Protein

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Genbank accession
YP_010065305.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIHYINESGTSKYWTFRRDGGFVVDTGSLTVTDGNISASGNINSATGVVSAPQINTKTIVFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDAATGVSYKRSGVYDLVANGLSIASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWIMPGTNAAFLSVQTQADENAAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKIVTGANNVMFYADGGITSTKQLSIYNGVYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYAQRVAPASGSTTGVIQFRIAGALLTGGGITSSGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSETNFYIIPTLQNAGESGGISNLRPFTINLANGSVMMGNHTQAGKNLLTIDNVSKFVQTDVRLRVNMDSDAIVVNASSQAASNFIQGRKADVTKWYLGIGDGGNVVRMHNYTYSHGIALNSDTVDITKPLKINDIRIGTDGNITGGTGNFANLNTTLNRKTNVGGWAGSSVDGWYKFATVTIPQGTGTVTFKISGGAGFNFKSYSQASVAEIVLRTGNNNPKGINAVLWNRSDLSFNQIATMNTSGDTYDVYVFCAGYTNALVVEYSCSENSSVTVVGLNGGIQPVVDTLPEGHVVGKTVRLLNNIGGTFAAGESNIVTRGEYVTDNQKGMRIKSNGNNIGSNAALIRNDGGSFYILATDKNTEEKPDAANGDWNGLRPFSINMTDGRVGMNHGLNITGGGLNVTGGNTNLGNITSRVVSSARAPAGWGDNSDTMKSKITFMADHGDLSNSGSYYPIVGAWSNYGSAGYRQTFEFGWVGSGTTSGWRDGIIRIRGDNANGQQARWRFTMDGTLDCPGKVLLPQTGAFGVNTSNGLGGNSITFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLDGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSARVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1292 AA
molecular weight: 137757,45000 Da
isoelectric point:8,17828
aromaticity:0,08824
hydropathy:-0,29946

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
675–733
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
677–750
IPR048388 IPR030392 Coil
YP_010065305.1
1 1292
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Citrobacter phage vB_CroM_CrRp10
[NCBI] 		2079276 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010065305.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054899 [NCBI]
CDS location
range 130501 -> 134379
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATTTAAGCATTTCCGCTGGCGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGAGATTATTTACAGAACGGTACATATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACAGCTGGTAATGGTGCATGGGCAAATCAACACCTAAATAAAGCTCCTATCTTTACAGATTTGAGCTCAACTACTTCCGTTTCAGAATATCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAACGAAGGAAGTTTTAAAATTCATTATATCAACGAATCGGGAACTTCAAAATACTGGACATTTCGTAGAGATGGCGGATTTGTTGTTGATACAGGAAGTTTGACAGTAACAGATGGAAATATTTCTGCTTCTGGTAATATTAATTCGGCTACTGGGGTAGTTTCTGCTCCGCAAATCAATACAAAGACTATAGTATTTGACACAAAAGCATTTGGACAATACGATTCACAATCATTAGTTCAATATGTTTACCCTGGAACTGGTGAAACAAACGGAATCAATTACCTTCGCAAATTCCGTGCAAAATCTGGTGGTACAATTTATCATGAATTAGCTTCTGCACAAACCGGAAAAAGTGATGAACTTTCTTGGTGGACTGGTAATACAGCGGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGTTCTTTAGTATTACGACGTTCACTTGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATCAATAACTACGGCTCCACTGGAGCAATGGGTGAATGCTATATAGTAATTGGAGACGCCGCAACAGGTGTATCATATAAAAGATCTGGTGTATACGATTTAGTTGCTAACGGTCTTTCTATAGCATCTATTACTCCTGACAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCGTTATTTGGGCGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACGTGGATTATGCCTGGAACGAATGCTGCATTTTTATCAGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACGCTGCTGGAGACGGCCAGACACATATTGGCTATAACTCAGGCGGAAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCGGGTATTCTTAAAATAGTAACCGGTGCAAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCCACTAAGCAGCTTTCAATATATAATGGCGTATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCTGGACAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTATTTTTATGCGCAGCGTGTAGCTCCTGCATCAGGTTCAACAACTGGAGTAATTCAATTTAGAATTGCTGGAGCATTATTAACCGGTGGGGGTATTACATCATCAGGTTCTATTGTTACTGAGTCAAGTTTAGTTGCAAATAATGGATTGTCTGTAAATGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACAGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGCCGTTCGGAAACTAACTTTTATATTATTCCAACTTTACAAAATGCCGGAGAATCGGGCGGTATAAGTAATTTACGCCCATTTACCATCAATCTCGCAAATGGTAGTGTTATGATGGGCAATCATACACAAGCCGGAAAAAATTTGCTTACTATTGATAACGTATCAAAATTCGTTCAAACCGATGTTAGACTTCGAGTTAATATGGATTCTGACGCTATTGTGGTAAATGCTTCATCTCAAGCTGCATCTAACTTTATTCAAGGACGTAAGGCTGATGTTACAAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGAAACGTCGTTCGTATGCATAATTACACCTACTCTCACGGTATTGCATTAAACTCTGATACTGTCGATATTACTAAGCCTCTTAAAATTAATGATATTCGAATTGGTACAGATGGTAACATCACAGGTGGTACTGGTAATTTTGCTAACTTAAATACAACGTTAAATCGTAAAACCAACGTGGGCGGTTGGGCTGGTAGTTCTGTTGACGGATGGTATAAATTTGCTACGGTAACAATTCCTCAGGGTACTGGTACAGTGACTTTTAAGATTTCCGGCGGCGCTGGTTTTAATTTTAAAAGCTATAGCCAAGCTTCTGTTGCAGAAATAGTTCTTCGCACGGGTAATAATAATCCTAAAGGCATAAACGCTGTACTGTGGAATAGGTCAGACCTGAGTTTTAATCAGATAGCTACTATGAATACATCTGGCGATACTTATGATGTATACGTGTTCTGTGCCGGTTATACAAATGCGTTAGTGGTTGAATATTCCTGTAGTGAAAACTCTTCGGTAACCGTAGTCGGTCTTAACGGAGGCATTCAGCCAGTTGTTGACACATTGCCTGAGGGACATGTTGTAGGTAAAACAGTTCGTCTGTTAAATAATATTGGCGGAACTTTTGCAGCTGGAGAATCTAACATTGTTACTCGCGGTGAATACGTTACTGATAATCAAAAAGGCATGCGTATTAAATCTAACGGTAATAATATAGGTTCTAATGCAGCTTTAATTAGAAATGATGGCGGAAGTTTTTATATTTTAGCTACAGATAAAAATACGGAAGAAAAACCCGATGCAGCTAATGGTGATTGGAATGGCTTAAGACCTTTCTCTATTAATATGACTGATGGCCGCGTTGGTATGAACCATGGGTTGAATATTACTGGTGGTGGATTAAACGTTACTGGTGGTAATACTAACTTAGGTAATATTACTTCGCGAGTGGTTTCATCTGCACGTGCACCTGCTGGTTGGGGTGATAACTCGGACACAATGAAATCTAAAATCACCTTCATGGCAGACCATGGTGATTTATCTAATTCAGGTAGTTATTATCCTATTGTCGGTGCATGGAGTAATTATGGCTCAGCAGGTTATCGTCAGACCTTTGAGTTCGGATGGGTTGGCTCTGGCACTACATCGGGTTGGCGTGATGGTATTATTCGTATACGCGGCGACAATGCTAACGGCCAGCAAGCAAGATGGCGCTTTACAATGGACGGTACTCTAGACTGCCCTGGTAAAGTACTGCTACCACAAACAGGTGCCTTTGGTGTCAATACATCAAATGGTCTCGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGCGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTCAAACCTATCGAAAACGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTGACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTAGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTGCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
9a4eb63ba2d58b6afe013a36c02f48503208d9987bff6bd62f2f7f5959a78c42
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5137
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Citrobacter rodentium phages Mizuno,C.M., Debarbieux,L. and Roach,D.R. 2008-04 — GenBank