Protein

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Genbank accession
YP_010674194.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,69
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MISYNNSAPNAVNNVGQFGATEGSIGAYKSAAEYASDSKYWAMLSQKNYNNIGEILKEVERLYAEGNLLKEDIEQLKSDFENQNQILLGLIQQTGEAIDNTNTAIGEANAATDRANQAVQDVLAQLDKISNMSVVATTLPPGTPATGSFDNSTGVFSFGIPEGQPGKDGKDGTDGTISDIGDVAISTPVSDDYGFFVDKDDGGLYRTPMSEIAKLVPAVTSFNGRTGPVVPAAGDYTVSQVTGAAASGVNNDINQIRGLTTALSVAQGGTGAKNADDARTNLSAMLDSKTGLDGTTNLNDLNGLKAGFYYQPASANAKPELNYPTQLAGSLVVVKTGAGTGYSCKQVYSLYNNPNVTYSRVLNASAGPTSPWSEWVRHVALSRVEEGSSATYMYSSYAPDAPRLQVWTSGLWGCHNGTNWVPLSLAQGGTGATSAAGARAILNLDRFVATASETQMLSSSGDKKVFINSNNNTWGCYDITNSRFIPLGINQGGTGATTADAARMSLVAAKSGANSDITSMTNVVNFTQSPTIPDAVSSNEPVALGQLSTETAALDTKITEAKDAAAAANTNANSRVLTSQLSDTSEVAQGDALVGVMAPFTGATARTQHDKNLDVISIADFGGGTNWSDNGPALQRAITYAASASGNNRGMVYIPPGVWNFTSGVTVPGNVSIKGAGVGSTQLKINSANLVLFDVGNGTNNPNNVSISDLHVLVSSTCTANPLFRFRNGYNCGIDNIRVDGPWYDLIHFRGGAAQFVYRVSDSILNGTSASRHTITIGESSSDGVVQDVFLTNLVLGGRTTGYGVYEKYSSGVYATNVDSLNVNVGWAWEPATGCYCKGSFYTAILGDTNSTAGLRIRPQAGTTVNDLTFNGCWVSSAGSNSSHHGLIIDSSAGTVANISFNGLTAVNNKGHGVYINGSTTGYGYEFTNLSVSNNSQAGASLCSGMKIVAGSSHINISNGHAGGTLGLGTNNQAYGIDVEAGTGNSIKIVNMEMHNNKLGAMNFGATGPYNRIEGCSPFRTRMKGAVELKNGTSSITVNPGLNRPFGGADVQVTPTTDLGALRYWVTQSGNSFTINTNANVSGGQWFSWAVDASYS
Physico‐chemical
properties
protein length:1096 AA
molecular weight: 114213,59120 Da
isoelectric point:5,08643
aromaticity:0,07755
hydropathy:-0,20620

Domains

Domains [InterPro]
Coil
59–79
Coil cd19958 IPR012334
IPR011050
614–959
IPR011050
YP_010674194.1
1 1096
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoP_WFI101126
[NCBI] 		2508203 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010674194.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070991.1 [NCBI]
CDS location
range 9852 -> 13142
strand +
CDS
ATGATCAGTTACAACAACTCAGCACCTAATGCAGTTAATAACGTAGGTCAGTTTGGTGCTACAGAAGGCTCTATCGGTGCTTACAAATCAGCAGCTGAATATGCATCTGATTCCAAGTATTGGGCGATGCTTTCTCAAAAGAACTATAACAACATTGGTGAGATTCTTAAAGAAGTAGAAAGACTTTATGCAGAAGGTAATTTATTAAAAGAAGATATTGAACAACTCAAATCTGATTTTGAAAACCAAAACCAAATACTTCTCGGACTCATTCAGCAAACCGGTGAAGCCATTGACAACACTAATACTGCTATTGGCGAAGCTAATGCAGCAACAGATCGAGCTAACCAAGCAGTGCAAGATGTTCTTGCTCAATTAGATAAGATTTCTAACATGTCTGTTGTTGCTACAACCCTTCCTCCGGGAACCCCTGCAACTGGGAGTTTTGATAACAGTACAGGTGTTTTCTCTTTTGGTATCCCCGAAGGACAACCCGGTAAAGACGGCAAAGATGGAACGGACGGTACAATCTCTGATATTGGGGATGTTGCCATAAGCACCCCTGTGTCTGATGATTACGGATTCTTTGTGGATAAAGATGATGGTGGTTTGTATCGAACTCCGATGAGTGAGATCGCTAAGTTAGTTCCGGCAGTGACCAGTTTCAATGGTCGTACTGGTCCTGTTGTTCCAGCTGCTGGAGACTACACAGTAAGTCAAGTTACTGGCGCAGCTGCTTCTGGTGTTAACAACGATATTAACCAGATTCGCGGGTTAACCACTGCCTTATCTGTAGCTCAGGGTGGTACAGGTGCTAAGAATGCAGATGACGCTAGAACTAACCTATCTGCAATGCTTGACTCTAAAACAGGGCTTGACGGAACAACAAATCTCAATGACTTAAATGGATTAAAAGCTGGGTTTTATTACCAACCTGCTTCTGCTAATGCAAAACCAGAACTTAACTACCCTACACAACTGGCAGGTTCTTTAGTAGTAGTCAAGACAGGTGCAGGTACAGGATATTCATGTAAGCAGGTTTATAGTTTATACAACAACCCTAACGTAACCTACTCTCGTGTACTTAACGCCAGTGCAGGCCCAACCTCTCCTTGGTCTGAATGGGTAAGACATGTGGCCCTAAGTAGAGTAGAAGAGGGATCTTCCGCTACTTACATGTACTCCTCTTACGCTCCGGATGCTCCTAGACTTCAGGTTTGGACTAGTGGTTTGTGGGGGTGTCATAACGGTACTAACTGGGTTCCTTTGTCCTTAGCTCAAGGTGGCACTGGAGCAACATCAGCAGCTGGTGCTCGAGCTATTTTAAACTTGGATAGGTTTGTAGCAACAGCATCAGAAACTCAGATGCTCTCCTCTTCTGGAGACAAGAAGGTTTTCATTAACAGTAATAATAACACATGGGGATGTTATGACATTACCAACTCTCGCTTTATCCCACTAGGGATCAATCAGGGAGGTACTGGAGCAACCACTGCTGATGCAGCTCGTATGTCTCTTGTTGCTGCTAAGAGTGGTGCTAACTCTGACATAACCTCTATGACTAATGTGGTTAATTTCACTCAGTCTCCAACAATCCCCGATGCAGTGTCTTCTAATGAGCCTGTTGCTCTTGGGCAACTTTCCACAGAAACTGCCGCTTTGGATACGAAGATAACAGAAGCTAAGGATGCTGCTGCTGCTGCTAACACTAATGCTAATAGCAGAGTTCTCACTTCACAACTATCAGATACATCTGAAGTTGCTCAAGGGGACGCTTTAGTGGGGGTTATGGCTCCTTTTACTGGTGCTACTGCTCGTACTCAGCATGATAAAAACCTTGATGTGATCTCTATAGCTGACTTTGGTGGTGGTACAAACTGGTCAGATAACGGTCCAGCTCTTCAGAGAGCAATCACATATGCAGCTTCTGCATCTGGTAACAACCGTGGTATGGTTTATATCCCTCCGGGAGTGTGGAATTTCACTTCTGGCGTAACTGTTCCGGGTAACGTTTCTATTAAAGGGGCTGGGGTTGGTTCAACCCAATTAAAAATAAATTCTGCTAACTTAGTTTTATTTGATGTTGGTAACGGAACCAATAACCCGAACAACGTCAGTATCTCTGATTTACATGTTCTTGTAAGTTCCACTTGCACAGCAAACCCTTTATTCCGTTTTAGAAATGGATATAATTGTGGTATTGATAACATCCGTGTTGATGGGCCTTGGTATGACCTTATCCACTTCCGTGGTGGTGCTGCTCAGTTCGTCTACCGAGTCTCGGATAGTATCCTAAACGGTACTTCAGCTAGCCGTCATACGATTACCATTGGTGAATCTTCATCAGACGGTGTTGTTCAAGATGTTTTCTTAACAAACTTAGTCCTTGGTGGAAGAACTACCGGATACGGTGTTTATGAAAAATACTCTTCTGGAGTTTATGCGACTAATGTTGATTCTCTCAACGTTAACGTAGGTTGGGCTTGGGAACCTGCTACTGGATGTTACTGTAAAGGAAGTTTCTACACTGCAATTCTTGGTGATACTAACTCTACAGCTGGTCTTAGAATTAGACCTCAGGCTGGTACAACAGTTAATGACTTAACTTTCAATGGATGTTGGGTAAGTTCCGCTGGGTCTAACAGTTCTCATCATGGTTTGATCATTGATAGTTCTGCTGGTACTGTAGCAAACATTAGCTTTAATGGTTTAACTGCTGTGAACAACAAAGGTCATGGTGTCTACATTAATGGATCTACTACTGGATACGGTTATGAGTTCACAAACCTTAGTGTCTCTAATAACAGTCAAGCTGGTGCTTCTCTGTGTAGTGGTATGAAAATTGTAGCCGGTTCTTCTCACATAAACATTTCTAATGGTCATGCGGGTGGTACTCTTGGTTTAGGTACAAACAACCAAGCCTATGGTATTGACGTTGAGGCTGGTACTGGCAACTCTATTAAAATTGTAAACATGGAGATGCACAATAACAAGCTCGGGGCTATGAATTTTGGGGCAACCGGTCCTTACAACAGGATTGAAGGGTGTTCACCTTTTAGAACCAGGATGAAAGGGGCAGTAGAGCTTAAAAATGGTACATCCTCTATTACAGTAAACCCAGGTTTGAACAGACCATTTGGTGGTGCTGATGTTCAGGTTACTCCTACTACAGATCTAGGCGCTTTGCGTTATTGGGTTACTCAGAGTGGTAACAGCTTTACTATCAACACCAACGCTAATGTCAGTGGGGGTCAATGGTTCTCTTGGGCTGTTGATGCATCTTATAGTTAA

Tertiary structure

PDB ID
3d9ea39216968b8a2e9de52b223f51bab8d52de77481d56c2cba471c6212140e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7216
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank