UniProt accession
A0A1D7S9U2 [UniProt]
Protein name
LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,54
Protein sequence
MNINKVSQAVTNQLPDFISSEYELFSKFIEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLNYLDIDQLDVDILDGQTVLVENIDKDSTRIAVESVDQFLAQNGTILIGDEIIFYEDVISAPNIAISPGISYQQVLLKSIELQSPLSQFDDVKRDFVLLSQDRPVAPPTAKHLLVRTYSRYLVPEVDFQVSGNSIVFTEAPRTALTSDGADETSIQFLSGFLENSIIDLDDISPSFGDGITKFRITSGGEKFVPEVDEYVIAYYDGRLLLPKIDYVFDKDLFIFRSLVPLKGRRLDLFYIDAPIPSFGTGSFANARVNDDGKIYSVVTKNAGSGYRFEYPPSINIESESGSGAAAVALINGVKNLQLISGGIGYSDTNPPVVQIESPTKDGSTVAIITATVENGSVSKLTLENSGSGYTSVPRISFKQPGGAVVSTPTIVNGSISGTIDIISTGSGYSTPPEIYIDEPTGPNGIKASLRTNLSSDGEVASVTILNPGQGYETVPRIKIIEPVGAQVLETVVDADGRLINIELLDGGSGYSDVPSVYIIDDRVSNTGQYLGGSGAKATASIFNGRITDINVTEFGTGYSQEFPPRVVIQAPPQASASVDIGINEITGFEVLESGSGYSKAQFLGCARAASAITGYTEDGNAIFKSNTSASAATIDTEVKCLDAVFVKRILDKYTEQLLPDVPKLDYNAIDVRTAIKNIKSFYSTKGTTFSIEYLFKLLYGESVSVSYPKDQIIKPSAATWSINTILRATLVSGDPRNIQDALIQQEADIADINVKDASALVENYIAIETANITIYELVLSEETIKGSFVVPYKTRLAEPLDENTSIITVDSTIGWPERNGEFVLGGTEVVQYKEKSLNQFIECTRGSAGSIGGVGNSRVWDSATEVTSNFRVYLNKGTSQEVVMNIVGIVDAQQTNLTDTGSYYLPGDKLTVAKLGGTGEQPLLTTWLYNVKKLIEIESITFGGINDRFATVTCSNNHGLLVGDEVTIYGANPILYNGTFTVTSRDTDTVFQYQLPQTALVEPQGNILVSVNLNKGKSIDTAINNNISVYTTNIQNSFFNDNYVYVASTGIPNYNVGPFPGSALFPGNQRKLNRFPQSPVTISTKDAITPGPIGTWVNGVSIWSYKSTSSKTFGPIVDVSITNSGQGYDAASPPNITISGGGGSGATAEVIVNGSVTNIEVEDGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGSVSNILITNGGTGYTSQPTITVVGGGGTGATASALVRGPIKSVNLLSQGTSYTSTPNVLISSGTGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGSGYTTAPEVQIQGEGFGAKARAIIDTEGENAGRVTGVEILNRGIGYVQGTTVINLTSIGQDAQFNANVFQWTYNLQETATFDSSQGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFENTSGQIKEQETQLEHSPIIGWAFDGTPIYGPYGYQDPTDQTSDLIRVSSSYRLKTNLVYDQITNPNPYRIEGSPLSVDPAGTFIEDYVYSFASGDLDQYNGRFCKTPEYPEGRYCYFVTIDNTEDGNPVFPYVLGPSFNSVVDSWNLVDSAIQQNIPRGVVRFRDPYQNVDIDVERIPNASTNALTLENGDLLLFEVEDENRDGIISQDETDDPDQILEEPPLQIFDYFPKVKVESKVDIEVETISRFENASITDFVIENAGENYQVNDKLIFNNDGTGGTGASARISRINGENIISYDYEYVNGRNYGVLRTEQPHNLVEGDTIFIDYEENIETTNKTFVVRQFRGIEQIVIDQTGSGYNDEIPPTIIIDGDGESAELEAVVDSVGSIKNVNILNSGNGYTENPRVILSHPQVFKKADYFVTKIDNQEYVKVNDCFVNESKESFICGKTLDDGGNTVAFVAKLSAGGVKEWQKTLELNSGLQYAEFQKVYVNGNNVWVVGVNKPNISILNAYNPDIIVAKYTQSNDGLSATLQFQKAYAGISGGTRSDNVTKIVPLGEDRVAIAGYTDTNSSSPYDGFIAILDAVGTFNVKRKISSTNLSEKVVDVAFDSSGTVYAILETATSKNAADINFAIARLTLSSTALTINWVKEIKNNAYSFLNTSLTIDEFDEMYVSSTLQLKSDDTTRDSFWVGKFNTDGVNLWNYRYLAPGRDINLVQKSKIDIFNELNVAFTRTNHLTDKKTVDTVKLNYKGEIVNHVTTDFIDNTVEGITAHAMDVDVSGDVYIFGQTSWNRNEAIFSFDTDLSDTTEHHTLTTIGLNNSVVNENSILKIYGFQTGQPTIWENSAAKVAGTSLGDALSDDFTIDFLLYKDNTNGNAETLVANQQTLLSIGDATDTTGGLWLYYNTDGSADNGRVELVVANSSNTIASSAAAVGTNSNLFANDTWQLISLKKEGNNFKVYINGVEQISGNVNNTSLGSKDIHIGNIPGFAGTGGFIEDNQGQFFIDALRIRNRGVAVTYPSDFTTLPSAGAIALNHTWVDTAWFDQQLSRYDYIDYLGFGYKVDKNADADRLGTFDNLINSDYGFVRTSVGAVTGSSLVITTTGYALGESGLQTLDYSDAATTMSEGTVTLTYSRDIWSSRTSTVPSPGSQKLKVTANVRDRYYFKTFDIVKIDNVQELTINQQFAFTVGAKLLLKNGETFVNSGYITKVDYENLKVFVAINNNDWDNDIDVYELSTEQFNEQDTFGITGPVPNDINEIRQTFPEVNNTTPGTFDIDLSNYDAPEEVGGTNNLDQYAKFKSFSEFDYSVRIDEVGGSSTYSVGSVVVLEPGQITWNASYSTAQITGLTGVLKITLIANLAKILQVTSVSNSDIVYVISNTLHYLTEGEQLYIDGNPSRTVNSVVYDEYDGSFPVDEIISPVEFTYKLLQTAVSLPSSNASSVSVFVKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLLGGNLSFSKDPVYKLEYSFNSIERIGTPGVTGQGVPTPSVKLKVTRDVITNISYYFDPSRTGEDSPIIPESYLDVTFSPYVGTFTITSTSGGTITRGDDVFRFLLVNQPERAATTANASYSTSSVKAVGSIGQIRIVNPGGFYTKLPVVSRIQSTRNIERVEIEDPGTEYAVGVYTGVPIQGDGEGGIVAITVADGTDDEGGLIPGQIQRVVVTSPGKGYTTAFIDIESVNGILGPGLTGSGAIVNVIIPPFGTGASIFTLGEEIGKIKNLKNNNFGFDYPHDYTLRPEITFPINAQLTATSILDSITVTNPGSGYTQAPEVVIIGGGGSGAIAEATIKNGRLNTIEVKDPGAGYSSQPSVQLKSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIQNGAEVTLNVIDTGDGIEFPLAAGAIGRLNGTTTYYAIAGTENSLEDDQLKIALTAANAELGDSINFVNAGTGRQQVLTSSFGATAEANVVTSTFLEGELVYQGISLDFATATGYVSTNSGWQVGPRILKLVDYTGTFVEGERITGVISKSSGIISTLKIARGVLEVGSITKTTGQFIDDVGKPSEIVQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINEWKDILIRNVHPASFKVFGELSISDYTTIPNKATDFELTKSVQLANEAIVPNIQNFTLVEPIYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISNLFDGVRTAFPLTVNNGDPVIANANQLVVILNGVVQTPEVAFEIQSDSIVFSEPPQPPASVRYVNVEIQQIPTVDITFSSISGIFPNIGNTLTGTGSGAKLTVTKVVGNTVSGFFTVGTAFTSNELVLGNTTGFASLFASQTDVVNNGLFIFGESITNLEGNTAVIEDVNLESGSETPLAKLRYGVGISTTSLEVINYTSTVDEPQNVPAGTFVVNQDYQIGREIVRIISITQNADSSTLIVERARLGTSAGSIQQDTPFYGTSITITNKLTLSKTAGTYQSTPGLYDIVLNDVIVAAQSGVVARITSTSPYRDPATNAVVEQVEISEGSSFFALLFDRLSSVTYPNIVLDDISQSQISVVEFDDNVTDFNTKFPENELVTNYVLPYDNETGDFEDNEFIKNFKIEYGNKTGNFVSSENLTVRKLSLTNEVGDGFFSAGQVLRTQDTKAQIIGYNQARKTVFLGKIGRTQSNGADYHEVVFNNSAQLDTAQKKYGSASLLLANTTTDYVSVATSSEFGFGTGEFTLECWIRPTTVVGTQYILDLRASAADTAPKLYLEGDELRYGSAGTDHITGGTLIANTWHHVSVAKSGTTTKLFLDGIQVGSDFTDNNDYGSSQPIIIGADYANANSIDGHIDELRVSNSARYTAAFTPRNGMFQGDVNVVLLIHFDGADTQTYTEDWSGSQDFTFGELLNNDAILATTNANGGAVVAGFTGNSQRYLDAANLLEANKNFIAKEVVYLTKQQYPSLVIPGGDINCEDDIRDVVQQICEDLRNGSNSHMWDAAAIYVDRTVPAAVTLNHIETEVEETIWAYNKVGDMIPYIVNNVLWTVSGSHGVSQFTDTTITDSNNTVYTQFTPTAATYDPATGDMVLTIGAHSLTTSNQIKIDGGSIVFTCDSDDNATQHAYPRIDDPFYNKVIGIDAVDATTITVNVGESPEDAQFVHTFVSADTNAISVLNYTTGDCADVVSTADNLLNILVDTLDQANQVTPVDHLGGVTRVEPEYEYLGGTVDGFYEVPFAADYNDTGSNTLYSNIIGTLDMNRFYDAANLIRANRAAIVDKASYDLIQRYPDLALDMPRNEDGSGDGTDRCKVDLGLILDAIANDIEIGGNLKTVTASKFYIGANNRLLHIRLQIWQSVYAHTRLAYYAKQAITGDLDNTNTNALIIGDWGITNDPGNCANVQTAIDTLVSKLNDTIAPTGDDFNIAADRLYFNRDYIAEEAVGLLDQEFTYVLNNISYTAFSYPDGSAGRDTCIRDLKNYILPSIISDLQTGGNNSTIEAIEFYLTANLQLNHIEEQLSATIFAIEQLRNLGLKAIQNLLYDKGFGAIDPQYAAVSTTTSAYRDALSMTDVQSVMARYGELVDIAVSILSPAGKPGRFASQQLLFNKNYYRSEIANIVDGQFGAGSWQYNEFIDGLVENLS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Physico‐chemical
properties
protein length:6395 AA
molecular weight: 690945,38350 Da
isoelectric point:4,37412
aromaticity:0,09617
hydropathy:-0,13389

Domains

Domains [InterPro]
IPR013320
STR
2270–2430
PF13385
LEC
4082–4223
IPR006558
LEC
4100–4227
A0A1D7S9U2
1 6395
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
STR
RBD
ATT 1-1275 | STR 1276-2936 | STR 3109-3984 | STR 4047-4594 | RBD 4595-4921 | STR 5118-5274 | RBD 5564-6395
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8
[NCBI]
756278 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Neptunevirus > Neptunevirus srim18
Host Synechococcus
[NCBI]
1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO10454.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349286 [NCBI]
CDS location
range 48653 -> 67840
strand +
CDS
ATGAATATCAATAAGGTCTCCCAAGCAGTTACGAATCAACTCCCAGACTTTATTTCGTCGGAGTATGAACTGTTTTCAAAGTTTATTGAATATTACTACAAGTCTCAGGAAAAGACTGGTCTAGGACAGAATATCCTCAATAACTTTCTTAATTATTTGGATATCGACCAATTGGATGTTGATATTCTCGATGGTCAGACGGTTCTTGTAGAAAATATTGATAAAGATTCCACAAGAATTGCCGTTGAAAGTGTCGATCAGTTTTTGGCGCAAAACGGCACTATTCTGATTGGAGACGAAATTATCTTCTATGAAGATGTAATTTCTGCTCCAAATATCGCTATTAGTCCTGGTATTTCGTATCAGCAGGTATTATTAAAGTCTATTGAACTTCAGAGTCCACTCTCGCAGTTTGATGATGTTAAGAGAGATTTTGTTTTACTGAGTCAAGATAGACCTGTTGCTCCACCAACAGCAAAGCATTTACTAGTAAGAACTTATAGTAGGTACTTAGTTCCTGAAGTAGATTTCCAAGTATCTGGGAATTCTATTGTTTTTACTGAAGCTCCAAGAACAGCATTAACTTCCGATGGTGCTGATGAAACTAGCATTCAGTTTCTTAGTGGATTTCTCGAAAACAGTATCATTGACCTTGATGATATTTCTCCTTCTTTTGGTGATGGTATCACTAAATTCAGGATTACCAGTGGTGGAGAAAAGTTTGTTCCAGAAGTTGATGAGTATGTCATTGCATATTATGATGGAAGACTTTTACTTCCAAAAATTGATTATGTTTTTGATAAGGACCTATTTATTTTTAGAAGTCTTGTTCCCTTAAAAGGAAGAAGACTCGACCTCTTTTACATCGATGCCCCCATTCCATCTTTCGGAACTGGTTCATTTGCAAATGCTAGAGTTAATGATGATGGGAAAATTTATTCTGTTGTAACTAAAAATGCTGGTTCTGGATATAGATTTGAATATCCACCTTCAATCAATATTGAATCCGAATCTGGAAGTGGGGCAGCTGCTGTTGCTCTTATCAATGGTGTTAAGAATTTACAATTAATTTCGGGTGGTATCGGTTATAGTGACACCAATCCACCAGTAGTTCAGATTGAGTCACCAACAAAAGACGGTTCAACAGTTGCTATTATTACAGCAACTGTTGAAAATGGAAGTGTTTCTAAATTAACGTTAGAAAATTCTGGAAGTGGGTATACGTCTGTACCAAGAATTAGTTTTAAACAACCTGGTGGGGCAGTAGTTTCTACCCCAACCATCGTCAATGGTTCTATTTCTGGAACTATTGACATTATTTCTACTGGTTCTGGGTATAGTACACCACCAGAAATCTATATCGATGAACCAACTGGTCCTAACGGAATCAAGGCATCTCTTAGAACTAATTTAAGTTCTGACGGAGAAGTTGCATCTGTAACAATTTTAAATCCTGGTCAAGGATATGAGACTGTTCCCAGAATTAAAATTATCGAACCAGTTGGTGCTCAAGTTTTAGAAACCGTAGTTGATGCTGATGGTCGTTTAATTAATATCGAACTTCTTGATGGTGGAAGTGGATATAGTGATGTACCTTCGGTGTACATCATTGACGATAGAGTAAGTAATACTGGACAATATCTTGGTGGTTCTGGTGCTAAAGCCACAGCATCCATTTTCAATGGAAGAATTACTGACATTAATGTTACGGAATTTGGTACTGGATATAGTCAGGAATTTCCACCAAGAGTTGTTATCCAGGCACCTCCACAGGCATCTGCTTCTGTAGATATTGGTATTAATGAAATTACTGGATTTGAAGTATTGGAGTCTGGTTCTGGATATTCCAAAGCGCAGTTTCTTGGATGTGCTAGAGCAGCTAGTGCAATTACTGGATATACCGAAGATGGAAATGCAATCTTCAAATCTAATACTAGTGCTTCTGCTGCAACTATTGATACTGAAGTAAAGTGCTTAGATGCGGTATTTGTCAAGAGAATTCTAGACAAGTATACCGAACAACTTTTGCCAGATGTTCCTAAACTCGATTATAATGCAATCGATGTAAGAACGGCAATTAAAAATATTAAGTCTTTCTATTCTACTAAGGGAACTACCTTTAGTATTGAATACCTATTCAAGTTGCTTTATGGTGAGTCTGTAAGTGTTTCTTATCCAAAAGACCAAATTATTAAACCATCTGCTGCTACTTGGTCGATTAACACCATTTTACGCGCAACTTTAGTTAGTGGTGACCCAAGAAATATTCAAGATGCTCTAATTCAACAAGAAGCAGATATTGCCGATATCAACGTTAAAGATGCTAGTGCTCTTGTTGAAAACTATATTGCAATTGAAACTGCTAACATAACTATCTACGAATTGGTTCTTTCTGAAGAAACCATTAAAGGTTCCTTTGTCGTACCCTATAAAACAAGACTTGCTGAACCACTGGATGAAAATACTAGTATCATCACAGTTGACTCGACGATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGTGAGTTCGTTCTTGGTGGAACGGAAGTTGTACAATATAAAGAAAAATCTTTAAACCAGTTTATTGAATGTACTAGAGGTTCTGCTGGTTCTATCGGTGGTGTTGGAAATTCTAGAGTTTGGGATTCTGCTACTGAAGTAACTTCTAATTTTAGAGTATATCTCAATAAGGGAACTTCTCAAGAAGTTGTTATGAATATTGTTGGTATCGTTGATGCACAACAAACTAATTTGACGGATACTGGTTCTTATTATCTTCCTGGTGATAAACTTACTGTTGCAAAACTCGGTGGCACTGGAGAACAACCATTATTGACAACCTGGTTGTACAACGTTAAAAAATTAATTGAGATTGAGTCTATTACTTTCGGCGGAATTAATGATAGATTCGCAACAGTTACTTGTAGTAATAATCATGGTTTGTTGGTTGGCGATGAGGTCACCATTTATGGCGCTAACCCTATCCTGTATAATGGAACCTTTACTGTAACATCTAGAGATACTGATACTGTTTTCCAGTATCAACTACCTCAAACTGCTTTGGTTGAACCTCAGGGCAACATTCTTGTGTCTGTCAACCTTAATAAGGGTAAGTCTATTGATACGGCAATTAATAACAATATTTCTGTATATACAACTAATATTCAGAACTCGTTCTTTAACGATAATTACGTCTATGTTGCTTCCACTGGTATTCCTAACTATAATGTTGGACCTTTTCCAGGGTCGGCACTTTTCCCTGGAAACCAAAGAAAGTTAAATAGATTTCCCCAGTCTCCAGTAACAATCTCCACTAAAGATGCTATTACACCAGGACCTATTGGTACATGGGTAAATGGCGTATCAATTTGGTCTTATAAATCGACTTCAAGTAAAACTTTTGGACCAATTGTCGATGTCTCGATTACCAATTCTGGTCAGGGGTATGATGCTGCATCTCCACCAAATATTACAATTTCTGGTGGCGGCGGTTCGGGCGCTACCGCTGAAGTTATTGTTAACGGTTCTGTAACGAATATTGAGGTTGAGGATGGTGGTTCTGGGTATACTTCCTCTCCATTGGTCTCCATCGTCGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCTGCGACAGCAATTATTACCAAGGGTAGTGTATCTAATATTTTAATTACCAATGGAGGTACTGGATACACGTCTCAACCAACTATTACTGTTGTTGGTGGGGGTGGAACTGGCGCTACTGCGTCGGCATTAGTTCGTGGTCCAATTAAATCTGTAAATCTTTTATCTCAAGGAACATCCTATACTTCTACTCCAAATGTCTTAATTAGTTCTGGTACTGGAGCAGTTGCTCAGGCGATTGTGAATAATGGTCGTATTATCTCTATTGCTATCATTTCTGCTGGTAGTGGTTACACTACTGCCCCAGAAGTTCAGATTCAAGGTGAAGGTTTTGGTGCTAAAGCAAGAGCGATTATCGATACTGAAGGGGAAAATGCTGGTAGAGTTACTGGTGTTGAAATTCTTAACAGGGGTATTGGATATGTTCAGGGCACGACTGTTATTAATCTGACTTCTATTGGACAAGATGCACAGTTTAATGCAAATGTATTCCAGTGGACTTATAACTTACAAGAAACAGCAACATTTGATTCTTCTCAAGGTTCTGTTTTTGAAGGATTTAACAATCAGTATGGTGGCGAATATGCACACCTGTCCAACCCACAAAGACTTCGTTATATTTTAGGTGATAATCTATTTGAAAATACTAGTGGTCAAATTAAAGAGCAGGAGACTCAATTAGAGCACTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGAACTCCCATCTATGGTCCATATGGATATCAGGATCCAACTGACCAGACATCCGACCTTATCCGAGTTTCTAGTTCTTATAGATTGAAGACTAACTTAGTTTATGACCAAATTACAAATCCCAATCCATATAGAATTGAAGGTTCGCCCCTGTCTGTAGACCCAGCAGGAACATTTATTGAAGACTATGTTTACTCCTTTGCATCTGGAGACTTAGACCAATATAATGGTAGATTCTGTAAGACACCTGAATATCCAGAGGGTAGATATTGTTACTTCGTTACCATTGATAACACTGAAGATGGTAATCCTGTATTCCCCTATGTTTTAGGTCCAAGTTTTAACTCTGTTGTAGACTCTTGGAACCTTGTAGACTCTGCAATTCAGCAAAATATTCCTCGCGGGGTTGTTCGCTTTAGAGACCCATATCAAAATGTTGATATTGATGTAGAAAGAATTCCTAATGCATCTACAAATGCATTGACATTGGAAAATGGCGACCTACTGTTATTTGAAGTTGAGGATGAAAATAGAGACGGTATCATTAGTCAAGATGAGACGGATGACCCAGATCAAATTTTAGAAGAACCTCCTCTCCAAATCTTTGATTACTTCCCCAAGGTAAAAGTTGAATCTAAAGTTGACATTGAAGTCGAGACTATCAGTAGATTTGAAAATGC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