Protein

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Genbank accession
WCF56983.1 [GenBank]
Protein name
tailspike protein/preneck appendage
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAIQDKFNKSNVIYKITRDIDLDGGTLTIPAGCTLDFQGGTFNNGTIILSSGIYFKGTNTKFNGVFLKYNSNISNVKIEGIEFVGSKNTNAQSADELTAAIRYTGEVSIDVLLIRDCIIHGYNSGIMLKASNAIIEDNTFYDNGALETIVGVHDGEVDISFYAATSNIKNNIIIKNNKCLSNYVHRNIDAGELKAETNIIIDGNICISQSSLNVEDPVTLRKSTCIMVGYRGVQDFNTPVIICNNICKHSSWSGIYIRGTNPSDVDYKTKYIANIHNNYLENITQVEDNTYFGAIAVVLKEGSIIEGNTIVKCTQGINLGFIHKDSHTSVIGNTILDCNWAIWNDSYSYNLNIQSNTIKKAVMGIIVNEVAASATDVASKQATILDNVIELSSEGNIGIRIYTYYGKNLKVDGNTIYCVKGTGIGIQIAQLSTSTELYPYVVSNNNLNNLNVGIQIEPTTFLRNEGRYVDFNRFFNCTTGIVFNTNLSGSLFVVEGNSFQSCDNIFNNQKGISALFEGKHKTNDTFIIYDNYEGVDYNNSTYGYLVDPPVCFRKKKFLEGDEVVSFKGYFSKAICQTSAPDASSDSYSKWKVEGGAMTTQVSNFCAVTGQIVYDSTLKKGKLWNGTAWVNLDGTPLA
Physico‐chemical
properties
protein length:637 AA
molecular weight: 70007,96070 Da
isoelectric point:5,35755
aromaticity:0,10047
hydropathy:-0,12716

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacteroides phage PhiCrAssBcn9
[NCBI] 		3023115 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCF56983.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ221544 [NCBI]
CDS location
range 23214 -> 25127
strand +
CDS
ATGGCAATACAAGATAAATTTAATAAGTCTAATGTTATCTATAAGATAACAAGGGATATAGACCTTGATGGGGGTACTCTTACTATACCAGCAGGATGCACTCTTGACTTTCAGGGAGGCACATTTAATAATGGTACTATTATATTGTCAAGTGGAATCTATTTTAAGGGAACTAATACAAAGTTTAATGGAGTATTTCTTAAATATAATAGTAATATTAGTAATGTTAAAATTGAGGGTATTGAGTTTGTAGGTAGTAAAAATACAAATGCCCAAAGTGCAGATGAATTAACTGCTGCAATAAGATATACAGGTGAAGTGTCTATTGATGTGTTATTAATAAGAGATTGTATTATACATGGGTATAACTCAGGTATTATGTTAAAAGCATCTAATGCTATTATAGAGGATAATACATTCTATGATAATGGAGCATTAGAAACTATAGTAGGAGTACATGATGGAGAAGTTGATATATCTTTTTATGCTGCTACCTCTAATATAAAAAATAACATTATTATTAAAAATAATAAATGTTTATCTAACTATGTACATAGAAATATTGATGCTGGAGAACTTAAAGCAGAGACTAATATTATAATTGATGGTAATATATGTATCTCACAGTCCTCATTAAATGTAGAAGACCCTGTTACTCTTAGAAAGAGTACTTGTATTATGGTAGGCTATAGAGGTGTACAGGACTTTAATACACCTGTTATTATATGTAATAATATATGTAAACATTCAAGTTGGTCAGGTATTTACATTAGAGGAACTAATCCATCTGATGTTGATTATAAGACAAAATACATTGCAAACATACATAATAATTACTTGGAGAATATTACACAAGTTGAGGACAATACATATTTTGGGGCTATAGCTGTAGTATTAAAAGAAGGTTCTATTATAGAGGGTAATACTATTGTAAAATGTACACAGGGAATAAACTTGGGTTTTATACATAAAGATTCACATACATCTGTAATAGGAAATACAATACTTGATTGTAATTGGGCTATATGGAATGATAGTTATTCATATAATCTGAATATTCAAAGTAACACAATTAAGAAAGCTGTAATGGGTATTATTGTCAATGAAGTTGCAGCTTCTGCAACTGATGTTGCATCTAAGCAAGCTACTATCCTTGATAATGTTATTGAGTTATCATCAGAAGGAAATATCGGAATTAGGATATATACCTATTATGGTAAAAATTTAAAAGTAGATGGTAATACTATTTACTGTGTTAAAGGTACTGGTATTGGTATTCAGATTGCACAACTTTCCACTTCTACAGAACTATACCCTTATGTAGTTTCAAATAATAACCTGAATAATCTTAATGTAGGTATCCAAATAGAACCTACTACTTTCCTTAGAAATGAGGGTAGATATGTTGATTTTAATAGGTTCTTTAACTGTACAACAGGTATTGTCTTCAATACTAATCTTTCTGGTTCACTTTTTGTGGTAGAGGGAAACTCTTTTCAAAGTTGTGATAACATATTTAATAATCAGAAAGGTATAAGTGCATTATTTGAAGGAAAACATAAAACAAATGATACCTTTATTATATATGATAACTATGAAGGAGTAGATTATAATAATTCGACTTATGGATATTTAGTTGACCCTCCAGTTTGTTTTAGAAAAAAGAAGTTTTTAGAAGGAGATGAAGTTGTTTCATTTAAAGGTTATTTTAGTAAAGCAATATGTCAGACTTCTGCACCTGATGCCTCCTCAGATTCTTATTCTAAGTGGAAAGTTGAAGGAGGAGCAATGACTACTCAAGTTTCTAATTTCTGTGCTGTTACAGGTCAAATTGTATATGATAGTACATTGAAGAAAGGAAAATTGTGGAATGGTACAGCATGGGTTAATCTTGATGGAACACCTTTAGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
3d408f7ea878f53c1e129daf1ccee2e1492ea86010f0bd1dd453d8b35c018a0b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7740
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50