIIGDWGITNDPGNCANVQTAIDTLVSKLNDTIAPTGDDFNIAADRLYFNRDYIAEEAVGLLDQEFTYVLNNISYTAFSYPDGSAGRDTCIRDLKNYILPSIISDLQTGGNNSTIEAIEFYLTANLQLNHIEEQLSATIFAIEQLRNLGLKAIQNLLYDKGFGAIDPQYAAVSTTTSAYRDALSMTDVQSVMARYGELVDIAVSILSPAGKPGRFASQQLLFNKNYYRSEIANIVDGQFGAGSWQYNEFIDGLVENLS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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6395 AA molecular weight: 690945,38350 Da isoelectric point: 4,37412 aromaticity: 0,09617 hydropathy: -0,13389
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–437
ATT
1–437
DC_1338
ATT
415–515
ATT
415–515
IPR013320
STR
2270–2430
STR
2270–2430
PF13385
LEC
4082–4223
LEC
4082–4223
IPR006558
LEC
4100–4227
LEC
4100–4227
1
6395
Architecture
ATT 1-1275 | STR 1276-2936 | STR 3109-3984 | STR 4047-4594 | RBD 4595-4921 | STR 5118-5274 | RBD 5564-6395
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-RIM8 [NCBI] |
756278 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Neptunevirus > Neptunevirus srim18 |
| Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO10454.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349286
[NCBI]
CDS location
range 48653 -> 67840
strand +
strand +
CDS
ATGAATATCAATAAGGTCTCCCAAGCAGTTACGAATCAACTCCCAGACTTTATTTCGTCGGAGTATGAACTGTTTTCAAAGTTTATTGAATATTACTACAAGTCTCAGGAAAAGACTGGTCTAGGACAGAATATCCTCAATAACTTTCTTAATTATTTGGATATCGACCAATTGGATGTTGATATTCTCGATGGTCAGACGGTTCTTGTAGAAAATATTGATAAAGATTCCACAAGAATTGCCGTTGAAAGTGTCGATCAGTTTTTGGCGCAAAACGGCACTATTCTGATTGGAGACGAAATTATCTTCTATGAAGATGTAATTTCTGCTCCAAATATCGCTATTAGTCCTGGTATTTCGTATCAGCAGGTATTATTAAAGTCTATTGAACTTCAGAGTCCACTCTCGCAGTTTGATGATGTTAAGAGAGATTTTGTTTTACTGAGTCAAGATAGACCTGTTGCTCCACCAACAGCAAAGCATTTACTAGTAAGAACTTATAGTAGGTACTTAGTTCCTGAAGTAGATTTCCAAGTATCTGGGAATTCTATTGTTTTTACTGAAGCTCCAAGAACAGCATTAACTTCCGATGGTGCTGATGAAACTAGCATTCAGTTTCTTAGTGGATTTCTCGAAAACAGTATCATTGACCTTGATGATATTTCTCCTTCTTTTGGTGATGGTATCACTAAATTCAGGATTACCAGTGGTGGAGAAAAGTTTGTTCCAGAAGTTGATGAGTATGTCATTGCATATTATGATGGAAGACTTTTACTTCCAAAAATTGATTATGTTTTTGATAAGGACCTATTTATTTTTAGAAGTCTTGTTCCCTTAAAAGGAAGAAGACTCGACCTCTTTTACATCGATGCCCCCATTCCATCTTTCGGAACTGGTTCATTTGCAAATGCTAGAGTTAATGATGATGGGAAAATTTATTCTGTTGTAACTAAAAATGCTGGTTCTGGATATAGATTTGAATATCCACCTTCAATCAATATTGAATCCGAATCTGGAAGTGGGGCAGCTGCTGTTGCTCTTATCAATGGTGTTAAGAATTTACAATTAATTTCGGGTGGTATCGGTTATAGTGACACCAATCCACCAGTAGTTCAGATTGAGTCACCAACAAAAGACGGTTCAACAGTTGCTATTATTACAGCAACTGTTGAAAATGGAAGTGTTTCTAAATTAACGTTAGAAAATTCTGGAAGTGGGTATACGTCTGTACCAAGAATTAGTTTTAAACAACCTGGTGGGGCAGTAGTTTCTACCCCAACCATCGTCAATGGTTCTATTTCTGGAACTATTGACATTATTTCTACTGGTTCTGGGTATAGTACACCACCAGAAATCTATATCGATGAACCAACTGGTCCTAACGGAATCAAGGCATCTCTTAGAACTAATTTAAGTTCTGACGGAGAAGTTGCATCTGTAACAATTTTAAATCCTGGTCAAGGATATGAGACTGTTCCCAGAATTAAAATTATCGAACCAGTTGGTGCTCAAGTTTTAGAAACCGTAGTTGATGCTGATGGTCGTTTAATTAATATCGAACTTCTTGATGGTGGAAGTGGATATAGTGATGTACCTTCGGTGTACATCATTGACGATAGAGTAAGTAATACTGGACAATATCTTGGTGGTTCTGGTGCTAAAGCCACAGCATCCATTTTCAATGGAAGAATTACTGACATTAATGTTACGGAATTTGGTACTGGATATAGTCAGGAATTTCCACCAAGAGTTGTTATCCAGGCACCTCCACAGGCATCTGCTTCTGTAGATATTGGTATTAATGAAATTACTGGATTTGAAGTATTGGAGTCTGGTTCTGGATATTCCAAAGCGCAGTTTCTTGGATGTGCTAGAGCAGCTAGTGCAATTACTGGATATACCGAAGATGGAAATGCAATCTTCAAATCTAATACTAGTGCTTCTGCTGCAACTATTGATACTGAAGTAAAGTGCTTAGATGCGGTATTTGTCAAGAGAATTCTAGACAAGTATACCGAACAACTTTTGCCAGATGTTCCTAAACTCGATTATAATGCAATCGATGTAAGAACGGCAATTAAAAATATTAAGTCTTTCTATTCTACTAAGGGAACTACCTTTAGTATTGAATACCTATTCAAGTTGCTTTATGGTGAGTCTGTAAGTGTTTCTTATCCAAAAGACCAAATTATTAAACCATCTGCTGCTACTTGGTCGATTAACACCATTTTACGCGCAACTTTAGTTAGTGGTGACCCAAGAAATATTCAAGATGCTCTAATTCAACAAGAAGCAGATATTGCCGATATCAACGTTAAAGATGCTAGTGCTCTTGTTGAAAACTATATTGCAATTGAAACTGCTAACATAACTATCTACGAATTGGTTCTTTCTGAAGAAACCATTAAAGGTTCCTTTGTCGTACCCTATAAAACAAGACTTGCTGAACCACTGGATGAAAATACTAGTATCATCACAGTTGACTCGACGATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGTGAGTTCGTTCTTGGTGGAACGGAAGTTGTACAATATAAAGAAAAATCTTTAAACCAGTTTATTGAATGTACTAGAGGTTCTGCTGGTTCTATCGGTGGTGTTGGAAATTCTAGAGTTTGGGATTCTGCTACTGAAGTAACTTCTAATTTTAGAGTATATCTCAATAAGGGAACTTCTCAAGAAGTTGTTATGAATATTGTTGGTATCGTTGATGCACAACAAACTAATTTGACGGATACTGGTTCTTATTATCTTCCTGGTGATAAACTTACTGTTGCAAAACTCGGTGGCACTGGAGAACAACCATTATTGACAACCTGGTTGTACAACGTTAAAAAATTAATTGAGATTGAGTCTATTACTTTCGGCGGAATTAATGATAGATTCGCAACAGTTACTTGTAGTAATAATCATGGTTTGTTGGTTGGCGATGAGGTCACCATTTATGGCGCTAACCCTATCCTGTATAATGGAACCTTTACTGTAACATCTAGAGATACTGATACTGTTTTCCAGTATCAACTACCTCAAACTGCTTTGGTTGAACCTCAGGGCAACATTCTTGTGTCTGTCAACCTTAATAAGGGTAAGTCTATTGATACGGCAATTAATAACAATATTTCTGTATATACAACTAATATTCAGAACTCGTTCTTTAACGATAATTACGTCTATGTTGCTTCCACTGGTATTCCTAACTATAATGTTGGACCTTTTCCAGGGTCGGCACTTTTCCCTGGAAACCAAAGAAAGTTAAATAGATTTCCCCAGTCTCCAGTAACAATCTCCACTAAAGATGCTATTACACCAGGACCTATTGGTACATGGGTAAATGGCGTATCAATTTGGTCTTATAAATCGACTTCAAGTAAAACTTTTGGACCAATTGTCGATGTCTCGATTACCAATTCTGGTCAGGGGTATGATGCTGCATCTCCACCAAATATTACAATTTCTGGTGGCGGCGGTTCGGGCGCTACCGCTGAAGTTATTGTTAACGGTTCTGTAACGAATATTGAGGTTGAGGATGGTGGTTCTGGGTATACTTCCTCTCCATTGGTCTCCATCGTCGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCTGCGACAGCAATTATTACCAAGGGTAGTGTATCTAATATTTTAATTACCAATGGAGGTACTGGATACACGTCTCAACCAACTATTACTGTTGTTGGTGGGGGTGGAACTGGCGCTACTGCGTCGGCATTAGTTCGTGGTCCAATTAAATCTGTAAATCTTTTATCTCAAGGAACATCCTATACTTCTACTCCAAATGTCTTAATTAGTTCTGGTACTGGAGCAGTTGCTCAGGCGATTGTGAATAATGGTCGTATTATCTCTATTGCTATCATTTCTGCTGGTAGTGGTTACACTACTGCCCCAGAAGTTCAGATTCAAGGTGAAGGTTTTGGTGCTAAAGCAAGAGCGATTATCGATACTGAAGGGGAAAATGCTGGTAGAGTTACTGGTGTTGAAATTCTTAACAGGGGTATTGGATATGTTCAGGGCACGACTGTTATTAATCTGACTTCTATTGGACAAGATGCACAGTTTAATGCAAATGTATTCCAGTGGACTTATAACTTACAAGAAACAGCAACATTTGATTCTTCTCAAGGTTCTGTTTTTGAAGGATTTAACAATCAGTATGGTGGCGAATATGCACACCTGTCCAACCCACAAAGACTTCGTTATATTTTAGGTGATAATCTATTTGAAAATACTAGTGGTCAAATTAAAGAGCAGGAGACTCAATTAGAGCACTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGAACTCCCATCTATGGTCCATATGGATATCAGGATCCAACTGACCAGACATCCGACCTTATCCGAGTTTCTAGTTCTTATAGATTGAAGACTAACTTAGTTTATGACCAAATTACAAATCCCAATCCATATAGAATTGAAGGTTCGCCCCTGTCTGTAGACCCAGCAGGAACATTTATTGAAGACTATGTTTACTCCTTTGCATCTGGAGACTTAGACCAATATAATGGTAGATTCTGTAAGACACCTGAATATCCAGAGGGTAGATATTGTTACTTCGTTACCATTGATAACACTGAAGATGGTAATCCTGTATTCCCCTATGTTTTAGGTCCAAGTTTTAACTCTGTTGTAGACTCTTGGAACCTTGTAGACTCTGCAATTCAGCAAAATATTCCTCGCGGGGTTGTTCGCTTTAGAGACCCATATCAAAATGTTGATATTGATGTAGAAAGAATTCCTAATGCATCTACAAATGCATTGACATTGGAAAATGGCGACCTACTGTTATTTGAAGTTGAGGATGAAAATAGAGACGGTATCATTAGTCAAGATGAGACGGATGACCCAGATCAAATTTTAGAAGAACCTCCTCTCCAAATCTTTGATTACTTCCCCAAGGTAAAAGTTGAATCTAAAGTTGACATTGAAGTCGAGACTATCAGTAGATTTGAAAATGC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