Protein

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Genbank accession
WLW37664.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,67
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MPKFISGRVPVNGPGAAATDRTTFLGLEDAEPNLGLASADNSVITTQTDGTRGISDTPTVTGINATGIVTATTGIITTVNAETVDAGSNLYAVAGVVTTITTTDQIGAASTITNLTSTDVTVTRLGVTDTVGTGATFTTLVGTISTITRLTVTDTVGTAGTFTDLAVNRLVPTDTVGTAATFTDTTITRLAPTDTVGTGATFTTAVVTDATVTRLAPTDTVGTGATFTTAVVSRLTPTDTVGTAGTFTDLNVTRLTPTDTVGTAATFTTLTLSTLTSTSGTLDIDATLVDTTTLRAVTGVVTDLTVDDRIVVSGGATIAGVTTFRSNIQAYGGLRDNDGELGAPGQVLQSTGSGLNWVNAAAGGISIRDEGGVVGTAGSVVDVNFSGPGVTATASGVGATITIGQLDTANGLDSEVQYNNGGTLGGATGFVFLDSTNFVGIGSTNPQRQVTIGGDGTVHGNWYTERTFTTTNIPLDALEYVPKSYVDAIQAGIVIKAAVSAATTAGLSGVTYTNGLSGVGAKLFPNVNGALVIDGVTLDIQQRVLIKDQGLAGVGNTLENGFYEVTRVGSGSTSWELQRANDYDEVDEVVAGAFAFVLEGTRNNGNGFVQLTREPVAIGTSAIEYTQFTAPGQVNAGDGLTKTANTIDVVTADATAITVNPDSINLTALNPTQSTVSTGATIFVQSISVDQYGRITGVVTSNQIGVAGTNFTGVVKVPPEATSGLNVNGEGALDLTNFPTFTNLNVTGISTQRVIVGTSFTTGSLSVSGISTFEDSLNFNDNVKLNIGSGNDLQIYHNGSDSFIQDVGTGRLYVQSDGTGIELQKVGGENLAKFITDGAVELYYDNSKKFETKSDGVDITGELQSDTLDVDGLANIQGSLTLQSDLLMGDNDLLKIGDSDDLQISHNGSVSIIDGRFHPIEIRHQSEVHAKFNDDGAVELYYDNAKKFETTGFGVTVNGTLFADSVQVGGATTVGGTLELDSYLKDNFGQVGAATSVLIGDASGVKWESIAIAALQGPKGEKGQKGEKGVDGTKGQKGEQGVQGIKGQKGELGPQGPQGQKGQKGEQGVVGPTGPQGPAGVDGQKGQKGEKGAQGAQGPKGQKGAVGPTGPTGPKGQKGEPGPTGPKGAQGPKGQKGQQGSTGPTGPTGPTGPTGPTGQKGQKGATGPTGPKGQKGEPGPNNTPSVTITGSGNDVLNFSANTSNDNRGMSFNNRTAVTADYNDGYLRLNNQNEFGNGTYTPERIRADSGLYVNGSQGISAPGGNYGTVRSTGGGNGGWEGFSVDNRAAFMFANDATGGQYNDQDNEWMFYAERNSYGYVYWNGDWRFRSQSDGLYVRGDVTVASDRRLKENIKPLEGSLDKVLQMRGVSFEWQTEARREEGEKIGFIAQEMLEVEPRVVKLNGAGPDETTEYYGVSYENLTAHLVEAVKEQNAIINNLKERIENLENQHGPE
Physico‐chemical
properties
protein length:1452 AA
molecular weight: 149664,57530 Da
isoelectric point:4,54510
aromaticity:0,06061
hydropathy:-0,26274

Domains

Domains [InterPro]
DC_0955
STR
585–885
DC_0955 IPR050149 IPR030392 Coil
DC_0955
STR
874–1120
DC_0955 IPR008160 IPR030392
IPR008160
STR
1017–1075
IPR008160 DC_1985
WLW37664.1
1 1452
Architecture
STR
STR
RBD
STR 585-1120 | STR 1122-1180 | RBD 1181-1450 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-8S55
[NCBI] 		3038207 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 8102
[NCBI] 		84588 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WLW37664.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ504983.1 [NCBI]
CDS location
range 23411 -> 27769
strand +
CDS
ATGCCTAAGTTTATTTCTGGTCGCGTACCTGTCAATGGTCCTGGTGCGGCAGCCACAGACAGAACCACATTCCTAGGACTGGAGGATGCTGAACCTAATTTGGGTTTGGCTTCTGCTGACAATTCCGTCATTACTACGCAGACGGATGGGACCAGAGGTATTAGTGACACCCCGACTGTAACTGGTATCAATGCAACTGGCATTGTAACGGCCACTACAGGTATTATCACAACAGTCAACGCCGAGACTGTTGACGCAGGAAGTAATTTATATGCTGTTGCTGGTGTTGTTACTACAATTACCACAACGGATCAAATTGGTGCTGCAAGCACCATCACTAATCTGACATCTACGGATGTTACAGTTACCCGATTAGGTGTTACCGACACTGTTGGTACTGGTGCTACATTTACGACTTTGGTTGGAACGATCTCAACCATCACCAGACTCACAGTTACTGACACTGTAGGAACTGCGGGTACATTTACGGATCTAGCTGTAAATAGACTTGTTCCAACGGATACAGTTGGTACTGCTGCTACATTTACAGACACAACTATCACCAGACTTGCTCCTACAGACACTGTGGGTACTGGTGCTACATTCACTACCGCTGTAGTAACTGATGCAACGGTAACAAGACTTGCTCCAACTGATACTGTTGGTACTGGTGCTACATTCACCACGGCCGTTGTTAGTAGATTAACTCCGACTGATACTGTTGGTACAGCTGGTACTTTCACAGACTTAAATGTAACTAGACTCACTCCAACAGACACTGTTGGTACGGCTGCAACATTTACTACATTAACTCTTTCCACTCTTACATCTACATCAGGTACTCTTGATATTGATGCCACACTGGTAGATACTACTACTCTTCGTGCAGTAACTGGTGTTGTTACCGATCTCACAGTTGATGATCGTATTGTTGTCAGTGGTGGTGCTACGATTGCTGGTGTTACCACTTTCCGATCAAACATTCAGGCCTATGGTGGTCTTCGTGATAATGATGGAGAATTGGGTGCGCCTGGCCAAGTTCTGCAATCTACAGGATCAGGTCTGAACTGGGTTAATGCTGCCGCTGGTGGTATTTCGATCAGAGATGAAGGTGGTGTTGTTGGTACTGCTGGATCTGTTGTTGATGTCAACTTCTCTGGCCCAGGTGTAACTGCTACCGCAAGTGGTGTTGGTGCTACAATTACCATCGGACAACTTGACACTGCAAATGGTTTAGATAGTGAAGTTCAATACAATAACGGTGGTACTCTCGGTGGTGCAACTGGTTTTGTCTTTCTTGACAGTACCAATTTTGTTGGTATCGGAAGTACAAATCCACAGAGACAGGTAACCATCGGTGGAGATGGTACTGTTCATGGAAATTGGTACACCGAAAGAACATTTACAACCACCAACATTCCTCTTGATGCCTTAGAATACGTTCCTAAGTCATATGTTGACGCTATTCAGGCGGGTATCGTTATTAAGGCCGCCGTATCTGCTGCAACTACTGCTGGGTTGAGTGGTGTAACATATACGAATGGTCTTTCTGGTGTCGGTGCAAAGTTATTCCCCAACGTAAACGGAGCACTGGTAATTGATGGTGTTACCCTTGACATTCAACAACGTGTCCTGATTAAAGACCAGGGTCTAGCAGGTGTCGGTAATACACTTGAGAATGGATTCTATGAGGTTACTAGAGTTGGTTCTGGATCAACATCTTGGGAACTTCAGAGAGCTAATGATTATGATGAAGTTGATGAAGTCGTCGCTGGTGCGTTCGCGTTCGTACTGGAAGGTACAAGAAACAATGGTAATGGTTTCGTTCAGCTGACGAGAGAACCAGTTGCGATTGGTACATCTGCGATTGAATATACACAGTTTACCGCGCCTGGTCAGGTAAATGCTGGTGACGGTCTTACTAAGACTGCTAACACTATTGATGTTGTAACTGCTGATGCTACCGCAATTACAGTCAATCCTGATAGCATCAACCTCACTGCACTGAACCCGACACAGAGCACTGTATCAACTGGTGCTACCATATTCGTGCAGTCTATAAGTGTTGATCAATACGGTAGAATCACTGGTGTTGTTACATCTAACCAAATAGGTGTTGCTGGAACAAACTTTACTGGTGTTGTCAAAGTTCCTCCAGAGGCCACAAGTGGTCTGAATGTTAATGGAGAAGGTGCTCTTGATCTCACTAATTTCCCAACATTCACTAACCTGAATGTAACTGGTATCTCTACTCAGAGAGTAATTGTTGGTACTTCATTCACTACTGGATCTTTAAGTGTCAGTGGTATTTCTACATTTGAAGATAGTCTCAACTTCAATGACAATGTTAAACTCAACATTGGTAGTGGTAATGACTTACAAATTTATCATAATGGTTCTGACAGTTTTATACAAGATGTTGGCACAGGTAGACTGTATGTTCAAAGTGATGGAACTGGAATAGAGTTACAAAAGGTAGGTGGAGAAAATTTAGCAAAATTCATTACAGATGGTGCAGTAGAACTTTACTATGACAACTCCAAGAAATTTGAAACCAAATCAGACGGTGTAGACATCACTGGCGAACTTCAGTCTGACACCCTGGATGTTGATGGATTAGCAAACATTCAAGGTAGTTTAACCCTTCAAAGTGATCTCTTGATGGGTGATAATGACTTACTTAAGATTGGAGATAGTGATGACTTACAAATTTCTCACAATGGAAGTGTAAGTATAATTGATGGACGTTTCCACCCAATCGAAATAAGACATCAGTCAGAGGTTCACGCTAAATTTAATGATGATGGTGCAGTAGAACTCTACTATGACAACGCCAAGAAATTTGAAACCACTGGTTTTGGTGTTACGGTAAATGGAACTCTATTTGCTGATTCCGTTCAAGTTGGTGGTGCTACAACAGTTGGTGGTACATTAGAACTTGATTCTTATCTGAAAGACAACTTTGGTCAGGTTGGTGCTGCAACATCTGTTCTGATTGGTGATGCAAGTGGCGTTAAGTGGGAATCGATTGCGATTGCTGCACTCCAAGGTCCTAAAGGTGAGAAAGGACAGAAAGGTGAGAAGGGTGTTGACGGAACCAAGGGCCAAAAGGGTGAACAGGGCGTACAGGGTATCAAGGGTCAGAAAGGTGAACTTGGTCCTCAAGGTCCTCAGGGTCAGAAAGGTCAGAAGGGCGAACAGGGTGTAGTTGGTCCTACTGGTCCTCAGGGCCCTGCTGGTGTTGATGGTCAGAAAGGCCAGAAGGGTGAGAAAGGTGCTCAGGGTGCTCAAGGTCCTAAGGGTCAGAAGGGTGCTGTTGGTCCTACTGGCCCTACTGGTCCTAAGGGTCAGAAGGGCGAACCAGGACCTACTGGTCCCAAGGGTGCTCAGGGTCCTAAGGGTCAGAAGGGTCAACAGGGATCCACGGGTCCAACAGGTCCTACCGGCCCTACAGGTCCAACAGGTCCTACTGGCCAGAAAGGTCAGAAGGGTGCTACAGGTCCCACAGGTCCTAAGGGTCAAAAGGGTGAACCAGGACCTAACAACACTCCATCAGTAACAATTACTGGTAGTGGTAATGATGTTCTGAACTTCTCGGCTAACACCTCTAATGACAACAGAGGTATGTCGTTCAACAATAGAACGGCTGTTACCGCTGACTATAATGATGGTTACTTAAGACTCAACAACCAGAATGAATTTGGTAATGGTACTTACACGCCAGAAAGAATCCGTGCTGATTCTGGACTTTATGTGAACGGTAGTCAGGGTATTTCTGCCCCTGGTGGTAACTATGGAACCGTTAGAAGTACGGGTGGTGGTAATGGTGGATGGGAAGGTTTCTCTGTAGATAACAGAGCGGCCTTCATGTTTGCTAATGATGCCACAGGTGGTCAGTACAATGACCAAGATAATGAGTGGATGTTCTATGCAGAACGAAATAGTTATGGATATGTCTACTGGAATGGTGATTGGAGATTCAGATCACAGAGTGATGGTCTTTATGTAAGAGGCGATGTCACTGTTGCTTCTGACCGTAGATTGAAAGAGAACATCAAACCTCTTGAAGGTTCTCTTGATAAAGTTCTGCAAATGCGTGGTGTGTCATTTGAGTGGCAGACCGAAGCTAGAAGAGAAGAAGGTGAAAAGATTGGATTCATCGCTCAGGAAATGTTAGAGGTTGAACCAAGAGTTGTGAAACTCAATGGTGCAGGCCCAGATGAAACAACTGAGTATTATGGTGTATCATATGAGAACCTTACCGCTCACTTAGTTGAAGCTGTGAAGGAACAAAACGCGATCATAAATAACTTGAAGGAGAGAATCGAAAACCTGGAGAACCAGCATGGCCCTGAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
70f56fe68a4080e3ca3d587cb3155aa02996b2cb0bca6b4299e2cc483894fede
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5175
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50