Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009887012.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MALDPNINRIKFLRSSTAGAKPTTAAIQPGEIAINLADRTLYSTDGNAIIDIGFGLGGSVNGPINATGQISTNDFLYSKYGFSVNSETADGRGISLYGNGYTASNGLPSYGLAMAATSKYGTFGAVSGSHATYLTTNSGTNRGWIFNYNGTTNVASISGTGIATFARVDAPLNGNANTATKLQSARNINGVLFDGTSDINTPAITDVVSFDNRTVKPSDVRNKAMGVYFTSKAGLNGAGDTNYGDFLSLSTYQDGTGGKVNGLYFNKLSREILHYQSDLNSNSWGTPKTIAYTDSSITGNAASATRLQTARTINGTAFDGTANINVNATYSEFIPDGANLNDYKTPGLYYCPTDAGAATQLNLPFSNAYSLFVERHAGIKQTITQYASNKTFIRKFYNGYWDNWRQLAFLDPSDQKFTENITLEKASSAATINVKTTTDNTSELVLSNRNKTASVGLVPDGTFFIWDSSRQTSFMSFTPDGVQSVLNSKLLINTPASLNSTGQETFTVTGGESSPIRFKINRAGAITTNSPVTGVSSIPHAISFNWYNTEWQIGNARDGSTGTVGFGITKGNDTLVWRHDGNSMTNYGNISNTGWISAQGDISSNGNISNTGSISTQGNISSNGNLSTAGSISGDSLITRTGRIGAPTSTYHYLDIGRDGTDITTVGQYGGAFRVVDTSNGATSFYVDSVDAKFSGKITTKPVTFYWNVTDLGNSTAAITVPDAIAPISKTGYAPFIHGSVQTDGIGYRTNVSIGAWRGSNTWTSSGAYIAIGGNDNYTTEDFRFMTGGYIGTSGGTLNILGTLNAPTLTSTTGSFTTVNTTNINAQGSIVMSAAPGGSGRSGMYTGNGDGASFSTCNIDIGSHWGLGFKDNLGNRNIIFDTRAGNASFKGSIRIGASFADETQLLPTSNQLQILTSGGQARNISTGGVLASDAYADASKVPVNGIYSKGDIKTSTWVYASKFTGPTGSGDGMFDGNASTATKLQTARTFQITGGITTNAVSFDGQQNVVLTASNVDGSKVTGVVPEAVKAQTLAVTPQKNAKLVASWKGTILQSMTPTLTIVDANTLRVRLADDSPSNRLPVLRFNVKIGTVYHLAFSDTMLPINGTVTFVQTGLTWVEVDLNSPNHGLSGSGNGVNVMAITYSAYGCYFEGSISQIIGTTGPKDSQWAYVLKLNSPTTDATYNLSGSSQDATWVADKNIWYLNPAQPVITAGAMISPDRLNFFAADTDAPTRMRSNMVTAQIWDIV
Physico‐chemical
properties
protein length:1248 AA
molecular weight: 131546,74560 Da
isoelectric point:6,58181
aromaticity:0,09375
hydropathy:-0,21731

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
334–408
cd19958 IPR005601
YP_009887012.1
1 1248
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_AbaM_Lazarus
[NCBI] 		2686289 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009887012.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049493 [NCBI]
CDS location
range 155197 -> 158943
strand +
CDS
ATGGCATTAGATCCAAATATTAACAGAATTAAATTTTTACGATCTTCTACTGCTGGAGCTAAACCTACTACTGCAGCGATTCAACCAGGCGAAATTGCTATCAATTTGGCAGATAGAACTCTTTACTCAACCGATGGTAATGCTATTATTGATATCGGTTTTGGTTTGGGTGGAAGTGTCAATGGGCCAATAAATGCAACAGGGCAAATTAGTACCAATGACTTTTTATATTCAAAGTATGGATTTTCTGTAAATTCAGAAACTGCAGATGGACGCGGTATTTCATTATATGGTAATGGATATACCGCATCAAACGGTCTGCCGTCATACGGGCTTGCGATGGCTGCTACAAGTAAATATGGTACATTTGGTGCTGTGTCAGGTTCGCACGCAACTTACCTTACTACAAACTCAGGTACTAACCGTGGTTGGATTTTTAACTATAACGGGACTACCAATGTAGCTTCAATTTCGGGAACCGGCATTGCGACATTTGCTCGTGTAGATGCTCCGTTAAACGGTAATGCTAATACAGCAACCAAACTTCAATCAGCTAGAAACATTAATGGCGTGTTGTTCGACGGCACATCAGATATTAATACACCAGCTATCACTGACGTCGTTTCATTTGATAATAGAACTGTTAAACCTTCTGATGTTAGAAATAAAGCCATGGGTGTTTATTTTACTTCAAAGGCAGGTTTAAATGGCGCGGGTGATACCAATTATGGTGATTTTTTATCTCTAAGCACTTATCAAGATGGCACTGGAGGAAAGGTAAACGGTTTATATTTCAATAAATTATCTCGAGAAATATTACATTACCAGTCAGATTTAAATTCAAATTCGTGGGGAACTCCGAAAACGATTGCGTATACAGATAGTTCTATTACCGGCAATGCTGCATCAGCAACACGCTTACAGACAGCCAGAACTATCAATGGTACTGCATTTGATGGTACTGCGAATATCAATGTCAATGCTACATATTCGGAATTTATTCCTGATGGCGCGAATTTAAATGATTATAAAACTCCAGGGCTATATTATTGTCCTACTGATGCTGGTGCAGCGACTCAATTAAATTTACCGTTTAGTAATGCGTATTCGTTGTTTGTTGAGAGACATGCTGGAATTAAACAGACCATTACCCAATATGCGTCAAATAAAACTTTTATTCGTAAATTTTATAATGGTTATTGGGATAATTGGCGTCAATTAGCTTTCTTAGACCCAAGTGATCAGAAATTTACAGAAAATATCACTTTGGAAAAAGCTTCTTCTGCTGCAACAATCAACGTTAAAACTACTACTGATAATACTTCTGAACTTGTTTTAAGTAATAGAAATAAAACAGCGTCTGTAGGACTTGTGCCAGACGGTACTTTTTTTATATGGGATTCAAGTAGACAAACATCATTCATGTCATTTACGCCAGACGGTGTGCAATCTGTATTGAATTCTAAGTTGTTGATTAATACTCCAGCATCATTGAACTCTACCGGCCAAGAAACATTTACTGTTACTGGTGGAGAAAGCTCTCCGATTAGATTTAAAATTAACCGCGCTGGGGCAATCACTACTAACTCGCCTGTTACTGGTGTTTCTTCTATTCCCCATGCTATATCATTTAACTGGTATAATACAGAATGGCAAATAGGTAACGCCCGTGATGGTTCTACTGGTACTGTTGGTTTTGGTATTACTAAAGGTAATGATACGTTAGTATGGCGCCATGATGGTAATAGCATGACCAACTACGGTAACATTAGTAATACGGGTTGGATCAGTGCGCAAGGAGATATTTCATCTAATGGTAACATTAGTAATACAGGTTCGATCAGTACGCAAGGAAATATTTCATCTAATGGTAACTTGAGTACTGCAGGTTCAATCAGCGGAGATAGTTTAATCACTAGAACTGGTCGTATCGGTGCGCCAACATCTACGTATCACTATCTCGATATCGGTAGAGACGGTACAGATATTACTACGGTCGGTCAATATGGAGGTGCATTTAGAGTTGTTGATACATCTAATGGAGCTACTTCGTTTTATGTAGACTCGGTTGATGCTAAATTTTCAGGTAAGATTACTACAAAACCTGTGACTTTCTATTGGAATGTAACAGATTTAGGTAATTCTACTGCAGCTATCACGGTTCCAGATGCTATTGCTCCTATAAGTAAAACTGGATATGCTCCTTTTATTCACGGTTCTGTCCAAACCGATGGTATTGGATATAGAACTAACGTATCTATTGGTGCTTGGAGAGGTTCTAATACTTGGACATCTTCAGGTGCTTATATTGCTATTGGCGGTAATGATAACTATACGACAGAAGATTTTAGATTCATGACTGGTGGTTATATTGGCACAAGTGGCGGTACTTTAAATATCTTAGGTACTTTAAATGCACCTACTTTAACATCTACAACTGGATCTTTCACTACCGTTAATACAACAAATATTAACGCCCAAGGCAGTATTGTGATGAGTGCTGCGCCTGGTGGATCTGGGCGCAGCGGTATGTATACAGGAAATGGTGACGGTGCGTCCTTCTCTACCTGTAATATAGATATAGGTTCTCATTGGGGCTTAGGATTCAAAGATAATTTAGGAAACAGAAATATTATCTTTGATACCCGTGCAGGTAATGCGTCGTTTAAAGGATCTATTAGAATCGGTGCATCTTTTGCTGATGAGACTCAATTATTACCTACATCAAACCAACTTCAAATATTAACTTCAGGCGGTCAAGCTAGAAATATTTCGACTGGTGGCGTATTGGCTTCTGATGCTTACGCCGATGCTAGTAAAGTTCCAGTAAATGGTATCTACTCAAAAGGTGATATTAAAACATCTACATGGGTATATGCATCTAAATTCACCGGTCCTACTGGATCAGGTGATGGTATGTTTGACGGTAATGCATCTACTGCAACCAAATTGCAAACTGCAAGAACTTTCCAAATTACTGGCGGCATCACTACAAATGCAGTATCATTTGACGGACAGCAAAACGTAGTGTTAACTGCAAGCAATGTAGATGGTTCAAAAGTTACAGGCGTGGTTCCTGAGGCGGTTAAAGCGCAAACTCTTGCAGTGACACCGCAAAAAAATGCGAAATTGGTTGCATCATGGAAGGGTACCATATTGCAATCTATGACGCCTACACTAACTATTGTTGATGCAAATACACTTCGTGTTAGATTAGCAGACGATAGTCCGAGTAACAGATTGCCAGTATTGAGATTTAATGTGAAAATCGGCACAGTGTATCATCTCGCATTTAGTGATACTATGTTGCCGATCAATGGCACAGTAACTTTCGTCCAAACTGGGTTAACATGGGTTGAAGTTGATCTTAATTCACCTAACCACGGGCTATCAGGTTCAGGCAATGGTGTAAATGTTATGGCGATAACATATTCTGCATATGGTTGTTATTTTGAGGGCTCAATTAGCCAAATCATTGGCACAACAGGACCGAAAGACAGTCAATGGGCATATGTATTGAAACTCAATTCTCCGACAACTGATGCTACATATAATCTTAGCGGATCTTCGCAAGATGCAACATGGGTTGCAGATAAAAATATTTGGTATCTTAATCCTGCGCAGCCGGTGATAACTGCAGGCGCTATGATTTCTCCTGATAGATTGAATTTCTTCGCTGCTGATACAGATGCTCCAACAAGAATGCGTTCTAATATGGTAACTGCACAAATCTGGGACATTGTATAA

Tertiary structure

PDB ID
0424b0c7344fd29e704e5d25131b650e8d0f7b3a2e1923c574efe7107f42abf4
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4683
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50